ОПИУМ
269 subscribers
39 photos
3 videos
11 links
Автор @dnlkstrkn
Download Telegram
Оказалось, что я могу узнать поисковые запросы после просмотра моих видео
Путаница с количеством аминокислот, входящих в состав белков
В литературе и статьях встречается два основных варианта:
• В состав белков входит 20 α-аминокислот;
• В состав белков входит 21 α-аминокислота.
Отличие всего на одну аминокислоту — селеноцистеин. Почему один автор пишет про него, а другой нет? Может второй умнее? Или знает больше?

Формулировка «в состав белков входит» туманна. Даже слишком. К примеру, если я возьму коллаген и начну изучать его структуру, то найду две аминокислоты, которые не относятся к 20/21 стандартным: 4-гидроксипролин и 5-гидроксилизин.
Значит ли это, что в состав белков входят 22 или 23 аминокислоты? Нет! Если постараться, то можно найти ещё 4 аминокислоты, которые встречаются в некоторых белках: 6-N-метиллизин, гамма-карбоксиглутамат, десмозин и пирролизин.

Почему же некоторые аминокислоты относят к стандартным, а другие нет? Тут нужно добавить новое понятие — протеиногенные аминокислоты. Это аминокислоты, которые кодируются генетическим кодом - имеют свой триплет или кодон. Следовательно, эти аминокислоты включаются в белок в ходе трансляции — его синтеза.
Ниже можно посмотреть на такие аминокислоты. И их всего 20!
Гидроксипролин, гидроксилизин, гамма-карбоксиглутамат и десмозин не имеют своих кодонов - они образуются за счёт модификации аминокислот. Модификация — это изменение аминокислоты после того, как белок был синтезирован.
Эти аминокислоты будут получены из протеиногенных: гидроксипролин из пролина, гидроксилизин из лизина и так далее.
Модификация придаёт аминокислотам дополнительные свойства, которые потребуются белку.

Заметили, что я не назвал две аминокислоты? Да, селеноцистеин и пирролизин. С ними всё сложно...
Дело в том, что они включатся в состав белка в процессе его синтеза — во время трансляции. Но своих триплетов в генетическом коде не имеют. Пирролизин нас не интересует, потому что он встречается только у некоторых бактерий. Но селеноцистеин входит в состав белков нашего организма. Пример такого белка — глутатионпероксидаза.

Каким же образом селеноцистеин включается в белок, если у него нет триплета? Специальным способом — через стоп-кодон UGA. Но при одном условии — матричная РНК должна включать определенную последовательность. Она называется последовательность вставки селеноцистеина (SECIS) и включает ~ 60 нуклеотидов. Эта штука входит в мРНК, которые отвечают за синтез селен-содержащих белков. SECIS заставляет встраивать селеноцистеин на месте кодона UGA.
Если же в мРНК такой последовательности нет, то кодон UGA вызывает остановку синтеза белка.

Не каждый стоп-кодон UGA вызывает встраивание селеноцистеина - это, скорее, редкое исключение для некоторых матричных РНК.
Примерно такой же механизм характерен для пирролизина.

Из-за этого селеноцистеин не всегда относят к протеиногенным кислотам: где-то напишут про 20 аминокислот, а где-то про 21. И это не совсем честно, потому что пирролизин остаётся без внимания. Хотя имеет тот же механизм встраивания - пусть и встречается он только у бактерий.
Забыл прикрепить гидроксипролин/лизин
Потратил на эту схемку 12 часов, теперь ещё бы видео снять))
Зацените аргументы против Дарвиновской теории прямиком из 1867 года:

Представим себе белого человека, потерпевшего кораблекрушение на острове, населённом неграми… Наш выживший герой, возможно, станет среди них королём; он убьёт очень много чернокожих людей в борьбе за выживание; он заведёт очень много жён и детей, в то время как множество его подданных будут жить холостяками и умрут холостяками… Качества и способности нашего белого человека несомненно помогут ему дожить до глубокой старости, но даже его длинной жизни явно не хватит для того, чтобы кто-то из его потомков в каком-либо поколении стал полностью белым… В первом поколении будет несколько дюжин смышлёных молодых мулатов, чей ум будет в среднем превосходить негритянский. Нас не удивит, что трон в течение нескольких поколений будет принадлежать более или менее желтокожему королю; но сможет ли поверить кто-то, что население всего острова постепенно станет белым или пусть даже жёлтым?..
В нашем случае признак попал в исключительно благоприятные условия, способствующие его сохранению, — способствующие, и всё же неспособные закрепить и сохранить его.
-Флеминг Дженкин.

Тогда Мендель ещё не был широко известен научному миру, поэтому для Дарвина такие аргументы были неоспоримы - он даже назвал их «Кошмарами Дженкина»
Всё-таки меня удивляет самоуверенность жизни. Весь метаболизм держится на ферментах, но многие из них требуют коферментов. Что сделает умное существо? Правильно, будет синтезировать витамины, а из них получать коферменты. Большинство прокариот так и делает, что позволяет им освободиться ото всех цепей. Почти ото всех.
Что сделает ещё более умное существо? Откажется от метаболических путей, которые приводят к синтезу этих витаминов. И поставит себя в полную зависимость от пищи. Абсурд? Но это работает…
Не поймите меня не правильно, плюс у такого отказа есть и большой - не придется набирать армию ферментов, проводящих синтез витаминов. Так клетка освободит себе много энергии и аминокислот.
Но только представьте себе первую клеточку, которая решила порвать связи с самостоятельным синтезом. Это настоящая героиня. И все мы её потомки.
Ставь лайк, если тоже ничего не понимаешь, а смотреть картавого приходится…
Вчера смотрел на водомерок. Всегда думал, что они держатся на воде только за счёт гидрофобных липидов на лапках, но нет - там всё покруче. На лапках водомерок огромное количество микроскопических волосков, что увеличивает длину границы соприкосновения. Кстати, что-то похожее есть и у гекконов.
И вот эти волоски нужно постоянно покрывать липидами, а то водомерка утонет.
А вот ещё что-то интересненькое. Этот жук бегает прямо под водой! Предполагается, что под брюшком у него создаётся воздушный пузырь