Audio
🎙 کاربرد های بالینی توالی یابی تمام ژنوم
👤دکتر Liz Worthey، پژوهشگر و مدیر موسسه بیوتکنولوژی HudsonAlpha
⏱مدت : 8 دقیقه
🔝آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
👤دکتر Liz Worthey، پژوهشگر و مدیر موسسه بیوتکنولوژی HudsonAlpha
⏱مدت : 8 دقیقه
🔝آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🔔نخستین ساختار پروتئین Tardigrade در هفته جاری به دیتابیس PDB وارد شد.
t.co/APqVhA8aBp
✍️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
t.co/APqVhA8aBp
✍️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
Building_a_virtual_ligand_screening.pdf
413.1 KB
🎁مقاله با موضوع غربالگری مجازی با کمک نرم افزار های رایگان
📄 Building a virtual ligand screening pipeline
using free software: a survey
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📄 Building a virtual ligand screening pipeline
using free software: a survey
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
دوره آموزشی زبان برنامه نویسی پایتون و کاربرد آن در بیوانفورماتیک
▫️مدت: 12 جلسه 20 ساعت
▪️تاریخ شروع: 3 شهریور
▪️هزینه دوره: 450 هزار تومان
⏳ آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
▫️مدت: 12 جلسه 20 ساعت
▪️تاریخ شروع: 3 شهریور
▪️هزینه دوره: 450 هزار تومان
⏳ آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
◼️دوره آموزشی زبان برنامه نویسی پایتون و کاربرد آن در بیوانفورماتیک
▪️مدت دوره: 12 جلسه 20 ساعت
▪️هزینه دوره: 450 هزار تومان
▪️تاریخ جلسات: روزهای جمعه از ساعت 9 تا 13 به مدت 4 هفته برگزار می گردد
🏆آموختن برنامه نویسی بهترین نوع سرمایه گذاری است که شما می توانید برای پژوهش یا کارتان انجام دهبد. "پایتون برای زیست شناس ها"، یک دوره برنامه نویسی کامل برای مبتدیان است که مهارت های مورد نیاز شما را برای مواجهه با مسایل رایج زیستی و بیوانفورماتیکی فراهم می آورد.
@practicalbioinformatics
🔹چرا برنامه نویسی بیاموزیم؟
ممکن است دیده باشید که همکاران شما برای صرفه جویی در زمان و تعامل با مجموعه داده های بزرگ، برنامه نویسی می کنند.
ممکن است مسئول شما از شما خواسته باشد تا برای پروژه آینده تان برنامه نویسی بیاموزید.
ممکن است شما در میان آگهی های شغلی جستجو کرده باشید و متوجه شده باشید که چه تعداد از آنها مهارت های برنامه نویسی را از شما طلب می کنند.
ممکن است ، جهت ادامه تحصیل در رشته های مرتبط در ایران و دیگر کشور ها، داشتن مهارت برنامه نویسی یکی از ملزومات پذیرش دانشگاه باشد.
🔹فهرست مطالب
🔸در جلسات ابتدایی، شما خواهید آموخت که چرا پایتون انتخاب مناسبی برای زیست شناس ها و مبتدیان است. همچنین می آموزید که چگونه پایتون را بر روی سیستم عامل خود نصب کنید و نیز چگونه محیط برنامه نویسی خود را تنظیم کنید. این جلسات با مرتبط کردن شما با تمام نرم افزارهای رایگان مورد نیاز شما تکمیل می شود.
🔸در ادامه، شما خواهید آموخت که چگونه می توانید مانند توالی های DNA و پروتئین را دستکاری کنید و چگونه اشتباهاتتان در برنامه نویسی را برطرف کنید. مثال: محاسبه ی محتوای GC و AT، تبدیل توالی DNA و RNA به یکدیگر و پروتئین. و..
🔸در بخش سوم، چگونگی خواندن و نوشتن داده ها در فایلها را فرا خواهید گرفت. همچنین می آموزید که چگونه با مسیرهای فایل ها و فرمت فایل FASTA دست و پنجه نرم کنید. مثال: تقسیم DNAی ژنومی، نوشتن یک فایل FASTA. و..
🔸در بخش پنجم، می آموزید که چگونه در یک برنامه واحد، قسمت های مختلف و زیادی از داده ها را پردازش کنید و با ابزارهای پیشرفته تری برای دستکاری توالی ها آشنا خواهید شد. مثال: مقایسه و الایمنت توالی ها، تریم کردن (پیرایش) توالی ها، الحاق اگزون ها. پیدا کردن موتیف ها و..
🔸همچنین، خواهید آموخت که چگونه با خلق دستورالعمل های شخصی خودتان، می توانید پایتون را مفیدتر کنید و نیز بهترین راه ارزیابی آن دستورالعمل ها در جهت بالا بردن سرعت کار را فرا می گیرید. مثال: تحلیل ترکیب آمینواسیدی توالی پروتئین. ابزار تحلیل متون و مقالات موجود در pubmed . و..
....
@practicalbioinformatics
🔹جامعه ی مخاطبان
این کارگاه برای تمام پژوهشگران و محققین و دانشجویان در زمینه ی زیست شناسی که می خواهند برنامه نویسی بیاموزند، طراحی شده است. سرفصل دروس برای افراد مبتدی تنظیم شده است، از افرادی که تجربه های قبلی در برنامه نویس دارند با افتخار دعوت می شود تا در این کارگاه جهت یادآوری حضور پیدا کنند، اما احتمالا سرعت پیشرفت کلاس برای این افراد کمی کند به نظر خواهد رسید. اگر هنوز مردد هستید جهت مشاوره و دریافت اطلاعات بیشتر با ما تماس بگیرید
👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻
📞 09106665590
🌐www.DrugDesign.ir
@practicalbioinformatics
🏴نشاني: خیابان طالقاني -خیابان سميه - بین مفتح و موسوی - پلاک 122-طبقه 4 - واحد 404
▪️مدت دوره: 12 جلسه 20 ساعت
▪️هزینه دوره: 450 هزار تومان
▪️تاریخ جلسات: روزهای جمعه از ساعت 9 تا 13 به مدت 4 هفته برگزار می گردد
🏆آموختن برنامه نویسی بهترین نوع سرمایه گذاری است که شما می توانید برای پژوهش یا کارتان انجام دهبد. "پایتون برای زیست شناس ها"، یک دوره برنامه نویسی کامل برای مبتدیان است که مهارت های مورد نیاز شما را برای مواجهه با مسایل رایج زیستی و بیوانفورماتیکی فراهم می آورد.
@practicalbioinformatics
🔹چرا برنامه نویسی بیاموزیم؟
ممکن است دیده باشید که همکاران شما برای صرفه جویی در زمان و تعامل با مجموعه داده های بزرگ، برنامه نویسی می کنند.
ممکن است مسئول شما از شما خواسته باشد تا برای پروژه آینده تان برنامه نویسی بیاموزید.
ممکن است شما در میان آگهی های شغلی جستجو کرده باشید و متوجه شده باشید که چه تعداد از آنها مهارت های برنامه نویسی را از شما طلب می کنند.
ممکن است ، جهت ادامه تحصیل در رشته های مرتبط در ایران و دیگر کشور ها، داشتن مهارت برنامه نویسی یکی از ملزومات پذیرش دانشگاه باشد.
🔹فهرست مطالب
🔸در جلسات ابتدایی، شما خواهید آموخت که چرا پایتون انتخاب مناسبی برای زیست شناس ها و مبتدیان است. همچنین می آموزید که چگونه پایتون را بر روی سیستم عامل خود نصب کنید و نیز چگونه محیط برنامه نویسی خود را تنظیم کنید. این جلسات با مرتبط کردن شما با تمام نرم افزارهای رایگان مورد نیاز شما تکمیل می شود.
🔸در ادامه، شما خواهید آموخت که چگونه می توانید مانند توالی های DNA و پروتئین را دستکاری کنید و چگونه اشتباهاتتان در برنامه نویسی را برطرف کنید. مثال: محاسبه ی محتوای GC و AT، تبدیل توالی DNA و RNA به یکدیگر و پروتئین. و..
🔸در بخش سوم، چگونگی خواندن و نوشتن داده ها در فایلها را فرا خواهید گرفت. همچنین می آموزید که چگونه با مسیرهای فایل ها و فرمت فایل FASTA دست و پنجه نرم کنید. مثال: تقسیم DNAی ژنومی، نوشتن یک فایل FASTA. و..
🔸در بخش پنجم، می آموزید که چگونه در یک برنامه واحد، قسمت های مختلف و زیادی از داده ها را پردازش کنید و با ابزارهای پیشرفته تری برای دستکاری توالی ها آشنا خواهید شد. مثال: مقایسه و الایمنت توالی ها، تریم کردن (پیرایش) توالی ها، الحاق اگزون ها. پیدا کردن موتیف ها و..
🔸همچنین، خواهید آموخت که چگونه با خلق دستورالعمل های شخصی خودتان، می توانید پایتون را مفیدتر کنید و نیز بهترین راه ارزیابی آن دستورالعمل ها در جهت بالا بردن سرعت کار را فرا می گیرید. مثال: تحلیل ترکیب آمینواسیدی توالی پروتئین. ابزار تحلیل متون و مقالات موجود در pubmed . و..
....
@practicalbioinformatics
🔹جامعه ی مخاطبان
این کارگاه برای تمام پژوهشگران و محققین و دانشجویان در زمینه ی زیست شناسی که می خواهند برنامه نویسی بیاموزند، طراحی شده است. سرفصل دروس برای افراد مبتدی تنظیم شده است، از افرادی که تجربه های قبلی در برنامه نویس دارند با افتخار دعوت می شود تا در این کارگاه جهت یادآوری حضور پیدا کنند، اما احتمالا سرعت پیشرفت کلاس برای این افراد کمی کند به نظر خواهد رسید. اگر هنوز مردد هستید جهت مشاوره و دریافت اطلاعات بیشتر با ما تماس بگیرید
👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻
📞 09106665590
🌐www.DrugDesign.ir
@practicalbioinformatics
🏴نشاني: خیابان طالقاني -خیابان سميه - بین مفتح و موسوی - پلاک 122-طبقه 4 - واحد 404
https://goo.gl/G1h8DX
🏳🔔مقاله ای که ادعا می کند قادر به پیش بینی چهره فرد از طریق ژنوم آن است
یک مقاله از کریگ ونتر پیشگام توالی یابی ژنوم که ادعا می کند از طریق DNA افراد امکان پیش بینی ویژگی های فیزیکی چهره آنها وجود دارد، طوفانی از انتقاد را براه انداخته است. داوران و حتی همکاران این مقاله می گویند که توانایی استفاده از ژن های یک شخص برای شناسایی فرد، که می تواند ترس های غیر ضروری برای حفظ حریم خصوصی ژنتیکی را افزایش دهد، بیش از حد است.
در مقاله1 که در تاریخ 5 سپتامبر در مجموعه آکادمی ملی علوم (PNAS) منتشر شده است، ونتر و همکارانش در شرکت ط Human Longevity, Inc. (HLI) ، که در سان دیگو کالیفرنیا مستقر هستند، کل ژنوم 1061 نفر از سنین و اقوام مختلف را توالی یابی کردند. با استفاده از داده های ژنتیکی، همراه با عکس های با کیفیت بالا 3D از چهره های شرکت کنندگان، محققان از روش هوش مصنوعی برای پیدا کردن تفاوت های کوچک در توالی های DNA، که SNP نامیده می شود، با ویژگی های چهره مانند طول استخوان گونه. استفاده کردند. این تیم همچنین SNP های که با عوامل مرتبط با قد، وزن، سن، ویژگی های صوتی و رنگ پوست ارتباط دارد، را مورد بررسی قرار دادند.
صحت این رویکرد برای شناسایی یک فرد را از یک گروه ده نفر که به طور تصادفی از پایگاه داده HLI انتخاب شده اند 74٪ بوده است. یافته های این مقاله نشان می دهد که سازمان های انتظامی، دانشمندان و دیگر افرادی که ژنوم انسان ها را اداره می کنند، باید از داده ها به دقت محافظت کنند.
اما سایر متخصصان ژنتیک، با مطالعه مقاله، می گویند که به نظر آنها، این ادعا بسیار غلو امیز است...
مارک شریور، یک انسان شناس در دانشگاه ایالتی پنسیلوانیا در دانشگاه پارک، می گوید: "من فکر نمی کنم که این مقاله خیلی نگران کننده باشد، زیرا آنها هیچ توانایی این فرد را از DNA نشان نمی دهند."
از طرفی محققان دیگری با بررسی های بروی داده های این مقاله و چاپ ان در bioRxiv اعلام می دارند که داده های پایگاه داده HLI بسیار کوچک بوده و افزودن اطلاعات جنس سن و نژاد در مطالعات این مقاله باعث بوجود امدن این نتایج شده است و دانستن این سه عامل به تنهایی خود میتواند نتایج 74٪ را بدست اورد.
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🏳🔔مقاله ای که ادعا می کند قادر به پیش بینی چهره فرد از طریق ژنوم آن است
یک مقاله از کریگ ونتر پیشگام توالی یابی ژنوم که ادعا می کند از طریق DNA افراد امکان پیش بینی ویژگی های فیزیکی چهره آنها وجود دارد، طوفانی از انتقاد را براه انداخته است. داوران و حتی همکاران این مقاله می گویند که توانایی استفاده از ژن های یک شخص برای شناسایی فرد، که می تواند ترس های غیر ضروری برای حفظ حریم خصوصی ژنتیکی را افزایش دهد، بیش از حد است.
در مقاله1 که در تاریخ 5 سپتامبر در مجموعه آکادمی ملی علوم (PNAS) منتشر شده است، ونتر و همکارانش در شرکت ط Human Longevity, Inc. (HLI) ، که در سان دیگو کالیفرنیا مستقر هستند، کل ژنوم 1061 نفر از سنین و اقوام مختلف را توالی یابی کردند. با استفاده از داده های ژنتیکی، همراه با عکس های با کیفیت بالا 3D از چهره های شرکت کنندگان، محققان از روش هوش مصنوعی برای پیدا کردن تفاوت های کوچک در توالی های DNA، که SNP نامیده می شود، با ویژگی های چهره مانند طول استخوان گونه. استفاده کردند. این تیم همچنین SNP های که با عوامل مرتبط با قد، وزن، سن، ویژگی های صوتی و رنگ پوست ارتباط دارد، را مورد بررسی قرار دادند.
صحت این رویکرد برای شناسایی یک فرد را از یک گروه ده نفر که به طور تصادفی از پایگاه داده HLI انتخاب شده اند 74٪ بوده است. یافته های این مقاله نشان می دهد که سازمان های انتظامی، دانشمندان و دیگر افرادی که ژنوم انسان ها را اداره می کنند، باید از داده ها به دقت محافظت کنند.
اما سایر متخصصان ژنتیک، با مطالعه مقاله، می گویند که به نظر آنها، این ادعا بسیار غلو امیز است...
مارک شریور، یک انسان شناس در دانشگاه ایالتی پنسیلوانیا در دانشگاه پارک، می گوید: "من فکر نمی کنم که این مقاله خیلی نگران کننده باشد، زیرا آنها هیچ توانایی این فرد را از DNA نشان نمی دهند."
از طرفی محققان دیگری با بررسی های بروی داده های این مقاله و چاپ ان در bioRxiv اعلام می دارند که داده های پایگاه داده HLI بسیار کوچک بوده و افزودن اطلاعات جنس سن و نژاد در مطالعات این مقاله باعث بوجود امدن این نتایج شده است و دانستن این سه عامل به تنهایی خود میتواند نتایج 74٪ را بدست اورد.
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔سخنرانی با موضوع :
کاربرد متن کاوی در بیوانفورماتیک
Text Mining in Bioinformatics
خانم دکتر تنوری
⏳شنبه 25 شهریور ساعت 10 صبح
ثبت نام:goo.gl/ytir17
آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
کاربرد متن کاوی در بیوانفورماتیک
Text Mining in Bioinformatics
خانم دکتر تنوری
⏳شنبه 25 شهریور ساعت 10 صبح
ثبت نام:goo.gl/ytir17
آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔گزارش تصویری سخنرانی در زمینه های :
1) کاربرد متن کاوی در بیوانفورماتیک
و
2) روش های شناسایی اینتراکنش هدف دارو
📆شنبه 25 شهریور
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
1) کاربرد متن کاوی در بیوانفورماتیک
و
2) روش های شناسایی اینتراکنش هدف دارو
📆شنبه 25 شهریور
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📣 در چهارمین «نمایشگاه بین المللی زیست فناوری ایران» منتظر شما هستیم.
⏳27 الی 29 شهریور ماه
📌تهران - مصلی بزرگ امام خمینی (ره) -درب44 جنوبي - غرفه 448
@Practicalbioinformatics
⏳27 الی 29 شهریور ماه
📌تهران - مصلی بزرگ امام خمینی (ره) -درب44 جنوبي - غرفه 448
@Practicalbioinformatics
🔔امروز سالگرد تولد انتونی کلارک است. کسی که در سال 1951 گوسفندی را تغییر داد تا الفا 1 انتی تریپسین را در شیر خود تولید کند
دارویی که برای درمان فیبروسیس به کار میرود.
@Practicalbioinformatics
دارویی که برای درمان فیبروسیس به کار میرود.
@Practicalbioinformatics
خدمات داکینگ پارس سیلیکو :
داکینگ پروتئین-لیگاند
داکینگ پروتئین-پروتئین
داکینگ پروتئین-اسید نوکلئیک
داکینگ انتی ژن-انتی بادی
داکینگ پروتئین-پپتید
🌎 https://goo.gl/ZSbJM2
@practicalbioinformatics
داکینگ پروتئین-لیگاند
داکینگ پروتئین-پروتئین
داکینگ پروتئین-اسید نوکلئیک
داکینگ انتی ژن-انتی بادی
داکینگ پروتئین-پپتید
🌎 https://goo.gl/ZSbJM2
@practicalbioinformatics
Forwarded from Exirlabs
نظرسنجی اکونومیست درباره ی پیش بینی آینده ی صنعت سلامت از نظر 400 نفر از رهبران صنایع دنیای سلامت.
➡️ @ExirLabs
🌐www.Exirlabs.com
➡️ @ExirLabs
🌐www.Exirlabs.com
▪️بخش های مختلف بدن انسان با ترکیب های مختلفی از میکروبها پوشیده شده است.
▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
▪️میکروبهای تغییر دهنده ذهن : چگونه میکروبیوم برروی مغز و رفتار تاثیر می گذارد.!
🗣 Elaine Hsiao at TEDxCaltech
▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🗣 Elaine Hsiao at TEDxCaltech
▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics