Продолжается регистрация на VII Международную научно-практическую школу «Анализ единичных клеток»
Студенты магистратуры "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток", а также все заинтересованные приглашаются принять участие в научно-практической школе “Анализ единичных клеток” (ASCA WORKSHOP 2026), которая пройдет 27-29 мая в Томске.
Школа посвящена современным single-cell и пространственным омиксным технологиям и биоинформатическим методам анализа данных. Участники смогут познакомиться с актуальными инструментами и подходами в обработке биомедицинских данных, а также опробовать их на практических занятиях.
Мероприятие полезно студентам, магистрантам, аспирантам, а также научным сотрудникам, работающим на стыке биологии, медицины и биоинформатического анализа данных.
❗️ Регистрация до 23 марта.
Международные научно-практические школы «Анализ единичных клеток» проводятся с 2019 года и традиционно собирают ведущих ученых России и зарубежья, специалистов в области молекулярной и клеточной биологии и биоинформатики. За семь лет школа сформировала профессиональное сообщество, Ассоциацию анализа единичных клеток, объединившую уже более 400 человек из 48 стран.
Подробнее в карточках.
Студенты магистратуры "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток", а также все заинтересованные приглашаются принять участие в научно-практической школе “Анализ единичных клеток” (ASCA WORKSHOP 2026), которая пройдет 27-29 мая в Томске.
Школа посвящена современным single-cell и пространственным омиксным технологиям и биоинформатическим методам анализа данных. Участники смогут познакомиться с актуальными инструментами и подходами в обработке биомедицинских данных, а также опробовать их на практических занятиях.
Мероприятие полезно студентам, магистрантам, аспирантам, а также научным сотрудникам, работающим на стыке биологии, медицины и биоинформатического анализа данных.
❗️ Регистрация до 23 марта.
Международные научно-практические школы «Анализ единичных клеток» проводятся с 2019 года и традиционно собирают ведущих ученых России и зарубежья, специалистов в области молекулярной и клеточной биологии и биоинформатики. За семь лет школа сформировала профессиональное сообщество, Ассоциацию анализа единичных клеток, объединившую уже более 400 человек из 48 стран.
Подробнее в карточках.
❤2🥰2
Forwarded from Томский НИМЦ
🔬 «Знания из области биоинформатики сейчас не только преимущество, но и необходимость»
Магистрант Томского НИМЦ Елена Кравченко о том, как технологии анализа отдельных клеток могут помочь пациентам с кардиологическими заболеваниями.
📍 Елена Кравченко, научный сотрудник отделения клинической лабораторной диагностики НИИ кардиологии Томского НИМЦ. В 2025 году стала обладателем Стипендии Президента РФ.
🔗 Подробнее в материале
🔹 Узнать больше о магистратуре Томского НИМЦ
Магистрант Томского НИМЦ Елена Кравченко о том, как технологии анализа отдельных клеток могут помочь пациентам с кардиологическими заболеваниями.
📍 Елена Кравченко, научный сотрудник отделения клинической лабораторной диагностики НИИ кардиологии Томского НИМЦ. В 2025 году стала обладателем Стипендии Президента РФ.
— Тема моей магистерской диссертации «Мета-анализ данных РНК-секвенирования отдельных клеток при атеросклерозе коронарных, сонных и бедренных артерий». Мы видим интерес со стороны клиницистов к результатам исследования, поскольку они ежедневно сталкиваются с тем, что течение и симптомы атеросклероза варьируются в зависимости от локализации поражения. Результаты нашей работы помогут усовершенствовать подходы к лечению атеросклероза, — поделилась Елена Кравченко.
🔗 Подробнее в материале
🔹 Узнать больше о магистратуре Томского НИМЦ
❤7👏2
Преподаватели магистратуры - Марат Сабиров
🎓 Продолжаем знакомить вас с преподавателями магистратуры Томского НИМЦ! Сегодня в рубрике «Будем знакомы» канд. биол. наук Марат Сабиров.
Программа магистратуры «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» позволяет овладеть актуальным набором знаний и умений для работы в разных областях науки и индустрии. Кроме этого, она дает возможность познакомиться со специалистами, которые непосредственно применяют эти знания и навыки в своих исследованиях.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
🎓 Продолжаем знакомить вас с преподавателями магистратуры Томского НИМЦ! Сегодня в рубрике «Будем знакомы» канд. биол. наук Марат Сабиров.
Программа магистратуры «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» позволяет овладеть актуальным набором знаний и умений для работы в разных областях науки и индустрии. Кроме этого, она дает возможность познакомиться со специалистами, которые непосредственно применяют эти знания и навыки в своих исследованиях.
Я веду курс «Эпигеномика единичных клеток». Он посвящен современным подходам к изучению регуляции экспрессии генов на уровне отдельных клеток. В рамках курса магистранты знакомятся с основами регуляторной геномики, разнообразием регуляторных элементов и методами их изучения как в bulk-, так и в single-cell разрешении. Особое внимание уделяется анализу данных современных технологий, таких как scATAC-seq, а также методам реконструкции взаимодействий между регуляторными элементами генома.
По итогам курса студенты формируют понимание принципов эпигенетической регуляции, осваивают навыки работы с данными эпигеномных исследований на уровне единичных клеток и учатся применять эти подходы для решения актуальных задач.
Хочу пожелать нашим магистрантам каждый день сталкиваться с задачами, которые они не знают, как решить. Успешно с ними справляться и не бояться трудностей, ведь именно сложные новые вызовы помогают профессиональному росту.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
👍7❤1🥰1
🌊 На гребне науки: Мария Королева о том, как совмещать магистратуру и профессиональный спорт
Мария Королева проходит обучение по новой магистерской программе Томского НИМЦ «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток». В интервью она рассказала, как удается совмещать науку с профессиональным спортом, а также о планах на будущее и перспективах применения знаний из области биоинформатики в своих исследованиях.
🔗 Подробнее в материале
🎓 Подробнее о магистратуре Томского НИМЦ
Мария Королева проходит обучение по новой магистерской программе Томского НИМЦ «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток». В интервью она рассказала, как удается совмещать науку с профессиональным спортом, а также о планах на будущее и перспективах применения знаний из области биоинформатики в своих исследованиях.
Важное преимущество магистратуры — уникальный материал лекций: нас учат ведущие ученые, которые строят курсы на основе актуальных мировых статей, а не базовых учебных пособий. Программа очень интенсивная — порой поток информации кажется запредельным, однако при подготовке к экзамену или зачету по конкретным темам как будто все встает на свои места. Особенно ценно, что Томский НИМЦ делает ставку на практику и активно развивает сотрудничество между научными центрами Томска и Москвы.
🔗 Подробнее в материале
🎓 Подробнее о магистратуре Томского НИМЦ
❤8🔥3👍1🥰1
🧬 Транскриптомика единичных клеток
📚 Один из ключевых курсов магистратуры - «Транскриптомика единичных клеток» (2 семестр, 108 часов), посвящён современным подходам к анализу данных single-cell RNA-seq.
В рамках курса студенты знакомятся с основными технологиями секвенирования РНК единичных клеток и возможностями их применения, осваивают полный цикл анализа данных: от предобработки, контроля качества и нормализации до кластеризации, визуализации и анализа дифференциальной экспрессии. Особое внимание уделяется задачам идентификации клеточных типов, анализу траекторий развития, а также изучению межклеточных коммуникаций. Практическая часть курса включает работу с реальными биомедицинскими данными.
✨ Курс ведёт Хозяинова Анна Алексеевна, младший научный сотрудник лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ. Среди приглашённых лекторов Alexander Predeus (Principal Bioinformatician, Wellcome Sanger Institute) с лекцией о деконволюции клеточного состава и биологической интерпретации данных РНК-секвенирования при помощи референсных транскриптомных атласов единичных клеток и Roman Sankowski (Medical Professional, University Medical Center Freiburg), прочитает лекцию о коррекции батч-эффекта в данных РНК-секвенирования.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
📚 Один из ключевых курсов магистратуры - «Транскриптомика единичных клеток» (2 семестр, 108 часов), посвящён современным подходам к анализу данных single-cell RNA-seq.
В рамках курса студенты знакомятся с основными технологиями секвенирования РНК единичных клеток и возможностями их применения, осваивают полный цикл анализа данных: от предобработки, контроля качества и нормализации до кластеризации, визуализации и анализа дифференциальной экспрессии. Особое внимание уделяется задачам идентификации клеточных типов, анализу траекторий развития, а также изучению межклеточных коммуникаций. Практическая часть курса включает работу с реальными биомедицинскими данными.
✨ Курс ведёт Хозяинова Анна Алексеевна, младший научный сотрудник лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ. Среди приглашённых лекторов Alexander Predeus (Principal Bioinformatician, Wellcome Sanger Institute) с лекцией о деконволюции клеточного состава и биологической интерпретации данных РНК-секвенирования при помощи референсных транскриптомных атласов единичных клеток и Roman Sankowski (Medical Professional, University Medical Center Freiburg), прочитает лекцию о коррекции батч-эффекта в данных РНК-секвенирования.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
🔥4❤1👍1🥰1
🧬 От клеточных моделей к биоинформатике единичных клеток
Магистрант Томского НИМЦ Роза Сарыглар рассказала о своем опыте обучения по программе «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» и исследованиях на стыке экспериментальной биологии и анализа данных.
🔗 Подробнее в материале
🎓 Подробнее о программе магистратуры
Магистрант Томского НИМЦ Роза Сарыглар рассказала о своем опыте обучения по программе «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» и исследованиях на стыке экспериментальной биологии и анализа данных.
«Программа «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» закрывает именно тот разрыв, который я ощущала в своей подготовке: она объединяет глубокое понимание биологии с современными вычислительными подходами. Для меня важно, что нас обучают преподаватели, которые сами активно работают в области single-cell исследований».
🔗 Подробнее в материале
🎓 Подробнее о программе магистратуры
❤4👍2
🎓 Мы запускаем цикл открытых онлайн-лекций!
Приглашаем студентов и всех заинтересованных присоединиться к первой лекции.
🧬 Тема: Поиск антивирусных препаратов широкого спектра для подготовки к будущим пандемиям
🧑🔬Лектор: Александр Яневски, PhD, Европейский университет в Санкт-Петербурге
📅 Дата: 5 мая
🕒 Время: 12:00 Мск
💻 Платформа: Zoom
На лекции будут рассмотрены современные подходы биоинформатики к разработке противовирусных препаратов, а также роль вычислительных методов в подготовке к будущим эпидемиологическим вызовам.
🔗 Регистрация по ссылке
🎓 Подробнее о магистратуре
Приглашаем студентов и всех заинтересованных присоединиться к первой лекции.
🧬 Тема: Поиск антивирусных препаратов широкого спектра для подготовки к будущим пандемиям
🧑🔬Лектор: Александр Яневски, PhD, Европейский университет в Санкт-Петербурге
📅 Дата: 5 мая
🕒 Время: 12:00 Мск
💻 Платформа: Zoom
На лекции будут рассмотрены современные подходы биоинформатики к разработке противовирусных препаратов, а также роль вычислительных методов в подготовке к будущим эпидемиологическим вызовам.
🔗 Регистрация по ссылке
🎓 Подробнее о магистратуре
🔥11❤1
🎓 Преподаватели магистратуры: Константин Оконечников
Продолжаем рубрику «Наставники». Сегодня познакомим Вас с преподавателем магистерской программы «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» Константином Оконечниковым.
— Магистратура Томского НИМЦ открывает широкие возможности как для научной карьеры, так и для работы в высокотехнологичных направлениях биомедицины, фармацевтики и IT. Это время, когда можно углубиться в выбранную специализацию, получить практический опыт исследований, научиться работать с современными данными и технологиями, а также сформировать профессиональные связи с научными группами и индустрией.
Особенно важно понимать, что технологии сегодня развиваются очень быстро: инструменты анализа, методы секвенирования и вычислительные подходы постоянно меняются. Однако базовые навыки, полученные в магистратуре такие как умение анализировать данные, критически мыслить, работать с научной литературой, решать сложные задачи и быстро осваивать новое, остаются актуальными на протяжении всей карьеры. Именно они дают устойчивую основу для профессионального роста.
Мой курс «Использование методик секвенирования единичных клеток в исследованиях и диагностике рака» посвящён современным подходам к изучению онкологических заболеваний на уровне отдельных клеток. В рамках курса рассматриваются вопросы гетерогенности опухолей, их эволюции и метастазирования, а также роль геномных, транскриптомных и эпигеномных изменений в развитии рака. Особое внимание уделяется методам single-cell секвенирования (ДНК, РНК, эпигеномика), мультиомиксным подходам и пространственной транскриптомике, а также их применению в диагностике и прецизионной онкологии. По итогам курса магистранты формируют понимание современных технологий анализа опухолей на уровне единичных клеток, осваивают базовые подходы к работе с соответствующими данными и учатся применять эти методы для решения исследовательских и клинических задач в онкологии.
Желаю нашим магистрантам не бояться сложных задач и новых областей знаний. Биоинформатика находится на стыке биологии, медицины, математики и программирования, поэтому сначала может казаться, что нужно знать слишком много. Но именно постепенное освоение разных направлений делает обучение особенно интересным и перспективным.
Я бы посоветовал больше пробовать самостоятельно: запускать программы, анализировать реальные данные, читать современные статьи, задавать вопросы и не бояться ошибок. Практика даёт гораздо больше, чем пассивное изучение теории. Также важно сохранять любопытство — именно оно помогает двигаться вперёд, замечать новые возможности и находить нестандартные решения. Магистратура — это хорошее время, чтобы экспериментировать, искать свою специализацию и закладывать фундамент будущей карьеры.
🔗 Подробнее о программе магистратуры
Продолжаем рубрику «Наставники». Сегодня познакомим Вас с преподавателем магистерской программы «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» Константином Оконечниковым.
— Магистратура Томского НИМЦ открывает широкие возможности как для научной карьеры, так и для работы в высокотехнологичных направлениях биомедицины, фармацевтики и IT. Это время, когда можно углубиться в выбранную специализацию, получить практический опыт исследований, научиться работать с современными данными и технологиями, а также сформировать профессиональные связи с научными группами и индустрией.
Особенно важно понимать, что технологии сегодня развиваются очень быстро: инструменты анализа, методы секвенирования и вычислительные подходы постоянно меняются. Однако базовые навыки, полученные в магистратуре такие как умение анализировать данные, критически мыслить, работать с научной литературой, решать сложные задачи и быстро осваивать новое, остаются актуальными на протяжении всей карьеры. Именно они дают устойчивую основу для профессионального роста.
Мой курс «Использование методик секвенирования единичных клеток в исследованиях и диагностике рака» посвящён современным подходам к изучению онкологических заболеваний на уровне отдельных клеток. В рамках курса рассматриваются вопросы гетерогенности опухолей, их эволюции и метастазирования, а также роль геномных, транскриптомных и эпигеномных изменений в развитии рака. Особое внимание уделяется методам single-cell секвенирования (ДНК, РНК, эпигеномика), мультиомиксным подходам и пространственной транскриптомике, а также их применению в диагностике и прецизионной онкологии. По итогам курса магистранты формируют понимание современных технологий анализа опухолей на уровне единичных клеток, осваивают базовые подходы к работе с соответствующими данными и учатся применять эти методы для решения исследовательских и клинических задач в онкологии.
Желаю нашим магистрантам не бояться сложных задач и новых областей знаний. Биоинформатика находится на стыке биологии, медицины, математики и программирования, поэтому сначала может казаться, что нужно знать слишком много. Но именно постепенное освоение разных направлений делает обучение особенно интересным и перспективным.
Я бы посоветовал больше пробовать самостоятельно: запускать программы, анализировать реальные данные, читать современные статьи, задавать вопросы и не бояться ошибок. Практика даёт гораздо больше, чем пассивное изучение теории. Также важно сохранять любопытство — именно оно помогает двигаться вперёд, замечать новые возможности и находить нестандартные решения. Магистратура — это хорошее время, чтобы экспериментировать, искать свою специализацию и закладывать фундамент будущей карьеры.
🔗 Подробнее о программе магистратуры
🔥7❤1👍1
🎓 Продолжаем цикл открытых онлайн-лекций!
Приглашаем всех заинтересованных присоединиться ко второй лекции.
🧬 Тема: 3D-геномика единичных клеток
🧑🔬Лектор: Никита Ваулин, Медицинский университет Вены
📅 Дата: 12 мая
🕒 Время: 11:00 Мск
💻 Платформа: Zoom
На лекции обсудим, что конформация хроматина — ключ к пониманию и механистическому описанию регуляции экспрессии генов. Single-cell Hi-C и родственные методы позволяют увидеть, как разные ген-регуляторные программы реализуются в разных клеточных типах, а комбинация scHi-C с мультиомиксными подходами даёт возможность изучать эти программы сразу на нескольких уровнях.
🔗 Регистрация по ссылке
🎓 Подробнее о магистратуре
Приглашаем всех заинтересованных присоединиться ко второй лекции.
🧬 Тема: 3D-геномика единичных клеток
🧑🔬Лектор: Никита Ваулин, Медицинский университет Вены
📅 Дата: 12 мая
🕒 Время: 11:00 Мск
💻 Платформа: Zoom
На лекции обсудим, что конформация хроматина — ключ к пониманию и механистическому описанию регуляции экспрессии генов. Single-cell Hi-C и родственные методы позволяют увидеть, как разные ген-регуляторные программы реализуются в разных клеточных типах, а комбинация scHi-C с мультиомиксными подходами даёт возможность изучать эти программы сразу на нескольких уровнях.
🔗 Регистрация по ссылке
🎓 Подробнее о магистратуре
🔥6❤3👍1
Forwarded from Bioinformatics Institute
Продолжается приём заявок на интенсив по статистике для биологов и медиков, который пройдёт с 20 мая по 13 июня!
bioinf.me/education/workshops/stat | Регистрация открыта до 18 мая, 23:59 МСК
Если вы давно хотели разобраться в статистике, но не знали, с чего начать – этот интенсив для вас!
За месяц участники пройдут путь от основ биостатистики до многофакторного анализа данных, познакомятся с языком программирования R и научатся грамотно визуализировать и интерпретировать данные.
Для участия необходимо до 18 мая, 23:59 МСК:
🌱 пройти вводный курс на Stepik
🌱 заполнить анкету, которая станет доступна после прохождения курса
Ждём ваших заявок!❤️
✨ Мы в VK | Мы в почте | Мы в Telegram
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute
bioinf.me/education/workshops/stat | Регистрация открыта до 18 мая, 23:59 МСК
Если вы давно хотели разобраться в статистике, но не знали, с чего начать – этот интенсив для вас!
За месяц участники пройдут путь от основ биостатистики до многофакторного анализа данных, познакомятся с языком программирования R и научатся грамотно визуализировать и интерпретировать данные.
Для участия необходимо до 18 мая, 23:59 МСК:
Ждём ваших заявок!
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥3❤1👍1
Новый сервер для биоинформатических вычислений студентов
✨Хорошие новости! Для студентов магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" теперь доступен вычислительный сервер для анализа данных и работы с биоинформатическими задачами.
В распоряжение магистрантов предоставлен сервер HPE ProLiant DL380 Gen10, оснащённый двумя процессорами Intel Xeon Gold 6252, 256 ГБ оперативной памяти и дисковым пространством около 5 ТБ.
Сервер позволит студентам выполнять ресурсоёмкие вычисления, работать с большими биомедицинскими данными и запускать собственные аналитические пайплайны в рамках учебных и исследовательских проектов.
🎓 Подробнее о программе магистратуры
✨Хорошие новости! Для студентов магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" теперь доступен вычислительный сервер для анализа данных и работы с биоинформатическими задачами.
В распоряжение магистрантов предоставлен сервер HPE ProLiant DL380 Gen10, оснащённый двумя процессорами Intel Xeon Gold 6252, 256 ГБ оперативной памяти и дисковым пространством около 5 ТБ.
Сервер позволит студентам выполнять ресурсоёмкие вычисления, работать с большими биомедицинскими данными и запускать собственные аналитические пайплайны в рамках учебных и исследовательских проектов.
🎓 Подробнее о программе магистратуры
🔥11❤1