Привитые от COVID-19 будут умирать — но не от прививки, а просто потому, что они и так бы умерли

В прошлом году я рассказывала о двух графиках Our World in Data. Первый был о причинах смерти американцев, освещении этого вопроса в СМИ и поисковых запросах, а второй — о причинах смерти детей во всем мире. Если вы не читали тот пост, то прочтите сначала его.

Здесь же мы поговорим о смертности взрослых людей, так как прививки от новой коронавирусной инфекции детям не делают и всё внимание будет приковано ко взрослым.

По данным ВОЗ в 2016 году 294 900 россиян в возрасте от 15 до 69 лет умерли от сердечно-сосудистых заболеваний. Среди них нет привитых от COVID-19.

Смертность от сердечно-сосудистых заболеваний снижается, но постепенно, поэтому стоит ожидать похожих чисел для 2020 года. Просто представьте себе, что несколько сотен тысяч россиян активного возраста умрет от одних только сердечно-сосудистых заболеваний и в этом году, и еще примерно столько же — в следующем. И среди них совершенно точно будут привитые от COVID-19.

Люди будут умирать вне зависимости от того, привиты они или нет. Кстати, ВОЗ оценивает, что из нынешних пятнадцатилетних россиян до шестидесяти лет не доживут 20 %. При этом из нынешних пятнадцатилетних европейцев — 11 %.

Для иллюстрации данных по России я нарисовала несколько графиков о причинах смерти. Сначала я взяла данные с сайта Our World in Data, отфильтровала их по России, перевела на русский язык и затем еще раз отфильтровала, выбрав для наглядности первые семь самых распространенных в 2017 году причин смерти среди россиян. В датасете есть несколько вкладок с отфильтрованными и нефильтрованными данными. Любой человек может проверить достоверность моего датасета, сравнив его с оригинальным.

Затем я взяла данные ВОЗ. Последние из доступных — данные о смертях в 2016 году. У ВОЗ, в отличие от Our World in Data, систематизированное деление по разделам, группам и подгруппам причин. На графике показаны десять самых распространенных групп причин смерти россиян в 2016 году. На вкладках датасета вы можете отследить этапы фильтрации.

В обоих случаях я ограничилась возрастом от 15 до 69 лет.

Люди будут умирать — это неизбежно. Как с прививками, так и без прививок в анамнезе — будут в любом случае. Пожалуйста, помните об этом, когда будете читать СМИ.

#VNN_данные

===============================
Время, затраченное на пост и графики, — 8 часов. Кстати, больше всего времени ушло на фильтрацию данных, чтобы они были читаемы на графике.

Поддержать АНО „Коллективный иммунитет“: https://vaccina.info/donate

Этот же пост в „Инстаграме“, ВК и ФБ.

О важности проверки фактов и априорном доверии графикам

Многие знают сайт Our World in Data (OWD), на который я сама частенько люблю захаживать.

Мне понадобились данные о количестве сделанных доз вакцин от ковида во всем мире. Эти данные находятся здесь. На графике есть данные и о России. Но я-то знаю, что ни одного достоверного российского ресурса, откуда можно было бы взять данные о количестве проведенных вакцинаций, не существует.

Тогда я заглянула в таблицу с источниками данных для датасета, на основании которого строятся графики. Практически везде указаны министерства, "инфекционные" комитеты и прочие государственные структуры. Для России там внезапно в качестве источника фигурирует РФПИ, Российский фонд прямых инвестиций, спонсирующий R&D и производство "Спутника".

Дальше — больше. Ссылка из таблицы неожиданно ведет на этот твит: „The Russian Direct Investment Fund announced early this week that 1.5 million people had received the Sputnik V vaccine, but further investigation by @AFP found that only 1 million of those had taken place in Russia. We'll update our data accordingly." Причем в этой французской статье не дается никаких ссылок в подтверждение их слов о том, что якобы по сведениям РФПИ был привит один миллион человек.

Я на этом не успокоилась, так как, ежедневно следя за ходом вакцинации в стране, понимаю, что по состоянию на 13 января — дату получения Our World in Data последних данных для России — даже миллион привитых вряд ли наскребется. Иду на сайт РФПИ, а именно в раздел с пресс-релизами, и на последних двух страницах (с самой старой датой 11 декабря) не вижу ни одного заголовка, который говорил бы о числе проведенных вакцинаций.

В различных русскоязычных СМИ разве что цитируются слова Мурашко о том, что 1,6 миллиона доз введены в гражданский оборот. Но это же не значит, что столько было сделано. В процессе гугло- и яндексопоиска по русскоязычным новостям я также не нахожу ни одной новости, где бы РФПИ заявлял, что уже был сделан миллион доз.

Более того, странен выбор именно РФПИ, так как „Спутник“ это не единственная вакцина, использующаяся в России. Началась вакцинация еще и „ЭпиВакКороной“, поэтому получать данные только от РФПИ значит получать неполные данные.

Если поделить один миллион (якобы сделанных доз) на 144,4 миллиона человек (население России), то как раз и получается показатель 0,69 % привитого населения, фигурирующий в таблице OWD. Расходимся.

На основании всего вышеизложенного получается, что в OWD данные для России взяли просто на основании чьей-то болтовни в прессе, да еще и не на русском языке, не особо разобравшись, в чем разница между „N вакцин введено в гражданский оборот“ и „M вакцин сделано реципиентам“.

Нет, я от этого не перестану пользоваться OWD. Но это прекрасная иллюстрация того, что слепо брать оттуда данные, не проверяя скрупулезно каждый источник, нельзя.

Даешь бой априорному доверию графикам!

#VNN_COVID #VNN_данные

В продолжение позавчерашнего поста об априорном доверии графикам

На "Медиазоне" есть неплохой материал о том, сколько доз было сделано в регионах. Имеются справедливые замечания, в частности касательно того, что доказательства числа привитых в официальном "Твиттере" "Спутника" нет.

Далее идут карты об абсолютном числе привитых, о доле привитых и о доставке доз в субъекты. При этом ссылки на датасет, где, в свою очередь, содержались бы ссылки на официальные данные региональных властей и их заявления в СМИ, нет. А почему? Почему мы должны верить на слово "Медиазоне" и не доверять официальному "Твиттеру" "Спутника"? Только потому, что "Медиазона" модная, а официальный твиттер "Спутника" — не очень? :) Это при том, что сугубо эмоционально я за "Медиазону“ и очень хочу верить, что с данными и источниками у них всё в порядке. Но вера на слово это не наш метод. Я не могу быть уверена в том, что они правильно собрали датасет для этих карт, пока лично не зайду в него и не проверю хотя бы несколько ссылок.

А на сайте народного мониторинга есть такая таблица (пример для Петербурга). Впрочем, на "Медузе" правильно пишут: "Сколько все-таки людей уже вакцинировали в России? Самый честный ответ: никто не знает“, — подробно перечисляя причины, почему собственно никто не знает и пока и знать не может.

#VNN_COVID #VNN_данные

Открытые данные о вакцинации от ковида в России и в мире

Увы, касательно России до сих пор сказать особо нечего. Сайты Минздрава, covid19.rosminzdrav.ru, Роспотребнадзора, стопкоронавирус.рф по-прежнему не публикуют никакой официальной информации по поводу числа привитых от ковида. Всё, что мы имеем, это устные заявления разных экспертов, чиновников и директора РФПИ.

Проблема в том, что в России чиновники до сих пор, видимо, не очень понимают, что такое открытое правительство и открытые данные (я вообще сомневаюсь в том, что они слышали эти словосочетания). Из-за чего не хватает сил привести в порядок отчетность по вакцинации, которая представляет собой набор разных форм, заполняющихся от руки. По каждой вакцинации медсестра государственной поликлиники заполняет данные 6 раз:
* в прививочном сертификате;
* в медкарте на странице приема;
* в начале медкарты на странице о прививках;
* в журнале приема пациентов в кабинете иммунопрофилактики;
* в журнале учета профилактических прививок;
* в журнале поступления и расходования МИБП (вакцин).

Это вместо связанных баз данных, с помощью которых можно было бы отследить как судьбу каждой вакцины, так и список прививок или медотводов по каждому человеку. В общем, пока в России существуют все эти не связанные друг с другом бумажные системы отчетности, мы так и будем продолжать слушать праздную болтовню в пресс-релизах о числе привитых, а не иметь актуальную информацию непосредственно от правительства.

Сравните с тем, как это сделано, к примеру, в Финляндии: инфографики с разбивкой по регионам, таблица, абсолютное число прививок в каждой возрастной группе, доля привитых по возрастным группам, кумулятивное число прививок. С разъяснением о том, как работает финский вакцинальный регистр.

Или США: целый сборник датасетов на самые разные темы (от наполнения российского data.gov.ru хочется плакать), карта с подробной статистикой по каждому штату и множеству фильтров, возможность скачать датасет.

Германия: также информация о прививках по каждой федеральной земле, о поставках вакцин, датасет с разбивкой по каждому дню вакцинации.

#VNN_COVID #VNN_данные

Ковид у детей в США

Речь везде идет об американских детях:

1. За всё время пандемии до 18.06.2021 от ковида умерло не менее* 459 детей до 17 лет.
За всё время пандемии до 08.06.2021:
2. Ковид с симптомами развился не менее чем у 4 247 655 детей до 19 лет.
3. Не менее 32 059 детей до 19 лет были госпитализированы из-за ковида.
4. Не менее 1 905 детей до 19 лет оказались из-за ковида в реанимации.

Я обработала один из датасетов и сделала простенькую визуализацию в DataStudio.

В пику всем тем, кто утверждает, что "достаточно правильно питаться и заниматься спортом, и тогда никакой ковид не страшен“, — посмотрите на графики по количеству госпитализаций и помещений в реанимацию из-за ковида в связи с наличием или отсутствием хронических заболеваний.

Могу навизуализировать подобное для взрослых. Пишите комментарии, если интересно.

И немного подробнее о данных для любителей (нелюбители могут сразу посмотреть на графики)

*Что за странное такое не менее? Дело в том, что общее число смертей от ковида в США на 18 июня составляет 598 713 случаев. А на странице демографического анализа, где приведены абсолютные числа смертей на ту же дату, проанализрованы не все эти смерти, а 485 654. Очевидно, что среди более чем ста тысяч случаев, которых недостает в демографическом дэшборде, есть дети. Но мы не знаем, сколько именно, поэтому я и пишу не менее.

Кстати, изначально я делала запросы в датасеты Provisional COVID-19 Deaths by Sex and Age и Provisional COVID-19 Deaths by Week, Sex, and Age, где можно скачать полноценные датасеты и настроить визуализацию. Но данные в этих датасетах обновлены до 12 июня, поэтому в них абсолютное число смертей ниже, чем на вышеупомянутом дэшборде. Кроме того, в первом датасете нужно настраивать фильтры, так как без фильтрации будет несколько раз складываться число одних и тех же смертей.

В датасете COVID-19 Case Surveillance Public Use Data можно посмотреть случаи смерти, пребывания в реанимации и госпитализации в связи с наличием или отсутствием хронических заболеваний. Однако есть особенность: далеко не для всех случаев имеются такие данные.

Так, из более чем четырех миллионов случаев ковида у детей данные о сопутствующих хронических заболеваниях имеются лишь для ста двадцати тысяч детей. Для всех остальных стоит „данные отсутствуют“ или „неизвестно“. Если посчитать case-fatality rate (коэффициент летальности), поставив в знаменатель общее число заболевших (с учетом этих случаев, для которых мы не знаем исходов), то CFR для ковида у американских детей до 19 лет получается 0,015 %. Однако если поставить в знаменатель число тех заболевших, для которых мы точно знаем, умерли они или нет, то CFR уже почти вдвое выше, а именно 0,028 %. Причем для возрастной группы до 9 лет CFR составляет 0,033 %. Приятно осознавать: я сама догадалась, что по-хорошему в знаменателе должны быть только случаи с известными исходами, — и уже после я нашла этому подтверждение в научном письме ВОЗ, посвященном оценке смертности от ковида.

Ну и напоследок о том, почему я анализирую американские данные, а не российские. Дело в том, что финансируемый на деньги налогоплательщиков Росстат сидит на данных, словно курица на яйцах. Дэшбордов кот наплакал, экселевских таблиц публикуется тоже намного меньше, чем собирается данных. О встроенных инструментах визуализации я и вовсе промолчу. Но это еще ладно. А вот почему Росстат нагло игнорирует запросы на официальные почты ответственных сотрудников (я запрашивала статистику о прививках по основному календарю), это самый большой вопрос.

#VNN_COVID #VNN_data #VNN_данные

Время, затраченное на написание и публикацию поста, — 9,5 часов.
Поддержать АНО „Коллективный иммунитет“: https://vaccina.info/donate