Небольшой проект по мотивам статьи 10.7554/eLife.101886. Side-view сетап для наблюдения за сфероидами, аггрегацией клеток и тп, концепт и реализация:
— комбинация технологии агарозных лунок и side-view с помощью зеркал, места под зеркала встроены в агарозный молд
— два зеркала избавляют от необходимости бокового источника света, можно работать в лунках планшета
— можно интегрировать большее количество зеркал с двухсторонним напылением, каждое будет работать для освещения и для наблюдения
— зеркала first-surface mirrors, нарезаны вручную до нужного размера
— на видео в лунку добавлена суспензия клеток, затем клетки оседают и формируют сфероиды. Снято на инверте с инкубатором и автоматизированным фокусом
#сфероиды

AVERAGE УВБ-76 ENJOYER

⚡️⚡️⚡️ Источники в Кремле сообщили о наступлении нового года.

Замените римлян на русских и получите описание ситуации в каждой из лимитрофных пост-СССРовских республик (за исключением Белоруссии и Украины).

убран красный цвет как символ крови

Обезумевший от безнаказанности бункерный дед начал военную операцию.

Илон Маск создаёт батальон «Свобода Венесуэле».

Вставай, Каракас, прогоним янки вместе.

Призрак Каракаса сбил 3 десантных вертолёта США банкой гуакамоле.

Американские стримеры начинают продажу легендарных мачете Симона Боливара.

Макдональдс, Эпл, Виза и Мастеркард прекращают свою работу в США.

МОК запретило американским спортсменам выступать под американским флагом и гимном.

В рамках 20-го пакета российских санкций: Бараку Обаме запрещено посещать шашлычную «У Гурама».

Телеведущая «Эхо Детроита» Ксюндра Лариндер заявила, что больше не может есть на завтрак американские панкейки, так как по ее мнению эти «панкейки поддерживают войну».

Тим Кук, Марк Цукерберг, Тейлор Свифт, Бейонсе и Анджелина Джоли навсегда покинули США и переехали жить в Мытищи.

«Стыдно быть американцами, мы провалились, как нация. Мы больше не можем ни минуты жить в стране, воюющей со своими соседями» - заявили они газете «Мытищинский вестник».

Проблемы сигма-мужика-гигачада: купил шуруповёрт, к нему в комплекте шли битки нескольких размеров - и они ВСЕ И КАЖДЫЙ слизались об обычные саморезы за минуту! ПОД КОРЕНЬ ПОЧТИ СУКА.
Нашёл какие-то старые битки от ноунейм отвёртки - всё нормально вкрутилось.
Мне вот интересно - из какого блядь пластилина были сделаны битки из комплекта шуруповёрта?! Знаменитая сталь марки пластилин-3?!

С Рождеством Христовым!

Сфероиды? Органоиды? А как на счёт КУБАНОИДОВ?
https://patents.google.com/patent/US12491514B2/

Чтобы сравнивать эффекты разных веществ на биологию, например активность перспективного цитостатика на раковую культуру или эффекты вещества на какой-то фермент, биологи часто используют такую величину, как IC50. Это, грубо, при какой концентрации вещества дохнет половина клеток.

Насколько эта величина надёжно определяется? Нуууу... Если верить авторам статьи, в трети источников значения IC50 для одних мишеней (из базы ChEMBL) отличаются на порядок.

Помню эту проблему в кембле еще по g белкам. Чтобы избежать таких артефактов приходилось копаться глубоко в методиках... годах и авторах.

По годам проще... открывался подтип рецепторов и менялся тот самый радиомеченный лиганд который вытесняют из активного центра субстратом с разными концентрациями чтоб получить айси50.

Бывали авторы которые прям дичь гоняли и по сути приходилось просто выкидывать эти статьи из обучающей выборки.

А были еще авторы приколисты которые использовали концентрации в методике которые пипец как далеки от искомых айси50... делали буквально три повторности с разбросом, а потом экстраполировали нелинейную кривую... вот как раз в таких случаях и происходило отличие на порядок.

Айси50 как раз используется чтоб высчитывать Ki и бывали такие расхождения по константе... в одном источнике 6.5 в другом 7.3 в третьем 8.2... это как раз порядковые различия.

Так что когда сильные различия приходится смотреть клон клеток мишеней... искомый радиолиганд и собственно какие концентрации изучаемого использовались.