1.Bioconductor
احتمالا زیاد اسمش رو شنیدید و شاید باهاش کار هم کرده باشید. این ابزار بطور گسترده ای در پلتفرم لینوکس مورد استفاده قرار می گیرد و یک ابزار بیوانفورماتیکی منبع باز و آزاد است که بطور منسجم در زیست پزشکی برای آنالیز های با توان بالا کاربرد دارد. عمدتا از زبان برنامه نویسی R استفاده ولی از زبان های برنامه نویسی دیگرهم پشتیبانی می کند.
از ویژگی های Bioconductor می شود به گستردگی نوع داده هایی که آنالیز می کند، از آرایه های اولیگونوکلئوتیدی، آنالیز توالی ها و فلوسایتومتری تا تصویر سازی های قوی برای داده ها اشاره کرد. همچنین این ابزار، بسته های نرم افزاری جهت آنالیز بیان ژن مانند Limma، cDNA Arrays، Affy Arrays، Digital Gene Expression دارد.
اگر علاقه دارید که بیشتر با bioconductor آشنا بشید، ویدئو زیر را تماشا کنید.
#linux
#bioinformatics
#bioconductor
@genomefan
احتمالا زیاد اسمش رو شنیدید و شاید باهاش کار هم کرده باشید. این ابزار بطور گسترده ای در پلتفرم لینوکس مورد استفاده قرار می گیرد و یک ابزار بیوانفورماتیکی منبع باز و آزاد است که بطور منسجم در زیست پزشکی برای آنالیز های با توان بالا کاربرد دارد. عمدتا از زبان برنامه نویسی R استفاده ولی از زبان های برنامه نویسی دیگرهم پشتیبانی می کند.
از ویژگی های Bioconductor می شود به گستردگی نوع داده هایی که آنالیز می کند، از آرایه های اولیگونوکلئوتیدی، آنالیز توالی ها و فلوسایتومتری تا تصویر سازی های قوی برای داده ها اشاره کرد. همچنین این ابزار، بسته های نرم افزاری جهت آنالیز بیان ژن مانند Limma، cDNA Arrays، Affy Arrays، Digital Gene Expression دارد.
اگر علاقه دارید که بیشتر با bioconductor آشنا بشید، ویدئو زیر را تماشا کنید.
#linux
#bioinformatics
#bioconductor
@genomefan