#КлиническаяФармакология #КФ #Определение #математика #моделирование #ВИЧ #Кофе #ColdBrewNitro
Совершенно случайно попалось определение клинической фармакологии в только что прочитанной статье «Получение модель-интергированного доказательства для разработки и экспертизы воспроизведенных лекарств». Статья написана сотрудниками офиса воспроизведенных лекарств Центра экспертизы и изучения лекарств (CDER) Администрации по продуктам питания и лекарствам (FDA) и опубликована в журнале «Clinical pharmacology and Therapeutics». doi:10.1002/cpt.1282
«В целом клиническая фармакология нацелена на изучение разнообразных наблюдаемых ответов человека на лекарство и выяснения механизмов действия лекарства и источников их вариабельности. Количественная клиническая фармакология — есть часть клинической фармакологии, придающая измеримый численный смысл характеристикам массы, объема, концентрации и времени в контексте диспозиции лекарства, а также количественно определяемым параметрам ФД-эффектов и клинических ответов». Авторы взяли определение из Peck CC. Quantitative clinical pharmacology is transforming drug regulation. J. Pharmacokinet. Pharmacodyn. 37 617-628. (2010).
Сама статья заслуживает куда большего внимания, чем содержащееся в ней определение КФ, поскольку в ней FDA еще раз подчеркивает изменяющийся характер подтверждения биоэквивалентности. Количественное математическое моделирование (QMM) стало реальностью и для генериков (IVIVC/К, бутстрэппинг в испытаниях на растворение, PBPK, биоэквивалентность in silico, моделирование БЭ в особых группах). Все это позволяет избежать проведения КИ, повысить понимание особенностей формуляции и ее поведения в организме человека, целенаправленно создавать лекарства с заданной биодоступностью и т. п. Моделирование стало неотъемлемой частью экспертизы безопасности, эффективности и качества генериков в FDA.
Наконец, все в том же «Clinical pharmacology and Therapeutics» в статье «Борьба с эпидемией ВИЧ/СПИД: победы и барьеры», doi:10.1002/cpt.1202, говорится:
Еще одной проблемой остается лечение туберкулеза, гепатита и малярии как коинфекций, которые распространены в сообществе ВИЧ-инфицированных. Повышенная тяжесть заболевания, измененная терапевтическая эффективность и лекарственные взаимодействия вызывают затруднения в разноплановом лечении этих заболеваний. Более того, особые опасения вызывают дети и беременные женщины, которые часто исключаются из клинических исследований. В рамках этой проблемы Weld and Dooley обсуждают пробелы в знаниях в области дозирования, эффективности и безопасности многих новых противотуберкулезных лекарств и таковых первой линии терапии, а также их влияние на антиретровирусные лекарства в этих популяциях. Вероятность клинически важных лекарственных взаимодействий со лекарствами для их лечения высокая, при этом физиологические различия у беременных и младенцев могут еще больше вызывать затруднения с точки зрения безопасности и эффективности. #Клинические фармакологи играют важную роль в минимизации таких пробелов в знаниях, не только за счет поддержания включения «забытых» популяций, но также за счет планирования и проведения соответствующих клинических исследований с их последующей осмысленной интерпретацией.
На фотографии cold brew nitro (кофе холодного отжима со льдом нитро). Нитро придает пенку, различий во вкусе не ощутил 😊 Дороже на 20 рублей (300 вон).
Совершенно случайно попалось определение клинической фармакологии в только что прочитанной статье «Получение модель-интергированного доказательства для разработки и экспертизы воспроизведенных лекарств». Статья написана сотрудниками офиса воспроизведенных лекарств Центра экспертизы и изучения лекарств (CDER) Администрации по продуктам питания и лекарствам (FDA) и опубликована в журнале «Clinical pharmacology and Therapeutics». doi:10.1002/cpt.1282
«В целом клиническая фармакология нацелена на изучение разнообразных наблюдаемых ответов человека на лекарство и выяснения механизмов действия лекарства и источников их вариабельности. Количественная клиническая фармакология — есть часть клинической фармакологии, придающая измеримый численный смысл характеристикам массы, объема, концентрации и времени в контексте диспозиции лекарства, а также количественно определяемым параметрам ФД-эффектов и клинических ответов». Авторы взяли определение из Peck CC. Quantitative clinical pharmacology is transforming drug regulation. J. Pharmacokinet. Pharmacodyn. 37 617-628. (2010).
Сама статья заслуживает куда большего внимания, чем содержащееся в ней определение КФ, поскольку в ней FDA еще раз подчеркивает изменяющийся характер подтверждения биоэквивалентности. Количественное математическое моделирование (QMM) стало реальностью и для генериков (IVIVC/К, бутстрэппинг в испытаниях на растворение, PBPK, биоэквивалентность in silico, моделирование БЭ в особых группах). Все это позволяет избежать проведения КИ, повысить понимание особенностей формуляции и ее поведения в организме человека, целенаправленно создавать лекарства с заданной биодоступностью и т. п. Моделирование стало неотъемлемой частью экспертизы безопасности, эффективности и качества генериков в FDA.
Наконец, все в том же «Clinical pharmacology and Therapeutics» в статье «Борьба с эпидемией ВИЧ/СПИД: победы и барьеры», doi:10.1002/cpt.1202, говорится:
Еще одной проблемой остается лечение туберкулеза, гепатита и малярии как коинфекций, которые распространены в сообществе ВИЧ-инфицированных. Повышенная тяжесть заболевания, измененная терапевтическая эффективность и лекарственные взаимодействия вызывают затруднения в разноплановом лечении этих заболеваний. Более того, особые опасения вызывают дети и беременные женщины, которые часто исключаются из клинических исследований. В рамках этой проблемы Weld and Dooley обсуждают пробелы в знаниях в области дозирования, эффективности и безопасности многих новых противотуберкулезных лекарств и таковых первой линии терапии, а также их влияние на антиретровирусные лекарства в этих популяциях. Вероятность клинически важных лекарственных взаимодействий со лекарствами для их лечения высокая, при этом физиологические различия у беременных и младенцев могут еще больше вызывать затруднения с точки зрения безопасности и эффективности. #Клинические фармакологи играют важную роль в минимизации таких пробелов в знаниях, не только за счет поддержания включения «забытых» популяций, но также за счет планирования и проведения соответствующих клинических исследований с их последующей осмысленной интерпретацией.
На фотографии cold brew nitro (кофе холодного отжима со льдом нитро). Нитро придает пенку, различий во вкусе не ощутил 😊 Дороже на 20 рублей (300 вон).
#математика #3Blue1Brown #COVID2019 #экспоненциальный_рост
Математический YouTube-канал 3Blue1Brown, на котором приводятся объяснения различных базовых математических концепций с геометрической точки зрения. Объяснения матана и линала интересные и понятные. Благодаря каналу также разобрался в преобразовании Фурье. Также автор канала приводит достаточное понятное объяснение теоремы Байеса и т. д. Многие видео переведены на русский язык.
Вчера Grant Sanderson (автор канала) выпустил наглядное объяснение закономерностей экспоненциального роста на примере COVID-2019, а также привел небольшой анализ сценариев развития событий в зависимости от поведения различных множителей.
Голос Grant Sanderson очень приятный, что еще лучше помогает усваивать материал😊
Математический YouTube-канал 3Blue1Brown, на котором приводятся объяснения различных базовых математических концепций с геометрической точки зрения. Объяснения матана и линала интересные и понятные. Благодаря каналу также разобрался в преобразовании Фурье. Также автор канала приводит достаточное понятное объяснение теоремы Байеса и т. д. Многие видео переведены на русский язык.
Вчера Grant Sanderson (автор канала) выпустил наглядное объяснение закономерностей экспоненциального роста на примере COVID-2019, а также привел небольшой анализ сценариев развития событий в зависимости от поведения различных множителей.
Голос Grant Sanderson очень приятный, что еще лучше помогает усваивать материал😊
YouTube
Exponential growth and epidemics
A good time for a primer on exponential and logistic growth, no? Home page: https://www.3blue1brown.com Brought to you by you: http://3b1b.co/covid-thanks Da...
#статмех #математика
Перед началом курса по молекулярной термодинамике у меня было несколько страхов:
- что будет программирование
- что будет квантовая механика
- что будет тензорный анализ
- что будет теория меры с интегралом Лебега.
В итоге программирование есть и на MATLABе.
Квантовую механику коснулись со всеми ее Гамильтонианами, де Бройлями и волновой функцией.
Теперь вылезли тензоры (одно утешает, что совсем немного). С тензорами забавно: осваивая матан, в комментариях на одном из YouTube-каналов увидел просьбу к лектору (просто гениально преподает матан) рассмотреть тензорный анализ. Тогда я полез смотреть что это и понял, что не зря лектора просят рассмотреть эту тему в отдельном большом блоке видео. В итоге, как у меня иногда бывает, именно это и повстречалось в качестве темы, которую придется осваивать.
Кстати, забавно, что еще на первом курсе первого образования (медицинское), когда у нас была общая химия, на которой немного рассматривалась термодинамика, у меня было какое-то предчувствие, что еще придется в нее погрузиться и рассмотреть серьезно. Не прошло и 19 лет, как предчувствие сбылось 🙂
Одно радует, что на курсе по мол-термо Лебега, видимо, все же не коснемся. Меж тем, объяснение интеграла Лебега самим Лебегом достаточно любопытное:
Лебег резюмировал свой подход к интеграции в письме к Полу Монтелю :
"Я должен заплатить определенную сумму, которую накопил в кармане. Я вынимаю из кармана банкноты и монеты и отдаю их кредитору в том порядке, в котором я их нахожу, пока не наберу общую сумму. Это интеграл Римана. Но я могу поступить иначе. После того, как я вынул все деньги из кармана, я заказываю банкноты и монеты по идентичной стоимости, а затем я плачу несколько куч один за другим кредитору. Это мой интеграл".
Перед началом курса по молекулярной термодинамике у меня было несколько страхов:
- что будет программирование
- что будет квантовая механика
- что будет тензорный анализ
- что будет теория меры с интегралом Лебега.
В итоге программирование есть и на MATLABе.
Квантовую механику коснулись со всеми ее Гамильтонианами, де Бройлями и волновой функцией.
Теперь вылезли тензоры (одно утешает, что совсем немного). С тензорами забавно: осваивая матан, в комментариях на одном из YouTube-каналов увидел просьбу к лектору (просто гениально преподает матан) рассмотреть тензорный анализ. Тогда я полез смотреть что это и понял, что не зря лектора просят рассмотреть эту тему в отдельном большом блоке видео. В итоге, как у меня иногда бывает, именно это и повстречалось в качестве темы, которую придется осваивать.
Кстати, забавно, что еще на первом курсе первого образования (медицинское), когда у нас была общая химия, на которой немного рассматривалась термодинамика, у меня было какое-то предчувствие, что еще придется в нее погрузиться и рассмотреть серьезно. Не прошло и 19 лет, как предчувствие сбылось 🙂
Одно радует, что на курсе по мол-термо Лебега, видимо, все же не коснемся. Меж тем, объяснение интеграла Лебега самим Лебегом достаточно любопытное:
Лебег резюмировал свой подход к интеграции в письме к Полу Монтелю :
"Я должен заплатить определенную сумму, которую накопил в кармане. Я вынимаю из кармана банкноты и монеты и отдаю их кредитору в том порядке, в котором я их нахожу, пока не наберу общую сумму. Это интеграл Римана. Но я могу поступить иначе. После того, как я вынул все деньги из кармана, я заказываю банкноты и монеты по идентичной стоимости, а затем я плачу несколько куч один за другим кредитору. Это мой интеграл".
#учеба #Stanford #математика #диффуры #теорвер #статистика
10 декабря закончилась моя осенняя четверть в Стэнфорде. Несмотря на то что я думал, что четверть будет легче, чем остальные, таковой она отнюдь не была. В этой четверти взял два предмета.
Первый — теория вероятности. Стандартный академический курс: случайные процессы, распределения (в т. ч. бета, гамма, отрицательное биномиальное, гипергеометрическое), процессы Бернулли и Пуассона, объединенные распределения, условная вероятность, производящие функции. Знание матана до уровня функций нескольких переменных (для объединенных распределений). Курс уровня 200 (базовые магистерские курсы или продвинутые курсы бакалавриата). Программирования не было, и его немного даже не хватало, хотя и без того курс был очень насыщенным.
Второй — прикладная математика для химических и биологических наук. Курс уровня 300 (повышенная сложность). Планировал его брать в прошлом году, т. к. легкомысленно думал, что он, вероятно, не такой уж и сложный. Но так получилось, что все-таки в прошлом году взял статистическую механику / молекулярную термодинамику. В весеннюю четверть общался с сокурсницей по поводу CHEMENG 300 и выяснил, что это далеко не a walk in the park, что и оказалось на самом деле, если не сказать больше.
Темы включали: тензорный анализ, функции, генерирующие моменты, дифференциальные уравнения (обыкновенные и в частных производных), в т. ч. задача Штурма-Луивилля, преобразования Фурье и Лапласа, функции Грина, регулярная и сингулярная теории возмущений, комплексный анализ (включая интегрирование по замкнутому контуру, полюсы и теорема вычетов), стохастические процессы (кинетика и броуновское движение).
Многие задачи для домашних заданий так или иначе были взяты из личных работ преподавателя, за исключением, пожалуй, задачи по квантовой механике. Контрольных/экзаменов не было, т. к. и без них было очень тяжело. Вместе с тем был финальный проект, который в моем случае состоял в повторной разработке модели движения хромосомы (частица в вязкоупругой жидкости). Нужно было проанализировать ряд статей преподавателя, найти необходимы выражения и прийти к ним с помощью расчетов.
При решении задачи одно из выражений никак не удавалось получить ни с помощью методов, которые давали на курсе, ни с помощью численного интегрирования. В частности, не удавалось преобразовать функцию по Лапласу, поскольку она не была стандартной. При общении с преподавателем он, как бы невзначай, предложил воспользоваться аналитическим продолжением: «Посмотрите в интернете, как это делается». Конечно, с помощью этого метода получилось решить проблему, но для меня это оказалось очень нетривиально.
Весь курс был пронизан инженерным подходом к решению задач: пытаться делать разное, используя известные математические приемы, но без попытки строго математически доказать при этом с перепроверкой при помощи компьютерного моделирования.
Во время прохождения курса работал с двумя репетиторами-технарями, которые позволяли глубже прочувствовать тему, осознать материал/вопрос. Их прямо сейчас можно трудоустроить в отделы производства и разработок фармы, поскольку они на лету понимают проблемы (ведь в фарме они во многом технические) и предлагают различные адекватные пути их решений.
Завершив данный курс, я закрыл минимум по курсам категории 300 обязательный программы своей магистратуры. Поистенне это были тяжелые изнуряющие курсы, но дающие глубинное понимание закономерностей поведения материи, включая химических/биологических материалов и живых тканей.
10 декабря закончилась моя осенняя четверть в Стэнфорде. Несмотря на то что я думал, что четверть будет легче, чем остальные, таковой она отнюдь не была. В этой четверти взял два предмета.
Первый — теория вероятности. Стандартный академический курс: случайные процессы, распределения (в т. ч. бета, гамма, отрицательное биномиальное, гипергеометрическое), процессы Бернулли и Пуассона, объединенные распределения, условная вероятность, производящие функции. Знание матана до уровня функций нескольких переменных (для объединенных распределений). Курс уровня 200 (базовые магистерские курсы или продвинутые курсы бакалавриата). Программирования не было, и его немного даже не хватало, хотя и без того курс был очень насыщенным.
Второй — прикладная математика для химических и биологических наук. Курс уровня 300 (повышенная сложность). Планировал его брать в прошлом году, т. к. легкомысленно думал, что он, вероятно, не такой уж и сложный. Но так получилось, что все-таки в прошлом году взял статистическую механику / молекулярную термодинамику. В весеннюю четверть общался с сокурсницей по поводу CHEMENG 300 и выяснил, что это далеко не a walk in the park, что и оказалось на самом деле, если не сказать больше.
Темы включали: тензорный анализ, функции, генерирующие моменты, дифференциальные уравнения (обыкновенные и в частных производных), в т. ч. задача Штурма-Луивилля, преобразования Фурье и Лапласа, функции Грина, регулярная и сингулярная теории возмущений, комплексный анализ (включая интегрирование по замкнутому контуру, полюсы и теорема вычетов), стохастические процессы (кинетика и броуновское движение).
Многие задачи для домашних заданий так или иначе были взяты из личных работ преподавателя, за исключением, пожалуй, задачи по квантовой механике. Контрольных/экзаменов не было, т. к. и без них было очень тяжело. Вместе с тем был финальный проект, который в моем случае состоял в повторной разработке модели движения хромосомы (частица в вязкоупругой жидкости). Нужно было проанализировать ряд статей преподавателя, найти необходимы выражения и прийти к ним с помощью расчетов.
При решении задачи одно из выражений никак не удавалось получить ни с помощью методов, которые давали на курсе, ни с помощью численного интегрирования. В частности, не удавалось преобразовать функцию по Лапласу, поскольку она не была стандартной. При общении с преподавателем он, как бы невзначай, предложил воспользоваться аналитическим продолжением: «Посмотрите в интернете, как это делается». Конечно, с помощью этого метода получилось решить проблему, но для меня это оказалось очень нетривиально.
Весь курс был пронизан инженерным подходом к решению задач: пытаться делать разное, используя известные математические приемы, но без попытки строго математически доказать при этом с перепроверкой при помощи компьютерного моделирования.
Во время прохождения курса работал с двумя репетиторами-технарями, которые позволяли глубже прочувствовать тему, осознать материал/вопрос. Их прямо сейчас можно трудоустроить в отделы производства и разработок фармы, поскольку они на лету понимают проблемы (ведь в фарме они во многом технические) и предлагают различные адекватные пути их решений.
Завершив данный курс, я закрыл минимум по курсам категории 300 обязательный программы своей магистратуры. Поистенне это были тяжелые изнуряющие курсы, но дающие глубинное понимание закономерностей поведения материи, включая химических/биологических материалов и живых тканей.