Forwarded from В 33-х парсеках от Земли
Пост по ссылке и связанный с ним вопрос в чате мне напомнили о паре случаев.
Однажды у нас посередине эксперимента изменилась локализация одного регуляторного белка, слитого с GFP, как раз в клетках линии остеосаркомы U2OS. В первых экспериментах в норме белок был равномерно распределен в цитозоле, а при стрессах шел к лизосомам - зато потом он все время был колокализован с митохондриями.
В другом случае я получала с помощью лентивирусной трансдукции сенсор на митофагию из линии человеческих легочных фибробластов MRC5, иммортализованных большим Т-антигеном вируса SV40. Способ иммортализации убил р53 и ретинобластому в клетках, соответственно, нарушив G1-чекпоинт и репарацию ДНК. К этому могут добавиться последствия инсерционного мутагенеза при встраивании лентивирусного вектора. И мы имели возможность последствия геномной нестабильности увидеть в микроскоп.
Сенсор - химерный белок mCherry-GFP-FIS1, который окрашивает митохондрии в желтый цвет. Я регулярно наблюдала в культуре клетки, в которых митохондрии светятся только красным, что говорит о том, что в GFP что возникает мутация и он перестает светится. Пару раз я встречала только зеленые клетки, что говорило об аналогичной мутации в mCherry. Но однажды произошла любопытная вещь: спустя некоторое число пассажей вместо желтых митохондрий мы обнаружили, что в клетках цитоплазма равномерно окрашена в красный цвет, что говорило о том, что GFP сломался посередине, а mCherry и FIS1, отвечающий за митохондриальную локализацию репортера, транслировались отдельно. Нонсенс-мутация выглядит невероятной, так что, скорее всего, это или хромосомная перестройка, или мутация в GFP, которая привела к появлению 2A-сайта.
#лабораторный_могул
Однажды у нас посередине эксперимента изменилась локализация одного регуляторного белка, слитого с GFP, как раз в клетках линии остеосаркомы U2OS. В первых экспериментах в норме белок был равномерно распределен в цитозоле, а при стрессах шел к лизосомам - зато потом он все время был колокализован с митохондриями.
В другом случае я получала с помощью лентивирусной трансдукции сенсор на митофагию из линии человеческих легочных фибробластов MRC5, иммортализованных большим Т-антигеном вируса SV40. Способ иммортализации убил р53 и ретинобластому в клетках, соответственно, нарушив G1-чекпоинт и репарацию ДНК. К этому могут добавиться последствия инсерционного мутагенеза при встраивании лентивирусного вектора. И мы имели возможность последствия геномной нестабильности увидеть в микроскоп.
Сенсор - химерный белок mCherry-GFP-FIS1, который окрашивает митохондрии в желтый цвет. Я регулярно наблюдала в культуре клетки, в которых митохондрии светятся только красным, что говорит о том, что в GFP что возникает мутация и он перестает светится. Пару раз я встречала только зеленые клетки, что говорило об аналогичной мутации в mCherry. Но однажды произошла любопытная вещь: спустя некоторое число пассажей вместо желтых митохондрий мы обнаружили, что в клетках цитоплазма равномерно окрашена в красный цвет, что говорило о том, что GFP сломался посередине, а mCherry и FIS1, отвечающий за митохондриальную локализацию репортера, транслировались отдельно. Нонсенс-мутация выглядит невероятной, так что, скорее всего, это или хромосомная перестройка, или мутация в GFP, которая привела к появлению 2A-сайта.
#лабораторный_могул
Forwarded from AARDVARK
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Ровно 20 лет назад вышел великий Morrowind, задавший высочайшую планку для РПГ и игр с открытым миром.
Миром, в котором ты был мало чем ограничен и где тебе не очень-то рады.
Миром, где ты можешь как довольно быстро убить божество или двух, так и принять смерть от грязекраба.
Миром, где ты можешь помимо квестов, просто гулять, слушать крики Силт Страйдеров, охотиться на скальных наездников, наслаждаться видами Аскадианских островов, собирая грибы и травы или купить кошко-раба или рабыню редгардку.
Как свет Солнца, проходя сквозь кристалл лунного сахара, превращается в танец множества цветов, так и 3-я часть Древних свитков стала настоящим культом, порождающим смежные культы внутри культов.
Возрадуемся, что однажды волею Шигората вместе идеально сошлись люди, ресурсы и конечно же талант гениального композитора Джереми Соула.
НАС ВЫПУСТЯТ
ЭТО ТОЧНО!
Миром, в котором ты был мало чем ограничен и где тебе не очень-то рады.
Миром, где ты можешь как довольно быстро убить божество или двух, так и принять смерть от грязекраба.
Миром, где ты можешь помимо квестов, просто гулять, слушать крики Силт Страйдеров, охотиться на скальных наездников, наслаждаться видами Аскадианских островов, собирая грибы и травы или купить кошко-раба или рабыню редгардку.
Как свет Солнца, проходя сквозь кристалл лунного сахара, превращается в танец множества цветов, так и 3-я часть Древних свитков стала настоящим культом, порождающим смежные культы внутри культов.
Возрадуемся, что однажды волею Шигората вместе идеально сошлись люди, ресурсы и конечно же талант гениального композитора Джереми Соула.
НАС ВЫПУСТЯТ
ЭТО ТОЧНО!
Forwarded from Medach Career
Сотрудник в научную группу (#Москва)
Группа экспрериментальной биотерапии и диагностики, Института Регенеративной Медицины, Сеченовского Медицинского Университета( г. Москва) ищет сотрудника(лаборант или мнс) для выполнения проектов по планам группы. Ссылки на публикации отражены ниже.
В группе изучаются основы резистентности опухолей взрослых и детей к текущим терапевтическим подходам, молекулярные механизмы выживаемости опухолевых клеток в условиях стресса, разработка основ преодоления опухолевой резистентности и адаптации экспериментальными подходами (вирусные векторы, стволовые клетки, аптамеры, наночастицы) используая in vitro, и in vivo опухолевые модели.
Знание английского языка не ниже: чтение и перевод со словарем.
Дополнительно обязанности сотрудника будут включать обучение студентов Сеченовского Университета и Биомедицинского клуба основам молекулярной и клеточной биологии, вирусологии и др, руководство курсовыми и дипломами, написание научных статей в иностранные научные журналы.
Возможно также поступление в аспирантуру и соискательство ученой степени
Оставляйте отклик через сайт medach.pro либо обращайтесь напрямую Уласову Илье Валентиновичу по телефону +7(901) 797-5406 или по электронной почте: ulasov75@yahoo.com
Откликнуться
Публикации научной группы
MicroRNA 345 (miR345) regulates KISS1-E-cadherin functional interaction in breast cancer brain metastases
TMZ regulates GBM stemness via MMP14-DLL4-Notch3 pathway
Tamoxifen overrides autophagy inhibition in Beclin-1-deficient glioma cells and their resistance to adenovirus-mediated oncolysis via upregulation of PUMA and BAX
Editing Cytoprotective Autophagy in Glioma: An Unfulfilled Potential for Therapy
Genes that Mediate Metastasis across the Blood-Brain Barrier
Группа экспрериментальной биотерапии и диагностики, Института Регенеративной Медицины, Сеченовского Медицинского Университета( г. Москва) ищет сотрудника(лаборант или мнс) для выполнения проектов по планам группы. Ссылки на публикации отражены ниже.
В группе изучаются основы резистентности опухолей взрослых и детей к текущим терапевтическим подходам, молекулярные механизмы выживаемости опухолевых клеток в условиях стресса, разработка основ преодоления опухолевой резистентности и адаптации экспериментальными подходами (вирусные векторы, стволовые клетки, аптамеры, наночастицы) используая in vitro, и in vivo опухолевые модели.
Знание английского языка не ниже: чтение и перевод со словарем.
Дополнительно обязанности сотрудника будут включать обучение студентов Сеченовского Университета и Биомедицинского клуба основам молекулярной и клеточной биологии, вирусологии и др, руководство курсовыми и дипломами, написание научных статей в иностранные научные журналы.
Возможно также поступление в аспирантуру и соискательство ученой степени
Оставляйте отклик через сайт medach.pro либо обращайтесь напрямую Уласову Илье Валентиновичу по телефону +7(901) 797-5406 или по электронной почте: ulasov75@yahoo.com
Откликнуться
Публикации научной группы
MicroRNA 345 (miR345) regulates KISS1-E-cadherin functional interaction in breast cancer brain metastases
TMZ regulates GBM stemness via MMP14-DLL4-Notch3 pathway
Tamoxifen overrides autophagy inhibition in Beclin-1-deficient glioma cells and their resistance to adenovirus-mediated oncolysis via upregulation of PUMA and BAX
Editing Cytoprotective Autophagy in Glioma: An Unfulfilled Potential for Therapy
Genes that Mediate Metastasis across the Blood-Brain Barrier
https://gallantlab.org/huth2016/
Семантическая карта головного мозга. Люди заморочились и составили примерный атлас смысловых связей по откликам на фМРТ + привязали его к структурам мозга, с градацией по активности.
https://www.nature.com/articles/nature17637
Апдейт - добавил ссылку на более раннюю публикацию этой же группы, где есть первый концепт семантической карты, но без привязки к 3D структуре:
https://gallantlab.org/_downloads/2012.Huth.etal1.pdf
Семантическая карта головного мозга. Люди заморочились и составили примерный атлас смысловых связей по откликам на фМРТ + привязали его к структурам мозга, с градацией по активности.
https://www.nature.com/articles/nature17637
Апдейт - добавил ссылку на более раннюю публикацию этой же группы, где есть первый концепт семантической карты, но без привязки к 3D структуре:
https://gallantlab.org/_downloads/2012.Huth.etal1.pdf
Nature
Natural speech reveals the semantic maps that tile human cerebral cortex
Nature - It is thought that the meanings of words and language are represented in a semantic system distributed across much of the cerebral cortex. However, little is known about the detailed...
❤1
https://en.wikipedia.org/wiki/Pitch_drop_experiment
С удивлением узнал о нескольких почти параллельных экспериментов по теме супервязких жидкостей - до этого думал, что он проводится лишь в Австралии. Жаль в русской версии вики о них ни слова.
С удивлением узнал о нескольких почти параллельных экспериментов по теме супервязких жидкостей - до этого думал, что он проводится лишь в Австралии. Жаль в русской версии вики о них ни слова.
Forwarded from Пировалероновый Дзен 2.0: Нейробуддизм (O'Caide Sin Do'n Te Sin Nach Mbaineann Sin Do)
Я вам биохак принёс
https://youtu.be/JRjSyMXXN-o - интересное видео о фальсификациях в публикациях, каким-то образом прошедших ревью.
В биологии было много скандалов с невоспроизводимыми результатами, но обычно они касались каких-то фундаментальных вещей с претензией на прорыв, вроде многочисленных способов получения стволовых клеток с помощью простых веществ.
В классической органической химии проверить подлог проще простого - времени на проведение эксперимента тратится гораздо меньше, чем в биологии, равно как и стоимость расходников совершенно несопоставима - здесь химики выигрывают по многим статьям.
Таким образом, целенаправленный "фильтр на воспроизводимость" в биологии (особенно - если речь идёт о какой-то уточняющей статье, или статье без заявки на прорывное открытие), к сожалению, невозможен.
В биологии было много скандалов с невоспроизводимыми результатами, но обычно они касались каких-то фундаментальных вещей с претензией на прорыв, вроде многочисленных способов получения стволовых клеток с помощью простых веществ.
В классической органической химии проверить подлог проще простого - времени на проведение эксперимента тратится гораздо меньше, чем в биологии, равно как и стоимость расходников совершенно несопоставима - здесь химики выигрывают по многим статьям.
Таким образом, целенаправленный "фильтр на воспроизводимость" в биологии (особенно - если речь идёт о какой-то уточняющей статье, или статье без заявки на прорывное открытие), к сожалению, невозможен.
Forwarded from Антон Смирнов
Кто хотел попасть на нашу школу по рнк-сек, но не успел, вот ссылка на записи
https://disk.yandex.ru/d/F8Kr6uAL0hJAvA
Сайт школы
https://www.school-ngs.online/main
https://disk.yandex.ru/d/F8Kr6uAL0hJAvA
Сайт школы
https://www.school-ngs.online/main
Яндекс Диск
Школа по биоинформатике
Посмотреть и скачать с Яндекс Диска
Однажды красил линию HCT 15 на MSH6. Зачем - не помню, за давностью лет, но во-первых - это красиво
Forwarded from Кружок Пейпеца
Вы наверно замечали, что девочки спортсменки подростки зачастую отстают в половом развитии от сверстниц. В глаза мне всегда бросались профессиональные гимнастки с низким процентом жира. Оказывается там очень хитрая связь: дело в том, что при снижении массы тела ниже 10% от нормы, нарушается секреция лептина, которые в свою очередь выступает в качестве положительного модулятора кисспептиновой системы. P. S. Кисспептиновая система ключевой участник регуляции гонадостата, это такой аналог термостата только для пульсовой активности гонадотропин-релизинг нейронов, и её гипоактивация рассматривается как патофизиологическая основа для задержки полового развития, снижения либидо, гипогонадотропного гипогонадизма. Привет всём участницам чатиков 40 кг и любительницам заесть свои проблемы флуоксетином.