— Тема моей магистерской диссертации «Мета-анализ данных РНК-секвенирования отдельных клеток при атеросклерозе коронарных, сонных и бедренных артерий». Мы видим интерес со стороны клиницистов к результатам исследования, поскольку они ежедневно сталкиваются с тем, что течение и симптомы атеросклероза варьируются в зависимости от локализации поражения. Результаты нашей работы помогут усовершенствовать подходы к лечению атеросклероза, — поделилась Елена Кравченко.

Я веду курс «Эпигеномика единичных клеток». Он посвящен современным подходам к изучению регуляции экспрессии генов на уровне отдельных клеток. В рамках курса магистранты знакомятся с основами регуляторной геномики, разнообразием регуляторных элементов и методами их изучения как в bulk-, так и в single-cell разрешении. Особое внимание уделяется анализу данных современных технологий, таких как scATAC-seq, а также методам реконструкции взаимодействий между регуляторными элементами генома.

По итогам курса студенты формируют понимание принципов эпигенетической регуляции, осваивают навыки работы с данными эпигеномных исследований на уровне единичных клеток и учатся применять эти подходы для решения актуальных задач.

Хочу пожелать нашим магистрантам каждый день сталкиваться с задачами, которые они не знают, как решить. Успешно с ними справляться и не бояться трудностей, ведь именно сложные новые вызовы помогают профессиональному росту.

Свой путь в науку я начал с аспирантуры в 2009 году. Сейчас являюсь научным сотрудником лаборатории патофизиологии и экспериментальной терапии НИИ фармакологии и регенеративной медицины им. Е.Д. Гольдберга Томского НИМЦ.  Мои научные интересы сконцентрированы на поиске новых препаратов при нейродегенеративных состояниях, и, в частности, на фармакологической стимуляции нейрогенеза при болезни Альцгеймера и алкогольной энцефалопатии.

Отчасти решение поступить в магистратуру было неожиданным даже для самого себя. Главный стимул – получение принципиально новых знаний в области биоинформатики, которые могут сильно помочь в научных изысканиях нашей лаборатории. Никогда не скучно учиться чему-то новому!

В рамках магистерской диссертации я планирую изучить, какие изменения на уровне генов происходят в разных клетках мозга из-за хронического недосыпа. Известно, что одни клетки при недосыпе «испытывают стресс, работают плохо», а другие, наоборот, «активизируются» — именно этот дисбаланс приводит к нарушениям памяти, психоэмоциональным проблемам, а также повышает риск сосудистых катастроф и онкологических заболеваний.

Наша цель — найти универсальный генетический ответ мозга на депривацию сна, общий как для лабораторной мыши, так и для человека.

В перспективе это исследование может быть полезно при разработке новых лекарственных препаратов для лечения бессонницы и сопутствующих ей проблем.

Обучение в магистратуре очень интенсивное. Большой плюс сама программа:  максимум необходимых предметов и ничего лишнего. За время обучения я значительно расширил свой кругозор. Например, раздел по основам программирования стал для меня абсолютно новым опытом.

По окончании обучения в магистратуре есть планы применить полученные знания  в рамках исследований в области фармакологической стратегии регенерации нервной ткани.