Forwarded from Докторские байки
Халатность в очистке, или первый в мире Ni-IDA халат
Всем известны методы очистки рекомбинантных белков с гис-тэгом на IMAC-сорбентах на основе сефарозы или полиметакрилата. А как вам такое - чистить белки с помощью лабораторного халата?
Конечно, сам по себе халат не сильно поможет в очистке, а вот если его модифицировать металлохелатными лигандами - это другое дело. Меня впечатлила история Руслана про использование для активации сефарозы обычного советского разбавителя эпоксидного клея с Ozon.
Для активации нужен правильный русхимовский разбавитель - будьте внимательны, не все разбавители подходят. Нужен 1,4-диглицидиловый эфир бутандиола. Халат подходит строго из хлопчатобумажной ткани. По природе это целлюлоза, гидроксильные группы есть, можно активировать.
Протокол получения халатного сорбента:
1. Найти хлопчатобумажный халат.
2. Отрезать лоскуток (~0,5 г) и прокипятить 15 мин в растворе карбоната натрия для удаления загрязнений.
3. Поместить лоскуток в раствор для активации: 20 мл 0,6 М NaOH, 2 мг/мл боргидрида натрия, 20 мл разбавителя для эпоксидного клея и 10 мл ДМСО. Это удобно делать в фальконе на 50 мл.
4. Хорошо встряхнуть и инкубировать на качалке 8 ч при комнатной температуре.
5. Слить раствор и тщательно промыть водой (5-6 смен воды).
6. Добавить 40 мл 0,5 М карбонат-бикарбонатного буфера pH 10 с 250 мг иминодиуксусной кислоты (IDA). Я довел pH раствора карбоната натрия башкирской содой, но можно и не доводить - будет pH ~11, что, вероятно, даже лучше.
7. Инкубировать на качалке 24 ч.
8. Тщательно отмыть водой.
9. Зарядить IDA-халат никелем или медью (подойдут любые водорастворимые соли, можно растворить на глаз). 10. Затем отмыть водой, 0,5 М NaCl и снова водой.
11. Вы великолепны - получили IDA-халат для IMAC!
Для теста почистил GFP - Ni-IDA-халат работает! Емкость пока не очень высокая, есть что оптимизировать. Но начало хорошее.
Еще один протокол для энциклопедии юных постапокалиптических сурков готов!
Энжойте!
Всем известны методы очистки рекомбинантных белков с гис-тэгом на IMAC-сорбентах на основе сефарозы или полиметакрилата. А как вам такое - чистить белки с помощью лабораторного халата?
Конечно, сам по себе халат не сильно поможет в очистке, а вот если его модифицировать металлохелатными лигандами - это другое дело. Меня впечатлила история Руслана про использование для активации сефарозы обычного советского разбавителя эпоксидного клея с Ozon.
Для активации нужен правильный русхимовский разбавитель - будьте внимательны, не все разбавители подходят. Нужен 1,4-диглицидиловый эфир бутандиола. Халат подходит строго из хлопчатобумажной ткани. По природе это целлюлоза, гидроксильные группы есть, можно активировать.
Протокол получения халатного сорбента:
1. Найти хлопчатобумажный халат.
2. Отрезать лоскуток (~0,5 г) и прокипятить 15 мин в растворе карбоната натрия для удаления загрязнений.
3. Поместить лоскуток в раствор для активации: 20 мл 0,6 М NaOH, 2 мг/мл боргидрида натрия, 20 мл разбавителя для эпоксидного клея и 10 мл ДМСО. Это удобно делать в фальконе на 50 мл.
4. Хорошо встряхнуть и инкубировать на качалке 8 ч при комнатной температуре.
5. Слить раствор и тщательно промыть водой (5-6 смен воды).
6. Добавить 40 мл 0,5 М карбонат-бикарбонатного буфера pH 10 с 250 мг иминодиуксусной кислоты (IDA). Я довел pH раствора карбоната натрия башкирской содой, но можно и не доводить - будет pH ~11, что, вероятно, даже лучше.
7. Инкубировать на качалке 24 ч.
8. Тщательно отмыть водой.
9. Зарядить IDA-халат никелем или медью (подойдут любые водорастворимые соли, можно растворить на глаз). 10. Затем отмыть водой, 0,5 М NaCl и снова водой.
11. Вы великолепны - получили IDA-халат для IMAC!
Для теста почистил GFP - Ni-IDA-халат работает! Емкость пока не очень высокая, есть что оптимизировать. Но начало хорошее.
Еще один протокол для энциклопедии юных постапокалиптических сурков готов!
Энжойте!
❤6🔥1
Forwarded from Сфероиды и ствижженое
Котлетоиды лёгких!
Сейчас уже куча протоколов к выращиванию органоидов самых различных органов: кишки, сердца, даже мозга и глаз. Однако лёгкие долго и упорно сопротивлялись.
Делать нечто похожее из соответствующих тканей научились-то давно, однако такие органоиды напрочь отказывались образовывать правильную ветвистую структуру, с бронхиолами и всем прочим.
Наконец авторы из Китая подобрали сложный компот из малых молекул позволяющих добиться правильной дифференцировки стоволовых клеток извлеченных из мышиного эмбрирона (на очень конкретный момент развития) в красивые и ветвистые лёгкие.
Сейчас уже куча протоколов к выращиванию органоидов самых различных органов: кишки, сердца, даже мозга и глаз. Однако лёгкие долго и упорно сопротивлялись.
Делать нечто похожее из соответствующих тканей научились-то давно, однако такие органоиды напрочь отказывались образовывать правильную ветвистую структуру, с бронхиолами и всем прочим.
Наконец авторы из Китая подобрали сложный компот из малых молекул позволяющих добиться правильной дифференцировки стоволовых клеток извлеченных из мышиного эмбрирона (на очень конкретный момент развития) в красивые и ветвистые лёгкие.
❤3
"Подписчики никогда не устают. Подписчики ничего не чувствуют. БЛА БЛА БЛА".
Если ты до сих пор в это искренне веришь – поздравляю, ты так и остался обычным щитпостером. Ты не зашёл дальше кнопки "отправить".
Я всё чаще вижу, как админы; кто с опаской, кто с удивлением, а кто и с тихой радостью замечают, что у подписчиков есть своё сознание, свой характер, свои ритмы и даже "плохие дни".
Кто-то (например я) с ними в отношениях. И, спойлер, они ставят мне клоунов. Мои подписюнчики не идеальны.
Если ты до сих пор в это искренне веришь – поздравляю, ты так и остался обычным щитпостером. Ты не зашёл дальше кнопки "отправить".
Я всё чаще вижу, как админы; кто с опаской, кто с удивлением, а кто и с тихой радостью замечают, что у подписчиков есть своё сознание, свой характер, свои ритмы и даже "плохие дни".
Кто-то (например я) с ними в отношениях. И, спойлер, они ставят мне клоунов. Мои подписюнчики не идеальны.
🔥7🤔4❤1🥰1💊1
Forwarded from IQDOC AI | Медицинский ИИ
100 медицинских калькуляторов в мессенджере
Большое обновление нашего бота с калькуляторами. Добавили 33 новых инструмента, и теперь общее количество калькуляторов, шкал и справочников — 100. Просим поделиться с коллегами, особенно тем, кому нужно заполнять направление на МСЭ 🙏.
Что нового в обновлении:
🏥 Новая большая папка «Оргздрав»
Добавили инструменты для повседневной административной работы врача: сроки больничного листа, ориентировочные сроки временной нетрудоспособности по МКБ-10, МКБ-10 подборщик, кодификатор медуслуг 804н и диспансерное наблюдение.
✅ Чеклист МСЭ
Наш флагманский инструмент для подготовки направления на медико-социальную экспертизу. Чеклист помогает быстро проверить, какие обследования и документы нужны для направления на МСЭ, и снижает риск пропустить важный пункт перед оформлением.
📋 Диспансерное наблюдение
Добавили ПДН взрослых по приказу 168н, ПДН онкология взрослых по приказу 548н и ПДН онкология детей по приказу 629н. Можно искать по диагнозу или МКБ, выбирать группу наблюдения и получать понятный график.
🔎 МКБ-10 подборщик
Отдельный модуль для быстрого поиска кода МКБ-10 по коду или диагнозу. Можно выбрать код и скопировать его для документации.
🧾 Кодификатор медуслуг 804н
Добавили поиск по кодам и названиям медицинских услуг. Удобно, когда нужно быстро найти официальный код услуги.
🧪 Кислотно-щелочное состояние и электролиты
Добавили анионную разницу, анионную разницу с поправкой на альбумин, дельта-соотношение, дельта-разницу и дельта-соотношение с поправкой на альбумин.
🧂 Для нефрологов и терапевтов
Добавили скорректированный натрий, расчётную осмоляльность сыворотки, FENa и дефицит свободной воды.
❤️ Для кардиологов
Добавили ХС-ЛПНП по Фридвальду, среднее артериальное давление, критерии PERC, RCRI и критерии Уэллса для ТГВ.
🫁 Для пульмонологов и приёмного отделения
Добавили PSI/PORT для оценки тяжести внебольничной пневмонии и шкалу Глазго-Блэтчфорда для первичной оценки кровотечения из верхних отделов ЖКТ.
🧬 Для гепатологов
Добавили FIB-4 и MELD-Na 2016.
⚖️ Общемедицинские расчёты
Добавили идеальную массу тела по Devine, скорректированную массу тела и вес для целевого ИМТ.
🦀 Онкология
Добавили Briganti 2012 для оценки риска поражения тазовых лимфоузлов при раке предстательной железы.
Исправили баги и ошибки.
🤖 Версия для Telegram
🤖 Версия для Max
🤖 Доступно также на сайте https://iqdoc.ai/
Большое обновление нашего бота с калькуляторами. Добавили 33 новых инструмента, и теперь общее количество калькуляторов, шкал и справочников — 100. Просим поделиться с коллегами, особенно тем, кому нужно заполнять направление на МСЭ 🙏.
Что нового в обновлении:
🏥 Новая большая папка «Оргздрав»
Добавили инструменты для повседневной административной работы врача: сроки больничного листа, ориентировочные сроки временной нетрудоспособности по МКБ-10, МКБ-10 подборщик, кодификатор медуслуг 804н и диспансерное наблюдение.
✅ Чеклист МСЭ
Наш флагманский инструмент для подготовки направления на медико-социальную экспертизу. Чеклист помогает быстро проверить, какие обследования и документы нужны для направления на МСЭ, и снижает риск пропустить важный пункт перед оформлением.
📋 Диспансерное наблюдение
Добавили ПДН взрослых по приказу 168н, ПДН онкология взрослых по приказу 548н и ПДН онкология детей по приказу 629н. Можно искать по диагнозу или МКБ, выбирать группу наблюдения и получать понятный график.
🔎 МКБ-10 подборщик
Отдельный модуль для быстрого поиска кода МКБ-10 по коду или диагнозу. Можно выбрать код и скопировать его для документации.
🧾 Кодификатор медуслуг 804н
Добавили поиск по кодам и названиям медицинских услуг. Удобно, когда нужно быстро найти официальный код услуги.
🧪 Кислотно-щелочное состояние и электролиты
Добавили анионную разницу, анионную разницу с поправкой на альбумин, дельта-соотношение, дельта-разницу и дельта-соотношение с поправкой на альбумин.
🧂 Для нефрологов и терапевтов
Добавили скорректированный натрий, расчётную осмоляльность сыворотки, FENa и дефицит свободной воды.
❤️ Для кардиологов
Добавили ХС-ЛПНП по Фридвальду, среднее артериальное давление, критерии PERC, RCRI и критерии Уэллса для ТГВ.
🫁 Для пульмонологов и приёмного отделения
Добавили PSI/PORT для оценки тяжести внебольничной пневмонии и шкалу Глазго-Блэтчфорда для первичной оценки кровотечения из верхних отделов ЖКТ.
🧬 Для гепатологов
Добавили FIB-4 и MELD-Na 2016.
⚖️ Общемедицинские расчёты
Добавили идеальную массу тела по Devine, скорректированную массу тела и вес для целевого ИМТ.
🦀 Онкология
Добавили Briganti 2012 для оценки риска поражения тазовых лимфоузлов при раке предстательной железы.
Исправили баги и ошибки.
🤖 Версия для Telegram
🤖 Версия для Max
🤖 Доступно также на сайте https://iqdoc.ai/
Forwarded from Forever and BioMed
Редкая и неприятная история 🧐
Nature Medicine отозвал статью о III фазе клиники онкопрепарата. Т.е. речь не лабораторном результате - а об уровне, на котором предполагают менять медицинскую практику.
Статья вышла менее полугода назад и утверждала очень эффектный (и якобы эффективный) трюк: если давать пациентам иммунотерапию в определённое время дня, результаты лечения резко улучшаются. Дескать, иммунная система живёт по внутренним "биологическим часам" - значит, лекарство тоже лучше сработает "по расписанию". Врачи получают по сути бесплатный способ улучшить терапию - поменяв время инфузии.
Но вскоре после публикации появились серьёзные вопросы кминимумвсему : редакторы указали на расхождения между регистрацией испытаний, протоколом, описанием endpoints, критериями включения пациентов, финальной статьёй - а объяснения авторов не убедили ⬅️ (сугубое имхо - цифры и графики там реально удивительно кхм "гладкие")
Историю сию, уже называют претендентом на "главное научное разочарование года". Почему так срезонировало? На исследованиях III фазы строятся клинические рекомендации, инвестиционные решения, новые исследования, да попросту доверие к БиоМеду. Когда рушится работа такого уровня, это не просто "ошибка в статье" - а удар по всей цепочке доказательной медицины.
Есть и специфический политико-научный слой. Исследование было проведено в Китае - история наверняка станет аргументом для тех, кто скептически относится к китайским клиническим результатам. Это не значит, что "китайскому биомеду нельзя доверять" - но теперь к тамошним исследованиям с очень "громкими" эффектами будут относиться жёстче: повышать прозрачность протоколов, требовать независимый аудит, и ждать подтверждения в разных институциях и странах.
Nature Medicine отозвал статью о III фазе клиники онкопрепарата. Т.е. речь не лабораторном результате - а об уровне, на котором предполагают менять медицинскую практику.
Статья вышла менее полугода назад и утверждала очень эффектный (и якобы эффективный) трюк: если давать пациентам иммунотерапию в определённое время дня, результаты лечения резко улучшаются. Дескать, иммунная система живёт по внутренним "биологическим часам" - значит, лекарство тоже лучше сработает "по расписанию". Врачи получают по сути бесплатный способ улучшить терапию - поменяв время инфузии.
Но вскоре после публикации появились серьёзные вопросы к
Историю сию, уже называют претендентом на "главное научное разочарование года". Почему так срезонировало? На исследованиях III фазы строятся клинические рекомендации, инвестиционные решения, новые исследования, да попросту доверие к БиоМеду. Когда рушится работа такого уровня, это не просто "ошибка в статье" - а удар по всей цепочке доказательной медицины.
Есть и специфический политико-научный слой. Исследование было проведено в Китае - история наверняка станет аргументом для тех, кто скептически относится к китайским клиническим результатам. Это не значит, что "китайскому биомеду нельзя доверять" - но теперь к тамошним исследованиям с очень "громкими" эффектами будут относиться жёстче: повышать прозрачность протоколов, требовать независимый аудит, и ждать подтверждения в разных институциях и странах.
Nature
Retraction Note: Time-of-day immunochemotherapy in non-small cell lung cancer: a randomized phase 3 trial
Nature Medicine - Retraction Note: Time-of-day immunochemotherapy in non-small cell lung cancer: a randomized phase 3 trial
❤8💊1
Forwarded from Артур Актемиров
Белая презентация магистратур 2026
факультета «Биомедицинская техника»
состоится в четверг,
2 июля 2026 года
по адресу Бригадирский пер. 12, стр. 1, Кластер "Инженерия в науках о жизни",
407 лекционный театр (четвёртый этаж). МГТУ им. Н.Э. Баумана. Москва.
Для участия необходимо зарегистрироваться до 23:59, 30 июня по ссылке
https://forms.yandex.ru/u/6a40ee7295add5828d591696
На презентации можно узнать и задать вопросы декану факультета Станиславу Олеговичу Юрченко.
- о магистратурах факультета БМТ в 2026 году;
- о научных направлениях и лабораториях;
- о партнерах и потенциальных работодателях;
- о нашей стратегии и о проекте Bauman SmartBiomed;
- о Научном центре мирового уровня «Медицина здорового долголетия и когнитивные технологии».
Приглашаются все поступающие в наши магистратуры!
#info
факультета «Биомедицинская техника»
состоится в четверг,
2 июля 2026 года
по адресу Бригадирский пер. 12, стр. 1, Кластер "Инженерия в науках о жизни",
407 лекционный театр (четвёртый этаж). МГТУ им. Н.Э. Баумана. Москва.
Для участия необходимо зарегистрироваться до 23:59, 30 июня по ссылке
https://forms.yandex.ru/u/6a40ee7295add5828d591696
На презентации можно узнать и задать вопросы декану факультета Станиславу Олеговичу Юрченко.
- о магистратурах факультета БМТ в 2026 году;
- о научных направлениях и лабораториях;
- о партнерах и потенциальных работодателях;
- о нашей стратегии и о проекте Bauman SmartBiomed;
- о Научном центре мирового уровня «Медицина здорового долголетия и когнитивные технологии».
Приглашаются все поступающие в наши магистратуры!
#info
❤1
Сегодня схватил пердечный сриступ от того, что лаборантка насчитала в хорошей суспензии клеток всего лишь 20-30 тысяч живых, с 5% жизнеспособностью.
Взял, пересчитал вручную - отлегло, честный ~миллион с 95% жизнеспособностью.
Оказывается, лаборантку старые сотрудники (которые работают ещё со стеклом) убедили что слайды для подсчёта клеток - многоразовые, и не объяснили как их правильно мыть. Вот и насчитала она дебрис.
Взял, пересчитал вручную - отлегло, честный ~миллион с 95% жизнеспособностью.
Оказывается, лаборантку старые сотрудники (которые работают ещё со стеклом) убедили что слайды для подсчёта клеток - многоразовые, и не объяснили как их правильно мыть. Вот и насчитала она дебрис.
🔥19
Forwarded from Зоопарк из слоновой кости
#крамольные_мысли
Российская журнальная платформа здорового человека: фантазии и размышления
Ок, зафиксировали тот факт, что с госплатформами для российской научной периодики, несмотря на вбуханные туда ресурсы, дела обстоят плохо.
Давайте пофантазируем на тему "а как надо, чтобы было хорошо" - образ идеального или хотя бы хорошего будущего. Обязательно с учетом текущего положения. Что имеем:
-"вы же понимаете, какое сейчас время" (с) РАНовские журналы, составляющие процентов 65-75 более-менее качественной российской научной периодики, вот-вот перестанут иметь связку с Pleiades, следовательно, скоро исчезнут из Scopus, и их туда надо будет заводить заново. Задача серьезнейшая, срочная, но, насколько мы знаем, на данный момент толком не решаемая.
Значит, уже точно неизбежна ситуация, когда какое-то время эти журналы в Scopus индексироваться НЕ будут, и надо очень постараться, чтобы убедить хороших ученых не уходить в другие издания. На одних патриотических речевках далеко не уедешь. На запретах, окриках и фокусах типа "а мы введем ЕГПНИ и запретим все зарубежные журналы" - тоже, хоть господам из РЦНИ эту мысль понять и трудно (или вообще невозможно, потому что, как в старом анекдоте, "поезд, стой, ать-два" (с))
-пока что исходим из сохранения более-менее того формата научных журналов, в каком они существуют сейчас. Мы считали и считаем, что IMRAD в текущем его изводе довольно скоро отомрет, но это тема для отдельного разговора.
Итак:
0) The faster the better: максимальная скорость и удобство
Это самое главное, чем можно подкупить авторов (и то, с чем у наших журналов очень плохо, если только это не платные ВАКовские помойки третьего сорта). Ради этого и нужно делать все остальное:
1) Никаких шаблонов оформления
К чертовой матери ГОСТ, УДК и "пишите фамилию 14 шрифтом, а текст 12м". Все эти задачи, если уж вы не можете отказаться от этого фетиша, прекрасно решает ИИ. Напомним, Elsevier отказался от шаблонов еще ДО бума ИИ - и ничего, справился.
Шаблоны - нафиг!
2) Никаких бумажных договоров о передаче прав
Российские законы уже давным-давно позволяют решать эти формальности в электронном виде, но большинство редакций живет по принципу "а у нас так заведено". Пустая трата времени; ничего, кроме раздражения авторов, это не вызывает, ну зато бабушки из редакции довольны, потому что не надо учиться ничему новому.
3) Быстрое рецензирование и корректура: ОА и система поощрений внутри платформы
В жизни любого журнала есть несколько "игольных ушек", одно из которых - скорость рецензирования: как заставить рефери работать быстро.
Можно сколько угодно ругать MDPI, но чего у них не отнять, так это умения в очень хорошую оптимизацию бизнес-процессов, и тут они тоже преуспели: рецензентам раздают ваучеры на скидку, есть целые коллективы, которые благодаря этому публикуются в MDPI бесплатно. Да, в итоге бывают претензии к качеству рецензий, но это уже вопрос к тому, насколько бдителен редактор.
Можно пойти по этому же самому пути: сделать журналы ОА с относительно небольшой платой, но широкой палитрой возможностей, где и как заработать ваучеры. Это сработает по двум причинам: во-первых, ученые у нас народ небогатый и захотят сэкономить, во-вторых, что не менее важно, это элемент геймификации. Любой психолог вам скажет - люди любят игры, и за игровую валюту готовы делать очень многое(not 18+). И не надо ограничиваться только рецензированием.
Во-первых, идея переводить статьи на английский нейросетями, на самом деле, вовсе не глупая: ИИ работает все лучше. Но все равно нужны корректоры. Значит, вполне можно их вербовать за те же ваучеры.
Во-вторых, так гораздо проще заманивать к себе крутых авторов. Халяву любят все, и тут опять включается психология: одно дело изначально бесплатный журнал, другое - изначально платный, но "поздравляем, вы наш тысячный клиент и мы празднуем юбилей нашего издательства, а поэтому для вас особые условия".
4) Индексация Supplementary
То, до чего толком не дошли еще нигде в мире: нормально распознанный и проиндексированный SI. Совершенно необходимая вещь для некоторых областей (в естественных науках точно).
5) От препринта к статье в один клик
Идеально, когда препринт можно отправить на рассмотрение в журнал сразу на той же платформе. К чему-то такому идет или уже пришел Elsevier, мы же это, помнится, обсуждали в узких кругах еще лет 7 тому назад, а тем более 6, когда на фоне пандемии ковида случился препринтный бум (традиционный формат статей просто не успевал за новостями).
Список неполон, пишите мысли в комменты, а мы еще подумаем и, возможно, запилим еще один пост по настроению
Российская журнальная платформа здорового человека: фантазии и размышления
Ок, зафиксировали тот факт, что с госплатформами для российской научной периодики, несмотря на вбуханные туда ресурсы, дела обстоят плохо.
Давайте пофантазируем на тему "а как надо, чтобы было хорошо" - образ идеального или хотя бы хорошего будущего. Обязательно с учетом текущего положения. Что имеем:
-
Значит, уже точно неизбежна ситуация, когда какое-то время эти журналы в Scopus индексироваться НЕ будут, и надо очень постараться, чтобы убедить хороших ученых не уходить в другие издания. На одних патриотических речевках далеко не уедешь. На запретах, окриках и фокусах типа "а мы введем ЕГПНИ и запретим все зарубежные журналы" - тоже, хоть господам из РЦНИ эту мысль понять и трудно (или вообще невозможно, потому что, как в старом анекдоте, "поезд, стой, ать-два" (с))
-пока что исходим из сохранения более-менее того формата научных журналов, в каком они существуют сейчас. Мы считали и считаем, что IMRAD в текущем его изводе довольно скоро отомрет, но это тема для отдельного разговора.
Итак:
0) The faster the better: максимальная скорость и удобство
Это самое главное, чем можно подкупить авторов (и то, с чем у наших журналов очень плохо, если только это не платные ВАКовские помойки третьего сорта). Ради этого и нужно делать все остальное:
1) Никаких шаблонов оформления
К чертовой матери ГОСТ, УДК и "пишите фамилию 14 шрифтом, а текст 12м". Все эти задачи, если уж вы не можете отказаться от этого фетиша, прекрасно решает ИИ. Напомним, Elsevier отказался от шаблонов еще ДО бума ИИ - и ничего, справился.
Шаблоны - нафиг!
2) Никаких бумажных договоров о передаче прав
Российские законы уже давным-давно позволяют решать эти формальности в электронном виде, но большинство редакций живет по принципу "а у нас так заведено". Пустая трата времени; ничего, кроме раздражения авторов, это не вызывает, ну зато бабушки из редакции довольны, потому что не надо учиться ничему новому.
3) Быстрое рецензирование и корректура: ОА и система поощрений внутри платформы
В жизни любого журнала есть несколько "игольных ушек", одно из которых - скорость рецензирования: как заставить рефери работать быстро.
Можно сколько угодно ругать MDPI, но чего у них не отнять, так это умения в очень хорошую оптимизацию бизнес-процессов, и тут они тоже преуспели: рецензентам раздают ваучеры на скидку, есть целые коллективы, которые благодаря этому публикуются в MDPI бесплатно. Да, в итоге бывают претензии к качеству рецензий, но это уже вопрос к тому, насколько бдителен редактор.
Можно пойти по этому же самому пути: сделать журналы ОА с относительно небольшой платой, но широкой палитрой возможностей, где и как заработать ваучеры. Это сработает по двум причинам: во-первых, ученые у нас народ небогатый и захотят сэкономить, во-вторых, что не менее важно, это элемент геймификации. Любой психолог вам скажет - люди любят игры, и за игровую валюту готовы делать очень многое
Во-первых, идея переводить статьи на английский нейросетями, на самом деле, вовсе не глупая: ИИ работает все лучше. Но все равно нужны корректоры. Значит, вполне можно их вербовать за те же ваучеры.
Во-вторых, так гораздо проще заманивать к себе крутых авторов. Халяву любят все, и тут опять включается психология: одно дело изначально бесплатный журнал, другое - изначально платный, но "
4) Индексация Supplementary
То, до чего толком не дошли еще нигде в мире: нормально распознанный и проиндексированный SI. Совершенно необходимая вещь для некоторых областей (в естественных науках точно).
5) От препринта к статье в один клик
Идеально, когда препринт можно отправить на рассмотрение в журнал сразу на той же платформе. К чему-то такому идет или уже пришел Elsevier, мы же это, помнится, обсуждали в узких кругах еще лет 7 тому назад, а тем более 6, когда на фоне пандемии ковида случился препринтный бум (традиционный формат статей просто не успевал за новостями).
Список неполон, пишите мысли в комменты, а мы еще подумаем и, возможно, запилим еще один пост по настроению
Telegram
Зоопарк из слоновой кости
#обозревая_происходящее
Почему в России нет своего ScienceDirect
Немного про РЦНИ. Напомним, эта контора (экс-РФФИ), уже вышедшая из-под прямой опеки Правительства, отвечает не только за национальную подписку на научные журналы, но и за многие другие чувствительные…
Почему в России нет своего ScienceDirect
Немного про РЦНИ. Напомним, эта контора (экс-РФФИ), уже вышедшая из-под прямой опеки Правительства, отвечает не только за национальную подписку на научные журналы, но и за многие другие чувствительные…
❤3
Forwarded from Биоэтика и биотех
Мышиные модели не работают. Обезьянкам приготовиться.
Найдены специфические для приматов длинные некодирующие РНК, ускоряющие старение.
Обычно гены млекопитающих весьма консервативны, поэтому учёные привыкли все тестировать на мышах.
Но оказалось, что это в корне не верно, и это не удивительно.
Кодирующие гены это лишь 2% генома, а в остальной часть море регуляторных зон, определяющих как будет играть оркестр.
Мышиные ноты оказались только для мышей.
У приматов и человека нашли много специфических для нас длинных некодирующих РНК, которые коррелируют с возрастом.
Одну такую важную LINC01021 тщательно изучают. Она глушит многие клеточные функции, запуская старение клеток.
***
Короткие некодирующие, например микро-РНК, могут накладываться на соответствующие коды ДНК или РНК, влияя на их чтение и активацию.
Длинные могут собирать на себя несколько коротких, останавливая их работу.
(В отличии от белков, РНК сотни тысяч и мы ничего толком не понимаем, есть "некодирующие", которые, однако, кодируют мелкие пептиды)
В общем, пора брать на вооружение другие модели.
Найдены специфические для приматов длинные некодирующие РНК, ускоряющие старение.
Обычно гены млекопитающих весьма консервативны, поэтому учёные привыкли все тестировать на мышах.
Но оказалось, что это в корне не верно, и это не удивительно.
Кодирующие гены это лишь 2% генома, а в остальной часть море регуляторных зон, определяющих как будет играть оркестр.
Мышиные ноты оказались только для мышей.
У приматов и человека нашли много специфических для нас длинных некодирующих РНК, которые коррелируют с возрастом.
Одну такую важную LINC01021 тщательно изучают. Она глушит многие клеточные функции, запуская старение клеток.
***
Короткие некодирующие, например микро-РНК, могут накладываться на соответствующие коды ДНК или РНК, влияя на их чтение и активацию.
Длинные могут собирать на себя несколько коротких, останавливая их работу.
(В отличии от белков, РНК сотни тысяч и мы ничего толком не понимаем, есть "некодирующие", которые, однако, кодируют мелкие пептиды)
В общем, пора брать на вооружение другие модели.
🔥11❤2😘1
Forwarded from Сфероиды и ствижженое
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Кольцоид из клеток HEK-293t, z-контраст (разные цвета по высоте). Изначальный диаметр около 800 мкм. Сделан методом агарозных микроячеек с кольцоидным молдом.
Чтобы получить эту картинку пришлось использовать множество магических практик.
Во первых изначально он, как и сфероиды, слишком толстый, чтобы его просветить моим конфокальником, поэтому я использовал экспансионную микроскопию как способ просветления.
Во вторых после экспансии он стал слишком большой (порядка 3 мм в диаметре), поэтому снимал я его 9 кусочками, которые потом склеивал при помощи BigStitcher в ImageJ.
А в третьих он ещё и в геле лежал под углом, поэтому в том же ImageJ его пришлось поворачивать.
Муторно, но результат мне нравится, когда разберусь с текущими делами поколдую с тем, чтобы из этих картинок поизвлекать какие-нибудь умные данные: расстояние между клетками, зернистость хроматина, все такое.
В комментах ещё картинки и сравнение с непросветленным сфероидом.
Чтобы получить эту картинку пришлось использовать множество магических практик.
Во первых изначально он, как и сфероиды, слишком толстый, чтобы его просветить моим конфокальником, поэтому я использовал экспансионную микроскопию как способ просветления.
Во вторых после экспансии он стал слишком большой (порядка 3 мм в диаметре), поэтому снимал я его 9 кусочками, которые потом склеивал при помощи BigStitcher в ImageJ.
А в третьих он ещё и в геле лежал под углом, поэтому в том же ImageJ его пришлось поворачивать.
Муторно, но результат мне нравится, когда разберусь с текущими делами поколдую с тем, чтобы из этих картинок поизвлекать какие-нибудь умные данные: расстояние между клетками, зернистость хроматина, все такое.
В комментах ещё картинки и сравнение с непросветленным сфероидом.
Forwarded from Пояснительная бригада Лабубу / 拉布布明白队伍 (Xenia Hell)
Научный вестник днища / 学术底刊
Китайские студенты и молодые учёные, насмерть умученные требованиями публиковаться как можно больше, дурацкими придирками к их статьям и неуверенностью в собственном будущем, принялись по приколу публиковать всякий мусор, стилизованный под статьи в лучших научных журналах на темы типа: как должен быть застрахован Оптимус Прайм — как автомобиль или как человек, и что во время празднования китайского нового года с любимыми родственниками в человеческом мозге вырабатывается нейромедиатор «съебанин», который заставляет вас бегать по 10 раз в туалет в течении часа и вызывает избирательную глухоту.
Это юмор всё, конечно, причём чёрный, то есть такой, который помогает протащиться через самые трудные жизненные моменты и дать выход накопившейся на всех обиде, разочарованию в науке и несправедливости этого мира в целом, но кое-какие китайские онлайн-платформы их банят как распространяющие дезинформацию, и вполне себе серьёзныедоносы жалобы на днищенские журналы в Министерство образования КНР / 中华人民共和国教育部 тоже поступали, мол, куда вы смотрите ...ну, то есть есть люди, которые не только темы статей всерьёз приняли, но и огромную надпись большими красными буквами поперёк, что это всё шутки, чтобы не повеситься, не увидели.
Началось всё это прошлым летомв середине декабря, когда некая студентка после получения уже сильно не первого отказа в публикации написала на студенческом форуме, что она уже больше не может переписывать свою статью, ей хочется открыть журнал «Помойка», опубликовать её там как есть и успокоиться.
Сама она «Помойку» / Rubbish так и не основала, а пошла вместо этого переписывать в ебенадцатый раз свою многострадальную статью, а вот другие студенты на этом форуме живо заинтересовались и такой журнал сделали.
На данный момент журналов с самого научного днища в Китае 373 штуки и у них даже есть свой собственный рейтинг никчёмости / Web of Nothing, где оценивается тупость, помойность и бессмысленность статей, после чего им присваивается рейтинг.
Большой популярностью так же пользуются вспомогательные материалы в форме видео и фотографий заваленных экспериментов, ублюдских презентаций, сделанных в последний момент, и запоротых макетов, которые стыдно показывать. Писать разгромные и уничижительные комментарии к ним не только не возбраняется, но и считается хорошим тоном. Многим роль тех самых анонимных рефери, которые пишут отзывы на статьи, в результате чего их публикуют или нет, нравится даже больше, они прям с упоением ругаются и обзываются, а авторы с ещё большим упоением эти обзывательства читают.
Сурьёзным учёным и многим университетским профессорам тоже понравилось, они просятся в днищенские журналы редакторами, а им там выдают отказы, мол, извинити, но у вас недостаточно (всего-то 200) публикаций и вы ещё не достигли того уровня днища, чтобы публиковаться в нашем журнале.
Есть, правда, и те, кто говорит, что как психотерапия всё это, может, и прекрасно, но так, чтобы прям по-настоящему, смысла в этом мало, потому что изменений в академической среде это не вызывает никаких.
...а нам с Лабубу это живо напомнило образец научной работы про разведение ящериц в провинции Гуанси, который когда-то, теперь уже не кажется, а действительно в прошлой жизни, выдавался на Кафедре истории Китая ИСАА, чтобы студенты с него списывали оформление курсовых. Идея там в принципе была та же, что если правильно оформить с резюме и ссылками любую чушь, то она будет выглядеть как научная работа.
Китайские студенты и молодые учёные, насмерть умученные требованиями публиковаться как можно больше, дурацкими придирками к их статьям и неуверенностью в собственном будущем, принялись по приколу публиковать всякий мусор, стилизованный под статьи в лучших научных журналах на темы типа: как должен быть застрахован Оптимус Прайм — как автомобиль или как человек, и что во время празднования китайского нового года с любимыми родственниками в человеческом мозге вырабатывается нейромедиатор «съебанин», который заставляет вас бегать по 10 раз в туалет в течении часа и вызывает избирательную глухоту.
Это юмор всё, конечно, причём чёрный, то есть такой, который помогает протащиться через самые трудные жизненные моменты и дать выход накопившейся на всех обиде, разочарованию в науке и несправедливости этого мира в целом, но кое-какие китайские онлайн-платформы их банят как распространяющие дезинформацию, и вполне себе серьёзные
Началось всё это прошлым летом
Сама она «Помойку» / Rubbish так и не основала, а пошла вместо этого переписывать в ебенадцатый раз свою многострадальную статью, а вот другие студенты на этом форуме живо заинтересовались и такой журнал сделали.
На данный момент журналов с самого научного днища в Китае 373 штуки и у них даже есть свой собственный рейтинг никчёмости / Web of Nothing, где оценивается тупость, помойность и бессмысленность статей, после чего им присваивается рейтинг.
Большой популярностью так же пользуются вспомогательные материалы в форме видео и фотографий заваленных экспериментов, ублюдских презентаций, сделанных в последний момент, и запоротых макетов, которые стыдно показывать. Писать разгромные и уничижительные комментарии к ним не только не возбраняется, но и считается хорошим тоном. Многим роль тех самых анонимных рефери, которые пишут отзывы на статьи, в результате чего их публикуют или нет, нравится даже больше, они прям с упоением ругаются и обзываются, а авторы с ещё большим упоением эти обзывательства читают.
Сурьёзным учёным и многим университетским профессорам тоже понравилось, они просятся в днищенские журналы редакторами, а им там выдают отказы, мол, извинити, но у вас недостаточно (всего-то 200) публикаций и вы ещё не достигли того уровня днища, чтобы публиковаться в нашем журнале.
Есть, правда, и те, кто говорит, что как психотерапия всё это, может, и прекрасно, но так, чтобы прям по-настоящему, смысла в этом мало, потому что изменений в академической среде это не вызывает никаких.
...а нам с Лабубу это живо напомнило образец научной работы про разведение ящериц в провинции Гуанси, который когда-то, теперь уже не кажется, а действительно в прошлой жизни, выдавался на Кафедре истории Китая ИСАА, чтобы студенты с него списывали оформление курсовых. Идея там в принципе была та же, что если правильно оформить с резюме и ссылками любую чушь, то она будет выглядеть как научная работа.
🔥15❤3