🔔 مقاله برتر
⬅️ این مقاله جالب با عنوان "متاژنومیکس: ابزارها و بینش مورد نیاز برای آنالیز داده های توالی یابی نسل بعد (NGS) که از پژوهش های تنوع زیستی بدست آمده اند.
پیشرفت در روش توالی یابی نسل بعد (NGS) موجبات وقوع جهش های عظیمی در مطالعات اکولوژی میکروبی را فراهم آورده است. این امر به توسعه ی سریع پژوهشهایی در درون محیط طبیعی زندگی میکروبها و شکل گیری علمی با نام "متاژنومیکس" منجر شده است. این عبارت غالبا تحت عنوان "آنالیز DNA درون اجتماعات میکروبی و در نمونه های محیطی بدون نیاز به کشت دادن آنها" تعریف می شود. بسیاری از ابزارهای محاسباتی/آماری متاژنومیکس و پایگاه های داده ی مربوط به آنها به منظور بهره برداری از هجوم عظیم داده هایی که مرتبا تولید می شوند، ایجاد شده اند.
دراین مقاله ی مروری ما به بررسی این موضوع پرداخته ایم که چگونه فناوریهای توالی یابی به طرز بی نظیری با انواع مختلف پژوهش های متاژنومیکس وفق داده و سازگار شده اند. دراین میانه تمرکز ما بر تکنیک ها، ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی بوده است که در حال حاضر در دسترس ما هستند تا بتوانیم هر بخش منحصر بفرد از آنالیز مجموعه داده های متاژنومیک خاص را انجام دهیم. از سوی دیگر، سرنوشت و روند آینده ی این مطالعات را با توجه به توسعه ی ابزارها و فناوری های موجود، مورد بررسی قرار داده ایم. علاوه بر تمام اینها، ما ابزارهای مدیریت، توزیع و یکپارچه سازی داده ها را مورد بحث قرار داده ایم. ابزارهایی که ظرفیت و توان بالقوه ی انجام تحلیل های مقایسه ای متاژنومیک را بر روی مجموعه داده های چندگانه، دارا هستند و این عمل را از طریق استفاده از دیتابیس های خوش ساخت و استانداردهای تفسیر موجود انجام می دهند.
📝 Metagenomics: Tools and Insights for Analyzing Next-Generation Sequencing Data Derived from Biodiversity Studies
💾 Bioinformatics and Biology Insights (2015)
💡 doi:10.1093/gbe/evw046
✨ #Metagenomics #NGS
🌐 www.ParsSilico.com
🖥 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ
⬅️ این مقاله جالب با عنوان "متاژنومیکس: ابزارها و بینش مورد نیاز برای آنالیز داده های توالی یابی نسل بعد (NGS) که از پژوهش های تنوع زیستی بدست آمده اند.
پیشرفت در روش توالی یابی نسل بعد (NGS) موجبات وقوع جهش های عظیمی در مطالعات اکولوژی میکروبی را فراهم آورده است. این امر به توسعه ی سریع پژوهشهایی در درون محیط طبیعی زندگی میکروبها و شکل گیری علمی با نام "متاژنومیکس" منجر شده است. این عبارت غالبا تحت عنوان "آنالیز DNA درون اجتماعات میکروبی و در نمونه های محیطی بدون نیاز به کشت دادن آنها" تعریف می شود. بسیاری از ابزارهای محاسباتی/آماری متاژنومیکس و پایگاه های داده ی مربوط به آنها به منظور بهره برداری از هجوم عظیم داده هایی که مرتبا تولید می شوند، ایجاد شده اند.
دراین مقاله ی مروری ما به بررسی این موضوع پرداخته ایم که چگونه فناوریهای توالی یابی به طرز بی نظیری با انواع مختلف پژوهش های متاژنومیکس وفق داده و سازگار شده اند. دراین میانه تمرکز ما بر تکنیک ها، ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی بوده است که در حال حاضر در دسترس ما هستند تا بتوانیم هر بخش منحصر بفرد از آنالیز مجموعه داده های متاژنومیک خاص را انجام دهیم. از سوی دیگر، سرنوشت و روند آینده ی این مطالعات را با توجه به توسعه ی ابزارها و فناوری های موجود، مورد بررسی قرار داده ایم. علاوه بر تمام اینها، ما ابزارهای مدیریت، توزیع و یکپارچه سازی داده ها را مورد بحث قرار داده ایم. ابزارهایی که ظرفیت و توان بالقوه ی انجام تحلیل های مقایسه ای متاژنومیک را بر روی مجموعه داده های چندگانه، دارا هستند و این عمل را از طریق استفاده از دیتابیس های خوش ساخت و استانداردهای تفسیر موجود انجام می دهند.
📝 Metagenomics: Tools and Insights for Analyzing Next-Generation Sequencing Data Derived from Biodiversity Studies
💾 Bioinformatics and Biology Insights (2015)
💡 doi:10.1093/gbe/evw046
✨ #Metagenomics #NGS
🌐 www.ParsSilico.com
🖥 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ