Считается, что давным-давно, в стародавние времена Европейские популяции тянулись через такое узкое "бутылочное" горлышко малой численности, что выбора на ком жениться особо не было👰


Конечно, каждый старался посвататься  к невесте с другого края деревни, но поскольку размер деревенек был небольшой, в конце концов все соседи оказывались друг другу троюродными племянниками🙋

Так вот - теперь так уже не считается! Команда Харальда Ригбауэра из Лейпцига исследовала ДНК от 1785 ископаемых людей, живших за последние 45 000 лет. И только 54 из них были продуктами родственных браков между кузинами💍

Это всего 3%. Да и то, большинство из описанных случаев имели место на удаленных Британских островах (в каменном веке, естественно).

#Ученые не поверили своим глазам, потому что в современных популяциях человека такие браки составляют ДЕСЯТЬ процентов!!!

Тогда они прогнали через анализ контрольную группу современных людей с таким же географическим распределением. Как и ожидалось, среди 1941 современных людей нашлось 176 потомков от близкородственных браков третьей степени - то есть между кузенами💑

Напомню, что в 2019 г. ученые прокопали все доступные им 450,000 геномов из Биобанка Британии. Нашлось 125 человек с генами, предполагающими, что они были потомками родственников первой или второй степени родства. Сюда входят дяди, бабушки и дедушки, а также сводные братья и сестры - когда мама одна, а папы разные, или наоборот. Такое уже называется «крайним инбридингом». При экстраполяции на всю популяцию Британских островов - включая Ирландию - получается.... примерно 20 000 человек🤔

Получается, что #глобализация имеется только в макро-экономике. А вот в микро-экономике "домашнего хозяйства" своя рубашка к телу даже ближе, чем у пещерного человека.
#Экономисты давно подсчитали - главный двигатель близкородственных браков - вовсе не романтические случаи, а банальная забота о собственности и минимизация сопутствующих расходов.

Ссылка на статью - https://www.nature.com/articles/s41467-021-25289-w

Как вам такое? В вашем роду были родственные браки?

#семья #родня #своярубашкаближектелу #генетика https://www.nature.com/articles/s41467-021-25289-w

Бывает так — пошел чел. в магазин, и купил себе полезняшку👍 Ну, пилу например циркулярную, ведь ей так ровненько можно планочки для ремонта нарезать, просто ай! И вот он режет, режет себе планочки, а тут — телефон зазвонил. Дальше сами понимаете. Волшебная пила вполне способна порезать не только планочку, но и пальчик…😬

Вот так и человеческий #организм, а точнее организм млекопитающих, включая мышей. Завел себе организм не просто циркулярную пилу, а прямо целую иммунную систему. А к ней — целый огромный набор нужных генов, некоторые из которых отключают мозг (зачеркнуто) — ну чтоб не страшно было этой самой системой пользоваться🙃

Шутка, шутка, товарищи, не мозг, а просто систему починки нашей собственной ДНК.
И не везде, а только в этих самых иммунных клетках, ну чтобы они злее были, чтоб антитела производили позабористее.

Бывает, этот самый ген (отключающий репарацию #ДНК) самопроизвольно включается где не надо — точнее где попало, а вовсе не в иммунных клетках. Тогда в этих самых клетках начинают резко накапливаться мутации, и от этого рак получается 🙄

Первый шаг к тому чтобы отключить заклинившую циркулярку — найти той самый ген, что ее кодирует. Этот ген нашелся в обширном семействе FAM (для многих его членов функции до сих пор не найдены).

Обретший функцию FAM72A уже направлен бигфарме для поиска ингибиторов. Есть надежда, что обнаружится молекула для выключения этой не в тему активирующейся полезняшки. Это значит, мы скоро научимся на корню задавливать мутационный процесс в уже образовавшихся опухолях, и предотвращать их уход от химиотерапии🙏

Постарались для нас ученые из Торонто — и за это давайте им выкатим бочку сиропа кленового! 💛

А вам встречались опасные полезняшки?

https://www.nature.com/articles/s41586-021-04144-4?proof=t%3BHuman (активная пару дней повисит в профиле)

#бигфарма #генетика #профессорАнча https://www.nature.com/articles/s41586-021-04144-4?proof=t%3BHuman

Бывает так: сто человек поели какую-то пищу, и отлично себя чувствуют. А один — схватился за живот, и три дня пролежал на полатях. А бывает и наоборот. Сто человек заболели, поев каких-нибудь скажем грибов ядовитых, а один — даже не заметил😋

Возьмем сахарозу (глюкоза плюс фруктоза), и немного более сложную трегалозу (грибной сахар). В ягодах и грибах таких углеводов напихано под завязку. А переваривают эти два сахара специальные ферменты — сахараза-изомальтаза (ген SI) и трегалаза (ген TREH). Так вот, у жителей Лапландии, Гренландии и других приполярных районов, тысячелетиями кушавших в основном тюленину и оленину, активности этих генов мало👀

При «арктическом типе питания» простые сахара сами собой образуются внутри наших клеток, а потому дополнительный подвох сахаров вообще не нужен!

Переехав в город, #северяне переходят на «цивилизованный» комбикорм, но их диро-мясные гены от этого не меняются. Съев булочку с вареньем, оленеводы и китобои бегут в туалет🤐

Так вот, оказалось что умные лапландцы с мутацией гена SI (а таких среди них 3%) в юности не упорствуют в поедании сахара, а приспосабливаются поедать его по чуть-чуть, постепенно наращивая дозу. Тем самым они сдвигают состав своей микробиоты, и она получает способность переваривать добавленный сахар🍔 Никуда не девшаяся при этом мутация защищает лапландцев от всасывания этого самого сахара в кровь, а потому — никакого диабета, а только польза — переработав сахар, бактерии наделают для них полезнейший бутират👍

Но эта схема сработает только если лапландцы с детства придерживались умеренности — суперспособность перерабатывать мороженое вовсе не в жир, а в квадратики на животе без труда не дается☝

Как вам такая генетическая полезняшка?

https://www.gastrojournal.org/article/S0016-5085(21)04065-8/fulltext (активная ссылка на пару дней в шапке профиля)

#генетика #питание #гены

#Генетики уже довольно хорошо знают, какие #гены и внешние факторы влияют на развитие тяжелых форм заболевания.

Еще в середине 2020-го года вышли научные публикации о том, что меньше страдают от ковида люди с первой группой крови💉 Это подтвердилось с ростом числа заболевших.

Выяснили, что первая и третья группы крови имеют антитела группы анти-А, не сильно, но все же взаимодействующие с вирусом и ослабляющие его. Таким людям для заражения требуется больше вирусных частиц, чем другим.

Но при «Омикроне», когда инфекционная доза вируса резко упала, эта особенность не очень сказывается на заражаемости🙎

Ещё есть гены интерферонового ответа, влияющие на тяжесть цитокинового шторма (он значим при «Дельте» и гораздо меньше при «Омикроне»).

Исследования показали, что гены предрасположенности к
✅астме,
✅аллергическому риниту,
✅астматическому бронхиту
несколько защищают от тяжелого течения коронавирусной болезни.

Сперва думали, что причина в профилактическом приёме астматиками стероидов и антигистаминных препаратов, но оказалось, что помогают защите сами гены (впрочем, по статистике, риск снижается не до нуля, а на несколько процентов). Просто вируса очень много.

Пример: #каратист легче справится с напавшими хулиганами, чем человек не тренированный. Но если сразу нападут не два, а десять, чёрный пояс по каратэ вряд ли спасёт🤕

Как вам такая #генетика?

(из интервью изданию «Партнер» о влиянии генетики на будущее человечества)

Есть #заболевания, записанные в нашем геноме. Теоретически тест, проведённый в детстве, позволит отложить момент заболевания с помощью профилактики. Но не всё так гладко🤔

Есть, например, наследственная #болезнь хорея Гентингтона, которая быстро «портит» мозг (примерно к 35-ти годам) и после нескольких тяжелых лет больной умирает. Родные, видя, как он мучается (с нарушением моторики и сознания, приступами ярости), начинают активно тестироваться. Излечить болезнь нельзя — можно немного замедлить🙄

Так что, рано узнав #диагноз, человек лет 20 занимается профилактикой, тяжело переживает — и продлевает срок полноценной жизни на год-другой (это, кстати, все неофициально — пока идут испытания).

#Профилактика реальна, если вовремя узнать диагноз и записаться на испытания. Обычный #невропатолог пациенту — увы! — вариантов лечения не даст. Большой вопрос: нужен ли такой диагноз — или лучше пребывать в неведении? (как думаете?)❔

Но мы тестируем семьи, где есть ребёнок с рецессивным заболеванием, определяем мутации у родителей. Затем предотвращаем рождение следующего больного ребёнка, делая ПГД (преимплантационная генетическая диагностика), отбирая в пробирке эмбрионы без «поломки» и пересаживая их в матку. Так семье гарантировано здоровое потомство — это не игра в генетическую рулетку☝

(из интервью изданию «Партнер» о влиянии генетики на будущее человечества)

#генетика #диагностика

Нож!!
“врачи встроили в геном девочки модифицированные донорские T-лимфоциты — клетки, способные убивать опухоли.”

Клетки не могут встроиться в геном 🧬 . Ген может встроиться в геном.

Клетка - это здание библиотеки. Геном - набор книг. Хромосома - полка с книгами. Ген - это книга.

#гены #генетика #геном

За последние годы #ученые нашли немало генов, вносящих вклад в различные заболевания, а также построили формулы, позволяющие предсказывать риски этих заболеваний. Делается это по ассоциации, и работает❕


Если генный вариант определенно, статистически-значимо связан с каким-то заболеванием, значит, он играет роль в его патогенезе, то есть ПРИЧИНЯЕТ заболевание. Но ассоциация - не значит причинность. Ученые-генетики возможно, неправы. Ну то есть совсем неправы🤔

На что им указали статистики. Дело в том, что основное допущение ассоциативной генетики - то, что подбор пар у человека происходит случайно. Человек не выбирает🙃

Ну-ка честно скажите, вы то сами как думаете? Случайно или не случайно?
Другими словами, есть ли у человека половой отбор? Имеет ли значение размер груди, например? Или банковского счета, наоборот? Могут ли очкарики познакомиться в оптике, а физкультурники - на беговой дорожке?😉

А если основное допущение модели не выполняется, то и результаты моделирования можно выкинуть. То есть гены - генами, а функции - функциями. Если #бегун и бегунья оба имеют первую группу крови, - точно так же. как и их олимпийские дети, - это еще не значит что группа крови влияет на мощность икроножных мышц.

Так может генетика - это просто конспирология? Земля, очевидно, плоская, а генов вообще никто никогда не видел😉

Не знаю как у вас, а у меня ответ сам напрашивается.
Ведь нас сортируют. Умных - к умным, а меня - к вам🙃

#генетика #судьба https://tinyurl.com/mr2d8zxs

В Испании ученые обратили внимание на необычный случай.

Женщина, 36 лет, пережила 12 онкологических диагнозов. Нет-нет, это были не метастазы, а каждый раз новая опухоль, требующая лечения😱

Пять из этих опухолей были злокачественными! (но после лечения - не сами собой, но все же - исчезали).

Для начала, в возрасте трех лет, у нее в ушке выросла эмбриональная рабдомиосаркома (это оочень плохо) - девочку лечили без особой надежды, химией и облучением, и ... вылечили!👍

В 2001 г. в бедренной, плечевой и локтевой костях у девочки, к тому времени подросшей,  было замечено несколько костных образований,  - поставлен диагноз "энхондроматоз".

Кроме того, в 2001 г. была диагностирована светлоклеточная карцинома шейки матки стадии IB с поражением эктоцервикса и эндоцервикса, без признаков папилломавирусной инфекции, для лечения которой была проведена гистерэктомия, двусторонняя аднексэктомия, брахитерапия и наружная лучевая терапия.

В 2006 г. хирургически удалена плеоморфная аденома левой околоушной железы.

Год спустя она перенесла мастоидэктомию слева с паротидэктомией слева по поводу веретенообразной саркомы низкой степени злокачественности.

В период 2006–2010 гг. было удалено несколько диспластических невусов, липома молочной железы и пиломатриксома. В 2010 г. выполнена гемитиреоидэктомия по поводу многоузлового зоба. В 2012 г. выполнена полипэктомия одной аденомы толстой кишки с внутрислизистой аденокарциномой, а через 2 года выполнена резекция аденокарциномы прямой кишки pT3N0M0 (крупная опухоль, но без метастазов). Еще одна тубулярная аденома была удалена при контрольной колоноскопии в 2014 году.

Оказалось что у выросшей девочки отсутствует важный ген  - MAD1L1. Должно быть две работающие копии этого гена - а у девочки два поврежденных🤔

А ген-то давно изучен на мышах. Утрата обоих копий гена у мышей  приводит к внутриутробной гибели плода в 100 процентах случаев!  А девочка не только выжила, то и неплохо зажигает в свои 36.

30-40% клеток в крови девочки были анеуплоидными - какие-то хромосомы в них отсутствовали, а какие-то были в наличии. Но с лишней копией. И ничего!

Потому что природа устроила так, что некоторые из ее Т-клеток стали гиперактивными как раз против опухолей, что помогало девочке выживать, несмотря на онкологические напасти🤓

Как вам такая история болезни?

#генетика #гены #рак #онкология https://tinyurl.com/458k4hyd

Интересная статья про пост-вакцинные миокардиты прямо-таки всколыхнула ученых. Эти самые редкие, но нашумевшие миокардиты развиваются сразу после коронавирусной прививки в основном у мальчиков, и встречаются в одном случае на 100.000.
❔Но вот вопрос — это случай? или предрасположенность?

В #госпиталь японской провинции Оита поступили два мальчика 13 лет с миокардитом сразу после прививки Файзер. И были они — однояйцевые (идентичные) близнецы. Заболевание протекало почти одинаково, и на пятый день они выписались, все хорошо👍

#Врачи и #ученые, однако, заинтересовались — а не примешалась ли тут #генетика. Если «виновата» она, то просто отлично. Значит мы может выявить предрасполагающий генный вариант и потом говорить пациентам по результатам анализа: вам всем на вакцину строем, а вот конкретно вы — никакой прививки вам, увы🤓
И тогда осложенией не будет, ну или будет намного меньше.

На проблему поиска предрасподагающий генных вариантов отправилась команда из огромной толпы ученых. Они наберут международную когорту участников с пост-вакцинным миокардитом, все геномы отсеквенирут, и ген поймают👏

Под микроскопом будут рассматривать:
🔸(i) редкие врожденные нарушения иммунитета;
🔸(ii) редкие варианты генов, кодирующих саркомерные белки; и связанные с кардиомиопатией
🔸(iii) аллели человеческого лейкоцитарного антигена (HLA).

☝ВАЖНО: ничего хорошего в миокардите нет, хоть в фас на него смотри, хоть в профиль. И все же пост-вакцинный #миокардит обычно протекает мягче, чем острый миокардит после настоящей вирусной инфекции.

От пост-вакцинных миокардитов в мире погибло лишь несколько человек, что конечно ужасно, но все же общая выживаемость более 99% весьма впечатляет. А вот при настоящем вирусном миокардите — риск смерти или необходимость трансплантации сердца в первый год после диагноза составляет 4–5%.

И похоже, что пострадавшие от вакцины (я только про случаи миокардитов тут говорю) - это те же люди, что от «дикого» ковида приболели бы очень сильно, возможно фатально.

Генетика покажет... https://tinyurl.com/33wrz835

#Генетика, конечно, влияет на все. Кого-то #гены «толкают» под куст, где змея, а кого-то, наоборот, «отгоняют» подальше от опасного места. И так по каждому параметру🤔

Примерно так же унаследованные нами генные варианты мягонько разделяют людей на «чайников» и «кофейников», а также «ванщиков» и «душистов».

Так вот, для нас для «чайников» — хорошие новости. Гены, берущие «за локоток» чтобы подлить заварочки в чашечку, самую малипусенькую малость, но все же защищают нас от инфекции коронавирусом. Как — непонятно, но связь причинная (по научному, каузальная). Может, вещества какие в чае влияют, а может, и сама привычка «сначала чашечку чая спокойно выпить, а потом уже куда-нить сломя ног бежать»☕

Показано всесильным методом Менделевской рандомизации лично Анчей в содружестве с трудолюбивыми китайскими учеными и их большим сервером🙃

Как считаете, учитывая что Анча любит чай, — есть тут конфликт интересов? (но и кофе Анча тоже любит, просто мы его не проверяли)))

#чай #кофе #кофеманка #хочучаю https://tinyurl.com/4np4v8e2

#Генетика употребления алкоголя — любимая тема для «застольных» ученых бесед.

Главный ген, определяющий интенсивность похмелья называется ADH1B. Его вариант с Гистидином в позиции 48 (*48His) как раз таки и создает нам утреннюю головную боль и всеобщее «колбашение» слегка отравленного организма, а если кому досталось не одна копия гена с мутацией, а две — тому вообще никакого удовольствия бокал вина не дает, а одни лишь проблемы🤓

Поэтому обладатели двух копий варианта (*48His) быстренько обучаются само-ограничению🍷⛔

Казалось бы, неспособность переносить #алкоголь — явный дефект, ведь Вася из соседнего подъезда глушит как не в себя, а ему хоть бы хны. По сравнению с Васей, вынужденный трезвенник Петя выглядит слабачком😷

❗Но это не так! Последние данные ученых на материале народов Африки, все еще живущих в своих традиционных культурах показали, что «похмельный» вариант гена ADH1B — это полезная адаптация, приобретенная одновременно с привычкой выращивать зерновые и овощи, а не одной охотой и собирательством пробавляться. В общем, это признак цивилизации🤓

Более того, есть сильная защитная связь между «похмельным» вариантом ADH1B*48His и сердечно-сосудистыми фенотипами. Носители аллеля ADH1B*48His не только потребляют меньше алкоголя, но и имеют значительно более низкие артериальное давление, ИМТ, биомаркеры воспаления и «плохой» холестерин. У них снижен риск развития ишемической болезни сердца, крепкое психическое здоровье и ниже «смертность от всех причин». От уровня алкоголя эти защитные эффекты при этом вообще не зависят!👍

Из алкоголя «быстрый» фермент ADH1B*48His создает нам похмельный синдром за счет увеличения ацетальдегида. При поедании обычной пищи тот же самый фермент обеспечивает нейтрализацию окисленных жиров и других токсинов, Выходит, трезвеннику Пете от его «слабого» генотипа одна польза!

Интересно, что среди Россиян и других восточных славян «слабачков Петь» в процентном отношении заметно больше, чем в Западной и Центральной Европе. И это заметно противоречит мифу о том, «русские могут выпить больше» чем, к примеру, французы. Скорее всего, дело в том, что в таких состязаниях скорее примут участие короткоживущие Васи, которые именно потому и способны выпить немало, что их генотипы пока не научились настоящей цивилизации…

Впереди же планеты всей по частоте «похмельного» гена — Юго-Восточная Азия и ее островная «цивилизационная колыбель»🐳

А как у вас в смысле похмелья?

#похмелье #генетика #трезвость https://academic.oup.com/mbe/article/39/10/msac183/6677382?login=false

Есть такой белок — рилин. Если у ребенка этот ген отключен, #мозг формируется с таким трудом, что даже слои его коры оказываются перемешаны. Получаются, увы, сглаживание извилин, тяжелая умственная отсталость и эпилептические приступы😢

Название «рилин» происходит от английского глагола to reel — кружиться, вертеться, идти нетвёрдой походкой. Именно такая, «закрученная», неровная походка была отмечена у мышей с генетически обусловленным недостатком рилина. Да и соображалка у этих мышек работает из ряда вон плохо. И мыши с недостатком рилина, и (очень редкие) случаи рилинопатии у человека указывают на то, что ген рилина RELN страшно важный🐭

И вот ученые нашли «нежданчик». Мутация рилина попалась в группе из 1200 лиц с ранним генетически-обусловленным Альцгеймером. У всех больных была очплохая мутация гена пресенилина (ген PSEN1, мутация E280А — если кому конкретно интересно). Нарушения когниции у таких бедолаг наблюдают в среднем к возрасту 44 лет, а к 49 — уже все, полный Альцгеймер, тоже в среднем, конечно😱

Но в группу пациентов с подтвержденной мутацией затесался гражданин Х из Колумбии. Он работал себе спокойно, в 60 вышел на пенсию, и только в 67 родные заподозрили что он когнитивно ослаб (не до масштабов Альцгеймера, но все же). И отвели его на проверку. Тут и выяснилось, что он обладает зловредной мутацией PSEN1 E280А, которая давно уже должна была с ним полностью расправиться, а он — уклонился! ❤️

В поисках чуда ученые просеквенировали его геном и… нашли мутацию рилина H3447R. Казалось бы, такое сочетание должно было пациента совсем заколбасить. Однако, проделав функциональный анализ, ученые обнаружили что эта мутация не ослабляет, а усиливает рилин. То есть является настоящей мутацией «приобретения функции» — а именно, «спасать» наш мозг от Альцгеймера👍

Жалко, что встречается чудо-мутация редко. Настолько редко, что ей дали специальное имя — мутация COLBOS, в честь Колумбии и Бостона, откуда были ученые.

Так что вот. Не все мутации вредные, всякое бывает! 😇

#болезньальцгеймера #генетика https://tinyurl.com/5n8k8rk5

Почитав школьный учебник, легко сделать вывод о том, что генетические заболевания — дело чрезвычайно редкое. Да и университетский учебник приводит к такому же выводу.

Но это, увы, не так. Каждый из нас носит по 6-7, а то и больше вполне внятных мутаций, которые при неблагопрятном, но случайном раскладе могут бы привести к тяжелой патологии у родившегося ребенка.

Да и у нас такие мутации проявиться могут, правда, в возрасте зрелом или даже пожилом.

Возьмем для примера всего лишь одну группу редких генетических заболеваний — болезни экспансии повторяющихся последовательностей. До буквально вчерашнего дня считалось, что эти болезни встречаются  у одного из каждых
3000 человек (конечно, в среднем на популяцию).

А вот ученые из Лондона воспользовались своим Биобанком, в который собраны самые разные обитатели Британских островов, и проанализировали хранившиеся в этой базе данных геномы. Всего исследовали 82 176 самых обычных человеков.

И что вы думаете? Оказалось, что та или иная болезнь экспансии повторяющихся последовательностей встречается на каждые 283 человек. Некоторые из них еще заболеют и будут гадать, откуда на них такое свалилось, а некоторые уже страдают и бродят кругами в поисках диагноза.

Другими словами, частота встречаемости оказалась примерно в 12 раз выше, чем нам сообщили в учебнике.

Вот такие вот удивительные факты.
https://tinyurl.com/tz78dxem

#генетика #мутации

В первой части этого поста мы рассказали, что генетические заболевания встречаются намного чаще, чем про это рассказано в учебнике по лечебному делу. Раз в 12 примерно чаще. А, может, даже и больше.

Это означает, что и врачей-генетиков нам нужно примерно в 12 раз больше. Ведь сложный диагноз не сможет поставить ни участковый терапевт, ни педиатр.

Да и врач-генетик с такой постановкой справляется не всегда, а потому пациенты бродят по кругу.

Дело в том, что генетические болезни проявляют себя у разных людей по-разному. Никакого «общего» фенотипа зачастую нет. Дети — ладно. У детей есть «обязательство» проходить по этапам развития, да и история влияний окружающей среды у них, как правило, небольшая.

А вот с диагностикой генетических заболеваний, впервые проявляющихся у пожилых, просто швах, причем по всему миру.

Рассмотрим лишь один пример — экспансию повтора в гене C9orf72. Даже в пределах одной семьи эта болезнь может выглядеть и как деменция с тельцами Люи (это чисто «мозговой» фенотип, именно это заболевание сразило душечку Брюса Уиллиса), и как боковой амиотрофический склероз, где соображалка работает прекрасно, а вот мускулы быстро вянут.

И это еще не все. У каждого третьего пациента с экспансией повтора в гене C9orf72, заболевание начинается атипично: им ставят или болезнь Альцгеймера, или даже болезнь Хантингтона (БХ), как у Тринадцатой в «Доктор Хаус». А у них-то совсем другое...

И что же теперь с этим делать? Как человечество, мы движемся по направлению к повальному секвенированию экзомов и даже геномов. Подробный молекулярный разбор откроет возможности не только для диагностики, но во многих случаях и к коррекции фенотипа.

Огорчает одно — дешево, похоже, не будет. Но об этом в какой-нибудь следующей серии. 

#генетика #мутации