Forwarded from Neuroscience+
Есть ли границы у нейрогенеза? Конечен ли запас стволовых клеток? Можно ли использовать всю память заранее?
В первом приближении есть два типа нейрональных стволовых клеток в зубчатой извилине, первый из которых составляет т.н. "резервный" пул (называются radial glia-like или quiescent neural progenitors, имеют длинный отросток, направленный в сторону hilus), второй – активный пул.
О классификации:
NSPC were classified based on the expression of NestinGFP and GFAP [16, 46, 47]. Specifically, Nestin-GFP +/GFAP+ with characteristic radial glia-like morphology were classified as Type-1 cells. Type-2a cells were Nestin-GFP+/GFAP+, with horizontal morphology and Type-2b cells were Nestin-GFP+/GFAP−, also with horizontal morphology. Type-1, -2a and -2b cells were observed in animals of all ages (Fig. S1C–I). The numbers of proliferative NSPC decreased with age in Nestin-GFP mice [27](Fig.S1A,B).Furthermore, extra-sum-of-squares F-testing for best-fit decay curves showed that the total Nestin-GFP+ NSPC population decayed exponentially during aging (Fig. S1J). Importantly Nestin-GFP expression was consistent with native Nestin expression over time and was unaffected by aging in individual Type 1 NSPC [27] (Fig. S2A–C). Interestingly, Type-1, -2a, and -2b cells decayed following different patterns. Type-1 and -2a cells decayed linearly, while Type-2b cells followed exponential decay kinetics (Fig. S1K). The volume of the granule zone (SGZ plus granule cell layer (GCL)) did not change significantly with age (Fig. S1J). These data demonstrate that Type-1 and -2a NSPC persist into old age, while Type-2b cells are depleted earlier following an exponential decay.
Клетки из резервного пула медленно на протяжении жизни делятся, преимущественно ассиметрично и около трех раз, после чего дифференцируются в астроцит: это значит, что пул условно конечен (хотя, во первых, астроцит экспрессирует GFAP и Sox2, маркеры стволовых клеток, и при случае, возможно, восстанавливается в нейрональные нейрональную стволовую клетку, во-вторых иногда radial glia like SC делятся симметрично, хотя неясно, зачем).
Тонкость в том, что условия, традиционно "активирующие нейрогенез" (СИОЗС, аэробная активность), влияют только на второй пул и все, что случается и первый не истощают. Зато активное деление клеток первого пула происходит в патологических условиях, к примеру, при гиперактивации зубчатой извилины каиновой кислотой в модели средневисочной эпилепсии (при большой концентрации глутаматового агониста) и эпилептоформной активности (при небольшой).
Интересно, что резервный пул начинает делиться (в том числе симметрично) при нокдауне гамма-два сабьюнита рецептора ГАМК-А. Интересно, что социальная изоляция имеет те же эффекты на торможение и пролиферацию RGL, как и ноудаун гамма-два сабьюнита. Судя по экспериментам, все торможение RGL осуществляется эксклюзивно PV+ интернейронами зубчатой извилины через ГАМК-А с единственной композицией сабьюнитов, a5b3g2. Альфа5-сабьюнит считается ответственным за амнестические эффекты бензодиазепинов.
Таким образом, если не вдаваться в тонкости пролиферации, от про-пластических препаратов или интервенций память раньше времени не "закончится". В то же время, негативные условиях вроде нелеченных антиконвульсантами эпилепсии или БАР, социальной изоляции приближают (тепловую смерть) истощение резерва засчет активации пролиферации нейрональных стволовых клеток радиально-глиального типа.
Encinas JM, Michurina TV, Peunova N, Park JH, Tordo J, Peterson DA, et al. Division-coupled astrocytic differentiation and age-related depletion of neural stem cells in the adult hippocampus. Cell Stem Cell. 2011;8:566–79.
Kempermann G. The pessimist's and optimist's views of adult neurogenesis. Cell. 2011;145:1009–11.
Bonaguidi MA, Wheeler MA, Shapiro JS, Stadel RP, Sun GJ, Ming GL, et al. In vivo clonal analysis reveals self-renewing and multipotent adult neural stem cell characteristics. Cell. 2011;145:1142–55.
Lugert S, Taylor V. Neural stem cells: disposable, end-state glia? Cell Stem Cell. 2011;8:464–5.
Lucassen PJ, Toni N,
В первом приближении есть два типа нейрональных стволовых клеток в зубчатой извилине, первый из которых составляет т.н. "резервный" пул (называются radial glia-like или quiescent neural progenitors, имеют длинный отросток, направленный в сторону hilus), второй – активный пул.
О классификации:
NSPC were classified based on the expression of NestinGFP and GFAP [16, 46, 47]. Specifically, Nestin-GFP +/GFAP+ with characteristic radial glia-like morphology were classified as Type-1 cells. Type-2a cells were Nestin-GFP+/GFAP+, with horizontal morphology and Type-2b cells were Nestin-GFP+/GFAP−, also with horizontal morphology. Type-1, -2a and -2b cells were observed in animals of all ages (Fig. S1C–I). The numbers of proliferative NSPC decreased with age in Nestin-GFP mice [27](Fig.S1A,B).Furthermore, extra-sum-of-squares F-testing for best-fit decay curves showed that the total Nestin-GFP+ NSPC population decayed exponentially during aging (Fig. S1J). Importantly Nestin-GFP expression was consistent with native Nestin expression over time and was unaffected by aging in individual Type 1 NSPC [27] (Fig. S2A–C). Interestingly, Type-1, -2a, and -2b cells decayed following different patterns. Type-1 and -2a cells decayed linearly, while Type-2b cells followed exponential decay kinetics (Fig. S1K). The volume of the granule zone (SGZ plus granule cell layer (GCL)) did not change significantly with age (Fig. S1J). These data demonstrate that Type-1 and -2a NSPC persist into old age, while Type-2b cells are depleted earlier following an exponential decay.
Клетки из резервного пула медленно на протяжении жизни делятся, преимущественно ассиметрично и около трех раз, после чего дифференцируются в астроцит: это значит, что пул условно конечен (хотя, во первых, астроцит экспрессирует GFAP и Sox2, маркеры стволовых клеток, и при случае, возможно, восстанавливается в нейрональные нейрональную стволовую клетку, во-вторых иногда radial glia like SC делятся симметрично, хотя неясно, зачем).
Тонкость в том, что условия, традиционно "активирующие нейрогенез" (СИОЗС, аэробная активность), влияют только на второй пул и все, что случается и первый не истощают. Зато активное деление клеток первого пула происходит в патологических условиях, к примеру, при гиперактивации зубчатой извилины каиновой кислотой в модели средневисочной эпилепсии (при большой концентрации глутаматового агониста) и эпилептоформной активности (при небольшой).
Интересно, что резервный пул начинает делиться (в том числе симметрично) при нокдауне гамма-два сабьюнита рецептора ГАМК-А. Интересно, что социальная изоляция имеет те же эффекты на торможение и пролиферацию RGL, как и ноудаун гамма-два сабьюнита. Судя по экспериментам, все торможение RGL осуществляется эксклюзивно PV+ интернейронами зубчатой извилины через ГАМК-А с единственной композицией сабьюнитов, a5b3g2. Альфа5-сабьюнит считается ответственным за амнестические эффекты бензодиазепинов.
Таким образом, если не вдаваться в тонкости пролиферации, от про-пластических препаратов или интервенций память раньше времени не "закончится". В то же время, негативные условиях вроде нелеченных антиконвульсантами эпилепсии или БАР, социальной изоляции приближают (тепловую смерть) истощение резерва засчет активации пролиферации нейрональных стволовых клеток радиально-глиального типа.
Encinas JM, Michurina TV, Peunova N, Park JH, Tordo J, Peterson DA, et al. Division-coupled astrocytic differentiation and age-related depletion of neural stem cells in the adult hippocampus. Cell Stem Cell. 2011;8:566–79.
Kempermann G. The pessimist's and optimist's views of adult neurogenesis. Cell. 2011;145:1009–11.
Bonaguidi MA, Wheeler MA, Shapiro JS, Stadel RP, Sun GJ, Ming GL, et al. In vivo clonal analysis reveals self-renewing and multipotent adult neural stem cell characteristics. Cell. 2011;145:1142–55.
Lugert S, Taylor V. Neural stem cells: disposable, end-state glia? Cell Stem Cell. 2011;8:464–5.
Lucassen PJ, Toni N,
Forwarded from Neuroscience+
Kempermann G, Frisen J, Gage FH, Swaab DF. Limits to human neurogenesis-really? Mol Psychiatry 2019. https://doi.org/10.1038/s41380-018-0337-5
Circadian glucocorticoid oscillations preserve a population of adult hippocampal neural stem cells in the aging brain (Mol. Psy., 2019)
Neuronal circuitry mechanism regulating adult quiescent neural stem-cell fate decision (Nature, 2012).
Circadian glucocorticoid oscillations preserve a population of adult hippocampal neural stem cells in the aging brain (Mol. Psy., 2019)
Neuronal circuitry mechanism regulating adult quiescent neural stem-cell fate decision (Nature, 2012).
Molecular Psychiatry
Limits to human neurogenesis—really?
Limits to human neurogenesis—really?
Заметочка о правильной кадровой политике:
Иногда я коротаю ночи просмотром документалок, и недавно на глаза попалась документалка о французском иностранном легионе. Помимо интересных кадров с мест боевых действий, где англичане, снимавшие этот фильм, забыли запикать крики вроде "Шарже, блядь, шарже!", там показано заседание мини-комиссии по обсуждению кандидатов для вступления.
Во многих западных законодательствах существует понятие victimless crime (я не знаю, как юридически точно перевести его на русский) - то есть преступления, у которого нет жертвы или пострадавшего физического лица. Например, незаконное пересечение границы - это victimless crime, если вы никого не ограбили и не убили во время вашей поездки.
Так вот эта комиссия обсуждала кандидата с Украины, где ему в положительные характеристики было записано, что он прибыл во Францию нелегально. Если человек готов совершить ради чего-либо преступление, значит он этого очень сильно хочет. Как вы понимаете, французская фемида пропустила факт незаконного въезда мимо, и человек был успешно принят на контракт.
Я считаю, что это довольно иллюстративный случай ПРАВИЛЬНОЙ кадровой политики и психологии управления.
Иногда я коротаю ночи просмотром документалок, и недавно на глаза попалась документалка о французском иностранном легионе. Помимо интересных кадров с мест боевых действий, где англичане, снимавшие этот фильм, забыли запикать крики вроде "Шарже, блядь, шарже!", там показано заседание мини-комиссии по обсуждению кандидатов для вступления.
Во многих западных законодательствах существует понятие victimless crime (я не знаю, как юридически точно перевести его на русский) - то есть преступления, у которого нет жертвы или пострадавшего физического лица. Например, незаконное пересечение границы - это victimless crime, если вы никого не ограбили и не убили во время вашей поездки.
Так вот эта комиссия обсуждала кандидата с Украины, где ему в положительные характеристики было записано, что он прибыл во Францию нелегально. Если человек готов совершить ради чего-либо преступление, значит он этого очень сильно хочет. Как вы понимаете, французская фемида пропустила факт незаконного въезда мимо, и человек был успешно принят на контракт.
Я считаю, что это довольно иллюстративный случай ПРАВИЛЬНОЙ кадровой политики и психологии управления.
Иногда на рисёрчгейте меня фолловят разные учёные из экзотических стран. Но сегодня был просто феерический случай - зафолловил нигерийский(!) биоинформатик-докер(!!), занимающийся каннабиноидами(!!!) и флавонами из мексиканского мака(!!!).
Иногда такие экзотичные публикации стоит читать лишь ради расширения своего кругозора. Ланцет и нейчур - мейнстрим, даёшь андеграунд!
Надо будет на канал больше писать о таком. Например, об иранских токсикологах, скринящих микотоксины, или о чилийских фармакологах, увеличивающих проницаемость ГЭБ.
Иногда такие экзотичные публикации стоит читать лишь ради расширения своего кругозора. Ланцет и нейчур - мейнстрим, даёшь андеграунд!
Надо будет на канал больше писать о таком. Например, об иранских токсикологах, скринящих микотоксины, или о чилийских фармакологах, увеличивающих проницаемость ГЭБ.
Интересно, что на Древней Руси уже умели отличать гипоманию от депрессивных эпизодов, называя психически больных людей либо бесноватыми, либо блаженными соответственно.
Продолжая лингвистические наблюдения - сегодня узнал, что оказывается у русской поговорки "Лох не мамонт", есть английский аналог (упоминающийся с 19-го века) - "There's a sucker born every minute".
Если русская версия постулирует бессмертие лохов, то английская - настаивает на постоянном увеличении их поголовья.
Если русская версия постулирует бессмертие лохов, то английская - настаивает на постоянном увеличении их поголовья.
И снова продолжаем оффтоп в виде лингвистических наблюдений. В России иногда название десантных войск, ВДВ, расшифровывают как Войска Дяди Васи (в честь Маргелова), а в Англии их SAS расшифровывают всегда по-разному - Surrey Automotive Specialists или Shepway Assurances Services.
Английские шутливые расшифровки связаны с тем, что их десантные войска исторически были частью военной разведки, где говорить напрямую о чём-либо не принято.
Английские шутливые расшифровки связаны с тем, что их десантные войска исторически были частью военной разведки, где говорить напрямую о чём-либо не принято.
Forwarded from Кружок Пейпеца
Занимательный факт о метаболизме вина
1й бокал вина содержит ~73 ккал, а 5й бокал уже содержит ~61 ккал. Почему так? Дело в том, что с бОльшим поступлением алкоголя, включается дополнительный путь расщепления - окисление этанола при участии цитохром Р450 - зависимой микросомальной этанолокисляющей системы. Этот путь более энергозатратный, и тут на расщепление этанола затрачивается уже порядка 27%, против 12% при первом пути (окисление с помощью NAD-зависимой алкогольдегидрогеназы).
1й бокал вина содержит ~73 ккал, а 5й бокал уже содержит ~61 ккал. Почему так? Дело в том, что с бОльшим поступлением алкоголя, включается дополнительный путь расщепления - окисление этанола при участии цитохром Р450 - зависимой микросомальной этанолокисляющей системы. Этот путь более энергозатратный, и тут на расщепление этанола затрачивается уже порядка 27%, против 12% при первом пути (окисление с помощью NAD-зависимой алкогольдегидрогеназы).
Заметочка об опухолевых культурах: даже если вы прошли все круги ада, вылавливая и сортируя клетки по фенотипу и способности вечно пролиферировать, то они могут ВНЕЗАПНО пройти дифференцировку в культуре.
А вот мне интересно, а существует ли такой класс ферментов, который узнаёт НЕ случайную последовательность в ДНК или РНК, и заменяет её на случайную?
Допустим, у нас есть:
ATCGTATTCATCGGCTAGCTAGCTAATTCCCGAT
Где, назовём этот фермент "рандомаза" (лол) заменит выделенные жирным шрифтом нуклеотиды на случайные, просто залетевшие в карман связывания.
И возможно ли вообще, чисто теоретически, существование таких ферментов или систем ферментов?
Допустим, у нас есть:
ATCGTATTCATCGGCTAGCTAGCTAATTCCCGAT
Где, назовём этот фермент "рандомаза" (лол) заменит выделенные жирным шрифтом нуклеотиды на случайные, просто залетевшие в карман связывания.
И возможно ли вообще, чисто теоретически, существование таких ферментов или систем ферментов?
Forwarded from Бiоинформатика и лапки
Мне прислали тут пост одного из РТДшных футурологов о технологиях искусственной матки. Готовьтесь, сейчас котяху порвет.
О каком трансгуманизме, о каком иммортализме, о каком бессмертии вместо глобальной катастрофы может идти речь, если человек элементарно не умеет гуглить? Я потратил ровно две минуты, чтобы найти 1. статью про прототип, с опытами на овцах (не на мышах, а на овцах, которые вполне себе размером с человека), который потенциально возможно доработать для людей - https://www.nature.com/articles/ncomms15112?_ga=2.152468025.1476565385.1533513600-1633454762.1533513600;
2. обзор, которых "скорее всего нет, в силу отсутствия исходного материала для оных" - https://jme.bmj.com/content/44/11/751.abstract. Журнал да, биоэтический, с импактом всего в 1.889, но я даже не искал по сути;
Как я это сделал? Просто набрал "extra short term premature incubator" в Google Scholar. Абсолютно никакого полета интеллекта. Справится даже футуролог.
Ввод сочетания "artificial womb" тоже принес успех:
1. Обзор аж от 2011 года, КАРЛ, который называется просто "the artificial womb" (Buletti et al, 2011, пдфку загружу), на который где-то ссылался Панчин в "Сумме биотехнологий".
2. Статья от 2018 года, Development of the artificial womb. ://link.springer.com/article/10.1007/s40778-018-0120-1 в не самом лучшем (импакт 2.05 журнале), но уже со ссылками.
Что делает футуролог РТД? Вместо того, чтобы подумать логически и сообразить, что, наверное, технологии-предшественницы искусственной матки имеют какое-то отношение к репродукции, следовательно к недоношенным детям (даже если вспомнить любимый РТДшниками ТРИЗ, искусственная матка хорошо понимается, как предел развития инкубаторов для недоношенных детей, где они настолько недоношенные, что являются зиготой), футуролог начинает рассказывать про поддержание жизнеспособности органов вне организма, что вообще к теме не относится. Ну да, нет еще пайплайна (по крайней мере я за две минуты не нашел, а то мало ли, но скорее всего таки нет), используя который можно было бы вырастить ребенка из зиготы без живой матки. В главном-то он прав (сарказм).
Еще футуролог накатал какой-то сверхкраткий обзорчик, в котором заявил, что ПОСЛЕДСТВИЕМ ВНЕМАТОЧНОЙ БЕРЕМЕННОСТИ ЧАЩЕ ВСЕГО ЯВЛЯЮТСЯ ТЕРАТОМЫ И ТЕРАТОКАРЦИНОМЫ. Напоминаю, что тератома это такая опухоль с зубами/волосами, которая чаще всего считается недоразвитым сиамским близнецом (по самой распространенной теории, го в википедию за подробностями). У внематочной беременности обычно несколько другие последствия. Цитата из англовики: "Regardless of whether fetus in fetu and fetiform teratoma are one entity or two, they are distinct from and not to be confused with ectopic pregnancy."
Я несколько раз писал в лапках, что трансгуманистам, особенно публичным трансгуманистам, нужно повышать свой уровень проверки фактов. Это формирует репутацию движения. РТД, при всех их недостатках, стоит отдать должное за то, что о трансгуманизме люди слышали. Но это совершенно не значит, что им нужно прощать откровенную лажу. "Не специалист, но напишу". Писать не стоило.
https://t.me/alexeyturchin/1957
О каком трансгуманизме, о каком иммортализме, о каком бессмертии вместо глобальной катастрофы может идти речь, если человек элементарно не умеет гуглить? Я потратил ровно две минуты, чтобы найти 1. статью про прототип, с опытами на овцах (не на мышах, а на овцах, которые вполне себе размером с человека), который потенциально возможно доработать для людей - https://www.nature.com/articles/ncomms15112?_ga=2.152468025.1476565385.1533513600-1633454762.1533513600;
2. обзор, которых "скорее всего нет, в силу отсутствия исходного материала для оных" - https://jme.bmj.com/content/44/11/751.abstract. Журнал да, биоэтический, с импактом всего в 1.889, но я даже не искал по сути;
Как я это сделал? Просто набрал "extra short term premature incubator" в Google Scholar. Абсолютно никакого полета интеллекта. Справится даже футуролог.
Ввод сочетания "artificial womb" тоже принес успех:
1. Обзор аж от 2011 года, КАРЛ, который называется просто "the artificial womb" (Buletti et al, 2011, пдфку загружу), на который где-то ссылался Панчин в "Сумме биотехнологий".
2. Статья от 2018 года, Development of the artificial womb. ://link.springer.com/article/10.1007/s40778-018-0120-1 в не самом лучшем (импакт 2.05 журнале), но уже со ссылками.
Что делает футуролог РТД? Вместо того, чтобы подумать логически и сообразить, что, наверное, технологии-предшественницы искусственной матки имеют какое-то отношение к репродукции, следовательно к недоношенным детям (даже если вспомнить любимый РТДшниками ТРИЗ, искусственная матка хорошо понимается, как предел развития инкубаторов для недоношенных детей, где они настолько недоношенные, что являются зиготой), футуролог начинает рассказывать про поддержание жизнеспособности органов вне организма, что вообще к теме не относится. Ну да, нет еще пайплайна (по крайней мере я за две минуты не нашел, а то мало ли, но скорее всего таки нет), используя который можно было бы вырастить ребенка из зиготы без живой матки. В главном-то он прав (сарказм).
Еще футуролог накатал какой-то сверхкраткий обзорчик, в котором заявил, что ПОСЛЕДСТВИЕМ ВНЕМАТОЧНОЙ БЕРЕМЕННОСТИ ЧАЩЕ ВСЕГО ЯВЛЯЮТСЯ ТЕРАТОМЫ И ТЕРАТОКАРЦИНОМЫ. Напоминаю, что тератома это такая опухоль с зубами/волосами, которая чаще всего считается недоразвитым сиамским близнецом (по самой распространенной теории, го в википедию за подробностями). У внематочной беременности обычно несколько другие последствия. Цитата из англовики: "Regardless of whether fetus in fetu and fetiform teratoma are one entity or two, they are distinct from and not to be confused with ectopic pregnancy."
Я несколько раз писал в лапках, что трансгуманистам, особенно публичным трансгуманистам, нужно повышать свой уровень проверки фактов. Это формирует репутацию движения. РТД, при всех их недостатках, стоит отдать должное за то, что о трансгуманизме люди слышали. Но это совершенно не значит, что им нужно прощать откровенную лажу. "Не специалист, но напишу". Писать не стоило.
https://t.me/alexeyturchin/1957
Nature
An extra-uterine system to physiologically support the extreme premature lamb
Nature Communications - The ability to support the development of a premature fetus in the form of an extracorporeal system has had limited success. Here, the authors show that an extra-uterine...
Forwarded from Бiоинформатика и лапки
Пиши о будущем
@
Не умей гуглить
@
????????
@
Профит
@
Не умей гуглить
@
????????
@
Профит
Forwarded from Кружок Пейпеца
В свое время мне очень не хватало глоссария по терминам, связанным с фармакологией поведения. Нашла краткий вариант для вас, вдруг кому-то пригодится.