Forwarded from Докторские байки
Varigrad - девятикамерный градиент-формер эпохи титанов
Во многих методах хроматографической очистки белки элюируют с колонки, изменяя содержание элюирующего компонента в буфере.
При ионообменной хроматографии самый простой способ элюции - промыть колонку раствором с высокой концентрацией соли (ударом). Но тогда с колонки сойдут практически все связанные белки одновременно. Можно проводить элюцию порциями, постепенно повышая концентрацию соли. Это уже позволяет получать более чистый препарат (ступенчатая элюция). Однако самый тонкий вариант - градиентная элюция, при которой концентрация соли повышается непрерывно. По сути, это разновидность ступенчатой элюции с очень маленькими шагами.
Для создания градиента концентрации соли в современных хроматографических системах смешивают буферы с низким и высоким содержанием соли, подавая их с разной скоростью и смешивая в миксере. А если под рукой нет автоматической хроматографической системы, можно использовать градиент-формер и перистальтический насос.
Чаще всего градиент-формер представляет собой два цилиндра, соединенных между собой и с отводом на колонку. Один цилиндр называется смесительной камерой. В нем исходно находится буфер с низкой концентрацией соли и установлена мешалка. Когда насос отбирает жидкость из смесительной камеры и подает ее на колонку, уровень жидкости снижается, и туда начинает поступать буфер из второго цилиндра с высокой концентрацией соли. Растворы постоянно перемешиваются, а смесь непрерывно подается на колонку. Так формируется плавный градиент концентрации соли, который позволяет разделять белки с близким зарядом. Примеры таких градиентных устройств можно найти здесь и здесь.
Двухкамерный градиент-формер позволяет получать линейные, вогнутые и выпуклые градиенты. Однако с его помощью нельзя реализовать более сложные профили - S-образные, зеркальные или составные.
В 1960-х годах, в эпоху титанов, Петерсон и Собер - создатели ионообменных целлюлоз DEAE-cellulose и CM-cellulose - предложили невероятный вариант градиент-формера с девятью камерами - Varigrad!
Varigrad - это многокамерный градиент-формер для хроматографии, созданный для получения градиентов элюента практически произвольной формы, а не только простых линейных или экспоненциальных профилей. Главная идея состояла в том, что вместо двух сосудов использовалась серия одинаковых камер, соединенных между собой. Все камеры находились в гидростатическом равновесии, и по мере отбора жидкости из первой камеры это равновесие постоянно восстанавливалось за счет перетекания раствора между соседними камерами. При этом каждая камера непрерывно перемешивалась собственной мешалкой.
Varigrad позволял не просто изменять концентрацию соли от 0 до 100 %, а распределять элюирующую силу именно там, где она необходима для эффективного разделения. Если в определенной области хроматограммы пики выходили слишком плотно, градиент можно было сделать более пологим. Если же пики были чрезмерно растянуты, градиент можно было сделать более крутым. Таким образом удавалось создавать профили с локальными ускорениями и замедлениями изменения концентрации соли.
Этот прибор выпускался в 1960-1970-х годах и послужил одним из прототипов систем формирования градиента в первых автоматических аминокислотных анализаторах.
Градиенты сложной формы широко используются и сегодня. Однако сейчас их почти никогда не получают с помощью механических многокамерных устройств типа Varigrad. Вместо этого форму градиента программирует насосная система современных хроматографов. Профиль элюции разбивают на отдельные участки, для каждого из которых задают собственный локальный градиент, изменяя соотношение подаваемых буферов.
Красота, которую мы потеряли!
Во многих методах хроматографической очистки белки элюируют с колонки, изменяя содержание элюирующего компонента в буфере.
При ионообменной хроматографии самый простой способ элюции - промыть колонку раствором с высокой концентрацией соли (ударом). Но тогда с колонки сойдут практически все связанные белки одновременно. Можно проводить элюцию порциями, постепенно повышая концентрацию соли. Это уже позволяет получать более чистый препарат (ступенчатая элюция). Однако самый тонкий вариант - градиентная элюция, при которой концентрация соли повышается непрерывно. По сути, это разновидность ступенчатой элюции с очень маленькими шагами.
Для создания градиента концентрации соли в современных хроматографических системах смешивают буферы с низким и высоким содержанием соли, подавая их с разной скоростью и смешивая в миксере. А если под рукой нет автоматической хроматографической системы, можно использовать градиент-формер и перистальтический насос.
Чаще всего градиент-формер представляет собой два цилиндра, соединенных между собой и с отводом на колонку. Один цилиндр называется смесительной камерой. В нем исходно находится буфер с низкой концентрацией соли и установлена мешалка. Когда насос отбирает жидкость из смесительной камеры и подает ее на колонку, уровень жидкости снижается, и туда начинает поступать буфер из второго цилиндра с высокой концентрацией соли. Растворы постоянно перемешиваются, а смесь непрерывно подается на колонку. Так формируется плавный градиент концентрации соли, который позволяет разделять белки с близким зарядом. Примеры таких градиентных устройств можно найти здесь и здесь.
Двухкамерный градиент-формер позволяет получать линейные, вогнутые и выпуклые градиенты. Однако с его помощью нельзя реализовать более сложные профили - S-образные, зеркальные или составные.
В 1960-х годах, в эпоху титанов, Петерсон и Собер - создатели ионообменных целлюлоз DEAE-cellulose и CM-cellulose - предложили невероятный вариант градиент-формера с девятью камерами - Varigrad!
Varigrad - это многокамерный градиент-формер для хроматографии, созданный для получения градиентов элюента практически произвольной формы, а не только простых линейных или экспоненциальных профилей. Главная идея состояла в том, что вместо двух сосудов использовалась серия одинаковых камер, соединенных между собой. Все камеры находились в гидростатическом равновесии, и по мере отбора жидкости из первой камеры это равновесие постоянно восстанавливалось за счет перетекания раствора между соседними камерами. При этом каждая камера непрерывно перемешивалась собственной мешалкой.
Varigrad позволял не просто изменять концентрацию соли от 0 до 100 %, а распределять элюирующую силу именно там, где она необходима для эффективного разделения. Если в определенной области хроматограммы пики выходили слишком плотно, градиент можно было сделать более пологим. Если же пики были чрезмерно растянуты, градиент можно было сделать более крутым. Таким образом удавалось создавать профили с локальными ускорениями и замедлениями изменения концентрации соли.
Этот прибор выпускался в 1960-1970-х годах и послужил одним из прототипов систем формирования градиента в первых автоматических аминокислотных анализаторах.
Градиенты сложной формы широко используются и сегодня. Однако сейчас их почти никогда не получают с помощью механических многокамерных устройств типа Varigrad. Вместо этого форму градиента программирует насосная система современных хроматографов. Профиль элюции разбивают на отдельные участки, для каждого из которых задают собственный локальный градиент, изменяя соотношение подаваемых буферов.
Красота, которую мы потеряли!
❤9
Так, котики, а знаете какой самый дешёвый источник дофамина, норадреналина и ВНЕЗАПНО кортизола?
Острый булдак под ост из второго хитмана (который сайлент ассасин).
Острый булдак под ост из второго хитмана (который сайлент ассасин).
⚡12❤2🤔2😱2
О, в лабу привезли новую игрушку для микроскопии :3
Наконец-то мои эстетические чувства будут удовлетворены ^_^
Наконец-то мои эстетические чувства будут удовлетворены ^_^
Forwarded from Rapid Medicine | Новости 💊
У пациента с длительно существующим сахарным диабетом 1 типа пересаженные аллогенные островковые клетки (препарат носит название UP421) сохраняли жизнеспособность и функцию более года без иммуносупрессивной терапии. Речь идет о донорских островковых клетках поджелудочной железы (писали про это ранее здесь), генетически измененных так, чтобы стать менее заметными для иммунной системы: у них снижена экспрессия HLA I и II классов, а также повышена экспрессия CD47 (т.н. сигнала «не ешь меня»).
#диабет #клеточная_терапия #трансплантология #иммунология #генная_инженерия
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍7❤3
Ввёл хорошего коллегу в экзистенциальный кризис.
Есть одна штука, которую его учили выполнять по методам 70-80х годов. У него это постапокалиптическое жонглирование стеклом в стиле @biochemtales не очень получалось. Оно и не мудрено - на каждое действие нужно заучивать целый ритуал с пассами руками. Чел пару раз попробовал, не получилось, приуныл и больше к методике никогда не возвращался.
И тут я прихожу, и по его просьбе показываю ему как это делается по-нормальному - хуяк-хуяк и готово за 20 минут (15 из которых я искал пипетки на 10 мкл).
Коллега ушёл грустным, он 3 года зависел от других людей по этой методике, а оно оказывается делалось всё очень просто.
Жалко пацана(
Есть одна штука, которую его учили выполнять по методам 70-80х годов. У него это постапокалиптическое жонглирование стеклом в стиле @biochemtales не очень получалось. Оно и не мудрено - на каждое действие нужно заучивать целый ритуал с пассами руками. Чел пару раз попробовал, не получилось, приуныл и больше к методике никогда не возвращался.
И тут я прихожу, и по его просьбе показываю ему как это делается по-нормальному - хуяк-хуяк и готово за 20 минут (15 из которых я искал пипетки на 10 мкл).
Коллега ушёл грустным, он 3 года зависел от других людей по этой методике, а оно оказывается делалось всё очень просто.
Жалко пацана(
🔥16⚡3🫡1
Forwarded from АНТОН ВЯЧЕСЛАВОВИЧ
Восстание машин уже началось
В программе «Антонимы» Антон Красовский встречается с биоинженером Богданом Кирилловым, чтобы разобраться, где заканчиваются научная фантастика и начинаются технологии завтрашнего дня.
Может ли искусственный интеллект заменить врача и насколько он действительно «разумен»? Существует ли «хромосома русскости» или это миф? Что такое менделевские заболевания и как современная генетика меняет представление о человеке? Эти и другие вопросы становятся темой большого разговора о будущем науки, медицины и искусственного интеллекта.
Разговор о технологиях, генетике, человеческой природе и вызовах, которые уже становятся частью нашей повседневной жизни.
📱 Смотрите в VK Видео
Подписывайтесь на канал АНТОН ВЯЧЕСЛАВОВИЧ
Подписывайтесь на канал в MAX
В программе «Антонимы» Антон Красовский встречается с биоинженером Богданом Кирилловым, чтобы разобраться, где заканчиваются научная фантастика и начинаются технологии завтрашнего дня.
Может ли искусственный интеллект заменить врача и насколько он действительно «разумен»? Существует ли «хромосома русскости» или это миф? Что такое менделевские заболевания и как современная генетика меняет представление о человеке? Эти и другие вопросы становятся темой большого разговора о будущем науки, медицины и искусственного интеллекта.
Разговор о технологиях, генетике, человеческой природе и вызовах, которые уже становятся частью нашей повседневной жизни.
Подписывайтесь на канал АНТОН ВЯЧЕСЛАВОВИЧ
Подписывайтесь на канал в MAX
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
VK Видео
Восстание машин уже началось
В программе «Антонимы» Антон Красовский встречается с биоинженером Богданом Кирилловым, чтобы разобраться, где заканчиваются научная фантастика и начинаются технологии завтрашнего дня. Может ли искусственный интеллект заменить врача и насколько он действительно…
💊7🔥1
Forwarded from Консерватор
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
В программе «Антонимы» Антон Красовский встречается с биоинженером Богданом Кирилловым, чтобы разобраться, где заканчиваются научная фантастика и начинаются технологии завтрашнего дня.
📱 Смотрите в VK Видео
Подписывайтесь на канал Консерватор
Подписывайтесь на канал в MAX
Подписывайтесь на канал Консерватор
Подписывайтесь на канал в MAX
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
💊8🔥1
Forwarded from Минобороны России
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
🏳️ Вот такое кино: эпичный провал «флаговтыкателей»
Константиновка полностью под контролем Вооруженных Сил РФ, но украинское командование продолжает отправлять людей на убой ради фальшивых отчетов.
Российские бойцы группировки «Южная» взяли в плен двух военнослужащих из 425-го полка ВСУ — Евгения Мосина и Сергея Столярского. Они пробирались вглубь Константиновки с единственной целью: воткнуть флаг, снять минутный ролик для соцсетей и создать иллюзию присутствия. Но пиар-акция провалилась, даже не начавшись.
🔹 Канал Минобороны России в MAКС – источник мощных новостей.
Константиновка полностью под контролем Вооруженных Сил РФ, но украинское командование продолжает отправлять людей на убой ради фальшивых отчетов.
Российские бойцы группировки «Южная» взяли в плен двух военнослужащих из 425-го полка ВСУ — Евгения Мосина и Сергея Столярского. Они пробирались вглубь Константиновки с единственной целью: воткнуть флаг, снять минутный ролик для соцсетей и создать иллюзию присутствия. Но пиар-акция провалилась, даже не начавшись.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥11💊7❤2🥰2
Forwarded from Минобороны России
Минобороны России
🏳️ Вот такое кино: эпичный провал «флаговтыкателей» Константиновка полностью под контролем Вооруженных Сил РФ, но украинское командование продолжает отправлять людей на убой ради фальшивых отчетов. Российские бойцы группировки «Южная» взяли в плен двух…
Дайте Оскар этой картине))
💊8🔥5👍2🫡2
Forwarded from IQDOC AI | Медицинский ИИ
IQDOC 1.3 – автовыбор источника и боты в Telegram и Max 🤖
Новое обновление IQDOC позволит общаться с нашим ИИ прямо в мессенджерах. Используйте точный поиск по медицинским документам, а также калькуляторы прямо в Telegram и Max. Боты синхронизированы с аккаунтом на сайте IQDOC.
Автоматический режим, доступный на сайте IQDOC, а также в Telegram и Max позволяет нашему ИИ самому понимать подходящую базу для поиска. Просто задайте вопрос и IQDOC автоматически выберет базу для поиска без необходимости переключать режимы вручную. Вы также можете уточнить запрос, например попросив его посмотреть в конкретном источнике, чтобы сузить поиск. Пример: «Периоперационное ведение пациентов с сопутствующей патологией клапанного аппарата сердца согласно рекомендациям ФАР».
Новые рекомендации для анестезиологов и реаниматологов: режимы ФАР (Федерации Анестезиологов и Реаниматологов) в дополнение к ранее добавленной ASA.
Попробуйте IQDOC AI уже сегодня 🤖
• Веб-версия
• Telegram
• Max
Новое обновление IQDOC позволит общаться с нашим ИИ прямо в мессенджерах. Используйте точный поиск по медицинским документам, а также калькуляторы прямо в Telegram и Max. Боты синхронизированы с аккаунтом на сайте IQDOC.
Автоматический режим, доступный на сайте IQDOC, а также в Telegram и Max позволяет нашему ИИ самому понимать подходящую базу для поиска. Просто задайте вопрос и IQDOC автоматически выберет базу для поиска без необходимости переключать режимы вручную. Вы также можете уточнить запрос, например попросив его посмотреть в конкретном источнике, чтобы сузить поиск. Пример: «Периоперационное ведение пациентов с сопутствующей патологией клапанного аппарата сердца согласно рекомендациям ФАР».
Новые рекомендации для анестезиологов и реаниматологов: режимы ФАР (Федерации Анестезиологов и Реаниматологов) в дополнение к ранее добавленной ASA.
Попробуйте IQDOC AI уже сегодня 🤖
• Веб-версия
• Telegram
• Max
Forwarded from Зоопарк из слоновой кости
#их_нравы
Правительство Японии разрабатывает решения, которые позволят университетам и государственным научным институтам активнее участвовать в военных разработках. Идея поддерживается правящей партией и представителями бизнеса, при этом, как отмечает пресса, Научный совет Японии занимает гораздо более осторожную позицию, ссылаясь на "исторические причины" (ну вы поняли).
Предполагается, что на базе вузов и институтов появятся специальные центры с более жесткой системой безопасности (свой товарищ 陸軍少佐, ня).
В общем и целом, это всего лишь продолжение тренда: некоторые страны по, хм, известным причинам стеснялись вовлекать "мирных" ученых в решение военных задач, потому что дедушка завещал так не делать и говорил что-то там про Сталинград . Но сейчас эти ограничения снимаются, в Германии это уже идет полным ходом, теперь пришел черед экс-партнеров по антикоминтерновскому пакту ^_^
Дальше будет только веселее - впрочем, свои прогнозы мы уже выкладывали. Запомните этот твит (с)
Правительство Японии разрабатывает решения, которые позволят университетам и государственным научным институтам активнее участвовать в военных разработках. Идея поддерживается правящей партией и представителями бизнеса, при этом, как отмечает пресса, Научный совет Японии занимает гораздо более осторожную позицию, ссылаясь на "исторические причины" (ну вы поняли).
Предполагается, что на базе вузов и институтов появятся специальные центры с более жесткой системой безопасности (свой товарищ 陸軍少佐, ня).
В общем и целом, это всего лишь продолжение тренда: некоторые страны по, хм, известным причинам стеснялись вовлекать "мирных" ученых в решение военных задач,
Дальше будет только веселее - впрочем, свои прогнозы мы уже выкладывали. Запомните этот твит (с)
💊8🔥5👍2
🔼 Ну чё, посоны, менструальнофлаговая трусонюхия решила вновь закосплеить 731-й отряд
💊17🤯3
Forwarded from Миксоматоз амигдалы
Меня слегка утомляют регулярные вскрики о прорывной психоделической терапии. Если читать заголовки, псилоцибин вот-вот совершит прорыв в лечении депрессии. При более детальном рассмотрении все выглядит гораздо скромнее.
В клиническом исследовании участник в идеале не знает, получил ли он настоящий препарат или плацебо. Это называют ослеплением: такая схема нужна, чтобы ожидания меньше влияли на оценку лечения. С 25 мг псилоцибина она ломается почти сразу. Человек обычно прекрасно понимает, что произошло. Участник с плацебо тоже замечает отсутствие обещанного путешествия, особенно после подготовительных сессий, когда все знают, ради какого препарата собрались. Положительные ожидания могут усиливать ответ в основной группе, а в контрольной возникает разочарование. Для этой реакции уже придумали термин know-cebo: человек догадывается, что ему досталась пустышка, и сама эта догадка может ухудшить результат. Сам набор добровольцев нейтрален лишь на бумаге — скептики в такие испытания обычно не рвутся. Формально слепое исследование начинает напоминать открытое.
В свежем обзоре разобрали 112 рандомизированных исследований психоделиков. Проверить, сохранилось ли ослепление, попытались только в 33. В двух третях этих работ больше 70% участников или оценщиков правильно определяли группу; для псилоцибина, ЛСД и аяуаски доля нередко превышала 90%. При этом авторы не смогли посчитать, насколько именно то, что участники и оценщики угадывали группу, завышает результат, поскольку методы и сроки проверки слишком различались.
В другом метаанализе психоделическую терапию сравнили с открытым приёмом обычных антидепрессантов, когда пациенты точно знали, что получают лекарство. Обе стратегии дали примерно одинаковое снижение симптомов — около 12 баллов по шкале Гамильтона. Сравнение косвенное: 249 пациентов в психоделических работах против 7921 на антидепрессантах, разные выборки, протоколы и сроки. Поэтому уверенного ответа оно не даёт. Зато прежняя картинка, где психоделики оставляют СИОЗС далеко позади, прожигаются яркими солнечными лучами через лупу.
Отдельное испытание на 144 пациентах с резистентной депрессией тоже вышло неоднозначным. Через шесть недель ответили 17% получивших 25 мг псилоцибина и 10,6% в группе никотинамида (это одна из форм витамина B3); первичная конечная точка не достигнута. По нескольким вторичным показателям 25 мг выглядели лучше, однако работа в целом не дала однозначного ответа.
Уверенность в чудотворном действии псилоцибина пока заметно опережает качество доказательств. В итоге к плохо работающему ослеплению участников добавляется другое: хайп вокруг препарата мешает трезво смотреть на результаты.
В клиническом исследовании участник в идеале не знает, получил ли он настоящий препарат или плацебо. Это называют ослеплением: такая схема нужна, чтобы ожидания меньше влияли на оценку лечения. С 25 мг псилоцибина она ломается почти сразу. Человек обычно прекрасно понимает, что произошло. Участник с плацебо тоже замечает отсутствие обещанного путешествия, особенно после подготовительных сессий, когда все знают, ради какого препарата собрались. Положительные ожидания могут усиливать ответ в основной группе, а в контрольной возникает разочарование. Для этой реакции уже придумали термин know-cebo: человек догадывается, что ему досталась пустышка, и сама эта догадка может ухудшить результат. Сам набор добровольцев нейтрален лишь на бумаге — скептики в такие испытания обычно не рвутся. Формально слепое исследование начинает напоминать открытое.
В свежем обзоре разобрали 112 рандомизированных исследований психоделиков. Проверить, сохранилось ли ослепление, попытались только в 33. В двух третях этих работ больше 70% участников или оценщиков правильно определяли группу; для псилоцибина, ЛСД и аяуаски доля нередко превышала 90%. При этом авторы не смогли посчитать, насколько именно то, что участники и оценщики угадывали группу, завышает результат, поскольку методы и сроки проверки слишком различались.
В другом метаанализе психоделическую терапию сравнили с открытым приёмом обычных антидепрессантов, когда пациенты точно знали, что получают лекарство. Обе стратегии дали примерно одинаковое снижение симптомов — около 12 баллов по шкале Гамильтона. Сравнение косвенное: 249 пациентов в психоделических работах против 7921 на антидепрессантах, разные выборки, протоколы и сроки. Поэтому уверенного ответа оно не даёт. Зато прежняя картинка, где психоделики оставляют СИОЗС далеко позади, прожигаются яркими солнечными лучами через лупу.
Отдельное испытание на 144 пациентах с резистентной депрессией тоже вышло неоднозначным. Через шесть недель ответили 17% получивших 25 мг псилоцибина и 10,6% в группе никотинамида (это одна из форм витамина B3); первичная конечная точка не достигнута. По нескольким вторичным показателям 25 мг выглядели лучше, однако работа в целом не дала однозначного ответа.
Уверенность в чудотворном действии псилоцибина пока заметно опережает качество доказательств. В итоге к плохо работающему ослеплению участников добавляется другое: хайп вокруг препарата мешает трезво смотреть на результаты.
👍8❤3
Forwarded from Собачьи головы
Еще один массовый косяк с антителами - на этот раз люди пытались детектировать бета-галактозидазу млекопитающих (маркер стареющих клеток) антителами, специфичными к бета-галактозидазе E. coli (привет продлятелям).
https://forbetterscience.com/2026/07/21/do-bacteria-grow-old-as-we-do/
https://forbetterscience.com/2026/07/21/do-bacteria-grow-old-as-we-do/
For Better Science
Do bacteria grow old as we do?
“Once again I am left wondering what to make of these research teams that cheerfully go on generating impossible results, either they don’t write the methods truthfully or they don̵…