تفاوت دو رویکرد:
در حالی که غربالگری در مقیاس وسیع، ممکن است صدها ترکیب (lead) بالقوه را مشخص کند اما بسیاری از این ترکیبات در دور اول آزمایش ها حذف می گردند. طی این مرحله، تاثیر ترکیبات برروی سلول های کشت شده یا حیوانات بررسی شده تا دريابند چگونه این ترکیبات اثر می گذارند و آیا آنها اثر سمی دارند یا خیر.
رویکرد طراحی منطقی دارو، تعداد ترکیبات کمتری را نسبت به غربالگری در مقیاس وسیع طراحی می کند. در عین حال که این ترکیبات نسبت به هدف بسیار اختصاصی هستند. درواقع از مدل های شبیه سازی برپایه کامپیوتر جهت رسیدن به این اختصاصیت استفاده می گردد.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید
https://www.yourgenome.org/facts/how-are-drugs-designed-and-developed
در حالی که غربالگری در مقیاس وسیع، ممکن است صدها ترکیب (lead) بالقوه را مشخص کند اما بسیاری از این ترکیبات در دور اول آزمایش ها حذف می گردند. طی این مرحله، تاثیر ترکیبات برروی سلول های کشت شده یا حیوانات بررسی شده تا دريابند چگونه این ترکیبات اثر می گذارند و آیا آنها اثر سمی دارند یا خیر.
رویکرد طراحی منطقی دارو، تعداد ترکیبات کمتری را نسبت به غربالگری در مقیاس وسیع طراحی می کند. در عین حال که این ترکیبات نسبت به هدف بسیار اختصاصی هستند. درواقع از مدل های شبیه سازی برپایه کامپیوتر جهت رسیدن به این اختصاصیت استفاده می گردد.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید
https://www.yourgenome.org/facts/how-are-drugs-designed-and-developed
@yourgenome · Science website
How are drugs designed and developed?
Producing a new drug is an expensive and time-consuming process that is subject to extensive regulation.
مراحل کلی تولید يک دارو
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید
https://www.yourgenome.org/facts/how-are-drugs-designed-and-developed
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید
https://www.yourgenome.org/facts/how-are-drugs-designed-and-developed
بررسی رابطه ساختار - عملکرد پپتید آنتی میکروبیال polybia-cp موجب شناسایی و ایجاد کاندیدهای سنتتیک درمانی شده است
دانش محدودی درباره ارتباط عملکرد-ساختار پپتیدهای آنتی میکروبی وجود دارد. در این مطالعه، محققان تلاش کرده اند با پیاده کردن یک استراتژی، نقاط داغ عملکرد پپتید آنتی میکروبی polybia-cp را شناسایی کرده و با بهره گیری از پارامترهای فیزیکوشیمیایی آن، پپتیدهای سنتتیک غیر سمی طراحی کنند. انتظار می رود که با این استراتژی، پپتیدهای با خاصیت ضدمیکروبی مناسبی در in vitro و in vivo شناسایی شوند.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://www.nature.com/articles/s42003-018-0224-2#Fig1
دانش محدودی درباره ارتباط عملکرد-ساختار پپتیدهای آنتی میکروبی وجود دارد. در این مطالعه، محققان تلاش کرده اند با پیاده کردن یک استراتژی، نقاط داغ عملکرد پپتید آنتی میکروبی polybia-cp را شناسایی کرده و با بهره گیری از پارامترهای فیزیکوشیمیایی آن، پپتیدهای سنتتیک غیر سمی طراحی کنند. انتظار می رود که با این استراتژی، پپتیدهای با خاصیت ضدمیکروبی مناسبی در in vitro و in vivo شناسایی شوند.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://www.nature.com/articles/s42003-018-0224-2#Fig1
Nature
Structure-function-guided exploration of the antimicrobial peptide polybia-CP identifies activity determinants and generates synthetic…
Communications Biology - Marcelo D. T. Torres et al. turn toxic wasp-derived antimicrobial peptide polybia-CP into a viable antimicrobial with therapeutic activity in a mouse model. This study...
طراحی محاسباتی دارو چیست؟
طراحی محاسباتی دارو یک استراتژی موثر جهت سرعت بخشیدن و اقتصادی نمودن پروسه طراحی و توسعه دارو است.
چرا طراحی محاسباتی دارو در صنعت داروسازی اهمیت دارد؟
پروسه طراحی داروی جدید به طور کلی به عنوان یک پروسه بسیار ریسک پذیر و زمان بر شناخته می شود. چرخه طراحی و توسعه یک داروی مشخص از مفهوم اولیه تا رسیدن آن به بازار حدودا ۱۴ سال طول می کشد و بین ۱ الی ۸/۰ بیلیون دلار هزینه دارد. امروزه، توسعه سریع در شیمی ترکیبی و تکنولوژی غربالگری در مقیاس وسیع شرایط مناسبی را برای پروسه طراحی دارو در زمان کوتاه فراهم می کند.
طراحی محاسباتی دارو شامل چه بخش هایی است؟
افزایش وسیع اطلاعات از مولکول های زیستی باعث شده که روش های محاسباتی برای بسیاری از جنبه های پروسه طراحی و توسعه دارو به کار برده شود. روشهایی که می توانند حتی در کارآزمایی پیش بالینی به کار روند و به خوبی باعث تغییر pipeline ها برای طراحی و توسعه دارو شوند.
استفاده از روش های محاسباتی می تواند تا بیش از ۵۰ درصد از هزینه های طراحی دارو را کاهش دهد.
@genomefan
#طراحی_دارو #پپتید #ورکشاپ #خبر
https://www.nature.com/articles/aps2012109
طراحی محاسباتی دارو یک استراتژی موثر جهت سرعت بخشیدن و اقتصادی نمودن پروسه طراحی و توسعه دارو است.
چرا طراحی محاسباتی دارو در صنعت داروسازی اهمیت دارد؟
پروسه طراحی داروی جدید به طور کلی به عنوان یک پروسه بسیار ریسک پذیر و زمان بر شناخته می شود. چرخه طراحی و توسعه یک داروی مشخص از مفهوم اولیه تا رسیدن آن به بازار حدودا ۱۴ سال طول می کشد و بین ۱ الی ۸/۰ بیلیون دلار هزینه دارد. امروزه، توسعه سریع در شیمی ترکیبی و تکنولوژی غربالگری در مقیاس وسیع شرایط مناسبی را برای پروسه طراحی دارو در زمان کوتاه فراهم می کند.
طراحی محاسباتی دارو شامل چه بخش هایی است؟
افزایش وسیع اطلاعات از مولکول های زیستی باعث شده که روش های محاسباتی برای بسیاری از جنبه های پروسه طراحی و توسعه دارو به کار برده شود. روشهایی که می توانند حتی در کارآزمایی پیش بالینی به کار روند و به خوبی باعث تغییر pipeline ها برای طراحی و توسعه دارو شوند.
استفاده از روش های محاسباتی می تواند تا بیش از ۵۰ درصد از هزینه های طراحی دارو را کاهش دهد.
@genomefan
#طراحی_دارو #پپتید #ورکشاپ #خبر
https://www.nature.com/articles/aps2012109
Acta Pharmacologica Sinica
Computational drug discovery
Computational drug discovery
طراحی داروی پپتیدی جدید جهت متوقف کردن رشد سلول های سرطانی کبد مقاوم به درمان
کارسینومای هپاتوسلولار یکی از شایعترین انواع سرطان کبد در بزرگسالان است که بیش از ۹۰ درصد سرطان های کبد را شامل می شود و دومین عامل مرگ و میر در جهان است. Sorafenib داروی مورد استفاده جهت درمان این سرطان، دارای عوارض جانبی بسیاری است و تنها ۳ ماه باعث افزایش عمر بیماران می شود. محققین توانسته اند با طراحی یک پپتید جدید به نام FFW، که قادر به مهار اینتراکشن پروتیینSALL4 با رسپتورش NURD است، باعث مهار رشد سلول های سرطانی مقادم به sorafenib شوند.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://www.drugtargetreview.com/news/33950/peptide-drug-liver-cancer/
کارسینومای هپاتوسلولار یکی از شایعترین انواع سرطان کبد در بزرگسالان است که بیش از ۹۰ درصد سرطان های کبد را شامل می شود و دومین عامل مرگ و میر در جهان است. Sorafenib داروی مورد استفاده جهت درمان این سرطان، دارای عوارض جانبی بسیاری است و تنها ۳ ماه باعث افزایش عمر بیماران می شود. محققین توانسته اند با طراحی یک پپتید جدید به نام FFW، که قادر به مهار اینتراکشن پروتیینSALL4 با رسپتورش NURD است، باعث مهار رشد سلول های سرطانی مقادم به sorafenib شوند.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://www.drugtargetreview.com/news/33950/peptide-drug-liver-cancer/
Drug Target Review
Potential peptide drug could treat liver cancer effectively
Researchers have discovered that FFW and Sorafenib used together could reduce the growth of Sorafenib …
بیست و ششمین سمپوزیوم پپتید آمریکا، ژوئن 2019
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://www.aps2019.org/
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://www.aps2019.org/
کنفرانس طراحی دارو، سنگاپور، فوریه 2019
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://drugdiscovery.insightconferences.com/
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://drugdiscovery.insightconferences.com/
شرکت Catalent، خبر از سرمایه گذاری 200میلیون دلاری درطی سه سال آینده برای گسترش ظرفیت تولید داروی خود داده است که درراستای توسعه روزافزون بازار محصولات بیولوژیک آن است. محصولات بیولوژیک، 26% از کل درآمد 2.463 بیلیون دلاری این شرکت در سال مالی 2018 را تشکیل داده اند که تقریبا دوبرابر سال 2017 است.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://www.genengnews.com/news/catalent-invests-200m-in-fast-growing-biologics-manufacturing-business/
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
https://www.genengnews.com/news/catalent-invests-200m-in-fast-growing-biologics-manufacturing-business/
اساس ساختاری فعالیت سمی یک انسولین در ونوم حلزون شکارچی
یکی از سم های موجود در ونوم یک حلزون شکارچی ماهی، فرمی از انسولین به نام Con-Ins G1 هست که فاقد اسيدآمینه های کلیدی درگیر در اتصال به رسپتور انسولین هاست. محققان با مقایسه مدل ساختاری آن با کریستالوگرافی کمپلکس انسولین -رسپتور انسانی دریافته اند که این پپتید با موقعیت خاص اسیدآمینه های دیگرش، کمبود اسيدآمینه های شناخته شده درگیر در اتصال را جبران کرده است و تمایل اتصال مناسبی برای رسپتور انسولین دارد. این یافته، اميدهایی را برای افزایش فعالیت بیولوژیکی انسولین های درمانی ایجاد کرده است.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #پپتید
https://www.nature.com/articles/nsmb.3304
یکی از سم های موجود در ونوم یک حلزون شکارچی ماهی، فرمی از انسولین به نام Con-Ins G1 هست که فاقد اسيدآمینه های کلیدی درگیر در اتصال به رسپتور انسولین هاست. محققان با مقایسه مدل ساختاری آن با کریستالوگرافی کمپلکس انسولین -رسپتور انسانی دریافته اند که این پپتید با موقعیت خاص اسیدآمینه های دیگرش، کمبود اسيدآمینه های شناخته شده درگیر در اتصال را جبران کرده است و تمایل اتصال مناسبی برای رسپتور انسولین دارد. این یافته، اميدهایی را برای افزایش فعالیت بیولوژیکی انسولین های درمانی ایجاد کرده است.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #پپتید
https://www.nature.com/articles/nsmb.3304
Nature Structural & Molecular Biology
Structural basis for the poisonous activity of a predator's venom insulin
A potent toxin present in the venom of a fish-hunting cone snail is a minimized insulin (Con-Ins G1) lacking key residues involved in the receptor binding of most insulins. New data show that Con-Ins G1 nevertheless binds potently to the human insulin receptor…
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
برهمکنش های پروتئین-پروتئین و پروتئین-لیگاند اساس تقریباً تمام فرآیندهای مولکولی ارگانیسم های زنده هستند. امروزه، درک و پیشگویی این برهمکنش ها اهمیت زیادی در طراحی دارو دارد.
در شاخه زیست شناسی مولکولی و داروسازی، small molecule یک ترکیب ارگانیک با وزن مولکولی کم (کمتر از 900دالتون) و سایزی حدود 1نانومتر می باشد که در تنظیم فرایند زیستی نقش دارد.
بیشتر داروها نوعی small molecule هستند. از طرفی small molecules میتوانند به عنوان ابزار تحقیقاتی برای عملکردهای زیستی به کار رفته و منجر به ایجاد داروهای جدید شوند.
یکی از مواردی که با این رویکرد به نتیجه رسیده است، مولکول lenalidomide است.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر
در شاخه زیست شناسی مولکولی و داروسازی، small molecule یک ترکیب ارگانیک با وزن مولکولی کم (کمتر از 900دالتون) و سایزی حدود 1نانومتر می باشد که در تنظیم فرایند زیستی نقش دارد.
بیشتر داروها نوعی small molecule هستند. از طرفی small molecules میتوانند به عنوان ابزار تحقیقاتی برای عملکردهای زیستی به کار رفته و منجر به ایجاد داروهای جدید شوند.
یکی از مواردی که با این رویکرد به نتیجه رسیده است، مولکول lenalidomide است.
@genomefan
#طراحی_دارو #ورکشاپ #پپتید #خبر