📣خبر داغ این هفته
توالی یابی ژنوم انسان توسط دستگاه توالی یابی نانوپور اکسفورد
وسیله ای به اندازه کف دست انسان
مقاله این موفقیت نهم بهمن در مجله نیچر بیوتکنولوژی به چاپ رسید
@practicalbioinformatics

😱Scooped!
تحقیق شما را گروه دیگری زودتر منتشر کرده!
!نگران نباشید!
نشریه پلاس بیولوژی مقاله شما به علت تکراری بودن رد نمی کند
اگر کمتر ازشش ماه آن را ارایه دهید.
پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🛎با MinIT دیگر نیازی به لپ تاپ اختصاصی برای توالی یابی نانوپور با MinION ندارید.

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
@practicalbioinformatics

🛎با MinIT دیگر نیازی به لپ تاپ اختصاصی برای توالی یابی نانوپور با MinION ندارید

▪️ابزار MinIT یک وسیله از پیش تنظیم شده است که می تواند جایگزین سخت افزار شما برای توالی با MinION یا Flongle باشد.

▫️ویژگی های MinIT:
- نرم افزار از پیش نصب شده: سیستم عامل لینوکس، از جمله MinKNOW (نرم افزار کنترل توالی نانوپور).
- دارای بلوتوث: شما می توانید آزمایش های خود را با استفاده از یک لپ تاپ، تبلت یا گوشی هوشمند کنترل کنید
- قابلیت انجامbasecalling : فایلهای fastq در یک SSD درایو ذخیره می شوند،
- دارای هشت گیگ رم و 256 هسته GPU
- وزن کم زیر 500 گرم
- دارای پورت های USB 3، USB 2، HDMI ،Ethernet

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
@practicalbioinformatics

🔸درمان در پزشکی بسیار نادر است. مثل یک رویا می ماند که با یک تزریق بتوان هر دو نوع هموفیلی را درمان کرد.
#ژن_تراپی
www.goo.gl/v62nKk
🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
@practicalbioinformatics

اگر مایل به #کارآموزی در واحد مارکتینگ شرکت دانش بنیان نوژن اکسیر، مستقر در پارک فناوری پردیس هستید و نیز به زبان انگلیسی مسلط هستید، ما را از توانایی های دیگر خود مطلع کنید:

Info@ExirLabs.com

روحیه ی کار تیمی، برقراری ارتباط و آشنایی با مجموعه نرم افزارهای گرافیکی Adobe در اولویت نیازهای ماست.

رزومه های ارزشمند شما با افتخار بررسی و مراحل بعدی به اطلاع شما خواهد رسید.
http://fa.exirlabs.com/images/agahi.jpg
@ExirLabs

🔔 آیا به genome assembly و annotation علاقه مند هستید؟

📃شما این مقاله را باید بخوانید.👇
https://f1000research.com/articles/7-148/v1

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🎁لیست آدرس های فعال سایت Sci-Hub
sci-hub.la
sci-hub.tv
sci-hub.tw
sci-hub.hk
sci-hub.name
http://80.82.77.84
http://80.82.77.83
🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🌍نقشه پراکندگی شرکت های بیوتکنولوژی اروپا!

از نظر تعداد شرکت ها
1)آلمان
2)انگلیس
3)فرانسه

جزئیات بیشتر 👇
https://labiotech.eu/map/

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📊نظرسنجی دوره های آینده پارس سیلیکو 📝نظر به اهمیت علوم کامپیوتر ریاضیات و آمار در زیست شناسی ، آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو تصمیم به برگزاری دوره های کاربردی در این زمینه ها دارد. 🗳کدامیک از دوره های زیر را پیشنهاد می دهید؟
anonymous poll

یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک – 49
👍👍👍👍👍👍👍 43%

ریاضی و آمار در زیست شناسی – 36
👍👍👍👍👍 32%

الگوریتم های بیوانفورماتیک – 28
👍👍👍👍 25%

👥 113 people voted so far.

پانزدهمین کنگره سراسری بیوشیمی و ششمین کنگره بین المللی بیوشیمی و بیولوژی مولکولی 3 الي 6 شهریور ماه 97 در دانشگاه علوم پزشکی اصفهان.
راه های ارتباط با کنگره:
لینک سایت:
www.icbmb2018.com
لینک کانال تلگرام:
t.me/icbmb2018
تماس با دبیرخانه:
09032225747

💊طبق گزارش منتشر شده، در سال 2017 سازمان FDA تعداد 16 دارو پزشکی شخصی را در سال 2017 تایید کرده است👇

https://goo.gl/BHGT8Y

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🛎فرصت شغلی

✔️Searching for a PhD-level computational biologist to work on malaria genomics and transcriptomics at #broadinstitute and #HarvardChanSPH. Please RT
https://tinyurl.com/ycs6ktg8

▪️QUALIFICATIONS

▫️Ph.D. in computational biology, genetics, computer science, statistics, math, molecular biology, or related field, or equivalent practical experience.

▫️Expertise in Illumina sequencing data analysis tools and general knowledge of statistical methods for genomic and transcriptomic data analysis.

▫️Demonstrated ability to clearly communicate scientific ideas and results in oral presentations.

▫️A publication record reflecting high productivity and the ability to write clearly.

▫️Interest in infectious diseases and global health

▫️Familiarity with population genetic and molecular evolutionary analysis methods, including tests of natural selection and phylogenetics

▫️Fluency in Unix, standard bioinformatics tools (Python, R, or equivalent), and a programming language (C/C++, Java)

▫️Excellent communication, organization, and time management skills

Creative, organized, motivated, team player
👑ازمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics

📊بنچمارک - مقایسه مپرهای NGS
#NGS #aligner #mapping #sequencing

👑ازمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics

✍️مقاله 👇
یادگیری ماشین مبتنی بر شبکه و الگوریتم های تئوری گراف برای درمان دقیق سرطان
www.nature.com/articles/s41698-017-0029-7


🥇 پارس سیلیکو پیشرو در بیوانفورماتیک

@practicalbioinformatics

Rare Disease Day
امروز روز جهانی بیماری های نادر بود و در سرتاسر جهان مردم تشویق به کمک های خیرخواهانه به فعالیت های پژوهشی جهت پیشگیری و درمان این دسته از بیماریها شدند.
@ExirLabs

💐پارس سیلیکو این افتخار را داشت که در سومين كنفرانس زيست شناسي سامانه هاي ايران حضور داشته باشد.

🌹با تشکر از عوامل برگزاری این کنفرانس بسیار عالی و پربار

icsb2018

📣دوره ۳ روزه انالیز بیان ژن

🕰 ۷ الی ۹ فروردین

🎁۲۰ درصد تخفیف ثبت نام تا ۲۰ اسفند

📞 اطلاعات بیشتر:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍 www.goo.gl/9ytXkG

آزمایشگاه پارس سیلیکو👇
@practicalbioinformatics

▪️تبدیل فرمت FASTQ به FASTA با استفاده از خط فرمان

✍️ابزار های فراوانی برای تبدیل FASTQ به FASTA وجود دارد ولی یک دستور ساده در ترمینال لینوکس به راحتی میتونه این کارو انجام بدهد. و نیازی به دانلود و نصب نرم افزاری نیست.👇

paste - - - - < file.fq | cut -f 1,2 | sed 's/^@/>/' | tr "\t" "\n" > file.fa

#NGS
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics

▪️تبدیل فایل BAM به BED فرمت

✍️برای تبدیل فایل BAM به BED فرمت از این دستور پرل در خط فرمان استفاده کنید .👇👇

samtools view file.bam | perl -F'\t' -ane '$strand=($F[1]&16)?"-":"+";$length=1;$tmp=$F[5];$tmp =~ s/(\d+)[MD]/$length+=$1/eg;print "$F[2]\t$F[3]\t".($F[3]+$length)."\t$F[0]\t0\t$strand\n";'

#NGS #mapping
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics