♻️#ضربه ها و #آسیب های #مغزی (#TBI) می توانند منجر به #جهش های #ژنتیک و بیماری های #نورودژنراتیو #مغز شوند.
Traumatic Brain Injury (#TBI) Induces #Genome-Wide #Transcriptomic, #Methylomic, and Network #Perturbations in #Brain and #Blood Predicting #Neurological Disorders
پژوهشگران زیست شناسی و فیزیولوژی دانشگاه UCLA 🇺🇸 در پژوهشی که به تازگی منتشر شده است، دریافتند که آسیب های مغزی ناشی از ضربه در #ورزش، #جنگ، و محیط های #شهری و حتی #خانگی می تواند منجر به تداخل در فعالیت های ژنتیکی مغز شده و به بروز بیماری های کشنده مغزی ختم گردد که از طریق جریان خون به تمامی بدن پخش می شوند.
🔬این پژوهش که بر شبکه های ناقل #ژنتیکی #ژن هایی نظیر #Anax2، #Ogn، و #Fmod صورت گرفته است مشخص نمود تاثیرات آسیب های مغزی بر #هیپوکامپ بسیار زیاد است و بدلیل دخالت هیپوکامپ در #پیامدهی عصبی، #متابولیزم، #التهاب و بیماری، #عملکرد #خونی، و همپوشانی با فعالیت #لوکوسیت های #خون پیرامونی، مجر به انواع #اختلالات #روانپزشکی و #عصبی برای #مغز شده و می تواند گستره ای در حد اختلالات ناتوان کننده برای کل بدن را به همراه داشته باشد.
⚠️لازم به ذکر است بیشترین میزان سوانح و حوادث برای افراد در محیط های خانگی (منازل) رخ می دهد که در نظام های بهداشتی پیشرو، آموزش های عملی، سیستماتیک و تصویری به صورت ادواری و پی در پی برای کاهش این آسیب ها در سطح اجتماع ارائه می شوند.
Abstract
The complexity of the traumatic brain injury (#TBI) #pathology, particularly concussive injury, is a serious obstacle for #diagnosis, treatment, and #long-term prognosis. Here we utilize modern systems #biology in a rodent model of concussive injury to gain a thorough view of the impact of TBI on fundamental aspects of #gene regulation, which have the potential to drive or alter the course of the TBI pathology. TBI perturbed #epigenomic programming, #transcriptional activities (expression level and alternative splicing), and the organization of genes in networks centered around genes such as #Anax2, #Ogn, and #Fmod. Transcriptomic signatures in the #hippocampus are involved in #neuronal signaling, #metabolism, #inflammation, and #blood function, and they overlap with those in #leukocytes from #peripheral #blood. The homology between genomic signatures from blood and brain elicited by TBI provides proof of concept information for development of biomarkers of TBI based on composite #genomic patterns. By intersecting with human genome-wide association studies, many TBI signature genes and network regulators identified in our #rodent model were causally associated with brain disorders with relevant link to TBI. The overall results show that concussive brain injury reprograms genes which could lead to #predisposition to #neurological and #psychiatric disorders, and that genomic information from #peripheral #leukocytes has the potential to predict TBI #pathogenesis in the #brain.
لینک منبع 👇🏻(further reading)👇🏻
http://www.ebiomedicine.com/article/S2352-3964(17)30050-6/fulltext
✅(در صورت جذابیت و علاقمندی به موضوع، مطلب را برای دیگران نیز بازنشر فرمایید).
📢کانال #دکترامیرمحمدشهسوارانی
🍃🌹🌸💐🌸🌹🍃
@DrAmirMohammadShahsavarani
Traumatic Brain Injury (#TBI) Induces #Genome-Wide #Transcriptomic, #Methylomic, and Network #Perturbations in #Brain and #Blood Predicting #Neurological Disorders
پژوهشگران زیست شناسی و فیزیولوژی دانشگاه UCLA 🇺🇸 در پژوهشی که به تازگی منتشر شده است، دریافتند که آسیب های مغزی ناشی از ضربه در #ورزش، #جنگ، و محیط های #شهری و حتی #خانگی می تواند منجر به تداخل در فعالیت های ژنتیکی مغز شده و به بروز بیماری های کشنده مغزی ختم گردد که از طریق جریان خون به تمامی بدن پخش می شوند.
🔬این پژوهش که بر شبکه های ناقل #ژنتیکی #ژن هایی نظیر #Anax2، #Ogn، و #Fmod صورت گرفته است مشخص نمود تاثیرات آسیب های مغزی بر #هیپوکامپ بسیار زیاد است و بدلیل دخالت هیپوکامپ در #پیامدهی عصبی، #متابولیزم، #التهاب و بیماری، #عملکرد #خونی، و همپوشانی با فعالیت #لوکوسیت های #خون پیرامونی، مجر به انواع #اختلالات #روانپزشکی و #عصبی برای #مغز شده و می تواند گستره ای در حد اختلالات ناتوان کننده برای کل بدن را به همراه داشته باشد.
⚠️لازم به ذکر است بیشترین میزان سوانح و حوادث برای افراد در محیط های خانگی (منازل) رخ می دهد که در نظام های بهداشتی پیشرو، آموزش های عملی، سیستماتیک و تصویری به صورت ادواری و پی در پی برای کاهش این آسیب ها در سطح اجتماع ارائه می شوند.
Abstract
The complexity of the traumatic brain injury (#TBI) #pathology, particularly concussive injury, is a serious obstacle for #diagnosis, treatment, and #long-term prognosis. Here we utilize modern systems #biology in a rodent model of concussive injury to gain a thorough view of the impact of TBI on fundamental aspects of #gene regulation, which have the potential to drive or alter the course of the TBI pathology. TBI perturbed #epigenomic programming, #transcriptional activities (expression level and alternative splicing), and the organization of genes in networks centered around genes such as #Anax2, #Ogn, and #Fmod. Transcriptomic signatures in the #hippocampus are involved in #neuronal signaling, #metabolism, #inflammation, and #blood function, and they overlap with those in #leukocytes from #peripheral #blood. The homology between genomic signatures from blood and brain elicited by TBI provides proof of concept information for development of biomarkers of TBI based on composite #genomic patterns. By intersecting with human genome-wide association studies, many TBI signature genes and network regulators identified in our #rodent model were causally associated with brain disorders with relevant link to TBI. The overall results show that concussive brain injury reprograms genes which could lead to #predisposition to #neurological and #psychiatric disorders, and that genomic information from #peripheral #leukocytes has the potential to predict TBI #pathogenesis in the #brain.
لینک منبع 👇🏻(further reading)👇🏻
http://www.ebiomedicine.com/article/S2352-3964(17)30050-6/fulltext
✅(در صورت جذابیت و علاقمندی به موضوع، مطلب را برای دیگران نیز بازنشر فرمایید).
📢کانال #دکترامیرمحمدشهسوارانی
🍃🌹🌸💐🌸🌹🍃
@DrAmirMohammadShahsavarani
♻️ارتباط معکوس بین #اسکیزوفرنی و #ورم مفاصل (#آرتریت رماتوئید)
#Generating testable #hypotheses for #schizophrenia and #rheumatoid arthritis #pathogenesis by integrating #epidemiological, #genomic, and #protein interaction data
پژوهشگران روانپزشکی و اطلاعات بایومدیکال دانشگاه پیتسبورگ 🇺🇸 در پژوهشی که با تازگی منتشر شده است با بررسی های #ژنومی، #همه گیری شناختی، و تعامل #پروتئینی دریافتند که #خطای ژنتیکی منجر به آرتریت رماتوئید و اسکیزوفرنی در نواحی مشابهی از #ژنوم افراد ایجاد می شود.
🔬پیمایش های آمار حیاتی مشخص ساخته اند که در افراد مبتلا به اسکیزوفرنی و خویشاوندان آنها شیوع #رماتوئیدآرتریت به طرز معناداری از جمعیت کلی کمتر است. در پژوهش حاضر آنالیز داده های ژنتیک، به محدوده ای به نام #HLA دست یافت که #ژن های #HLA-B, #TNXB, #NOTCH4, #HLA-C, #HCP5, #MICB, #PSORS1C1, و #C6orf10 در آن قرار دارند. همچنین مشخص شد HLA-B و HLA-C بیشترین دخالت را هم در رماتوئیدآرتریت و هم در اسکیزوفرنی دارند.
Abstract
#Patients with #schizophrenia and their relatives have reduced prevalence of #rheumatoid_arthritis. Schizophrenia and rheumatoid arthritis #genome-wide association studies also indicate negative genetic correlations, suggesting that there may be shared #pathogenesis at the #DNA level or downstream. A portion of the inverse prevalence could be attributed to #pleiotropy, i.e., variants of a single #nucleotide #polymorphism that could confer differential risk for these disorders. To study the basis for such an #interrelationship, we initially compared lists of single nucleotide polymorphisms with significant #genetic associations (p < 1e-8) for schizophrenia or rheumatoid arthritis, evaluating patterns of #linkage #disequilibrium and apparent #pleiotropic risk profiles. Single nucleotide polymorphisms that conferred risk for both schizophrenia and rheumatoid arthritis were localized solely to the extended #HLA region. Among single nucleotide polymorphisms that conferred differential risk for schizophrenia and rheumatoid arthritis, the majority were localized to #HLA-B, #TNXB, #NOTCH4, #HLA-C, #HCP5, #MICB, #PSORS1C1, and #C6orf10; published functional data indicate that HLA-B and HLA-C have the most plausible pathogenic roles in both disorders. #Interactomes of these eight genes were constructed from protein–protein interaction information using publicly available databases and novel #computational #predictions. The genes harboring apparently pleiotropic single nucleotide polymorphisms are closely connected to rheumatoid arthritis and schizophrenia associated genes through common interacting partners. A separate and independent analysis of the interactomes of rheumatoid arthritis and schizophrenia genes showed a significant overlap between the two interactomes and that they share several common pathways, motivating functional studies suggesting a relationship in the #pathogenesis of schizophrenia/rheumatoid arthritis.
لینک منبع 👇🏻(further reading)👇🏻
https://www.nature.com/articles/s41537-017-0010-z
✅(در صورت جذابیت و علاقمندی به موضوع، مطلب را برای دیگران نیز بازنشر فرمایید).
📢کانال #دکترامیرمحمدشهسوارانی
🍃🌹🌸💐🌸🌹🍃
@DrAmirMohammadShahsavarani
#Generating testable #hypotheses for #schizophrenia and #rheumatoid arthritis #pathogenesis by integrating #epidemiological, #genomic, and #protein interaction data
پژوهشگران روانپزشکی و اطلاعات بایومدیکال دانشگاه پیتسبورگ 🇺🇸 در پژوهشی که با تازگی منتشر شده است با بررسی های #ژنومی، #همه گیری شناختی، و تعامل #پروتئینی دریافتند که #خطای ژنتیکی منجر به آرتریت رماتوئید و اسکیزوفرنی در نواحی مشابهی از #ژنوم افراد ایجاد می شود.
🔬پیمایش های آمار حیاتی مشخص ساخته اند که در افراد مبتلا به اسکیزوفرنی و خویشاوندان آنها شیوع #رماتوئیدآرتریت به طرز معناداری از جمعیت کلی کمتر است. در پژوهش حاضر آنالیز داده های ژنتیک، به محدوده ای به نام #HLA دست یافت که #ژن های #HLA-B, #TNXB, #NOTCH4, #HLA-C, #HCP5, #MICB, #PSORS1C1, و #C6orf10 در آن قرار دارند. همچنین مشخص شد HLA-B و HLA-C بیشترین دخالت را هم در رماتوئیدآرتریت و هم در اسکیزوفرنی دارند.
Abstract
#Patients with #schizophrenia and their relatives have reduced prevalence of #rheumatoid_arthritis. Schizophrenia and rheumatoid arthritis #genome-wide association studies also indicate negative genetic correlations, suggesting that there may be shared #pathogenesis at the #DNA level or downstream. A portion of the inverse prevalence could be attributed to #pleiotropy, i.e., variants of a single #nucleotide #polymorphism that could confer differential risk for these disorders. To study the basis for such an #interrelationship, we initially compared lists of single nucleotide polymorphisms with significant #genetic associations (p < 1e-8) for schizophrenia or rheumatoid arthritis, evaluating patterns of #linkage #disequilibrium and apparent #pleiotropic risk profiles. Single nucleotide polymorphisms that conferred risk for both schizophrenia and rheumatoid arthritis were localized solely to the extended #HLA region. Among single nucleotide polymorphisms that conferred differential risk for schizophrenia and rheumatoid arthritis, the majority were localized to #HLA-B, #TNXB, #NOTCH4, #HLA-C, #HCP5, #MICB, #PSORS1C1, and #C6orf10; published functional data indicate that HLA-B and HLA-C have the most plausible pathogenic roles in both disorders. #Interactomes of these eight genes were constructed from protein–protein interaction information using publicly available databases and novel #computational #predictions. The genes harboring apparently pleiotropic single nucleotide polymorphisms are closely connected to rheumatoid arthritis and schizophrenia associated genes through common interacting partners. A separate and independent analysis of the interactomes of rheumatoid arthritis and schizophrenia genes showed a significant overlap between the two interactomes and that they share several common pathways, motivating functional studies suggesting a relationship in the #pathogenesis of schizophrenia/rheumatoid arthritis.
لینک منبع 👇🏻(further reading)👇🏻
https://www.nature.com/articles/s41537-017-0010-z
✅(در صورت جذابیت و علاقمندی به موضوع، مطلب را برای دیگران نیز بازنشر فرمایید).
📢کانال #دکترامیرمحمدشهسوارانی
🍃🌹🌸💐🌸🌹🍃
@DrAmirMohammadShahsavarani
npj Schizophrenia
Generating testable hypotheses for schizophrenia and rheumatoid arthritis pathogenesis by integrating epidemiological, genomic…
Researchers in the USA identify variations in eight genes that potentially confer differential risk for schizophrenia and rheumatoid arthritis. Previous studies have shown that patients with schizophrenia (and their relatives) have a reduced risk of developing…
♻️روشی بدیع برای #شناسایی و #غربالگری بیماری #پارکینسون
A novel tool for #monitoring #endogenous #alpha-synuclein #transcription by #NanoLuciferase tag #insertion at the 3′end using #CRISPR-Cas9 #genome editing technique
پژوهشگران نوروساینس دانشگاه فلوریدای مرکزی 🇺🇸 در پژوهشی که به تازگی منتشر شده است روش ویرایش ژنوم #CRISPR-Cas9 را معرفی نموده اند که به کمک آن می توان به غربالگری و شناسایی زودهنگام #پارکینسون با قطعیت بالا اقدام نمود.
در روش حاضر سطح پروتیئن #آلفا-سینوکلین در #مغز سنجیده می شود. در بیماری پارکینسون سطح این پروتئین در مغز از حالت بهنجار خارج و بالا می رود. هنگام دارو درمانی و کنترل پارکینسون، سطح این پروتیئن مغزی در نورون ها دوباره به حال عادی باز می گردد. برای سنجش سطح آلفا-سینوکلیئن از روش CRISPR Cas9 استفاده شده است که روشی برای #ویرایش #DNA بدون کشتن سلول های #گیاهی و #جانوری است. با استفاده از این روش، ژن مسئول تولید آلفا-سینوکلین بگونه ای در هسته سلول تغییر می یابد که ماده ای رنگی را به پروتیئن محصول وصل نماید و به این ترتیب شناسایی و ردیابی سطح آلفا-سینوکلئین در سلول به سادگی امکان پذیر خواهد بود.
Abstract
#α-synuclein (#α-SYN) is a major pathologic contributor to #Parkinson’s disease (PD). #Multiplication of α-SYN encoding gene (#SNCA) is correlated with early onset of the disease underlining the significance of its #transcriptional regulation. Thus, monitoring #endogenous transcription of #SNCA is of utmost importance to understand PD #pathology. We developed a stable cell line expressing α-SYN endogenously tagged with #NanoLuc luciferase reporter using #CRISPR/Cas9-mediated genome editing. This allows efficient measurement of transcriptional activity of α-SYN in its native epigenetic landscape which is not achievable using exogenous transfection-based luciferase reporter assays. The NanoLuc activity faithfully monitored the transcriptional regulation of SNCA following treatment with different drugs known to regulate α-SYN expression; while exogenous promoter-reporter assays failed to reproduce the similar outcomes. To our knowledge, this is the first report showing endogenous monitoring of α-SYN transcription, thus making it an efficient #drug #screening tool that can be used for #therapeutic #intervention in #PD.
👇🏻[ادامه در لینک مطلب]👇🏻
https://www.nature.com/articles/srep45883
📢کانال #دکترامیرمحمدشهسوارانی
🍃🌹🌸💐🌸🌹🍃
@DrAmirMohammadShahsavarani
A novel tool for #monitoring #endogenous #alpha-synuclein #transcription by #NanoLuciferase tag #insertion at the 3′end using #CRISPR-Cas9 #genome editing technique
پژوهشگران نوروساینس دانشگاه فلوریدای مرکزی 🇺🇸 در پژوهشی که به تازگی منتشر شده است روش ویرایش ژنوم #CRISPR-Cas9 را معرفی نموده اند که به کمک آن می توان به غربالگری و شناسایی زودهنگام #پارکینسون با قطعیت بالا اقدام نمود.
در روش حاضر سطح پروتیئن #آلفا-سینوکلین در #مغز سنجیده می شود. در بیماری پارکینسون سطح این پروتئین در مغز از حالت بهنجار خارج و بالا می رود. هنگام دارو درمانی و کنترل پارکینسون، سطح این پروتیئن مغزی در نورون ها دوباره به حال عادی باز می گردد. برای سنجش سطح آلفا-سینوکلیئن از روش CRISPR Cas9 استفاده شده است که روشی برای #ویرایش #DNA بدون کشتن سلول های #گیاهی و #جانوری است. با استفاده از این روش، ژن مسئول تولید آلفا-سینوکلین بگونه ای در هسته سلول تغییر می یابد که ماده ای رنگی را به پروتیئن محصول وصل نماید و به این ترتیب شناسایی و ردیابی سطح آلفا-سینوکلئین در سلول به سادگی امکان پذیر خواهد بود.
Abstract
#α-synuclein (#α-SYN) is a major pathologic contributor to #Parkinson’s disease (PD). #Multiplication of α-SYN encoding gene (#SNCA) is correlated with early onset of the disease underlining the significance of its #transcriptional regulation. Thus, monitoring #endogenous transcription of #SNCA is of utmost importance to understand PD #pathology. We developed a stable cell line expressing α-SYN endogenously tagged with #NanoLuc luciferase reporter using #CRISPR/Cas9-mediated genome editing. This allows efficient measurement of transcriptional activity of α-SYN in its native epigenetic landscape which is not achievable using exogenous transfection-based luciferase reporter assays. The NanoLuc activity faithfully monitored the transcriptional regulation of SNCA following treatment with different drugs known to regulate α-SYN expression; while exogenous promoter-reporter assays failed to reproduce the similar outcomes. To our knowledge, this is the first report showing endogenous monitoring of α-SYN transcription, thus making it an efficient #drug #screening tool that can be used for #therapeutic #intervention in #PD.
👇🏻[ادامه در لینک مطلب]👇🏻
https://www.nature.com/articles/srep45883
📢کانال #دکترامیرمحمدشهسوارانی
🍃🌹🌸💐🌸🌹🍃
@DrAmirMohammadShahsavarani
Scientific Reports
A novel tool for monitoring endogenous alpha-synuclein transcription by NanoLuciferase tag insertion at the 3′end using CRISPR…
Scientific Reports volume 7, Article number: 45883 (2017) Cite this article