Биоинформатика и лапки
Photo
Кстати, а почему ещё никто не смоделил василиска Роко на прошивке от этой мухи?
Это что, товарищи, наше любимое гиперверие не исполним?
Это что, товарищи, наше любимое гиперверие не исполним?
❤1
Forwarded from Labrats
Приходит бактериальная рибосома к MsrE белку:
— Помогите, не могу синтезировать белок, у меня вход болит!
MsrE внимательно осматривает её 50S-субъединицу, вытаскивает оттуда застрявшую молекулу антибиотика и говорит:
— Знаете что, голубушка... пока вы будете называть свой пептидный тоннель входом, он так и будет у вас болеть!
— Помогите, не могу синтезировать белок, у меня вход болит!
MsrE внимательно осматривает её 50S-субъединицу, вытаскивает оттуда застрявшую молекулу антибиотика и говорит:
— Знаете что, голубушка... пока вы будете называть свой пептидный тоннель входом, он так и будет у вас болеть!
🔥7
Forwarded from Докторские байки
Вся очистка - в таблице
При очистке белков обычно ведут таблицу очистки, которая позволяет оценить эффективность каждого этапа по выходу, чистоте и степени обогащения целевого белка. К сожалению, во многих дипломных работах и даже диссертациях, где описана очистка белков, такие таблицы не приводятся.
Какие параметры указывают в таблице очистки ферментов или белков с измеряемой биологической активностью:
Объем раствора.
Общий белок. Его можно определить колориметрическими методами: Лоури, Брэдфорд, BCA-assay. Определение концентрации по A280 на начальных этапах очистки нецелесообразно, поскольку присутствует слишком много мешающих компонентов.
Общая активность. Для ферментов активность измеряют в единицах активности. Для некоторых ферментов можно сразу определить и количество активного белка. Например, для трипсина можно провести титрование активного центра и установить зависимость между активностью и количеством трипсина.
Если белок обладает измеряемой биологической активностью, ее выражают в биологических единицах активности, основанных на функциональном тесте (EC50, IC50, биологическая активность, нейтрализующая активность).
Удельная активность. Это самый важный показатель степени очистки фермента. Рассчитывается как отношение общей активности к общему количеству белка. Чем выше удельная активность, тем чище препарат.
Выход, %. Показывает, какая доля целевого белка сохранилась после данного этапа очистки. Рассчитывается как отношение общей активности на данном этапе к общей активности исходного лизата.
Степень очистки. Показывает, во сколько раз увеличилась удельная активность по сравнению с исходным материалом.
Таблицу очистки проще строить, если белок обладает какой-либо биологической активностью. Но если белок не является ферментом и не проявляет измеримую активность, классическая колонка «удельная активность» уже теряет смысл. В этом случае вместо параметров активности используют показатели чистоты.
Самый простой и распространенный способ определения чистоты — денситометрия SDS-PAGE гелей (в Bio-Rad Image Lab это делается очень просто). Также можно использовать капиллярный электрофорез или ВЭЖХ (HPLC).
Таблица очистки является аналогом баланса материального потока в химической технологии. Такая таблица позволяет оценивать эффективность отдельных стадий и всего протокола в целом, выявлять узкие места, сравнивать различные протоколы и оценивать воспроизводимость методики.
Энжойте и чистите белочки эффективно и воспроизводимо!
При очистке белков обычно ведут таблицу очистки, которая позволяет оценить эффективность каждого этапа по выходу, чистоте и степени обогащения целевого белка. К сожалению, во многих дипломных работах и даже диссертациях, где описана очистка белков, такие таблицы не приводятся.
Какие параметры указывают в таблице очистки ферментов или белков с измеряемой биологической активностью:
Объем раствора.
Общий белок. Его можно определить колориметрическими методами: Лоури, Брэдфорд, BCA-assay. Определение концентрации по A280 на начальных этапах очистки нецелесообразно, поскольку присутствует слишком много мешающих компонентов.
Общая активность. Для ферментов активность измеряют в единицах активности. Для некоторых ферментов можно сразу определить и количество активного белка. Например, для трипсина можно провести титрование активного центра и установить зависимость между активностью и количеством трипсина.
Если белок обладает измеряемой биологической активностью, ее выражают в биологических единицах активности, основанных на функциональном тесте (EC50, IC50, биологическая активность, нейтрализующая активность).
Удельная активность. Это самый важный показатель степени очистки фермента. Рассчитывается как отношение общей активности к общему количеству белка. Чем выше удельная активность, тем чище препарат.
Выход, %. Показывает, какая доля целевого белка сохранилась после данного этапа очистки. Рассчитывается как отношение общей активности на данном этапе к общей активности исходного лизата.
Степень очистки. Показывает, во сколько раз увеличилась удельная активность по сравнению с исходным материалом.
Таблицу очистки проще строить, если белок обладает какой-либо биологической активностью. Но если белок не является ферментом и не проявляет измеримую активность, классическая колонка «удельная активность» уже теряет смысл. В этом случае вместо параметров активности используют показатели чистоты.
Самый простой и распространенный способ определения чистоты — денситометрия SDS-PAGE гелей (в Bio-Rad Image Lab это делается очень просто). Также можно использовать капиллярный электрофорез или ВЭЖХ (HPLC).
Таблица очистки является аналогом баланса материального потока в химической технологии. Такая таблица позволяет оценивать эффективность отдельных стадий и всего протокола в целом, выявлять узкие места, сравнивать различные протоколы и оценивать воспроизводимость методики.
Энжойте и чистите белочки эффективно и воспроизводимо!
❤3
Адмем срочно нуждается в сижках и энергетиках, иначе больше не будем адмеметь и радовать папищеков((((999
2202 2092 5945 0590💊7😘2
Forwarded from Labrats
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Приходит Вовочка к отцу-академику и спрашивает:
– Пап, а в чем разница между теоретически и практически?
– Сложный вопрос ты задал, давай популяризаторов спросим
Приходят к Казанцевой:
— Ася, вот вы старому миллиардеру в жопу дадите за миллион долларов?
— Конечно, эти ж деньги помогут задаче популяризации науки!
Идут к Якутенко:
— Ирина, а вы дадите старому миллиардеру в жопу за миллион долларов?
— Конечно, многие ноют что им не хватает денег, но силы воли их заработать найти не могут. Я вот не такая, я потерплю и заработаю
Пошли к Панчину
– А вы, Александр, дадите старому милолиардеру за миллион долларов?
– Конечно, ведь на них я смогц еще ярче осветить проблемы продления человеческой жизни и приблизмть успех longevity-движения
— Вот видишь, Вовочка. Теоретически в русском сегменте популяризации 3 млн долларов. А практически – две шлюхи и один продажный пидорас
Источник видео
– Пап, а в чем разница между теоретически и практически?
– Сложный вопрос ты задал, давай популяризаторов спросим
Приходят к Казанцевой:
— Ася, вот вы старому миллиардеру в жопу дадите за миллион долларов?
— Конечно, эти ж деньги помогут задаче популяризации науки!
Идут к Якутенко:
— Ирина, а вы дадите старому миллиардеру в жопу за миллион долларов?
— Конечно, многие ноют что им не хватает денег, но силы воли их заработать найти не могут. Я вот не такая, я потерплю и заработаю
Пошли к Панчину
– А вы, Александр, дадите старому милолиардеру за миллион долларов?
– Конечно, ведь на них я смогц еще ярче осветить проблемы продления человеческой жизни и приблизмть успех longevity-движения
— Вот видишь, Вовочка. Теоретически в русском сегменте популяризации 3 млн долларов. А практически – две шлюхи и один продажный пидорас
Источник видео
🔥13❤7👍4🤔2