Возвращаясь к теме обнаружения данных (data discovery) то более всего она актуальна когда у компании/организации очень много разных систем и данных и есть потребность ответить себе на вопрос как узнать что и где хранится. Я ещё в допандемийное время много читал лекций про карты данных систематизацию источников данных, в первую очередь, в органах власти и госучреждениях. Но в основном я рассказывал про нетехнические методы, а есть и вполне технические, и разного рода ПО и сервисы каталогизации данных - это именно про такое.
Про примеры в виде проектов с открытым кодом Amundsen, Datahub, OpenMetadata я уже писал, как и про коммерческие каталоги. Важно помнить что все они созданы по модели стартапов, от самого минимума до постепенного расширения в тех направлениях где есть востребованность.
А есть и гораздо более системные масштабные проекты и это Egeria [1], продукт с открытым кодом от The Linux Foundation, в котором сложно найти удобный UI, зато есть дотошнейшее описание более 800 понятий который относятся. Например, то о чём я ранее рассказывал как "semantic types" (cемантические типы данных), там определено как Glossary Terms [2] и приведена их структура, значительно сложнее чем в большинстве коммерчески доступных сервисах.
В целом Egeria - это такой сверх-систематизированный заход на понимание природы корпоративных данных, процессов, людей, групп, подразделений, правил и инструментов и ещё всего остального связанного с данными в корпоративной среде.
По моим ощущениям всё скорее движется к систематизации стандартов OpenMetadata [3] и OpenLineage [4] или появлением нового стандарта, потому что OpenMetadata слишком ассоциировано с одноименным продуктом, а OpenLineage даёт чрезмерную вариативность, очень упрощён.
Ссылки:
[1] https://egeria-project.org/
[2] https://egeria-project.org/types/3/0330-Terms/
[3] https://docs.open-metadata.org/openmetadata/schemas/entities
[4] https://openlineage.io/
#datadiscovery #opendata #data #datatools #standards
Про примеры в виде проектов с открытым кодом Amundsen, Datahub, OpenMetadata я уже писал, как и про коммерческие каталоги. Важно помнить что все они созданы по модели стартапов, от самого минимума до постепенного расширения в тех направлениях где есть востребованность.
А есть и гораздо более системные масштабные проекты и это Egeria [1], продукт с открытым кодом от The Linux Foundation, в котором сложно найти удобный UI, зато есть дотошнейшее описание более 800 понятий который относятся. Например, то о чём я ранее рассказывал как "semantic types" (cемантические типы данных), там определено как Glossary Terms [2] и приведена их структура, значительно сложнее чем в большинстве коммерчески доступных сервисах.
В целом Egeria - это такой сверх-систематизированный заход на понимание природы корпоративных данных, процессов, людей, групп, подразделений, правил и инструментов и ещё всего остального связанного с данными в корпоративной среде.
По моим ощущениям всё скорее движется к систематизации стандартов OpenMetadata [3] и OpenLineage [4] или появлением нового стандарта, потому что OpenMetadata слишком ассоциировано с одноименным продуктом, а OpenLineage даёт чрезмерную вариативность, очень упрощён.
Ссылки:
[1] https://egeria-project.org/
[2] https://egeria-project.org/types/3/0330-Terms/
[3] https://docs.open-metadata.org/openmetadata/schemas/entities
[4] https://openlineage.io/
#datadiscovery #opendata #data #datatools #standards
egeria-project.org
Egeria Project - Open metadata and governance for enterprises
Open metadata and governance for enterprises - automatically capturing, managing and exchanging metadata between tools and platforms
Новости стандартизации, в W3C официально принят и опубликован стандарт Decentralized Identifiers (DIDs) v1.0 [1] в котором описана структура и логика присвоения постоянных идентификаторов объектов находящихся в децентрализованных реестрах.
Фактически - это стандарт для создания аналогов DOI, Handle и других подобных идентификаторов, но на основе Blockchain'а. Идея и область применения весьма интересные, одна из областей где децентрализованные технологии оправданы. Этот стандарт долгое время был черновиком и за этой время появилось более 100 идентификаторов/протоколов/спецификаций на его основе [2]․ Многие, но не все, из них относятся явно к крипте.
Из важных и интересных вопросов в том как будут эволюционировать существующие институции выдачи постоянных идентификаторов.
Ссылки:
[1] https://www.w3.org/TR/2022/REC-did-core-20220719/
[2] https://www.w3.org/TR/did-spec-registries/
#standards #blockchain #w3c #identifiers
Фактически - это стандарт для создания аналогов DOI, Handle и других подобных идентификаторов, но на основе Blockchain'а. Идея и область применения весьма интересные, одна из областей где децентрализованные технологии оправданы. Этот стандарт долгое время был черновиком и за этой время появилось более 100 идентификаторов/протоколов/спецификаций на его основе [2]․ Многие, но не все, из них относятся явно к крипте.
Из важных и интересных вопросов в том как будут эволюционировать существующие институции выдачи постоянных идентификаторов.
Ссылки:
[1] https://www.w3.org/TR/2022/REC-did-core-20220719/
[2] https://www.w3.org/TR/did-spec-registries/
#standards #blockchain #w3c #identifiers
www.w3.org
Decentralized Identifiers (DIDs) v1.0
Decentralized identifiers (DIDs) are a new type of identifier that
enables verifiable, decentralized digital identity. A DID refers to any
subject (e.g., a person, organization, thing, data model, abstract entity, etc.)
as determined by the controller of…
enables verifiable, decentralized digital identity. A DID refers to any
subject (e.g., a person, organization, thing, data model, abstract entity, etc.)
as determined by the controller of…
В рубрике как это работает у них, небольшой обзор проектов по работе с данными в биоинформатике. Небольшой потому что сама эта тема огромна, а публикуемые данные значительно превосходят любой портал открытых государственных данных.
Я сделаю акцент не на обработки больших наборов данных, а на проектах по повышению понимания данных и их систематизации.
Bioschemas
Многие знают про существование Schema.org как совместной инициативы поисковиков Google, Microsoft, Yahoo и Yandex для создания реестра для разметки именованных объектов. Bioschemas [1] - это расширение Schema.org объектами относящимся к химическим веществам, генам, таксонам, молекулам и другим данным важным для исследователей. Создание проекта финансируется Евросоюзом в рамках программы ELIXIR [2]. Проект идет уже более 5 лет [3] и его основная цель в том чтобы метаданные в каталогах и репозиториях данных связанных с науками о жизни были бы стандартизированы и удобны для работы.
Data Discovery Engine
Помимо структурированного описания объектов и понятий в каталогах данных важна ещё и возможность поиска по этому структурированному описанию. Data Discovery Engine [4] - это проект с руководствами по описанию метаданных и по их сбору из существующих каталогов данных таких как CD2H, N3C, Outbreak.info и NIAID Data Portal. Сейчас там агрегируются наборы данных (Datasets) и программные инструменты (Computational Tools), а в основе профили объектов определённые в Schema.org
FAIRSharing
Помимо Bioschemas в мире существуют сотни других стандартов публикации метаданных, как в науках о жизни, так и в других науках. FAIRSharing [5] - это один из крупнейших в мире каталогов таких стандартов в реестре которого собраны руководства, схемы, описания идентификаторов, рекомендации и тд. для данных публикуемых исследователями.
—
Ссылки:
[1] https://bioschemas.org
[2] https://www.elixir-europe.org/about-us/how-funded/eu-projects/excelerate
[3] https://docs.google.com/document/d/1vfRIT7Jk-RixpA7-_8vWLpXgFuYi2rjecx2wn04E2x0/edit#heading=h.7p6phpp9ttsf
[4] https://discovery.biothings.io/
[5] https://fairsharing.org
#opendata #openscience #openaccess #standards #data
Я сделаю акцент не на обработки больших наборов данных, а на проектах по повышению понимания данных и их систематизации.
Bioschemas
Многие знают про существование Schema.org как совместной инициативы поисковиков Google, Microsoft, Yahoo и Yandex для создания реестра для разметки именованных объектов. Bioschemas [1] - это расширение Schema.org объектами относящимся к химическим веществам, генам, таксонам, молекулам и другим данным важным для исследователей. Создание проекта финансируется Евросоюзом в рамках программы ELIXIR [2]. Проект идет уже более 5 лет [3] и его основная цель в том чтобы метаданные в каталогах и репозиториях данных связанных с науками о жизни были бы стандартизированы и удобны для работы.
Data Discovery Engine
Помимо структурированного описания объектов и понятий в каталогах данных важна ещё и возможность поиска по этому структурированному описанию. Data Discovery Engine [4] - это проект с руководствами по описанию метаданных и по их сбору из существующих каталогов данных таких как CD2H, N3C, Outbreak.info и NIAID Data Portal. Сейчас там агрегируются наборы данных (Datasets) и программные инструменты (Computational Tools), а в основе профили объектов определённые в Schema.org
FAIRSharing
Помимо Bioschemas в мире существуют сотни других стандартов публикации метаданных, как в науках о жизни, так и в других науках. FAIRSharing [5] - это один из крупнейших в мире каталогов таких стандартов в реестре которого собраны руководства, схемы, описания идентификаторов, рекомендации и тд. для данных публикуемых исследователями.
—
Ссылки:
[1] https://bioschemas.org
[2] https://www.elixir-europe.org/about-us/how-funded/eu-projects/excelerate
[3] https://docs.google.com/document/d/1vfRIT7Jk-RixpA7-_8vWLpXgFuYi2rjecx2wn04E2x0/edit#heading=h.7p6phpp9ttsf
[4] https://discovery.biothings.io/
[5] https://fairsharing.org
#opendata #openscience #openaccess #standards #data
bioschemas.org
Bioschemas - Bioschemas
Bioschemas relies and extends from schema.org and aims to reuse existing standards and reach consensus among a wide number of life sciences organizations and communities.
Google решили пристыдить Apple создав специальный сайт Get the message [1] для кампании по внедрению протокола/стандарта RCS [2] для передачи текстовых сообщений.
RCS - это, действительно, стандарт и, действительно, Apple его не поддерживает, только тут важно помнить что RCS в отличие от iMessage не поддерживает опции end-to-end шифрования (шифрования точка-точка) [3] и подвержено "законному перехвату". В Google, активно промоутирующих RCS, не могут этого не знать. Поэтому открытые стандарты - это хорошо, но открытые небезопасные стандарты по умолчанию - это ничего хорошего.
Впрочем и закрытость экосистемы Apple - это тоже ничего хорошего ни для кого кроме самой компании, но как-то не хочется выбирать между проприетарной безопасностью и непропроприетарной госслежкой.
Ссылки:
[1] https://www.android.com/get-the-message/
[2] https://www.gsma.com/futurenetworks/rcs/
[3] https://indianexpress.com/article/technology/social/google-new-chat-service-wont-be-secure-like-imessage-and-whatsapp-amnesty-international-5147050/
#standards #google #apple #messaging #rcs #privacy
RCS - это, действительно, стандарт и, действительно, Apple его не поддерживает, только тут важно помнить что RCS в отличие от iMessage не поддерживает опции end-to-end шифрования (шифрования точка-точка) [3] и подвержено "законному перехвату". В Google, активно промоутирующих RCS, не могут этого не знать. Поэтому открытые стандарты - это хорошо, но открытые небезопасные стандарты по умолчанию - это ничего хорошего.
Впрочем и закрытость экосистемы Apple - это тоже ничего хорошего ни для кого кроме самой компании, но как-то не хочется выбирать между проприетарной безопасностью и непропроприетарной госслежкой.
Ссылки:
[1] https://www.android.com/get-the-message/
[2] https://www.gsma.com/futurenetworks/rcs/
[3] https://indianexpress.com/article/technology/social/google-new-chat-service-wont-be-secure-like-imessage-and-whatsapp-amnesty-international-5147050/
#standards #google #apple #messaging #rcs #privacy
Android
Apple can fix the messaging between Androids & iPhones | Android
Messaging between Android and iPhone is broken. See how Apple can fix this text messaging problem by adopting modern texting standards like RCS.
Тем временем, буквально недавно, в июле, появилось предложение по изменению в стандарт HTTP добавлением типа запроса QUERY для запросов в базы данных [1] [2] нечто что имеет самое непосредственное отношение к современным базам данных, индексированию веб сайтов и работе большого числа веб ресурсов.
По сути идея в том чтобы иметь тип запросов который, с одной стороны, должен нести нагрузку при передаче от клиента, а с другой поддерживать кеширование, то что сейчас не обеспечивается для POST запросов ну или вернее обеспечивается путем настройки кеширующих веб-серверов, на уровне кеш серверов ключ-значение и так далее.
У меня лично нет уверенности в строгой необходимости такого изменения. Запросы в HTTP ещё давно проектировались по модели CRUD (GET, POST, DELETE, PUT и PATCH), а аналога SELECT никогда небыло. Большая часть REST API и запросов Ajax работают на базе GET или POST запросов.
Будет ли эффективен запрос QUERY? Хочется увидеть референсную реализацию и тестирование производительности.
Ссылки:
[1] https://datatracker.ietf.org/doc/draft-ietf-httpbis-safe-method-w-body/
[2] https://horovits.medium.com/http-s-new-method-for-data-apis-http-query-1ff71e6f73f3
#data #standards
По сути идея в том чтобы иметь тип запросов который, с одной стороны, должен нести нагрузку при передаче от клиента, а с другой поддерживать кеширование, то что сейчас не обеспечивается для POST запросов ну или вернее обеспечивается путем настройки кеширующих веб-серверов, на уровне кеш серверов ключ-значение и так далее.
У меня лично нет уверенности в строгой необходимости такого изменения. Запросы в HTTP ещё давно проектировались по модели CRUD (GET, POST, DELETE, PUT и PATCH), а аналога SELECT никогда небыло. Большая часть REST API и запросов Ajax работают на базе GET или POST запросов.
Будет ли эффективен запрос QUERY? Хочется увидеть референсную реализацию и тестирование производительности.
Ссылки:
[1] https://datatracker.ietf.org/doc/draft-ietf-httpbis-safe-method-w-body/
[2] https://horovits.medium.com/http-s-new-method-for-data-apis-http-query-1ff71e6f73f3
#data #standards
К вопросу о проектах по замене SQL на другие языки запросов, а есть и другой путь, создания спецификации описывающей все известные операции по работе с данными и работе SQL поверх неё и использования конверсии из её описания в SQL запросы.
Такой проект есть, он называется Substrait [1]. Его автор сооснователь проектов Apache Calcite, Apache Arrow, Apache Drill и ряда стартапов таких как Sundesk и Dreamio.
Основная идея в том чтобы стандарт для дата-операций был универсальным и через него можно было бы выполнять запросы к хранилищам данных.
Уже есть много референсных реализаций спецификации для Ibis, Dpyr, Apache Calcite, Trino и Spark.
Для тех кто не сталкивался с этими продуктами - все они представляют уровни абстракции для работы с данными. Например, Ibis в Python [3] даёт возможность делать SQL запросы без SQL. Удобно для тех кто любит Python way для работы с данными.
Substrait выглядит весьма перспективно, если вендоры в этом направлении потянутся, то может стать глобальной спецификацией и даже стандартом.
Ссылки:
[1] https://substrait.io/
[2] https://docs.google.com/presentation/d/1HQReIM6uB1Dli_yXfELOJWAE6KsvXAoUmHLlTYZ8laA/edit#slide=id.g1476627d6f9_0_213
[3] https://ibis-project.org
#standards #data #bigdata #dataengineering
Такой проект есть, он называется Substrait [1]. Его автор сооснователь проектов Apache Calcite, Apache Arrow, Apache Drill и ряда стартапов таких как Sundesk и Dreamio.
Основная идея в том чтобы стандарт для дата-операций был универсальным и через него можно было бы выполнять запросы к хранилищам данных.
Уже есть много референсных реализаций спецификации для Ibis, Dpyr, Apache Calcite, Trino и Spark.
Для тех кто не сталкивался с этими продуктами - все они представляют уровни абстракции для работы с данными. Например, Ibis в Python [3] даёт возможность делать SQL запросы без SQL. Удобно для тех кто любит Python way для работы с данными.
Substrait выглядит весьма перспективно, если вендоры в этом направлении потянутся, то может стать глобальной спецификацией и даже стандартом.
Ссылки:
[1] https://substrait.io/
[2] https://docs.google.com/presentation/d/1HQReIM6uB1Dli_yXfELOJWAE6KsvXAoUmHLlTYZ8laA/edit#slide=id.g1476627d6f9_0_213
[3] https://ibis-project.org
#standards #data #bigdata #dataengineering
Свежий стандарт по публикации результатов научной деятельности в открытом доступе Cross Domain Interoperability Framework (CDIF): Discovery Module [1] создан в рамках проекта WorldFAIR [2] и охватывает самые разнообразные объекты, но, что важнее, он описывает их публикацию используя schema.org что существенно повышает их находимость для поисковиков, в первую очередь, Google, но не только. Существенная часть стандарта про публикацию наборов данных, с отсылками в другим стандартам, включая DCAT, DataCite, ISO19115, EML, FGDC CSDGM, CERIF и DDI. Странно разве что отсутствие упоминания OAI-PHM. Как бы то ни было, потенциально это новый стандарт, который может быть вскоре одобрен в ЕС.
Ссылки:
[1] https://zenodo.org/records/10252564
[2] https://worldfair-project.eu/2023/12/05/cross-domain-interoperability-framework-cdif-discovery-module-v01-draft-for-public-consultation/
#opendata #datastandards #eu #standards #data #openaccess
Ссылки:
[1] https://zenodo.org/records/10252564
[2] https://worldfair-project.eu/2023/12/05/cross-domain-interoperability-framework-cdif-discovery-module-v01-draft-for-public-consultation/
#opendata #datastandards #eu #standards #data #openaccess
Zenodo
Cross Domain Interoperability Framework (CDIF): Discovery Module (v01 draft for public consultation)
In support of the WorldFAIR project and other activities to improve the implementation of the FAIR principles, the Cross-Domain Interoperability Framework (CDIF) Working Group is producing a suite of recommendations and guidelines. The CDIF will include…
Вышел стандарт DCAT-AP 3.0 по публикации каталогов открытых данных. Это официальный стандарт Евросоюза по публикации данных и он основан на стандарте DCAT 3.0 от W3C.
Изменений там немало, но и не критично. DCAT давно используется всеми основными разработчиками общедоступных каталогов данных и геоданных.
Его отдельные ревизии есть в ЕС, в США, в отдельных европейских странах и ещё в ряде стран мира.
В Армении, если появится государственный портал открытых данных, он тоже будет с поддержкой DCAT. Если не появится, то мы добавим поддержку в Open Data Armenia
В РФ стандарт DCAT ни в какой версии не применялся. В начале инициатив по открытости Минэк РФ придумал свои "методические рекомендации" с раскрытием метаданных в виде CSV файлов. Чтобы облегчить краулинг данных на портал data.gov.ru. Рекомендации эти применяют до сих пор, хотя они и морально и технически устарели, а data.gov.ru более не существует.
Пока же добавлю что DCAT поддерживается в Dateno при индексации каталогов и, в частности, метаданные из порталов на базе ArcGIS Hub собираются именно в формате DCAT.
#opendata #data #standards
Изменений там немало, но и не критично. DCAT давно используется всеми основными разработчиками общедоступных каталогов данных и геоданных.
Его отдельные ревизии есть в ЕС, в США, в отдельных европейских странах и ещё в ряде стран мира.
В Армении, если появится государственный портал открытых данных, он тоже будет с поддержкой DCAT. Если не появится, то мы добавим поддержку в Open Data Armenia
В РФ стандарт DCAT ни в какой версии не применялся. В начале инициатив по открытости Минэк РФ придумал свои "методические рекомендации" с раскрытием метаданных в виде CSV файлов. Чтобы облегчить краулинг данных на портал data.gov.ru. Рекомендации эти применяют до сих пор, хотя они и морально и технически устарели, а data.gov.ru более не существует.
Пока же добавлю что DCAT поддерживается в Dateno при индексации каталогов и, в частности, метаданные из порталов на базе ArcGIS Hub собираются именно в формате DCAT.
#opendata #data #standards
В рубрике как это устроено у них новый каталог открытых данных Словакии data.slovensko.sk заменил предыдущий портал data.gov.sk (более недоступен). Новый портал переписали на CSharp и его код доступен [1]. Из его особенностей - это ориентация на SPARQL, доступность возможности работы со SPARQL эндпоинтом, а также то что краулит из 12 каталогов открытых данных страны и подлерживает каталоги датасетов по стандартам DCAT-AP, SPARQL и CKAN API.
Выглядит любопытно, но эта картина была бы неполной если бы:
1. Разработчики не поломали бы все ссылки на data.gov.sk которые были в европейском data.europe.eu где новый портал даже не зарегистрирован, а старый уже недоступен и ссылки "протухли"
2. Нет общедоступной документации API нового каталога
3. Нет экспорта DCAT AP или CKAN API у нового каталога.
В целом очень неаккуратно. Про SPARQL я скажу так, у него и Semantic Web есть очень много сторонников в европейских проектахза госсчёт, но к современной дата инженерии он имеет смутное отношение. Вообще никакого, если честно. Экспорт данных в Parquet, удобное REST API и, может быть, даже GraphQL эндпоинт куда важнее.
Ссылки:
[1] https://github.com/slovak-egov/nkod-portal
#opendata #slovakia #eu #standards #data #datasets
Выглядит любопытно, но эта картина была бы неполной если бы:
1. Разработчики не поломали бы все ссылки на data.gov.sk которые были в европейском data.europe.eu где новый портал даже не зарегистрирован, а старый уже недоступен и ссылки "протухли"
2. Нет общедоступной документации API нового каталога
3. Нет экспорта DCAT AP или CKAN API у нового каталога.
В целом очень неаккуратно. Про SPARQL я скажу так, у него и Semantic Web есть очень много сторонников в европейских проектах
Ссылки:
[1] https://github.com/slovak-egov/nkod-portal
#opendata #slovakia #eu #standards #data #datasets
Вышла вторая версия стандарта Data Package [1] ранее он назывался Frictionless Data. Полезен он будет всем кто публикует табличные CSV файлы которые с его помощью очень хорошо описываются. Это большой плюс, особенно для тех кто не является дата инженерами или аналитиками, а рядовыми учёными, пользователям и тд.
Это же и минус. Лично я вспоминаю что мало какие интересные данные публиковал за последние годы именно в CSV. В основном же это были JSON lines файлы или parquet. А стандарт пока CSV ориентированный, что не отменяет его полезности если с CSV Вы работаете и активно. Или если пользователи готовят всё ещё данные в Excel, а надо бы что-то получше.
Так что ругаю я зря, а хвалю не зря. Стандарт надо использовать и развивать спектр поддерживающих его инструментов.
Ссылки:
[1] https://datapackage.org
#opensource #standards #opendata #data #okfn
Это же и минус. Лично я вспоминаю что мало какие интересные данные публиковал за последние годы именно в CSV. В основном же это были JSON lines файлы или parquet. А стандарт пока CSV ориентированный, что не отменяет его полезности если с CSV Вы работаете и активно. Или если пользователи готовят всё ещё данные в Excel, а надо бы что-то получше.
Так что ругаю я зря, а хвалю не зря. Стандарт надо использовать и развивать спектр поддерживающих его инструментов.
Ссылки:
[1] https://datapackage.org
#opensource #standards #opendata #data #okfn