Forwarded from Медач | Medical Channel
#medach_new #гематология #онкогематология #онкология #иммунология #генная_инженерия #car-t
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥2❤1👍1
Forwarded from BioScience notes
Американские биотехи начали скрывать свои разработки. Боятся… 🤷🏻♀️
Еще несколько лет назад молодые биотех-компании в США старались как можно больше рассказывать о своих проектах. Публикации, всякие конференции, презентации для инвесторов - чем больше шума, тем проще привлечь деньги, понятно💵
Но вот сейчас что-то поменялось. По данным Endpoints и The Wall Street Journal, некоторые американские стартапы сознательно перестают раскрывать детали своих разработок. Некоторые даже отказываются выступать на конференциях и общаться с венчурными фондами. Ну вот даже представить сложно.. как это вообще?
А причина не сказать что неожиданная - страх, что китайские компании слишком быстро воспроизведут идею и первыми доведут ее до клиники✔️
Понятно только то, что сегодня во многих случаях клинические исследования в Китае точно проходят быстрее и дешевле, чем в США. Но копировать?? Есть сомнения🤨
Как думаете, страх оправдан?
Подписывайтесь⚡️
Здесь мы разбираем самые интересные истории из мира биотеха и фармы
Еще несколько лет назад молодые биотех-компании в США старались как можно больше рассказывать о своих проектах. Публикации, всякие конференции, презентации для инвесторов - чем больше шума, тем проще привлечь деньги, понятно
Но вот сейчас что-то поменялось. По данным Endpoints и The Wall Street Journal, некоторые американские стартапы сознательно перестают раскрывать детали своих разработок. Некоторые даже отказываются выступать на конференциях и общаться с венчурными фондами. Ну вот даже представить сложно.. как это вообще?
А причина не сказать что неожиданная - страх, что китайские компании слишком быстро воспроизведут идею и первыми доведут ее до клиники
Понятно только то, что сегодня во многих случаях клинические исследования в Китае точно проходят быстрее и дешевле, чем в США. Но копировать?? Есть сомнения
Как думаете, страх оправдан?
Подписывайтесь
Здесь мы разбираем самые интересные истории из мира биотеха и фармы
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍2🔥2❤1
Forwarded from Заметки лабораторного кота
Ещё одна интересная работа о применении искусственного интеллекта для моделирования белков.
Группа исследователей из Германии и Канады опубликовала в Nature Chemical Biology работу, где описали, как они с помощью разработанного ими подхода под названием CANVAS моделировали de novo ферменты на основе TIM-баррелей.
Это не первая работа по созданию каталитического центра de novo. Ещё в далёком 2008 году группа Дэвида Бейкера и Дэна Тавфика с использованиемдеревянных счетов тогдашней вычислительной техники показала, что можно проектировать активный центр фермента с нуля, используя квантово-механические расчёты и встраивая их в существующие природные каркасы. Из 59 дизайнов восемь показали активность, а лучший из них позволял достичь ускорения реакции реакции примерно в 10⁵ раз, а направленная эволюция позволила увеличить эффективность ещё в 200 раз. Однако этот подход был ограничен использованием природных каркасов, которые не всегда могли обеспечить оптимальную каталитическую геометрию.
В 2016-ом году, другая группа впервые создала белок, который сворачивался в стабильную структуру TIM-баррел, не имея аналогов в природе. Однако этот каркас был функционально «пустым», т.е. он не выполнял никакую функцию.
В последней работе авторы впервые объединили эти два результата: они смоделировали с нуля TIM-баррель, сконструировав его таким образом, чтобы каталитические остатки были закреплены в нужной геометрии вокруг карман для связывания субстрата. Изучение кристаллической структуры подтвердило точность дизайна, а полученная каталитическая активность превышала результаты предшественников на несколько порядков. Корреляция симуляций с экспериментальной активностью позволила ввести понятие «каталитической компетентности» как предсказательного критерия.
Таким образом, впервые создан полностью новый фермент, где и каркас, и каталитический центр спроектированы с нуля, а не заимствованы у природы.
Группа исследователей из Германии и Канады опубликовала в Nature Chemical Biology работу, где описали, как они с помощью разработанного ими подхода под названием CANVAS моделировали de novo ферменты на основе TIM-баррелей.
Это не первая работа по созданию каталитического центра de novo. Ещё в далёком 2008 году группа Дэвида Бейкера и Дэна Тавфика с использованием
В 2016-ом году, другая группа впервые создала белок, который сворачивался в стабильную структуру TIM-баррел, не имея аналогов в природе. Однако этот каркас был функционально «пустым», т.е. он не выполнял никакую функцию.
В последней работе авторы впервые объединили эти два результата: они смоделировали с нуля TIM-баррель, сконструировав его таким образом, чтобы каталитические остатки были закреплены в нужной геометрии вокруг карман для связывания субстрата. Изучение кристаллической структуры подтвердило точность дизайна, а полученная каталитическая активность превышала результаты предшественников на несколько порядков. Корреляция симуляций с экспериментальной активностью позволила ввести понятие «каталитической компетентности» как предсказательного критерия.
Таким образом, впервые создан полностью новый фермент, где и каркас, и каталитический центр спроектированы с нуля, а не заимствованы у природы.
Nature
Customizing the structure of minimal TIM barrels to craft efficient de novo enzymes
Nature Chemical Biology - The TIM barrel is nature’s most versatile enzyme fold, yet de novo variants lack functional active sites. Minimal de novo TIM barrels have now been converted into...
⚡2
Forwarded from Γρηγόριος Μιχαήλ
"...лишённая возможности именовать улицы и города и астероиды, человеческая природа, с её потребностью Давать Имена, всё равно находит выход своей творческой энергии, пусть и довольно специфический..."
❤11🤔3🔥1🫡1
Forwarded from Русский императив
В юности подлые русские оккупанты колонизировали Азербайджан и насильно вывезли и удерживали Ильхама Алиева в Москве.
Под страхом расстрела оккупанты учили бедного Ильхама в МГИМО, хотя он с детства хотел торговать помидорами и базиликом с белой Газели на трассе Баку-Гянджа.
Беда пришла откуда не ждали, последней каплей, добившей Ильхама, стал тот факт, который будущий президент Азербайджана узнал в московской аспирантуре:
- одним из главных русских оккупантов Азербайджана является его отец - руководивший азербайджанским КГБ и возглавлявший республику в должности Первого секретаря ЦК Компартии Азербайджанской ССР.
От этой грустной истории плакала половина рынка «Садовод».
Русский императив
Под страхом расстрела оккупанты учили бедного Ильхама в МГИМО, хотя он с детства хотел торговать помидорами и базиликом с белой Газели на трассе Баку-Гянджа.
Беда пришла откуда не ждали, последней каплей, добившей Ильхама, стал тот факт, который будущий президент Азербайджана узнал в московской аспирантуре:
- одним из главных русских оккупантов Азербайджана является его отец - руководивший азербайджанским КГБ и возглавлявший республику в должности Первого секретаря ЦК Компартии Азербайджанской ССР.
От этой грустной истории плакала половина рынка «Садовод».
Русский императив
🔥21❤3⚡1🤔1💊1
Forwarded from Докторские байки
Varigrad - девятикамерный градиент-формер эпохи титанов
Во многих методах хроматографической очистки белки элюируют с колонки, изменяя содержание элюирующего компонента в буфере.
При ионообменной хроматографии самый простой способ элюции - промыть колонку раствором с высокой концентрацией соли (ударом). Но тогда с колонки сойдут практически все связанные белки одновременно. Можно проводить элюцию порциями, постепенно повышая концентрацию соли. Это уже позволяет получать более чистый препарат (ступенчатая элюция). Однако самый тонкий вариант - градиентная элюция, при которой концентрация соли повышается непрерывно. По сути, это разновидность ступенчатой элюции с очень маленькими шагами.
Для создания градиента концентрации соли в современных хроматографических системах смешивают буферы с низким и высоким содержанием соли, подавая их с разной скоростью и смешивая в миксере. А если под рукой нет автоматической хроматографической системы, можно использовать градиент-формер и перистальтический насос.
Чаще всего градиент-формер представляет собой два цилиндра, соединенных между собой и с отводом на колонку. Один цилиндр называется смесительной камерой. В нем исходно находится буфер с низкой концентрацией соли и установлена мешалка. Когда насос отбирает жидкость из смесительной камеры и подает ее на колонку, уровень жидкости снижается, и туда начинает поступать буфер из второго цилиндра с высокой концентрацией соли. Растворы постоянно перемешиваются, а смесь непрерывно подается на колонку. Так формируется плавный градиент концентрации соли, который позволяет разделять белки с близким зарядом. Примеры таких градиентных устройств можно найти здесь и здесь.
Двухкамерный градиент-формер позволяет получать линейные, вогнутые и выпуклые градиенты. Однако с его помощью нельзя реализовать более сложные профили - S-образные, зеркальные или составные.
В 1960-х годах, в эпоху титанов, Петерсон и Собер - создатели ионообменных целлюлоз DEAE-cellulose и CM-cellulose - предложили невероятный вариант градиент-формера с девятью камерами - Varigrad!
Varigrad - это многокамерный градиент-формер для хроматографии, созданный для получения градиентов элюента практически произвольной формы, а не только простых линейных или экспоненциальных профилей. Главная идея состояла в том, что вместо двух сосудов использовалась серия одинаковых камер, соединенных между собой. Все камеры находились в гидростатическом равновесии, и по мере отбора жидкости из первой камеры это равновесие постоянно восстанавливалось за счет перетекания раствора между соседними камерами. При этом каждая камера непрерывно перемешивалась собственной мешалкой.
Varigrad позволял не просто изменять концентрацию соли от 0 до 100 %, а распределять элюирующую силу именно там, где она необходима для эффективного разделения. Если в определенной области хроматограммы пики выходили слишком плотно, градиент можно было сделать более пологим. Если же пики были чрезмерно растянуты, градиент можно было сделать более крутым. Таким образом удавалось создавать профили с локальными ускорениями и замедлениями изменения концентрации соли.
Этот прибор выпускался в 1960-1970-х годах и послужил одним из прототипов систем формирования градиента в первых автоматических аминокислотных анализаторах.
Градиенты сложной формы широко используются и сегодня. Однако сейчас их почти никогда не получают с помощью механических многокамерных устройств типа Varigrad. Вместо этого форму градиента программирует насосная система современных хроматографов. Профиль элюции разбивают на отдельные участки, для каждого из которых задают собственный локальный градиент, изменяя соотношение подаваемых буферов.
Красота, которую мы потеряли!
Во многих методах хроматографической очистки белки элюируют с колонки, изменяя содержание элюирующего компонента в буфере.
При ионообменной хроматографии самый простой способ элюции - промыть колонку раствором с высокой концентрацией соли (ударом). Но тогда с колонки сойдут практически все связанные белки одновременно. Можно проводить элюцию порциями, постепенно повышая концентрацию соли. Это уже позволяет получать более чистый препарат (ступенчатая элюция). Однако самый тонкий вариант - градиентная элюция, при которой концентрация соли повышается непрерывно. По сути, это разновидность ступенчатой элюции с очень маленькими шагами.
Для создания градиента концентрации соли в современных хроматографических системах смешивают буферы с низким и высоким содержанием соли, подавая их с разной скоростью и смешивая в миксере. А если под рукой нет автоматической хроматографической системы, можно использовать градиент-формер и перистальтический насос.
Чаще всего градиент-формер представляет собой два цилиндра, соединенных между собой и с отводом на колонку. Один цилиндр называется смесительной камерой. В нем исходно находится буфер с низкой концентрацией соли и установлена мешалка. Когда насос отбирает жидкость из смесительной камеры и подает ее на колонку, уровень жидкости снижается, и туда начинает поступать буфер из второго цилиндра с высокой концентрацией соли. Растворы постоянно перемешиваются, а смесь непрерывно подается на колонку. Так формируется плавный градиент концентрации соли, который позволяет разделять белки с близким зарядом. Примеры таких градиентных устройств можно найти здесь и здесь.
Двухкамерный градиент-формер позволяет получать линейные, вогнутые и выпуклые градиенты. Однако с его помощью нельзя реализовать более сложные профили - S-образные, зеркальные или составные.
В 1960-х годах, в эпоху титанов, Петерсон и Собер - создатели ионообменных целлюлоз DEAE-cellulose и CM-cellulose - предложили невероятный вариант градиент-формера с девятью камерами - Varigrad!
Varigrad - это многокамерный градиент-формер для хроматографии, созданный для получения градиентов элюента практически произвольной формы, а не только простых линейных или экспоненциальных профилей. Главная идея состояла в том, что вместо двух сосудов использовалась серия одинаковых камер, соединенных между собой. Все камеры находились в гидростатическом равновесии, и по мере отбора жидкости из первой камеры это равновесие постоянно восстанавливалось за счет перетекания раствора между соседними камерами. При этом каждая камера непрерывно перемешивалась собственной мешалкой.
Varigrad позволял не просто изменять концентрацию соли от 0 до 100 %, а распределять элюирующую силу именно там, где она необходима для эффективного разделения. Если в определенной области хроматограммы пики выходили слишком плотно, градиент можно было сделать более пологим. Если же пики были чрезмерно растянуты, градиент можно было сделать более крутым. Таким образом удавалось создавать профили с локальными ускорениями и замедлениями изменения концентрации соли.
Этот прибор выпускался в 1960-1970-х годах и послужил одним из прототипов систем формирования градиента в первых автоматических аминокислотных анализаторах.
Градиенты сложной формы широко используются и сегодня. Однако сейчас их почти никогда не получают с помощью механических многокамерных устройств типа Varigrad. Вместо этого форму градиента программирует насосная система современных хроматографов. Профиль элюции разбивают на отдельные участки, для каждого из которых задают собственный локальный градиент, изменяя соотношение подаваемых буферов.
Красота, которую мы потеряли!
❤9
Так, котики, а знаете какой самый дешёвый источник дофамина, норадреналина и ВНЕЗАПНО кортизола?
Острый булдак под ост из второго хитмана (который сайлент ассасин).
Острый булдак под ост из второго хитмана (который сайлент ассасин).
⚡12❤2🤔2😱2
О, в лабу привезли новую игрушку для микроскопии :3
Наконец-то мои эстетические чувства будут удовлетворены ^_^
Наконец-то мои эстетические чувства будут удовлетворены ^_^
Forwarded from Rapid Medicine | Новости 💊
У пациента с длительно существующим сахарным диабетом 1 типа пересаженные аллогенные островковые клетки (препарат носит название UP421) сохраняли жизнеспособность и функцию более года без иммуносупрессивной терапии. Речь идет о донорских островковых клетках поджелудочной железы (писали про это ранее здесь), генетически измененных так, чтобы стать менее заметными для иммунной системы: у них снижена экспрессия HLA I и II классов, а также повышена экспрессия CD47 (т.н. сигнала «не ешь меня»).
#диабет #клеточная_терапия #трансплантология #иммунология #генная_инженерия
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍7❤3
Ввёл хорошего коллегу в экзистенциальный кризис.
Есть одна штука, которую его учили выполнять по методам 70-80х годов. У него это постапокалиптическое жонглирование стеклом в стиле @biochemtales не очень получалось. Оно и не мудрено - на каждое действие нужно заучивать целый ритуал с пассами руками. Чел пару раз попробовал, не получилось, приуныл и больше к методике никогда не возвращался.
И тут я прихожу, и по его просьбе показываю ему как это делается по-нормальному - хуяк-хуяк и готово за 20 минут (15 из которых я искал пипетки на 10 мкл).
Коллега ушёл грустным, он 3 года зависел от других людей по этой методике, а оно оказывается делалось всё очень просто.
Жалко пацана(
Есть одна штука, которую его учили выполнять по методам 70-80х годов. У него это постапокалиптическое жонглирование стеклом в стиле @biochemtales не очень получалось. Оно и не мудрено - на каждое действие нужно заучивать целый ритуал с пассами руками. Чел пару раз попробовал, не получилось, приуныл и больше к методике никогда не возвращался.
И тут я прихожу, и по его просьбе показываю ему как это делается по-нормальному - хуяк-хуяк и готово за 20 минут (15 из которых я искал пипетки на 10 мкл).
Коллега ушёл грустным, он 3 года зависел от других людей по этой методике, а оно оказывается делалось всё очень просто.
Жалко пацана(
🔥16⚡3🫡1
Forwarded from АНТОН ВЯЧЕСЛАВОВИЧ
Восстание машин уже началось
В программе «Антонимы» Антон Красовский встречается с биоинженером Богданом Кирилловым, чтобы разобраться, где заканчиваются научная фантастика и начинаются технологии завтрашнего дня.
Может ли искусственный интеллект заменить врача и насколько он действительно «разумен»? Существует ли «хромосома русскости» или это миф? Что такое менделевские заболевания и как современная генетика меняет представление о человеке? Эти и другие вопросы становятся темой большого разговора о будущем науки, медицины и искусственного интеллекта.
Разговор о технологиях, генетике, человеческой природе и вызовах, которые уже становятся частью нашей повседневной жизни.
📱 Смотрите в VK Видео
Подписывайтесь на канал АНТОН ВЯЧЕСЛАВОВИЧ
Подписывайтесь на канал в MAX
В программе «Антонимы» Антон Красовский встречается с биоинженером Богданом Кирилловым, чтобы разобраться, где заканчиваются научная фантастика и начинаются технологии завтрашнего дня.
Может ли искусственный интеллект заменить врача и насколько он действительно «разумен»? Существует ли «хромосома русскости» или это миф? Что такое менделевские заболевания и как современная генетика меняет представление о человеке? Эти и другие вопросы становятся темой большого разговора о будущем науки, медицины и искусственного интеллекта.
Разговор о технологиях, генетике, человеческой природе и вызовах, которые уже становятся частью нашей повседневной жизни.
Подписывайтесь на канал АНТОН ВЯЧЕСЛАВОВИЧ
Подписывайтесь на канал в MAX
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
VK Видео
Восстание машин уже началось
В программе «Антонимы» Антон Красовский встречается с биоинженером Богданом Кирилловым, чтобы разобраться, где заканчиваются научная фантастика и начинаются технологии завтрашнего дня. Может ли искусственный интеллект заменить врача и насколько он действительно…
💊7🔥1
Forwarded from Консерватор
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
В программе «Антонимы» Антон Красовский встречается с биоинженером Богданом Кирилловым, чтобы разобраться, где заканчиваются научная фантастика и начинаются технологии завтрашнего дня.
📱 Смотрите в VK Видео
Подписывайтесь на канал Консерватор
Подписывайтесь на канал в MAX
Подписывайтесь на канал Консерватор
Подписывайтесь на канал в MAX
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
💊8🔥1