В Томске работает первая в России магистерская программа по биоинформатике с фокусом на мультиомику единичных клеток
Первая в России магистерская программа "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток", сочетающая в себе теоретическое и практическое обучение в области мультиомики единичных клеток, была открыта на базе Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук (Томского НИМЦ) в 2025 году. Программа нацелена на подготовку специалистов, способных использовать самые современные подходы в биоинформатике.
Курс обучения охватывает полный цикл подготовки - от фундаментальных дисциплин, таких как молекулярная биология, генетика человека и молекулярная эволюция, до прикладных направлений биоинформатики и анализа данных. Студенты осваивают программирование, работу с Linux-системами и биостатистику в R, изучают омиксные технологии, методы анализа геномных и транскриптомных данных, а также специализированные курсы по геномике, транскриптомике и эпигеномике единичных клеток.
Преподаватели программы - это эксперты из Томского НИМЦ, МГУ, РУДН, Института биологии развития, ЦСП ФМБА России, Harvard Medical School, Hopp-Children's Cancer Center Heidelberg, Wellcome Sanger Institute и других ведущих научных и медицинских учреждений, которые обладают богатым научным и педагогическим опытом в области биоинформатики, генетики и молекулярной биологии.
Если вы хотите стать экспертом в области биоинформатики, работать с передовыми технологиями и внести свой вклад в развитие медицинской науки, поступайте на магистерскую программу в Томском НИМЦ.
В 2025 году к обучению приступили 9 человек; следующий набор начнется в июне 2026 года.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
Первая в России магистерская программа "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток", сочетающая в себе теоретическое и практическое обучение в области мультиомики единичных клеток, была открыта на базе Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук (Томского НИМЦ) в 2025 году. Программа нацелена на подготовку специалистов, способных использовать самые современные подходы в биоинформатике.
Курс обучения охватывает полный цикл подготовки - от фундаментальных дисциплин, таких как молекулярная биология, генетика человека и молекулярная эволюция, до прикладных направлений биоинформатики и анализа данных. Студенты осваивают программирование, работу с Linux-системами и биостатистику в R, изучают омиксные технологии, методы анализа геномных и транскриптомных данных, а также специализированные курсы по геномике, транскриптомике и эпигеномике единичных клеток.
Преподаватели программы - это эксперты из Томского НИМЦ, МГУ, РУДН, Института биологии развития, ЦСП ФМБА России, Harvard Medical School, Hopp-Children's Cancer Center Heidelberg, Wellcome Sanger Institute и других ведущих научных и медицинских учреждений, которые обладают богатым научным и педагогическим опытом в области биоинформатики, генетики и молекулярной биологии.
Если вы хотите стать экспертом в области биоинформатики, работать с передовыми технологиями и внести свой вклад в развитие медицинской науки, поступайте на магистерскую программу в Томском НИМЦ.
В 2025 году к обучению приступили 9 человек; следующий набор начнется в июне 2026 года.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
❤9
Зачем биоинформатику «мокрая» биология?
Рассказывает руководитель Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ Павел Ямщиков:
Уже на этапе планирования эксперимента биоинформатик может предложить экспериментальные решения (например, дополнительные контроли или сбор дополнительной информации для метаданных) для того, чтобы потом было проще и надёжнее анализировать данные. Кроме того, понимание лабораторных этапов и знание сильных и слабых сторон «мокрых» методик помогает корректно интерпретировать результаты: видеть, как протокол подготовки библиотеки влияет на результаты секвенирования и отличать настоящую биологическую вариабельность от экспериментальных ошибок.
Лабораторная практика – один из лучших способов разобраться в тонкостях экспериментальной части. В рамках Магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" такая возможность доступна студентам на первом курсе обучения. Так, студенты проходят практику по различным вариантам NGS, включая секвенирование единичных клеток и пространственную транскриптомику, на базе лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ (Томск) или лаборатории биологии единичных клеток НИИ молекулярной и клеточной медицины Медицинского института РУДН (Москва).
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
Рассказывает руководитель Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ Павел Ямщиков:
Не обязательно (и чаще всего невозможно) быть экспертом одновременно и в «мокрой», и в «сухой» биологии. Зато для эффективного сотрудничества и корректного анализа данных биоинформатику полезно разбираться в том, как работают «мокрые» биологи.
Уже на этапе планирования эксперимента биоинформатик может предложить экспериментальные решения (например, дополнительные контроли или сбор дополнительной информации для метаданных) для того, чтобы потом было проще и надёжнее анализировать данные. Кроме того, понимание лабораторных этапов и знание сильных и слабых сторон «мокрых» методик помогает корректно интерпретировать результаты: видеть, как протокол подготовки библиотеки влияет на результаты секвенирования и отличать настоящую биологическую вариабельность от экспериментальных ошибок.
Лабораторная практика – один из лучших способов разобраться в тонкостях экспериментальной части. В рамках Магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" такая возможность доступна студентам на первом курсе обучения. Так, студенты проходят практику по различным вариантам NGS, включая секвенирование единичных клеток и пространственную транскриптомику, на базе лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ (Томск) или лаборатории биологии единичных клеток НИИ молекулярной и клеточной медицины Медицинского института РУДН (Москва).
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
❤13
Студенты презентовали результаты ознакомительной практики
Студенты магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" успешно защитили результаты своей ознакомительной практики по биоинформатике.
В ходе практики они погрузились в реальные исследовательские задачи, познакомились с современными подходами к анализу биомедицинских данных и работой научных подразделений Томского НИМЦ, МГУ, РУДН, Института цитологии и генетики и НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина.
Практика была направлена на формирование ключевых профессиональных компетенций:
- понимание современных достижений и методологических основ биологии и смежных дисциплин и их применения в омиксных исследованиях
- умение использовать компьютерные технологии для решения задач анализа биомедицинских данных
- знакомство с принципами и возможностями омиксных технологий и приобретение навыков их выбора под исследовательские задачи
Защита прошла в формате презентаций, где студенты представили полученный опыт и первые шаги в работе с реальными научными данными.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
Студенты магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" успешно защитили результаты своей ознакомительной практики по биоинформатике.
В ходе практики они погрузились в реальные исследовательские задачи, познакомились с современными подходами к анализу биомедицинских данных и работой научных подразделений Томского НИМЦ, МГУ, РУДН, Института цитологии и генетики и НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина.
Практика была направлена на формирование ключевых профессиональных компетенций:
- понимание современных достижений и методологических основ биологии и смежных дисциплин и их применения в омиксных исследованиях
- умение использовать компьютерные технологии для решения задач анализа биомедицинских данных
- знакомство с принципами и возможностями омиксных технологий и приобретение навыков их выбора под исследовательские задачи
Защита прошла в формате презентаций, где студенты представили полученный опыт и первые шаги в работе с реальными научными данными.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
❤6👍2🔥1👏1
Томский НИМЦ: базовая площадка магистратуры
Базовой площадкой магистерской программы является Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук (Томский НИМЦ) - крупнейший академический медицинский научный центр в системе Минобрнауки России. Томский НИМЦ был основан в 2016 году, он объединяет академические институты медицинского профиля: НИИ онкологии, НИИ кардиологии, НИИ психического здоровья, НИИ медицинской генетики, НИИ фармакологии и регенеративной медицины имени Е.Д. Гольдберга (г. Томск) и филиал в г. Тюмень - Тюменский кардиологический научный центр.
В составе Томского НИМЦ функционируют порядка 50 научных лабораторий, а также 6 специализированных клиник на 1086 коек, обеспечивающих ежегодно обследование и лечение около 150000 пациентов по таким профилям медицинской помощи как кардиология для взрослых и детей, кардиохирургия, реанимация, онкология, педиатрия, неврология, терапия, психиатрия, радиология.
В настоящее время практическая подготовка студентов проходит на базе НИИ медицинской генетики, НИИ онкологии и Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ, где обучающиеся включаются в действующие научные проекты и получают опыт работы с современными лабораторными и аналитическими технологиями.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
Базовой площадкой магистерской программы является Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук (Томский НИМЦ) - крупнейший академический медицинский научный центр в системе Минобрнауки России. Томский НИМЦ был основан в 2016 году, он объединяет академические институты медицинского профиля: НИИ онкологии, НИИ кардиологии, НИИ психического здоровья, НИИ медицинской генетики, НИИ фармакологии и регенеративной медицины имени Е.Д. Гольдберга (г. Томск) и филиал в г. Тюмень - Тюменский кардиологический научный центр.
В составе Томского НИМЦ функционируют порядка 50 научных лабораторий, а также 6 специализированных клиник на 1086 коек, обеспечивающих ежегодно обследование и лечение около 150000 пациентов по таким профилям медицинской помощи как кардиология для взрослых и детей, кардиохирургия, реанимация, онкология, педиатрия, неврология, терапия, психиатрия, радиология.
В настоящее время практическая подготовка студентов проходит на базе НИИ медицинской генетики, НИИ онкологии и Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ, где обучающиеся включаются в действующие научные проекты и получают опыт работы с современными лабораторными и аналитическими технологиями.
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
❤8🔥4
Преподаватель магистратуры – Евгений Денисов
🎓 Мы начинаем серию постов про преподавателей и студентов магистратуры! Чтобы лучше познакомить вас с программой и людьми, которые ее создают, мы подготовили небольшие интервью с преподавателями и студентами. Первый герой рубрики - руководитель и преподаватель магистерской программы, Денисов Евгений Владимирович.
- Расскажите о Вашем курсе. Чему он посвящен? Какие навыки освоят магистранты по окончании курса?
- Как Вы думаете, какие потенциальные возможности открывает магистратура?
- Что бы Вы пожелали абитуриентам и первокурсникам программы?
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
🎓 Мы начинаем серию постов про преподавателей и студентов магистратуры! Чтобы лучше познакомить вас с программой и людьми, которые ее создают, мы подготовили небольшие интервью с преподавателями и студентами. Первый герой рубрики - руководитель и преподаватель магистерской программы, Денисов Евгений Владимирович.
- Расскажите о Вашем курсе. Чему он посвящен? Какие навыки освоят магистранты по окончании курса?
Мой курс «Омиксные технологии» в 1 семестре программы является вводным и посвящён современным высокопроизводительным технологиям анализа генома, эпигенома, транскриптома, протеома и метаболома, в том числе на уровне единичных клеток и пространственного разрешения. Курс также включает практические занятия по различным вариантам секвенирования (NGS).
- Как Вы думаете, какие потенциальные возможности открывает магистратура?
Программа магистратуры открывает доступ к современным высокотехнологичным методам анализа генетической информации; дает возможность принимать участие в самых передовых научных проектах и получать знания от ведущих ученых в сфере биоинформатики единичных клеток.
- Что бы Вы пожелали абитуриентам и первокурсникам программы?
В нашей сфере технологии развиваются стремительно, желаю нашим абитуриентам и первокурсникам не терять энергии и жажды получать новые знания, делиться опытом. Как очень точно отметил Льюис Кэрролл в книге «Алиса в Зазеркалье», «нужно бежать со всех ног, чтобы только оставаться на месте, а чтобы куда-то попасть, надо бежать как минимум вдвое быстрее!»
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
❤5👏3🔥1
Forwarded from Томский НИМЦ
⚡Азбука Томского НИМЦ: Биоинформатика
💬 Директор Томского НИМЦ, академик РАН Вадим Степанов:
– Мы научились генерировать огромное количество больших биологических данных: это и полные геномы, и транскриптомы, и экзомы, их количество в наших базах измеряется десятками тысяч. Но мы не всегда в состоянии извлечь весь заложенный в них смысл – это задача биоинформатиков.
Подробнее в карточках!
📍 Проект посвящен 10-летию Томского НИМЦ
#Азбука_ТомскогоНИМЦ
#ТомскийНИМЦ_10_лет
🔹 Томский НИМЦ в MAX
💬 Директор Томского НИМЦ, академик РАН Вадим Степанов:
– Мы научились генерировать огромное количество больших биологических данных: это и полные геномы, и транскриптомы, и экзомы, их количество в наших базах измеряется десятками тысяч. Но мы не всегда в состоянии извлечь весь заложенный в них смысл – это задача биоинформатиков.
Подробнее в карточках!
📍 Проект посвящен 10-летию Томского НИМЦ
#Азбука_ТомскогоНИМЦ
#ТомскийНИМЦ_10_лет
🔹 Томский НИМЦ в MAX
❤5🔥1