#DNA #history
Немного размышлений и моделирования про бутылочное горло Y-хромосомы в неолите:
https://www.sciencealert.com/neolithic-y-chromosome-bottleneck-warring-patrilineal-clans
Немного размышлений и моделирования про бутылочное горло Y-хромосомы в неолите:
https://www.sciencealert.com/neolithic-y-chromosome-bottleneck-warring-patrilineal-clans
ScienceAlert
Something Weird Happened to Men 7,000 Years Ago, And We Finally Know Why
Around 7,000 years ago - all the way back in the Neolithic - something really peculiar happened to human genetic diversity. Over the next 2,000 years, and seen across Africa, Europe and Asia, the genetic diversity of the Y chromosome collapsed, bec
#DNA #law #UnitedKingdom
Уже скоро законы Великобритании могут позволить изменять ДНК человека, чтобы снижать предрасположенность к различным наследственным заболеваниям или к развитию рака. Влияние на эмбрион человека, чтобы обезопасить его от возможных проблем в будущем, признано этичным.
Видимо проигрывать Китаю в биологической гонке совсем не хочется.
Как и терять учёных, которым приходится туда переезжать.
http://nuffieldbioethics.org/news/2018/heritable-genome-editing-action-needed-secure-responsible
Уже скоро законы Великобритании могут позволить изменять ДНК человека, чтобы снижать предрасположенность к различным наследственным заболеваниям или к развитию рака. Влияние на эмбрион человека, чтобы обезопасить его от возможных проблем в будущем, признано этичным.
Видимо проигрывать Китаю в биологической гонке совсем не хочется.
Как и терять учёных, которым приходится туда переезжать.
http://nuffieldbioethics.org/news/2018/heritable-genome-editing-action-needed-secure-responsible
The Nuffield Council on Bioethics
Heritable genome editing: action needed to secure responsible way forward - The Nuffield Council on Bioethics
#DNA #money
€400 за вроде как полный геном - будущее всё ближе! 👾
https://www.dantelabs.com/products/whole-genome-sequencing
€400 за вроде как полный геном - будущее всё ближе! 👾
https://www.dantelabs.com/products/whole-genome-sequencing
Dante Labs Global
Whole Genome Sequencing Test | Dante Labs
Get actionable insights for your healthcare with our personal 30X whole genome sequencing test. Medical grade. Enhance your health journey. Receive unique insights.
#biology #DNA #drugs #octopus
Биологи дали осьминогам экстази и иследовали их реакцию: https://gizmodo.com/scientists-gave-mdma-to-octopuses-and-what-happened-was-1829191638
Осьминогам понравилось: они трогали друг друга, плавали с распростёртыми щупальцами, переворачивались и проявляли интерес к звукам и запахам.
After hanging out in a bath containing ecstasy, the animals moved to a chamber with three rooms to pick from: a central room, one containing a male octopus and another containing a toy. This is a setup frequently used in mice studies. Before MDMA, the octopuses avoided the male octopus. But after the MDMA bath, they spent more time with the other octopus. They also touched the other octopus in what seemed to be an exploratory, rather than aggressive, manner.
The scientists took this to mean that despite our vastly different brains, social behavior is built into the very molecules coded by our DNA.
При превышении определённой дозировки осьминоги «выпадали на измену»: у них сбивалось дыхание и они белели.
Биологи дали осьминогам экстази и иследовали их реакцию: https://gizmodo.com/scientists-gave-mdma-to-octopuses-and-what-happened-was-1829191638
Осьминогам понравилось: они трогали друг друга, плавали с распростёртыми щупальцами, переворачивались и проявляли интерес к звукам и запахам.
After hanging out in a bath containing ecstasy, the animals moved to a chamber with three rooms to pick from: a central room, one containing a male octopus and another containing a toy. This is a setup frequently used in mice studies. Before MDMA, the octopuses avoided the male octopus. But after the MDMA bath, they spent more time with the other octopus. They also touched the other octopus in what seemed to be an exploratory, rather than aggressive, manner.
The scientists took this to mean that despite our vastly different brains, social behavior is built into the very molecules coded by our DNA.
При превышении определённой дозировки осьминоги «выпадали на измену»: у них сбивалось дыхание и они белели.
Gizmodo
Scientists Gave MDMA to Octopuses—and What Happened Was Profound
When humans take the drug MDMA, versions of which are known as molly or ecstasy, they commonly feel very happy, extraverted, and particularly interested in physical touch. A group of scientists recently wondered whether this drug might have a similar effect…
13philia
#DNA #law #UnitedKingdom Уже скоро законы Великобритании могут позволить изменять ДНК человека, чтобы снижать предрасположенность к различным наследственным заболеваниям или к развитию рака. Влияние на эмбрион человека, чтобы обезопасить его от возможных…
#China #DNA
Тем временем свежие новости по теме применения CRISPR из Китая:
https://www.technologyreview.com/s/612458/exclusive-chinese-scientists-are-creating-crispr-babies/
Тем временем свежие новости по теме применения CRISPR из Китая:
https://www.technologyreview.com/s/612458/exclusive-chinese-scientists-are-creating-crispr-babies/
MIT Technology Review
EXCLUSIVE: Chinese scientists are creating CRISPR babies
When Chinese researchers first edited the genes of a human embryo in a lab dish in 2015, it sparked global outcry and pleas from scientists not to make a baby using the technology, at least for the present. It was the invention of a powerful gene-editing…
#tree #DNA #SanFrancisco
Некоммерческая организация Archangel Ancient Tree Archive высадила в лесу под Сан-Франциско рощу из 75 ростков секвойевых деревьев, ДНК которых было клонировано из пяти пней возрастом до 3000 лет:
https://itc.ua/blogs/amerikanskie-ekoaktivistyi-vyisadili-sekvoyi-dnk-kotoryih-byilo-klonirovano-iz-drevnih-pney/
Некоммерческая организация Archangel Ancient Tree Archive высадила в лесу под Сан-Франциско рощу из 75 ростков секвойевых деревьев, ДНК которых было клонировано из пяти пней возрастом до 3000 лет:
https://itc.ua/blogs/amerikanskie-ekoaktivistyi-vyisadili-sekvoyi-dnk-kotoryih-byilo-klonirovano-iz-drevnih-pney/
ITC.ua
Американские экоактивисты высадили секвойи, ДНК которых было клонировано из древних пней
Некоммерческая организация Archangel Ancient Tree Archive высадила в лесу под Сан-Франциско рощу из 75 ростков секвойевых деревьев, ДНК которых было клонировано из пяти пней возрастом до 3000 лет. Как отмечается, несмотря на то, что секвойя и так является…
#tech #data #DNA #Microsoft
https://www.technologyreview.com/the-download/613158/microsoft-just-booted-up-the-first-dna-drive-for-storing-data/
https://www.technologyreview.com/the-download/613158/microsoft-just-booted-up-the-first-dna-drive-for-storing-data/
MIT Technology Review
Microsoft just booted up the first “DNA drive” for storing data
Microsoft has helped build the first device that automatically encodes digital information into DNA and back to bits again. DNA storage: Microsoft has been working toward a photocopier-size device that would replace data centers by storing files, movies…
13philia
#nature #mind #evolution #quote @dr_orlovsky недавно оптимистичное написал: «Последние открытия в области антропогенеза (новые виды человека, которые жили одновременно с Homo sapiens вплоть до всего лишь 15 тысяч лет назад), поведения высших животных (наличие…
#nature #mind #DNA #AI
И ещё на тему ИИ, обучения, эволюции и т. д. — небезынтересный препринт «манифеста Задорской революции» американского нейробиолога Anthony M. Zador'а:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/582643v1.full
И ещё на тему ИИ, обучения, эволюции и т. д. — небезынтересный препринт «манифеста Задорской революции» американского нейробиолога Anthony M. Zador'а:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/582643v1.full
bioRxiv
A Critique of Pure Learning: What Artificial Neural Networks can Learn from Animal Brains
Over the last decade, artificial neural networks (ANNs), have undergone a revolution, catalyzed in large part by better tools for supervised learning. However, training such networks requires enormous data sets of labeled examples, whereas young animals (including…
#DNA #health
О, малёхо обнадёживающих новостей:
“Welcome to the Age of One-Shot Miracle Cures That Can Cost Millions
Gene therapy appears to successfully treat once-incurable patients like “bubble boy” Omarion Jordan. But progress like this doesn’t come cheap.”
https://www.bloomberg.com/news/features/2019-06-05/gene-therapy-appears-to-be-beating-once-incurable-diseases
О, малёхо обнадёживающих новостей:
“Welcome to the Age of One-Shot Miracle Cures That Can Cost Millions
Gene therapy appears to successfully treat once-incurable patients like “bubble boy” Omarion Jordan. But progress like this doesn’t come cheap.”
https://www.bloomberg.com/news/features/2019-06-05/gene-therapy-appears-to-be-beating-once-incurable-diseases
13philia
#China #DNA Тем временем свежие новости по теме применения CRISPR из Китая: https://www.technologyreview.com/s/612458/exclusive-chinese-scientists-are-creating-crispr-babies/
#Japan #DNA
Относительно неожиданные новости из Японии:
https://www.nature.com/articles/d41586-019-02275-3?
Относительно неожиданные новости из Японии:
https://www.nature.com/articles/d41586-019-02275-3?
Nature
Japan approves first human-animal embryo experiments
Nature - The research could eventually lead to new sources of organs for transplant, but ethical and technical hurdles need to be overcome.
13philia
#China #DNA Тем временем свежие новости по теме применения CRISPR из Китая: https://www.technologyreview.com/s/612458/exclusive-chinese-scientists-are-creating-crispr-babies/
EL PAÍS English
Spanish scientists create human-monkey chimera in China
The team led by Juan Carlos Izpisúa injected stem cells into the animal embryos as part of research aimed at finding a way to grow organs for transplants
#quote #biology #virus #DNA #robot
Боитесь войны с роботами? А если с нано-роботами-репликантами?
Упс, оказывается она уже идёт несколько миллиардов лет. Поздно бояться:
«Нет, на этой картинке не чертёж космического зонда. Это вирус, одна из двух самых распространённых и загадочных форм жизни на планете Земля. При том, что он не живой. Вирусы не относятся к живым организмам. У них нет ни клеточной структуры, ни способности метаболизировать пищу. Это нано-роботы, задача которых впрыснуть в клетки свою ДНК. Между вирусами и бактериями непрестанно идёт борьба титанических, невообразимых масштабов, в которой ежедневно (!) гибнет половина бактерий в морях и океанах, коих на чайную ложку воды содержится 5 миллионов. Видали белые скалы Дувра? Это монумент павшим героям этой войны, они состоят из ахулиардов погибших микробов. Миллиарды лет идет непрестанная, сложнейшая гонка вооружений, в которой новые виды оружия, новые средства защиты и тактические уловки переизобретаются ежедневно. Заключаются союзы с туземными племенами. Идёт обмен опытом, транспортировка оружия и военные маневры, для которых используется маскировка. Есть бактерии-герои, которые бросаются на амбразуру, чтоб спасти товарищей. Вирусы, эти боевые роботы, не отстают от них, постоянно перепрограммируя себя, внося усовершенствования и работая на опережение. Современная наука со всеми супер-компьютерами не может просчитать, как сложится из аминокислот определённый протеин (оружие бактерии), но вирус может. Как он это делает — не знает никто. В вашем организме находится примерно 100 триллионов бактерий и 1 квадриллион вирусов».
Боитесь войны с роботами? А если с нано-роботами-репликантами?
Упс, оказывается она уже идёт несколько миллиардов лет. Поздно бояться:
«Нет, на этой картинке не чертёж космического зонда. Это вирус, одна из двух самых распространённых и загадочных форм жизни на планете Земля. При том, что он не живой. Вирусы не относятся к живым организмам. У них нет ни клеточной структуры, ни способности метаболизировать пищу. Это нано-роботы, задача которых впрыснуть в клетки свою ДНК. Между вирусами и бактериями непрестанно идёт борьба титанических, невообразимых масштабов, в которой ежедневно (!) гибнет половина бактерий в морях и океанах, коих на чайную ложку воды содержится 5 миллионов. Видали белые скалы Дувра? Это монумент павшим героям этой войны, они состоят из ахулиардов погибших микробов. Миллиарды лет идет непрестанная, сложнейшая гонка вооружений, в которой новые виды оружия, новые средства защиты и тактические уловки переизобретаются ежедневно. Заключаются союзы с туземными племенами. Идёт обмен опытом, транспортировка оружия и военные маневры, для которых используется маскировка. Есть бактерии-герои, которые бросаются на амбразуру, чтоб спасти товарищей. Вирусы, эти боевые роботы, не отстают от них, постоянно перепрограммируя себя, внося усовершенствования и работая на опережение. Современная наука со всеми супер-компьютерами не может просчитать, как сложится из аминокислот определённый протеин (оружие бактерии), но вирус может. Как он это делает — не знает никто. В вашем организме находится примерно 100 триллионов бактерий и 1 квадриллион вирусов».
#science #journal #DNA #gene #data #Excel
Напомнили тут про «чудесную» историю, когда у многих не была отключена автозамену в Экселе и названия ряда белков регулярно менялись на дату: MARCH1 [Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 1, E3 Ubiquitin Protein Ligase] → ‘1-Mar’, SEPT2 (Septin 2) → ‘2-Sep’ и т. д.
В результате около 20% статей в Нейчер (и не только в нём, куче других журналов тоже, пусть местами и с меньшим %) вышли с неверными результатами. На которые потом опирались и цитировали другие учёные, пошли неверные коррелации и т. п.
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-016-1044-7
https://sourceforge.net/projects/genenameerrorsscreen/
Напомнили тут про «чудесную» историю, когда у многих не была отключена автозамену в Экселе и названия ряда белков регулярно менялись на дату: MARCH1 [Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 1, E3 Ubiquitin Protein Ligase] → ‘1-Mar’, SEPT2 (Septin 2) → ‘2-Sep’ и т. д.
В результате около 20% статей в Нейчер (и не только в нём, куче других журналов тоже, пусть местами и с меньшим %) вышли с неверными результатами. На которые потом опирались и цитировали другие учёные, пошли неверные коррелации и т. п.
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-016-1044-7
https://sourceforge.net/projects/genenameerrorsscreen/
BioMed Central
Gene name errors are widespread in the scientific literature - Genome Biology
The spreadsheet software Microsoft Excel, when used with default settings, is known to convert gene names to dates and floating-point numbers. A programmatic scan of leading genomics journals reveals that approximately one-fifth of papers with supplementary…
#science #gene #DNA
Альтернатива CRISPR — вроде как более точный и эффективный метод редактирования генома 🧐
https://www.sciencealert.com/radical-new-crispr-upgrade-directly-edits-human-cells-to-get-rid-of-genetic-disease
https://doi.org/10.1038/s41586-019-1711-4
Update: на русском — https://itc.ua/news/zabudte-o-crispr-razrabotan-bolee-tochnyj-i-effektivnyj-metod-redaktirovaniya-genoma/
Альтернатива CRISPR — вроде как более точный и эффективный метод редактирования генома 🧐
https://www.sciencealert.com/radical-new-crispr-upgrade-directly-edits-human-cells-to-get-rid-of-genetic-disease
https://doi.org/10.1038/s41586-019-1711-4
Update: на русском — https://itc.ua/news/zabudte-o-crispr-razrabotan-bolee-tochnyj-i-effektivnyj-metod-redaktirovaniya-genoma/
ScienceAlert
Radical New Method Can Directly Edit Human Cells to Get Rid of Genetic Disease
This latest CRISPR upgrade could fix almost 90% of known disease-associated genes.
#medic #biology #DNA
И неплохая статья насчёт короновируса с Китая (и малёхо про современную классификацию вирусов):
https://nplus1.ru/material/2020/01/21/2019-ncov
И неплохая статья насчёт короновируса с Китая (и малёхо про современную классификацию вирусов):
https://nplus1.ru/material/2020/01/21/2019-ncov
nplus1.ru
С новым коронавирусом
Что такое 2019-nCoV и чего от него ждать
13philia
#medic #biology #DNA И неплохая статья насчёт короновируса с Китая (и малёхо про современную классификацию вирусов): https://nplus1.ru/material/2020/01/21/2019-ncov
#biology #DNA #China #coronavirus
Aaa...? 😮
https://bioinformatics.stackexchange.com/questions/11227/why-does-the-wuhan-coronavirus-genome-end-in-aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
Aaa...? 😮
https://bioinformatics.stackexchange.com/questions/11227/why-does-the-wuhan-coronavirus-genome-end-in-aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
Bioinformatics Stack Exchange
Why does the SARS-Cov2 coronavirus genome end in aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa (33 a's)?
The SARS-Cov2 coronavirus's genome was released, and is now available on Genbank. Looking at it...
1 attaaaggtt tataccttcc caggtaacaa accaaccaac tttcgatctc ttgtagatct
61 gttctctaaa cgaactt...
1 attaaaggtt tataccttcc caggtaacaa accaaccaac tttcgatctc ttgtagatct
61 gttctctaaa cgaactt...
13philia
#science #journal #DNA #gene #data #Excel Напомнили тут про «чудесную» историю, когда у многих не была отключена автозамену в Экселе и названия ряда белков регулярно менялись на дату: MARCH1 [Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 1, E3 Ubiquitin Protein…
#science #DNA #gene #data #Excel
Писал позавчера в твиттере об этом, зафиксирую и здесь: вышел «фикс» старой проблемы с неверной интерпретацией ряда генов Экселем (малёхо с неожиданной стороны):
https://www.nature.com/articles/s41588-020-0669-3 (via)
P. S. Внешним текстом: https://www.theverge.com/2020/8/6/21355674/human-genes-rename-microsoft-excel-misreading-dates
Писал позавчера в твиттере об этом, зафиксирую и здесь: вышел «фикс» старой проблемы с неверной интерпретацией ряда генов Экселем (малёхо с неожиданной стороны):
https://www.nature.com/articles/s41588-020-0669-3 (via)
P. S. Внешним текстом: https://www.theverge.com/2020/8/6/21355674/human-genes-rename-microsoft-excel-misreading-dates
Nature
Guidelines for human gene nomenclature
Nature Genetics - Standardized gene naming is crucial for effective communication about genes, and as genomics becomes increasingly important in health care, the need for a consistent language to...