Forwarded from Молбиол, биоинформатика, life science
pluripotent-stem-cell-protocol-handbook.pdf
4.8 MB
#протокол работы с iPSC от Thermo Fisher
Переболел тут простудой, и решил задуматься о душе. А именно - о первородном антигенном грехе.
Видите ли, наша иммунная система, встречаясь с каким-либо патогеном (будь то вирус или бактерия), "запоминает" успешные варианты антител для борьбы с ним.
Клетки памяти иммунной системы спокойно живут в организме до повторной встречи с патогеном... и становятся обузой для развития нормального иммунного ответа.
Суть в том, что за время, прошедшее с первой встречи организма с инфекционным агентом, сама эта бактерия (или вирус) могли значительно изменить состав репертуара поверхностных антигенов - либо за счёт изменения соотношения экспонированных белков (преимущественно в случае бактерий или даже простейших), либо за счёт мутаций - однонуклеотидных замен (в случае вирусов).
Организм "будит" клетки памяти (т.н. Т-cell зависимая активация), и они начинают активно вырабатывать антитела, но которые эффективны лишь к предыдущей версии патогена. Причём, что интересно - В-клетки, которые пытаются заявить "ну это самое, у нас как бы антиген изменился вообще-то" - проигрывают в селекции.
В итоге получается, что даже если организм до этого встречался с инфекцией - иммунный ответ при повторной встрече может быть хуже.
Видите ли, наша иммунная система, встречаясь с каким-либо патогеном (будь то вирус или бактерия), "запоминает" успешные варианты антител для борьбы с ним.
Клетки памяти иммунной системы спокойно живут в организме до повторной встречи с патогеном... и становятся обузой для развития нормального иммунного ответа.
Суть в том, что за время, прошедшее с первой встречи организма с инфекционным агентом, сама эта бактерия (или вирус) могли значительно изменить состав репертуара поверхностных антигенов - либо за счёт изменения соотношения экспонированных белков (преимущественно в случае бактерий или даже простейших), либо за счёт мутаций - однонуклеотидных замен (в случае вирусов).
Организм "будит" клетки памяти (т.н. Т-cell зависимая активация), и они начинают активно вырабатывать антитела, но которые эффективны лишь к предыдущей версии патогена. Причём, что интересно - В-клетки, которые пытаются заявить "ну это самое, у нас как бы антиген изменился вообще-то" - проигрывают в селекции.
В итоге получается, что даже если организм до этого встречался с инфекцией - иммунный ответ при повторной встрече может быть хуже.
Forwarded from Annette Birkin Research-lab
Проблема подбора донора и трансплантации костного мозга среди метисов [подборка, ч. 1/2]
Подборка состоит из научных исследований, статистических данных, а также конкретных личных примеров пациентов расово-смешанного происхождения, страдающих от разных тяжелых заболеваний, требующих трансплантации костного мозга и, как следствие, от невозможности поиска соответствующего донора. Данные примеры подаются ниже в виде статей без сокращения. Они призваны наглядно продемонстрировать проблемы пациентов разных расовых комбинаций (напр. белый-азиат, белый-негр, белый-индеец, белый-араб и т.п.)
Результат исследования доказывает, что людям расово-смешанного происхождения труднее найти подходящего донора для трансплантации костного мозга. Более того, ввиду генетической разницы и отличия иммунных систем у разных рас, метисам необходимо искать донора именно такой же расовой комбинации, как и они сами, что в некоторых случаях составляет нулевой шанс. И это при том, что метисы изначально, по своей природе, чаще подвергаются развитию различных смертельных заболеваний.
https://telegra.ph/Problemy-metisov-10-03
tg. #расовое_смешение
Подборка состоит из научных исследований, статистических данных, а также конкретных личных примеров пациентов расово-смешанного происхождения, страдающих от разных тяжелых заболеваний, требующих трансплантации костного мозга и, как следствие, от невозможности поиска соответствующего донора. Данные примеры подаются ниже в виде статей без сокращения. Они призваны наглядно продемонстрировать проблемы пациентов разных расовых комбинаций (напр. белый-азиат, белый-негр, белый-индеец, белый-араб и т.п.)
Результат исследования доказывает, что людям расово-смешанного происхождения труднее найти подходящего донора для трансплантации костного мозга. Более того, ввиду генетической разницы и отличия иммунных систем у разных рас, метисам необходимо искать донора именно такой же расовой комбинации, как и они сами, что в некоторых случаях составляет нулевой шанс. И это при том, что метисы изначально, по своей природе, чаще подвергаются развитию различных смертельных заболеваний.
https://telegra.ph/Problemy-metisov-10-03
tg. #расовое_смешение
Telegraph
Проблема подбора донора и трансплантации костного мозга среди метисов [подборка, ч. 1/2]
Подборка состоит из научных исследований, статистических данных, а также конкретных личных примеров пациентов расово-смешанного происхождения, страдающих от разных тяжелых заболеваний, требующих трансплантации костного мозга и, как следствие, от невозможности…
Forwarded from Annette Birkin Research-lab
Проблема подбора донора и трансплантации костного мозга среди метисов [подборка, ч. 2/2]
С увеличением числа расового разнообразия, проблема усугубляется и возникает больше типов, которым трудно отыскать соответствие. Метисы сразу нескольких расовых комбинаций имеют ещё более низкие шансы. Например, белая мать ребенка смешанной расы будет иметь даже куда больше генетического сходства со случайным белым человеком на улице, нежели со своим собственным ребенком.
https://telegra.ph/Problema-podbora-donora-i-transplantacii-kostnogo-mozga-sredi-metisov-podborka-ch-22-10-03
tg. #расовое_смешение
С увеличением числа расового разнообразия, проблема усугубляется и возникает больше типов, которым трудно отыскать соответствие. Метисы сразу нескольких расовых комбинаций имеют ещё более низкие шансы. Например, белая мать ребенка смешанной расы будет иметь даже куда больше генетического сходства со случайным белым человеком на улице, нежели со своим собственным ребенком.
https://telegra.ph/Problema-podbora-donora-i-transplantacii-kostnogo-mozga-sredi-metisov-podborka-ch-22-10-03
tg. #расовое_смешение
Telegraph
Проблема подбора донора и трансплантации костного мозга среди метисов [подборка, ч. 2/2]
VI. Раса имеет значение, когда пациенту требуется трансплантация стволовых клеток или костного мозга. Текст: Артур Аллен, 5 августа 2013 г. Источник: http://articles.washingtonpost.com/2013-08-05/national/41085742_1_stem-jeffrey-chell-ancestorshttps://we…
Forwarded from Annette Birkin Research-lab
Следует отметить, что почти 90% старых содержательных новостных статей попросту удалены из крупных ресурсов (примерно в 2012-2015 годы) и доступны разве что через Way back machine (сайт web.archive).
Либеральная система США пытается стирать любые признаки и факты, свидетельствующие о строгих расовых различиях, стоящие у них как бельмо на глазу, однако, что примечательно, многочисленные донорские кампании, из года в год устраиваемые родителями ради спасения своих смешанных чад, никоим образом не дают об этом забыть. И чем дальше, тем больше. СМИ вроде бы и охотно идут на помощь "diversity-семьям", но при этом явно кривясь, т.к. за этим следует необходимость объяснять проблемы генетической несовместимости какого-нибудь маленького метиса с миллионами донорского материала в крупных регистрах, которые постоянно пополняются разнообразным материалом, заметно не решая проблему.
Либеральная система США пытается стирать любые признаки и факты, свидетельствующие о строгих расовых различиях, стоящие у них как бельмо на глазу, однако, что примечательно, многочисленные донорские кампании, из года в год устраиваемые родителями ради спасения своих смешанных чад, никоим образом не дают об этом забыть. И чем дальше, тем больше. СМИ вроде бы и охотно идут на помощь "diversity-семьям", но при этом явно кривясь, т.к. за этим следует необходимость объяснять проблемы генетической несовместимости какого-нибудь маленького метиса с миллионами донорского материала в крупных регистрах, которые постоянно пополняются разнообразным материалом, заметно не решая проблему.
Ночной хадис на тему интересных инфекций.
Теперь расскажем вам про не летальный(!) вид вирусного менингита. Любите и жалуйте - лимфоцитарный хориоменингит, вызываемый ареновирусом (он же LCMV).
По своему типу это типичнейшая зооантропонозная инфекция - естественным резервуаром являются грызуны. В принципе, всё как обычно - передаётся либо со слюной и выделениями, либо при вдыхании пыли с мест обитания носителей.
По клинике - ну типичнейший менингит, ничем не отличается, характернейший набор симптомов с временными полинейропатиями. Летальность - минимальная.
На этом месте внимательный читатель задаст вопрос - а почему же поражается только мозг и вообще нервная система? Видите ли, входными воротами вируса является белок дистрогликан, который экспрессируется, главным образом в ЦНС (префронтальная кора, обонятельная луковица). Практически не поражаются структуры ствола мозга.
Интересный факт - уровень экспрессии дистрогликана также высок в лёгких и тестикулах, но почему-то пневмония в списке симптомов не фигурирует. Развёрнутой формы орхита также не наблюдается, поражения половых органов редки.
Теперь расскажем вам про не летальный(!) вид вирусного менингита. Любите и жалуйте - лимфоцитарный хориоменингит, вызываемый ареновирусом (он же LCMV).
По своему типу это типичнейшая зооантропонозная инфекция - естественным резервуаром являются грызуны. В принципе, всё как обычно - передаётся либо со слюной и выделениями, либо при вдыхании пыли с мест обитания носителей.
По клинике - ну типичнейший менингит, ничем не отличается, характернейший набор симптомов с временными полинейропатиями. Летальность - минимальная.
На этом месте внимательный читатель задаст вопрос - а почему же поражается только мозг и вообще нервная система? Видите ли, входными воротами вируса является белок дистрогликан, который экспрессируется, главным образом в ЦНС (префронтальная кора, обонятельная луковица). Практически не поражаются структуры ствола мозга.
Интересный факт - уровень экспрессии дистрогликана также высок в лёгких и тестикулах, но почему-то пневмония в списке симптомов не фигурирует. Развёрнутой формы орхита также не наблюдается, поражения половых органов редки.
До чего дошла глобализация: на презентации KAUST (универ в Саудовской Аравии) ведущие (англичанка и китаец) поясняют за Woman Club и Stress Consulting для иностранных студентов.
https://tehclub.site/products/mcdonnell-douglas-f-4-phantom-ii
Котики, а накидайте доната в биткоинах на покупку демилитаризованного истребителя, а? Ну позязя :3
Котики, а накидайте доната в биткоинах на покупку демилитаризованного истребителя, а? Ну позязя :3
Техклуб
McDonnell Douglas F-4 Phantom II, продажа, цена 2 950 000$
Купить McDonnell Douglas F-4 Phantom II, б/у, смотреть фото. Продается самолет McDonnell Douglas F-4 Phantom II 1959 года выпуска. Это единственный в мире частный фантом F-4, способный летать. Демилитаризованный, не является вооружением. McDonnell Douglas…
10.887940.pdf
175.2 KB
Недавно я писал о создании методами фотолитографии поверхностей, на которых шванновские клетки располагались строго полосами.
Оказывается, ещё раньше было исследование, где с помощью того же метода создали узор в горошек, с помощью которого было установлено, что оптимальным расстоянием между адгезивными и неадегезивными зонами, минимизирующим контакты клеток между ними, является 50-90 мкм.
Оказывается, ещё раньше было исследование, где с помощью того же метода создали узор в горошек, с помощью которого было установлено, что оптимальным расстоянием между адгезивными и неадегезивными зонами, минимизирующим контакты клеток между ними, является 50-90 мкм.
Forwarded from Три звезды
На фоне разговоров о том, что все больше патогенных бактерий приобретают устойчивость к используемым антибиотикам, и потому мы все умрем, эта статья выглядит достаточно обнадеживающей:
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)01058-8
В общем, открытый почти 70 лет назад и никому не интересный из-за своей низкой активности антибиотик вдруг оказался очень активным против спирохет (в частности, против боррелий). Наверняка это не единственный такой пример, и, наверное, за 70 лет люди успели понаоткрывать кучу таких "малоактивных" антибиотиков. Так что, если проскринить коллекцию на большем количестве патогенов, то может еще что-нибудь годное найдется.
#читаювсякоеговно
Если почитать некоторых популярных блогеров, то оказывается, что использование антибиотиков без указаний врача приравнивается к смертному греху. Мне эта точка зрения кажется несколько ограниченной. Я, например, мажу прыщи синтомициновой мазью (неплохо помогает, кстати). И что, мне реально предлагается идти к врачу за рецептом каждый раз, когда у меня на ебальнике вскакивает прыщ? Или, к примеру, иногда люди по разным причинам прутся в места, где врачей поблизости не наблюдается, и антибиотики берутся с собой на всякий случай. Мне этот подход представляется оправданным.
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)01058-8
В общем, открытый почти 70 лет назад и никому не интересный из-за своей низкой активности антибиотик вдруг оказался очень активным против спирохет (в частности, против боррелий). Наверняка это не единственный такой пример, и, наверное, за 70 лет люди успели понаоткрывать кучу таких "малоактивных" антибиотиков. Так что, если проскринить коллекцию на большем количестве патогенов, то может еще что-нибудь годное найдется.
#читаювсякоеговно
Если почитать некоторых популярных блогеров, то оказывается, что использование антибиотиков без указаний врача приравнивается к смертному греху. Мне эта точка зрения кажется несколько ограниченной. Я, например, мажу прыщи синтомициновой мазью (неплохо помогает, кстати). И что, мне реально предлагается идти к врачу за рецептом каждый раз, когда у меня на ебальнике вскакивает прыщ? Или, к примеру, иногда люди по разным причинам прутся в места, где врачей поблизости не наблюдается, и антибиотики берутся с собой на всякий случай. Мне этот подход представляется оправданным.
Forwarded from Pharmaceutical Innovations⚗️💊🧪 (Lex Luthor)
занятный лонгрид о действии антидепрессантов на фертильность и т. д.
Forwarded from Sci-Hub
beeder2019.pdf
92 KB
Beeder, L. A., & Samplaski, M. K. (2019). Effect of antidepressant medications on semen parameters and male fertility. International Journal of Urology. doi:10.1111/iju.14111
Программный текст из разряда "накипело".
Каждый, кто занимается биотехом, знает такое явление как "проприетарные коммерческие среды".
Суть заключается в следующем - композицию классических сред (RPMI-1640, EMEM, DMEM, F12 и прочая) можно легко нагуглить, и в случае необходимости оценить их влияние на эксперимент. Например, совершенно тривиальная задача - работа с MCF-7 для оценки чего-нибудь антиракового. Большинство не заморачивается, и растит культуры на том, на чём привыкли в их лаборатории. Однако, даже замена DMEM на DMEM/F12 может повлиять на результат эксперимента - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6037242/
Но, повторюсь, состав всех этих сред можно найти.
А что делать, если вы работаете в промышленной биотехнологии? Или, что ещё хуже, занимаетесь изучением наработки терапевтических белков и векторных вирусов?
Здесь вы, согласно логике производителей сред, должны ВЕРИТЬ. Причём ещё более искренне, чем во время посещения казино.
Вы должны ВЕРИТЬ, что их Super-Duper CHO-MegaMix заставит ваши СНО вырабатывать 146% белка по сравнению с контролем, что белок будет правильно прогликозилирован и что всё будет супер-дупер.
Мне такой подход в упор не понятен, равно как и не понятно почему FDA вообще разрешает использование подобных сред в биофармацевтике. Хочешь чтоб твои мега-супер-гига-экспрессионные среды допустили к использованию - раскрывай состав.
Такая игра в партизана - контрпродуктивна. Ведь если учёный захочет оценить влияние состава среды на конечный продукт - у него ничего не получится, т.к. состав нигде не опубликован, а оценивать % содержание десятков компонентов в образце - ебанёшься.
Так и живём: состав сред известен лишь приблизительно, на уровне слухов - "А я слышал, что в Gibco AEM много глюкозы и нуклеозидов!".
Каждый, кто занимается биотехом, знает такое явление как "проприетарные коммерческие среды".
Суть заключается в следующем - композицию классических сред (RPMI-1640, EMEM, DMEM, F12 и прочая) можно легко нагуглить, и в случае необходимости оценить их влияние на эксперимент. Например, совершенно тривиальная задача - работа с MCF-7 для оценки чего-нибудь антиракового. Большинство не заморачивается, и растит культуры на том, на чём привыкли в их лаборатории. Однако, даже замена DMEM на DMEM/F12 может повлиять на результат эксперимента - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6037242/
Но, повторюсь, состав всех этих сред можно найти.
А что делать, если вы работаете в промышленной биотехнологии? Или, что ещё хуже, занимаетесь изучением наработки терапевтических белков и векторных вирусов?
Здесь вы, согласно логике производителей сред, должны ВЕРИТЬ. Причём ещё более искренне, чем во время посещения казино.
Вы должны ВЕРИТЬ, что их Super-Duper CHO-MegaMix заставит ваши СНО вырабатывать 146% белка по сравнению с контролем, что белок будет правильно прогликозилирован и что всё будет супер-дупер.
Мне такой подход в упор не понятен, равно как и не понятно почему FDA вообще разрешает использование подобных сред в биофармацевтике. Хочешь чтоб твои мега-супер-гига-экспрессионные среды допустили к использованию - раскрывай состав.
Такая игра в партизана - контрпродуктивна. Ведь если учёный захочет оценить влияние состава среды на конечный продукт - у него ничего не получится, т.к. состав нигде не опубликован, а оценивать % содержание десятков компонентов в образце - ебанёшься.
Так и живём: состав сред известен лишь приблизительно, на уровне слухов - "А я слышал, что в Gibco AEM много глюкозы и нуклеозидов!".
PubMed Central (PMC)
An Effect of Culture Media on Epithelial Differentiation Markers in Breast Cancer Cell Lines MCF7, MDA-MB-436 and SkBr3
Background and objectives: Cell culture is one of the mainstays in the research of breast cancer biology, although the extent to which this approach allows to preserve the original characteristics of originating tumor and implications of cell culture ...