Студенты презентовали результаты ознакомительной практики

Студенты магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" успешно защитили результаты своей ознакомительной практики по биоинформатике.

В ходе практики они погрузились в реальные исследовательские задачи, познакомились с современными подходами к анализу биомедицинских данных и работой научных подразделений Томского НИМЦ, МГУ, РУДН, Института цитологии и генетики и НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина.

Практика была направлена на формирование ключевых профессиональных компетенций:

- понимание современных достижений и методологических основ биологии и смежных дисциплин и их применения в омиксных исследованиях
- умение использовать компьютерные технологии для решения задач анализа биомедицинских данных
- знакомство с принципами и возможностями омиксных технологий и приобретение навыков их выбора под исследовательские задачи

Защита прошла в формате презентаций, где студенты представили полученный опыт и первые шаги в работе с реальными научными данными.

Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/

Томский НИМЦ: базовая площадка магистратуры

Базовой площадкой магистерской программы является Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук (Томский НИМЦ) - крупнейший академический медицинский научный центр в системе Минобрнауки России. Томский НИМЦ был основан в 2016 году, он объединяет академические институты медицинского профиля: НИИ онкологии, НИИ кардиологии, НИИ психического здоровья, НИИ медицинской генетики, НИИ фармакологии и регенеративной медицины имени Е.Д. Гольдберга (г. Томск) и филиал в г. Тюмень - Тюменский кардиологический научный центр.

В составе Томского НИМЦ функционируют порядка 50 научных лабораторий, а также 6 специализированных клиник на 1086 коек, обеспечивающих ежегодно обследование и лечение около 150000 пациентов по таким профилям медицинской помощи как кардиология для взрослых и детей, кардиохирургия, реанимация, онкология, педиатрия, неврология, терапия, психиатрия, радиология.

В настоящее время практическая подготовка студентов проходит на базе НИИ медицинской генетики, НИИ онкологии и Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ, где обучающиеся включаются в действующие научные проекты и получают опыт работы с современными лабораторными и аналитическими технологиями.

Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/

Преподаватель магистратуры – Евгений Денисов

🎓 Мы начинаем серию постов про преподавателей и студентов магистратуры! Чтобы лучше познакомить вас с программой и людьми, которые ее создают, мы подготовили небольшие интервью с преподавателями и студентами. Первый герой рубрики - руководитель и преподаватель магистерской программы, Денисов Евгений Владимирович.

- Расскажите о Вашем курсе. Чему он посвящен? Какие навыки освоят магистранты по окончании курса?

Мой курс «Омиксные технологии» в 1 семестре программы является вводным и посвящён современным высокопроизводительным технологиям анализа генома, эпигенома, транскриптома, протеома и метаболома, в том числе на уровне единичных клеток и пространственного разрешения. Курс также включает практические занятия по различным вариантам секвенирования (NGS).

- Как Вы думаете, какие потенциальные возможности открывает магистратура?

Программа магистратуры открывает доступ к современным высокотехнологичным методам анализа генетической информации; дает возможность принимать участие в самых передовых научных проектах и получать знания от ведущих ученых в сфере биоинформатики единичных клеток.

- Что бы Вы пожелали абитуриентам и первокурсникам программы?

В нашей сфере технологии развиваются стремительно, желаю нашим абитуриентам и первокурсникам не терять энергии и жажды получать новые знания, делиться опытом. Как очень точно отметил Льюис Кэрролл в книге «Алиса в Зазеркалье», «нужно бежать со всех ног, чтобы только оставаться на месте, а чтобы куда-то попасть, надо бежать как минимум вдвое быстрее!»

Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/

🔬 «Знания из области биоинформатики сейчас не только преимущество, но и необходимость»

Магистрант Томского НИМЦ Елена Кравченко о том, как технологии анализа отдельных клеток могут помочь пациентам с кардиологическими заболеваниями.

📍 Елена Кравченко, научный сотрудник отделения клинической лабораторной диагностики НИИ кардиологии Томского НИМЦ. В 2025 году стала обладателем Стипендии Президента РФ.

— Тема моей магистерской диссертации «Мета-анализ данных РНК-секвенирования отдельных клеток при атеросклерозе коронарных, сонных и бедренных артерий». Мы видим интерес со стороны клиницистов к результатам исследования, поскольку они ежедневно сталкиваются с тем, что течение и симптомы атеросклероза варьируются в зависимости от локализации поражения. Результаты нашей работы помогут усовершенствовать подходы к лечению атеросклероза, — поделилась Елена Кравченко.

🔗 Подробнее в материале

🔹 Узнать больше о магистратуре Томского НИМЦ

Преподаватели магистратуры - Марат Сабиров

🎓 Продолжаем знакомить вас с преподавателями магистратуры Томского НИМЦ! Сегодня в рубрике «Будем знакомы» канд. биол. наук Марат Сабиров.

Программа магистратуры «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» позволяет овладеть актуальным набором знаний и умений для работы в разных областях науки и индустрии. Кроме этого, она дает возможность познакомиться со специалистами, которые непосредственно применяют эти знания и навыки в своих исследованиях.

Я веду курс «Эпигеномика единичных клеток». Он посвящен современным подходам к изучению регуляции экспрессии генов на уровне отдельных клеток. В рамках курса магистранты знакомятся с основами регуляторной геномики, разнообразием регуляторных элементов и методами их изучения как в bulk-, так и в single-cell разрешении. Особое внимание уделяется анализу данных современных технологий, таких как scATAC-seq, а также методам реконструкции взаимодействий между регуляторными элементами генома.

По итогам курса студенты формируют понимание принципов эпигенетической регуляции, осваивают навыки работы с данными эпигеномных исследований на уровне единичных клеток и учатся применять эти подходы для решения актуальных задач.

Хочу пожелать нашим магистрантам каждый день сталкиваться с задачами, которые они не знают, как решить. Успешно с ними справляться и не бояться трудностей, ведь именно сложные новые вызовы помогают профессиональному росту.

Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/