Потом придумаю
30 subscribers
295 photos
78 videos
1 file
104 links
Download Telegram
well well well
1
Что дозволено Юпитеру, не дозволено быку
🤣2
Сегодня волею судьбы попал на invited talk последнего автора этой статьи. Занимательно, что в 2024 слушал её же от первого автора на конференции в Ванкувере. Суть работы: самцы гуппи отличаются огромной вариативностью окраски, которая влияет на привлекательность для самок (частотно-зависимый половой отбор). Исследователи три поколения вели искусственный отбор на долю оранжевого пигмента и получили линии, где его стало примерно вдвое больше. Чтобы разобраться в генетике паттернов окраса, всех рыб сфотографировали и прогнали через несколько свёрточных сетей, которые вычленяли локальные паттерны окраса и эмбеддили в многомерный patternspace. В результате оказалось, что наследуемость окраски высокая, но сильно зависит от локализации на теле: где-то объясняется аутосомами, где-то X, местами Y. Интересным показался GWAS отдельных паттернов/локализаций, который обнаружил сигналы на аутосомах даже для признаков с Y-сцепленным наследованием. При детальном рассмотрении выяснилось, что риды с недавних дупликации на Y хромосоме ложились на исходные аутосомные участки этих дуплкаций.
Последние месяцы я много работаю с k-мерами и вижу для них "гвозди" повсюду. Кажется очевидным, что такие структурные варианты проще ловить сразу с помощью k-mer GWAS, потому что Y-гаплотипы у гуппи сильно различаются между популяциями, из-за чего использование референса нецелесообразно. У людей психиатрические заболевания и всякие нарушения развития цнс часто ассоциированы со структурно сложными регионами вроде сегментных дуплцикаций или экспансий повторов, где снип-подходы работают с переменным успехом, поэтому напрашивается мысль, что k-mer GWAS мог бы обнаружить такие структурные различия эффективнее.
👎21🕊1🤝1
💩2🙏2🕊1💔1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Eye-opening
Все попытки ввести структуру в жизнь через списки дел, тайм-менеджемент разбивались об стену самобичевания. Оказывается, дела могут занимать больше времени, чем изначально предполагалось, случаются непредвиденные обстоятельства, производительность внезапно не вырастает, если расписать по минутам день идеальной версии себя.
😁2💩21
2👏2💩2😇2😁1
Forwarded from ПОКЕШ
3😁1
🕊3🏆1😇1
Буду в алмате с 20 января по 5 февраля. Хочу со всеми встретиться
🍾42❤‍🔥1
Forwarded from ШИЗОСХРОН (Onkel Paul)
Notice how geohot in a single linkedin post doing better of alarming
2