乌鸦观察
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——地狱乌鸦
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#DeepMind #蛋白质 #三维结构 #人工智能

【DeepMind宣布能够预测蛋白质结构】

Alphabet旗下总部位于英国的人工智能公司DeepMind表示,它可以预测蛋白质的结构。这一突破有望大大加快新药的开发过程。

科学家们花费了数十年时间试图弄清一个问题:最开始为链状的化合物的蛋白质,如何折叠成三维形状?这些形状决定了其行为。

即使是识别单个蛋白质的形状也可能需要数年时间,但DeepMind表示,其AlphaFold系统能够在数天内提供准确结果,精度在一个原子的宽度以内。

“这一进步是我们在一项长期重大科学挑战中的首个大突破,”DeepMind的创始人和首席执行官杰米斯•哈萨比斯(Demis Hassabis)表示。他补充说,他希望这将“对我们理解疾病和生命生物学的能力产生重大影响”。DeepMind在2014年被谷歌(Google)以4亿英镑收购。(FT)(Nature)(BBC)(DeepMind
#科研 #人工智能 #蛋白质 #蛋白质结构 #Alphafold #DeepMind

【人工智能程序预测出98.5%的人类蛋白质结构】

英国“深度思维”公司研究人员领衔的团队22日在英国《自然》杂志发表报告说该公司的人工智能程序“阿尔法折叠”(AlphaFold)预测出98.5%的人类蛋白质结构,有助于深入理解一些关键生物学信息从而更好开展药物研发。

人类蛋白质组是指人类基因组编码所有蛋白质的集合,考虑到理解人类蛋白质组对健康和医药的重要性,研究人员一直以来付出大量努力来确定其中的蛋白质结构,但用普通实验方法预测蛋白质结构十分耗时。人类基因组中目前只有三分之一的蛋白质3D结构已通过实验确定。

“阿尔法折叠”是“深度思维”公司开发的一款人工智能程序可用于预测蛋白质结构。该公司研究人员利用“阿尔法折叠”确定了覆盖几乎整个人类蛋白质组(98.5%的所有人类蛋白质)的蛋白质结构,并将这些结构放入公开的数据库免费供全球科研人员使用。

氨基酸是连接起来形成蛋白质的亚单位。研究人员还让“阿尔法折叠”对人类蛋白质组58%的氨基酸结构位置给出可信预测;其中对35.7%的结构位置预测达到很高可信度。(新华社)

相关报道📰
【DeepMind’s AI predicts structures for a vast trove of proteins】- Nature
【DeepMind puts the entire human proteome online, as folded by AlphaFold】- techcrunch
#一氧化碳 #蛋白质 #乙醇梭菌蛋白 #碳中和

【科技日报:中国首次实现从一氧化碳到蛋白质的合成并形成万吨级工业产能】

中国农业科学院饲料研究所10月30日宣布,中国在一碳生物合成领域取得重大突破性进展:全球首次实现从一氧化碳到蛋白质的合成,并已形成万吨级工业产能。这一举突破了天然蛋白质植物合成的时空限制,可以弥补饲用蛋白对外依存度过高的最大短板,同时对促进国家“双碳”目标实现深具意义。

中国农科院饲料所与北京首朗生物技术有限公司经多年联合攻关,突破了乙醇梭菌蛋白核心关键技术,大幅度提高反应速度(22秒合成),创造了工业化条件下一步生物合成蛋白质收率最高85%的世界纪录。

该项研究以含一氧化碳、二氧化碳的工业尾气和氨水为主要原料,制造新型饲料蛋白资源乙醇梭菌蛋白,将无机的氮和碳转化为有机的氮和碳,实现了从0 到1的自主创新,具有完全自主知识产权。

以工业化生产1000万吨乙醇梭菌蛋白(蛋白含量83%)计,相当于2800万吨进口大豆(蛋白含量30%)当量,“不与人争粮、不与粮争地”,开辟了一条低成本非传统动植物资源生产优质饲料蛋白质的新途径,可减排二氧化碳2.5亿吨,节省耕地10亿亩(以平均亩产大豆300斤计)。(科技日报
乌鸦观察
#Nature #年度总结 #谭德塞 #北极 #乌拉圭 #检测 #登革热 #mrna疫苗 #辉瑞 #张永振 #BLM #抗议 #李兰娟 #新西兰 #福奇 【Nature年度十大人物,直面2020年的科学和社会挑战】 谭德塞:警示全球 1月30日,世卫组织总干事谭德塞宣布新冠疫情为“国际关注的突发公共卫生事件”,要求各成员国积极应对 Verena Mohaupt:极地巡逻 Verena Mohaupt是史上最大规模的北极科考任务——北极气候研究多学科漂浮观测站(MOSAiC)的后勤负责人。 Gonzalo…
#Nature #年度总结 #南非 #Omicron #疫苗公平 #科普 #FDA #全球变暖 #极端天气 #火星 #航天 #人工智能 #蛋白质 #论文造假

【《自然》杂志年度十大人物公布 中国火星探测任务总设计师张荣桥上榜】

英国《自然》杂志15日公布了2021年度十大人物榜单,这一榜单旨在选出十位在当年重大科学事件中占有一席之地的人物。《自然》杂志特写部主编理查德·蒙纳斯特斯基表示:“从追踪危险的新冠变异株到证明气候变化在极端天气中的作用,再到将探测器送上火星,本年度《自然》十大人物聚焦身处重要科学事件中心的个人,这些科学事件对全球产生了深远的影响。”

新冠研究占据半壁江山

南非夸祖鲁—纳塔尔研究创新与测序平台主任图里奥·德·奥利维拉和他的团队拉响了奥密克戎的警报

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英国卫生安全局的流行病学家米汉·卡尔将该机构的科学报告拆解成通俗易懂的内容发布在社交媒体上,帮助传播关于新冠肺炎的关键信息。

珍妮特·伍德考克带领美国食品药品监督管理局度过了风波不断的一年,包括应对在新冠疫苗加强针和一种阿尔茨海默病药物上做出的争议性决定。

气变仍是重大科学问题

伦敦的格兰瑟姆气候变化与环境研究所的气候科学家弗列德里克·奥托与其他研究人员合作,快速评估了人为导致的气候变化是否在引发特定极端天气方面起到了一定作用。

今年,各国在承认原住民群体对于保护生物多样性和预防全球变暖的重要性上迈出了实质性步伐,这离不开前联合国职员、目前在菲律宾工作的维多利亚·托利—科尔普斯等环保人士的努力。

火星车和人工智能

今年的重大科学事件还包括中国成为第二个让火星车成功着陆火星的国家,这也是中国国家航天局和火星探测任务总设计师张荣桥交出的完美答卷。

人工智能研究员蒂姆尼特·格布鲁成立了一个研究所,在她之前工作的基础上研究如何以更合乎伦理的方式开发人工智能系统,就在一年前,她因这些工作离开科技巨头谷歌一事曾闹得沸沸扬扬。

计算机科学家古伊拉姆·卡巴纳揭露了数以千计的造假论文充斥着软件生成的无意义文字,为全世界敲响了警钟。

人工智能研究员约翰·詹珀和他在伦敦 DeepMind 的同事公开了阿尔法折叠的代码,阿尔法折叠能利用AI技术以惊人的准确率预测蛋白质结构。

附注:现代科学研究是由团队——且往往是大型团队——合作完成的,然而科研世界也充满了个人发挥影响的故事。《自然》年度十大人物(Nature’s 10)并非一个奖项,也不是全球前十排行榜,它是对今年重要科学进展、事件以及其中一些关键人物和他们同事的记录。十大人物由《自然》编辑选出,集中了影响2021年一些最重要科学事件的个人。(中新社)(NaturePrtfolio)