Таких историй у меня и знакомых - воз и маленькая тележка. Но есть другой тип факапов, которые всерьёз заставляют задуматься об имптортозамещении в биотехе. О нормальном импортозамещении, а не о простом переклеивании шильдиков на китайской технике.
Многое оборудование продаётся с т.н. hardware-ключами для запуска, в том числе и после длительного простоя для диагностики и ПНР + с обязательным заключением контракта на сервисное обслуживание и гарантийный ремонт. Вы просто не сможете запустить некоторые девайсы в отсутствии инженера от компании-производителя. Но в одном из мест закупщики этого не знали, и решили купить девайс стоимость 15 млн б/у от после южноамериканского НИИ. Девайс привозят... а он стоит мёртвым грузом в уголке, как куча хлама. В конце концов начальники начальника одумываются, идут на полон в российское представительство, мол "Так-то так-то, неразумные парубки, решили копеечку сэкономить, в землю-матушку кланяемся - возьмите на гарантийное обслуживание!", и за много денег выписали наладчика. Наладчик от производителя приехал, поругался - половина плат и датчиков оказалась нерабочей. За много денег их поменяли. В итоге, вместо 1-2 млн (стоимость гарантии при покупке "в белую"), девайс обошёлся на 5млн дороже (вызов и оплата инженеров от производителя, замена начинки, и гарантийное обслуживание).
Другой тип факапов уже больше относится к импортозамещению. После 2014 года некоторые компании отказываются продавать биореактора, мол "будете использовать для наработки сибирской язвы против демократии!!!". Особенно этим грешат американские компании, продающие так называемые single use bioreactors - двухсоставные биореакторы, состоящие из греющей рубашки, газовой системы, блока управления и собственно одноразового мешка-реактора, простерилизованного гамма-пушкой. Для обхода таких ограничений некоторые конторы заказывают аналоги (по сути - реплики) таких систем в Китае... лучше бы не заказывали. Здесь всё настолько плохо, что даже в анонимном телеграм-канале это описывать не буду из профессиональной солидарности и сочувствия тем, кому приходится работать с такими поделиями. Ребята, держитесь!
Если бы я был абстрактным Потаниным или Вексельбергом, и если бы хотел инвестировать в биотех, то первым делом дал бы денег на создание компаний, аналогичных по набору и качеству продукции Corning и Cytiva (бывшее биотех подразделение GE). Сначала пластик и расходка - и уже потом об антителах можно думать.

https://youtu.be/TtmVfWj20nY
Научпоп здорового человека. Никакой анимации, весёлой музыки, а простое и понятное изложение протокола трансформации бактерий и принципа метода.

И да, кстати, самая лучшая национальная идея для России - национал-трансгуманизм.
Все кто против - новиопы на зарплате и англичано-шведы.

Я, будучи перфекционистом, был в ужасе, когда узнал, что для создания гибридомных линий многие люди используют пульпу селезёнки. Простой гомогенат, мол - "видимых неоднородностей нет - и так сойдёт".
Как надо, программа минимум: пропустить гомогенат селезёнки животного через клеточное ситечко (cell strainer).
Как надо, программа максимум: пропущенные клетки почистить на фиколле.
Как надо, если вы буржуй и перфекционист: выделять В-клетки на сортере из лимфоцитарной фракции, очищенной на фиколле.

Пока только теория, но интересно.

Опубликована новая гипотеза о том, как именно происходит кодирование памяти в мозге. Бенджамин Голт (Benjamin Goult), нейробиолог из Кентского университета (Великобритания), полагает, что информация откладывается в бинарном виде в виде конфигураций белков, чувствительных к механическим воздействиям (механочувствительных белков). Так, белок под названием «талин» предположительно служит базовой единицей, чем-то вроде механического переключателя, сохраняющего информацию в синапсе (соединении между нейронами).

Большие скопления механочувствительных белков образуют сеть переключателей (mesh), в которой записывается код (meshCODE). Электрические сигналы (потенциалы действия), генерируемые и получаемые нейронами, воздействуют на механизмы, являющиеся частью цитоскелета, и эти механизмы «обновляют» записанную информацию.

Гипотеза Голта опубликована в журнале «Frontiers in Molecular Neuroscience» (импакт-фактор 4) в открытом доступе по свободной лицензии Creative Commons. #Нейробиология #Память #Гипотезы https://medicalxpress.com/news/2021-03-theory-memories-brain.html

Биоинформатик делает нейросеть: сидит на стуле, пишет код, насиживает простатит и геморрой.

Мокрый биолог делает нейросеть: УУИИИИ САМОЛЁТИКИ УПРАВЛЯЕМЫЕ НЕЙРОНАМИ!
https://youtu.be/1w41gH6x_30

К слову, запись довольно старая, а сама публикация (найду, если будет время) вышла у группы аж в 2004 году.

А вот и сама публикация. Они покрывали микроэлектроды PEI и ламинином, для того чтоб дать клеткам, севшим на эти области, преимущество. Но я уверен, что за 16 лет с момента публикации, кто-то додумался до чего-то более крутого.

Генетическая инженерия позволяет создать т.н. "гуманизированные" антитела. Когда видоспецифичный Fc-фрагмент от антитела, полученного изначально в мышиных, кроличьих или крысиных клетках, заменяется на человеческий. Такие антитела более чем пригодны для терапии, т.к. к ним не образуются вторичные антитела.
Существует также методика иммунизации in vitro, о ней сегодня и будет хадис. Антитела к некоторым веществам или патогенам достаточно сложно получить из-за этических или технических причин. Например, для увеличения иммунного ответа, вещества иногда химически связывают с иммуногенным белком-носителем, что не есть хорошо - бывают случаи, когда на уровне организма иммуногенность белка-носителя настолько высока, что выделить клетки, продуцирующие антитела к объекту интереса не представляется возможным. Кроме того, иммунизация животного может занимать около месяца, селекция гибридомы - ещё столько же.
Для иммунизации in vitro (IVI, in vitro immunization) обычно нужны лишь три основные вещи: PBMC животного или человека, пептид LLME (он выключает клетки-супрессоры, оставляя активными только В-клетки из всего множества выделенных лимфоцитов), и два коротких сигнальных нуклеотида. Принцип крайне прост: к выделенным и отмытым PBMC на 20-30 минут добавляют супрессорный пептид LLME, затем от него отмывают 2 раза, добавляют сигнальный олиг, ИЛ2 и ИЛ4, рассаживают на плашки, добавляют антиген интереса (белок, инактивированный патоген, низкомолекулярное вещество и т.п.), через три дня добавляют второй сигнальный олиг, а через 4 дня начинают скрининг.
Всё легко и просто! И всего за 2 недели можно получить нужное антитело + его генетическую последовательность для встройки в экспрессионную плазмиду для дальнейшего биотехнологического шаманства.

Сама публикация

https://youtu.be/pmnzIhbX2bg
С одной стороны, можно поржать над пьяными мартышками, с другой - очень интересный тезис, что % умеренно пьющих и клинических алкоголиков примерно одинаков у обезьян и людей.

Бионические глаза и нейропротезы

Порядка 40 млн слепых людей во всем мире нуждаются в технологиях, которые смогут вернуть им способность видеть. Однако до сих пор не существует доступного способа протезирования зрения. Мы привыкли ассоциировать зрение лишь с глазами – тем не менее, помимо самих глазных яблок в процессе участвует зрительная кора головного мозга, которой мы фактически «видим», и нервные пути, которые соединяют глаза с мозгом. В зависимости от определённой патологии можно попытаться реализовать протезирование практически на каждом из этих этапов.

В 1956 году австралийский ученый Дж. И. Тассикер запатентовал первый ретинальный имплант, который почти не давал полезного зрения, но смог показать, что можно искусственно вызывать зрительные сигналы. Ретинальный имплант (имплант сетчатки) вводит визуальную информацию в сетчатку, электрически стимулируя её выжившие нейроны. На тот момент вызванные зрительные восприятия имели довольно низкое разрешение, достаточное лишь для распознавания простых объектов. Из-за технологических ограничений прошло очень много времени, прежде чем появились какие-то реальные разработки, способные дать зрение, с которым человек мог бы полноценно видеть. Так, в 2019 году в мире насчитывалось около 50 активных проектов, фокусирующихся на протезировании зрения.

Пару лет назад на рынке было доступно три ретинальных импланта, которые прошли клинические испытания и были сертифицированы государственными регулирующими органами: европейским CE Mark и американским FDA.

1) Second Sight Medical Products, США
2) Pixium Vision, Франция
3) Retina Implant AG, Германия

IRIS II (Pixium Vision) и Argus II (Second Sight) имели внешние устройства (очки с видеокамерой и блок обработки видеосигнала). Слепой человек смотрит при помощи камеры, с нее картинка направляется в процессор, где изображение обрабатывается и распадается на 60 пикселей (для системы Argus II). Затем сигнал направляется через трансмиттер на электродную решетку, вживленную на сетчатке, и электрическим током стимулируются оставшиеся живые клетки.

В немецком импланте Alfa АMS (Retina Implant) нет внешних устройств, и человек видит своим собственным глазом. Имплант на 1600 электродов вживляется под сетчатку. Свет через глаз попадает на светочувствительные элементы и происходит стимуляция током. Питается имплант от подкожного магнитного коннектора. Все три ретинальных импланта больше не производятся, так как появилось новое поколение кортикальных протезов (для стимуляции коры головного мозга, а не сетчатки глаза), но они остались своего рода вехой в индустрии, и технологии, на которых они основываются, продолжает совершенствоваться.

Однако, несмотря на значительное количество проектов фундаментальных разработок по улучшению ретинальных имплантов, ни один из них ещё не прошел клинические испытания:

1) Улучшенный имплант DRY AMD PRIMA компании Pixium с увеличением количества электродов для стимуляции большего количества клеток сетчатки проходит клинические испытания;
2) Retina Implant AG закрыли производство;
3) Second Sight проводят клинические испытания своего кортикального импланта, но в марте 2020 года компания уволила 80% сотрудников из эксплуатационно-производственного подразделения.

В следующей публикации продолжим разговор об основных фундаментальных технологиях в области ретинальных имплантов.

Редко выходят статьи, которые заставляют меня восхититься умением и мозгами авторов. На канале я уже рассматривал методики создания органоидов из нервных клеток, однако в статье авторов из стенфорда был создан конструкт из трёх типов тканей - собственно кортикальные нейроны, нейроны ядер спинного мозга и мышечные клетки. Сложные коктейли ростовых факторов, несколько месяцев работы - и вот it's alive!

Я уже писал про in vitro иммунизацию, клац - https://t.me/smallpharm/1742
И теперь спрашиваю у подписчиков - кто-нибудь хочет проверить этот метод? Кто-нибудь уже делал что-то подобное?
Ответы можно писать в чат или на почту с gmail адресов.
Есть ДЕЛО

Вах какой микротом! Один удовольствие барашэк рэзат!

Ищу себе гистолога-патоморфолога в группу. Сидим с эйчаром на hh, пилим вакансию. Так вот, из профобластей там самым близкие оказалось Медицина (Другое) ну и с натяжкой Биотехнология. Зато можно указать чабана! Штош. Ищу чабана микроскопов, пастуха гистослайдов.

Тренды ретинальных имплантов: основные фундаментальные технологии

Ретинальные нанотрубки
Группа ученых из Китая (Shanghai Public Health Clinical Center) в 2018 году провела эксперимент на мышах, в ходе которого вместо не функционирующих фоторецепторов сетчатки предложила использовать нанотрубки. Преимущество этого проекта — высокая избирательность действия ввиду малого размера нанотрубок. Каждая из них может стимулировать всего несколько клеток сетчатки.

Биопиксели
Группа ученых из Оксфорда стремится сделать протез максимально приближенным к естественной сетчатке. Биопиксели в проекте выполняют функцию, схожую с настоящими клетками. Они имеют оболочку из липидного слоя, в который встроены фоточувствительные белки. На них воздействуют кванты света, и, как в настоящих клетках, изменяется электрический потенциал и возникает электрический сигнал.

Перовскитная искусственная сетчатка
При помощи технологии перовскитной искусственной сетчатки китайские ученые пытаются предоставить возможность не только получать световые ощущения, но и различать цвет за счет моделирования сигнала таким образом, чтобы он воспринимался мозгом как имеющий определенную цветность.

Фотогальваническая пленка Polyretina
В Polyretina используется маленькая пленка, покрытая слоем химического вещества, которое обладает свойством поглощения света и конверсии его в электрический сигнал. Пленка размещена на сферическом основании для её удобного размещения на глазном дне.

Субретинальное введение полупроводникового полимера
Итальянские ученые предлагают технологию введения полупроводникового полимерного раствора под сетчатку, при помощи которого свет фиксируется и трансформируется в электрические сигналы.

Российский опыт ретинального протезирования
В России в 2017 году при поддержке фондов «Со-единение» и «Искусство, Наука и Спорт» было приобретено и установлено два ретинальных импланта Argus II американской компании Second Sight. Это единственные операции по восстановлению зрения, которые были проведены в России за все время. Каждая операция вместе с реабилитацией стоила порядка 10 млн руб, а сама система имплантации для одного пациента – порядка $140 тыс. Все прошло успешно, и два полностью слепых жителя Челябинска – Григорий (не видел 20 лет) и Антонина (не видела 10 лет) – получили предметное зрение. Оба пациента имели диагноз «пигментный ретинит» (куриная слепота).
В России опытом в протезировании зрения может похвастаться лишь один проект — АНО Лаборатория «Сенсор-Тех».