Zmall Pharma
3.38K subscribers
2.08K photos
113 videos
207 files
1.36K links
Заметочки
Кто хочет задать вопросы, прорекламиться - smallpharm@protonmail.com (почта с Mail.ru и корпоративных адресов может не дойти)

Место для дискуссий -
https://t.me/smallpharm_talk

Место для интересностей -
https://sponsr.ru/smallpharma/
Download Telegram
Forwarded from БиоКотик
2 рис. "родословная" ходжикинии у цикад Magicicada
3 рис. редукция генома у эндосимбионтов
4. 5. рис бактериом, бактериоциты
Forwarded from БиоКотик
РАЩЕПЛЕНИЕ ГЕНОМА ЭНДОСИМБИОНТА ЦИКАД
Эндосимбионт — микроорганизм, живущий внутри другого организма (хозяина) и приносящий ему пользу.
Бактериом — специализированный орган некоторых насекомых, в котором находятся эндосимбиотические бактерии. Бактериом содержит специализированные клетки, называемые бактериоциты — клетки в которых присутствуют прокариотические эндосимбиотические организмы.

Внутри цикад в специальных органах бактериомах живут бактерии-эндосимбионты Sulcia muelleri (шульция) и Hodgkinia cicadicola (Ходжикиния). Они производят десять аминокислот, которые отсутствуют в растительном соке – любимом напитке цикад. Без этих микробов насекомым не выжить. Бактериям тоже не выжить вне хозяев – слишком много генов они утратили за миллионы лет уютного эндосимбиоза.

Но вот у пушистой южноамериканской цикады Tettigades undata Hodgkinia (ходжикиния) каким-то образом распалась на две версии – назовем их «ходж» и «киния» – со своим набором предковых генов у каждой. Только вместе эти две половинки некогда единого целого могут обеспечить цикаду аминокислотами, которые обычно производятся цельногеномной ходжкинией.
У одних видов цикад две версии бактерии, у других – три, четыре, шесть. У периодических цикад – не меньше 20: у 17-летних нашлось от 27 до 39 геномных колечек с разным набором генов, у 13-летних – от 26 до 42, но вполне может быть и больше.
Таким образом, каждая периодическая цикада представляет собой совокупность множества видов: собственно цикада, шульция и бог весть сколько версий ходжкинии – «ходжк», «оджки», «жкини», «иния», «ход», «джк», «кин», «ния», «хо», «дж», «ки», «ни», «я» и т. п.! Ни одна из этих версий не будет полезной сама по себе – цикаде нужен почти полный их комплект, чтобы получать нужные аминокислоты. И когда самки десятого выводка будут откладывать яйца, в каждое из них придется пихать как можно больше этих бактерий, чтобы повысить шансы на сборку необходимого комплекта. Это оборачивается не только лишними тратами энергии, но и дефицитом места для другого важного симбионта – шульции. И это при том, что ходжкинии производят всего две, а шульции – восемь из десяти недостающих цикаде аминокислот!

Из всех известных бактерий, состоящих в симбиозах с насекомыми, только ходжкиния расщепляется с таким патологическим энтузиазмом. Это может быть связано с относительно длительным жизненным циклом ее хозяев: чем дольше жизнь – тем выше вероятность редкого эволюционного события, такого как расщепление генома эндосимбионта. И в этом нет ничего хорошего для цикад. Вместо одной ходжкинии им приходится управляться с целым ворохом недоходжкиний, случайная утеря одной из которых может привести к коллапсу всей симбиотической системы. Со временем геном ходжкинии наверняка будет крошиться еще пуще, и это рано или поздно приведет к вымиранию периодических цикад.
https://batrachospermum.ru/2021/05/cicada-hodgkinia/
Zmall Pharma pinned Deleted message
Факты об искусстве цитометрии и просто FACS:
- для качественно исполненной Aria часто надо плясать с бубном - for better performance;
- нередко результаты - просто Canto;
- а программа для сбора и обработки данных - Diva дивная;
- сначала ты работаешь на Jazz, а завтра уезжаешь на PhD или постдок;
- а Symphony обеспечивает максимальную широту спектра флуорохромов и эмоций из-за недостаточной компенсации в данных и психике.
Еще срели цитометров и сортеров этой фирмы есть Melody и Celesta.

Интересно, кто в Becton Dickinson настолько любил музыку, что так назвал эти шедевры технической мысли?
Впрочем, название одного из ранних приборов BD, FACSCalibur, отсылает нас уже к литературе - артуриане: кто справился с лазерным мечом, тот вышел не на щите, а со щитом.
https://www.nature.com/articles/s41598-019-42529-8

ДОГАДАЛИСЬ ЧТО МОЖНО ПРОКАЧИВАТЬ КОЛЛАГЕНАЗУ ЧЕРЕЗ МИКРОФЛЮИДНЫЕ ДЕВАЙСЫ
@
СТАТЬЯ В NATURE

Что-то здесь не так с этим миром.
Nachtmahr - это если бы СРИГН или Австро-Венгрия дожила до киберпанка.
Люблю их)
Forwarded from Микола Канян
Когда мне было 20 лет, реклама всевозможных ретродискотек 1970х-1980х заставляла меня гадать, как же будут выглядеть ретродискотеки для моего поколения. Теперь я знаю как.
Forwarded from NanoBioSmartLab
Towards microRNA-based therapeutics in cancer

🗓 Wed, December 01, 2021
12:00 PM - 1:30 PM
 EST / 8:00 PM - 9:30 PM

MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs that regulate gene expression to control important aspects of development and metabolism, such as cell differentiation, apoptosis, and lifespan. Various microRNAs, including let-7, miR-34, miR-21, and miR-155 are implicated in human cancers. Specifically, human let-7 and miR-34 are poorly expressed or deleted in lung cancer, and their over-expression in lung cancer cells inhibits their growth. Further, let-7 and miR-34 regulate the expression of important oncogenes implicated in lung cancer, suggesting a mechanism for their involvement in cancer.

In this virtual seminar you will learn about:
🧬Properties and functions of microRNAs
🧬Roles for microRNAs in cancer
🧬Methods for detecting and studying microRNAs

🌐 Register

#обучение #webinar #вебинар
Оказывается, можно отжать митохондрии. А дальше надо исследовать, можно ли споткнуться о свободные митохондрии, как о почку.
Forwarded from InScience.News
Американские ученые обнаружили, что раковые клетки могут высасывать митохондрии из иммунных клеток с помощью особых нанотрубок-щупалец. Это подавляет иммунную систему и позволяет опухолям расти. Однако если не дать раковым клеткам вытащить митохондрии, то развитие болезни останавливается.

О том, как ученые пришли к этому открытию и как оно может помочь при терапии рака, читайте на InScience.News: https://inscience.news/ru/article/world-science/biology/8083
Моё отношение к пульверизаторам науки
Они крутые) С одним сотрудником из их лаборатории работал раньше - рекомендую!
Forwarded from Ilya Sokolov
Лаборатория в University of Cambridge ищет Senior Research Associate (к.ф.-м.н./к.б.н./к.х.н.)! Мы заинтересованы в человеке, имеющем большой опыт в вычислительной биологии (в особенности, обработка и применение ML к данным NGS). Плюсом будет технический бэкграунд, владение одним и более языком программирования (c++, python, bash, perl, php), знание вычислительных методов в структурной биологии и опыт работы с администрированием серверов. Из экспериментальных методов приветствуются навыки в области молекулярного клонирования и генной инженерии, но в целом наличие опыта в мокрой биологии не критично.
https://www.jobs.cam.ac.uk/job/32250/
В ТВОИХ РУКАХ СТОИТ ПО ЧИПУ
@
ТЫ СОБРАЛ VR-СЕТ ЧИСТО ДЛЯ ТОГО, ЧТОБ ЕБАШИТЬ ДАННЫЕ
@
В ТВОЕЙ КРОВИ БОЛТАЮТСЯ НЕ ПРОШЕДШИЕ КИ ПРЕПАРАТЫ ДЛЯ ПОВЫШЕНИЯ УРОВНЯ КОГНИТИВНЫХ СПОСОБНОСТЕЙ И ПРОДЛЕНИЯ ЖИЗНИ
@
ТЫ ЗАПЛАНИРОВАЛ ОПЕРАЦИЮ ПО КОРРЕКЦИИ ЗРЕНИЯ, ДАБЫ ПРЕОДОЛЕТЬ СВОЮ ВЕЧНУЮ БЛИЗОРУКОСТЬ И ЧИТАТЬ ЭТОТ МИР ПОПИКСЕЛЬНО
@
КОПИШЬ НА ГЕНОМОД ИМЕНИ ЛИЗЫ ПЕРРИШ, ЗНАЯ, ЧТО ОНА НЕ ДАСТ
@
ЧИТАЕШЬ, КАК ФАНАТКА ПЕДОВОК ПЕРЕПИЛА ЯГИ И ПЕРЕКУРИЛАСЬ ОДНОРАЗОВЫМИ ВЕЙПАМИ
@
ЗАВТРА В БАРОКАМЕРЕ БУДЕТ НЕ +30
Forwarded from Холархия
Мемная кривая IQ: давайте выпишем тупых из реакции. Часть вторая — деакселерация

У Лукьяненко в книжке «Звезды - холодные игрушки» была цивилизация Геометров — пародия на человечество из «Полдень, XXII век» Стругацких. Ребята отличались особым подходом к контактам с другими цивилизациями. У них существовал институт Регрессоров — особый культурный спецназ, который занимался тем, что внедрялся к другим инопланетным цивилизациям и замедлял их научно-техническое развитие, чтобы они вошли в империю Геометров не как равные, а как дорогие «Друзья». Как всегда, даже средняя научная фантастика показывает реальные тенденции лучше, чем истории политологов, экономистов и прочих международных отношателей, ведь Регрессоры реально существуют и работают против нас.

Вы, дорогие читатели Холархии, не поверите, но есть персонажи в условно правой тусовке, друзья целого Дугина, которые буквально считают развитие русской науки в России силами русских чем-то плохим. Эти куски говна изобретают изощренные теории заговора, чтобы русские дохли от ковида, а русские ученые строили карьеру по принципу «Диплом-чемодан-аэропорт-Вашингтон». То есть реально, искусственный интеллект, изучение мозга, большие данные в медицине, генетическое редактирование — все придумано мировым лобби трансгуманистов (да, теми самыми, которые трупами в снежки играют). Почему-то это как раз те области, которые активно развиваются в РФ сейчас, а не те, что были развиты ранее, вроде атомной физики, и не те, которые значительно отстают, например, энергосберегающие технологии. Совпадение? Не думаю.

Имеджн: ты русский ученый из центра Гамалеи. Ебнул ковид окда, ты начал пилить вакцину. Запилил шикарную вакцину, выкатил на клинические испытания, прекрасно понимая, что большая часть этого процесса избыточна, но этого требует закон. Закон в силу эпидемии удалось немного подвинуть, и клинические испытания шли параллельно с началом вакцинации населения. И началось. Сначала порриджи-либерахи обозвали чудо отечественных биотехнологий «путинской жижей» и сагитировали либерально настроенную часть народа не прививаться. Затем, когда уже порриджи побежали за укольчиком, подключились ебанашки, почуявшие запах денег, и начали справки толкать или сливать вакцину в апельсины. В итоге привившие апельсин порриджи, долбоебы с покупной справкой и прочие одаренные личности мало того, что дохнут сами, а в статистике смертности идут как привитые, так еще и формируют резервуар для вируса, который эволюционирует в сторону снижения эффективности твоей вакцины. Охуенно, да? Уже мотивирует спиздить трактор, когда границы откроют?

Я надеюсь, что все, кто читает этот текст, понимают, что продвигать через свой медиаресурс идею о том, что русским не следует конкурировать в высоких технологиях с Западом — буквально русофобия и предательство Родины. Полагаю, что читателям Холархии это объяснять не требуется, а если надо объяснять, то не надо объяснять. Подобных «специалистов по искусственному интеллекту» и «борцов с цифровым Левиафаном» (с максимально соборным американским непрофильным образованием — если уж это не подозрительно для маленьких любителей конспирологии, то как читать-то научились, лол) нужно гнать отовсюду ссаными тряпками. Dixi.

Железный @biolapki — специально для Холархии.

Подписаться | Написать нам | Стать патроном
Адепты церкви св. Греты Тунберг утверждают, что любые углеводороды опасны и вообще гроб-гроб-кладбище.
Это происходит из-за фундаментального непонимания микробиологии. А в особенности, такой дисциплины как биотрансформация органических соединений в почве.
Суть в том, что довольно много почвенных бактерий способны к терминальному (или субтерминальному) окислению линейных углеводородов. Что касается же ароматических соединений, особенно у которых есть метильные или гидроксильные группы, за которые могут "зацепиться" ферменты - тут то же самое. Причём в большинстве случаев реакции идут вплоть до раскрытия бензольного кольца и ассимиляции этого соединения как источника углерода в клетке.
Пролили на землю ксилол? Не беда - в огромном почвенном микробиоме найдутся бактерии, способные его сожрать.
Более того - даже банальная синегнойная палочка (Pseudomonas aeruginosa) демонстрирует довольно широкую специфичность к углеводородным субстратам.
"Бактерии разлагающие нефть" - это не миф, и не святой Грааль экологической биотехнологии, а вполне себе обыденная реальность. Единственное, к чему все стремятся, так это к повышению % концентрации субстрата, при котором эти бактерии способны эффективно делать своё дело.