Bioinformatics
3.05K subscribers
700 photos
83 videos
64 files
830 links
تنها کانال تخصصی بیوانفورماتیک ایران
🔺All in one!!🔺
💎Bioinformatics, Computational biology, Modern medicine and Biomedical informatics💎
👨‍💻Learn with experts!
🔥پزشکی نوین
‼️زیست شناسی محاسباتی
Download Telegram
💎یادگیری عمیق، تکنولوژی سه بعدی برای بهبود مدل سازی ساختاری و ایجاد داروهایی بهتر

🌀پروتئین ها به عنوان مولکول های مهم و کاربردی در بدن انسان شناخته شده اند. به طور معمول در بدن بیش از 20000 نوع پروتئین مختلف وجود دارد که هرکدام در بسیاری از فرآیندهای زیستی ضروری برای حیات انسان مشارکت دارند.

💠محققان دانشگاه پوردو با استفاده از یادگیری عمیق مسیر جدیدی طراحی کرده اند تا به درک بهتری از چگونگی برهمکنش پروتئین ها در بدن دست یابند. این مسیر جدید زمینه ی ایجاد مدل هایی با صحت بالا از برهمکنش های پروتئینی دخیل در بیماری های مختلف را محیا می سازد تا بتوان با استفاده از آن داروهایی کارآمد تر و بهتر طراحی نمود که به صورت کاملا اختصاصی، برهمکنش های پروتئینی را هدف قرار دهند.

💡دایسوک کیهارا استاد علوم زیستی و کامپیوتر دانشگاه پوردو و تیم اش سیستمی را توسعه به نام DOVE را توسعه داده اند که از "DOcking decoy selection deep neural nEtwork" برگرفته شده است. این سیستم سطح مشترک پروتئین-پروتئین را اسکن می کند و با استفاده از اصول یادگیری عمیق، ویژگی های ساختاری مدل های درست از نادرست را شناسایی و ثبت می کند.

🎯ژیائو وانگ، دانشجوی عضو تیم تحقیقاتی می گوید: "کار ما یک پیشرفت بزرگ در زمینه بیوانفورماتیک است. احتمالا این اولین باری است که محققان به طور موفقیت آمیزی با استفاده از یادگیری عمیق و ویژگی های سه بعدی، مدل های پروتئینی موثر را با سرعت بیشتری می یابند. این اطلاعات می تواند برای ایجاد داروهای هدفمند استفاده شود تا به طور خاص برهم کنش های پروتئین-پروتئین مورد نظر را بلاک کند."

📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://www.codecool.ir/journal%20detail?file=5189

📝 تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

📝تعداد کلمات: 370 کلمه

زمان مطالعه: کمتر از 2 دقیقه

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📌لینک مقاله:
https://www.sciencedaily.com/releases/2020/01/200110101031.htm
♿️استفاده از Hololens برای کمک به یادگیری و آموزش روابط اجتماعی به کودکان کم بینا و نابینا


📽مایکروسافت شرکت سازنده Hololens، ابزار تصویربرداری پیشرفته با استفاده از فناوری واقعیت افزوده است.

برای کودکان بزرگ شدن با نقص بینایی یا نابینایی می تواند بسیار دشوار باشد زیرا بینایی بخش بزرگی از روابط اجتماعی و ارتباط بین انسان ها را تشکیل می دهد. این پروژه ی مایکروسافت می تواند به چنین کودکانی کمک کند.

💎در پروژه توکیو که از طرف مایکروسافت حمایت می شود، قرار است محققان بتوانند با کمک فناوری هوش مصنوعی و واقعیت افزوده برای افراد بخصوص افراد کم توان، ابزاری کارآمد بسازند. مثل راهنمای مجازی صوتی برای افرادی که به هر دلیلی نمی توانند از صفحه کلید یا صفحه لمسی استفاده کنند.

🌀اد کوترل از محققان مایکروسافت می گوید: " ما به عنوان یک انسان، خیلی خیلی مهم و حساس است که موقعیت های اجتماعی را به خوبی درک کنیم، اینکه چگونه با انسان های دیگر ارتباط برقرار کنیم و متوجه ورود افراد به اتاقمان شویم و بدانیم که آن ها در حال انجام چه کاری هستند و یا ارتباطشان با ما چیست؟ اما برای افراد کم بینا و نابینا بسیاری از علائم و نشانه ها که برای ما بسیار عادی است، وجود ندارد"

🎯راه حل تجربی پروژه "توکیو" این است که با استفاده از Hololens ، که فاقد لنز است، شناسایی اشیاء و افراد برای کم بینایان و نابینایان ممکن شود.

🌟این ابزار یک هد بند با فناوری پیشرفته است که مجموعه ایی از نرم افزارها آن را پشتیبانی می کنند که از علائم محیطی استفاده می کند. به عنوان مثال وقتی فردی در فاصله ۴ متری در سمت راست تشخیص داده می شود ، دستگاه با یک کلیک نشان می دهد که در آن موقعیت فردی قرار دارد.اگر چهره فردی شناسایی شود ، اسم فرد اعلام می شود اگر چهره فردی شناسایی نشود، با یک صدای ممتد توجه کاربر را به سمت آن فرد جلب کند و با قرارگیری صورت کاربر در مسیر فرد ناشناس، صدا قطع می شود.

💡موارد بسیاری است که دانشمندان امیدوارند بتوانند به ابزار در حال توسعه خود بیافزایند.

📝تهیه و تنظیم:
#رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری
#بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه‌ها:
#اخبار_فناوری

📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می‌توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.

https://www.codecool.ir/journal%20detail?file=5204

📝تعداد کلمات: 487 کلمه
زمان مطالعه: کمتر از سه دقیقه

📌منبع:
https://techcrunch.com/2020/01/28/modified-hololens-helps-teach-kids-with-vision-impairment-to-navigate-the-social-world/

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🌀مغز چطور درشرایط مختلف تصمیم میگیرد؟ مطالعات ناحیه ایی غیر منتظره را در این امر دخیل نشان دادند.

✴️هنگامی که از خیابان عبور می کنید، اول سرتان را به کدام سمت می چرخانید تا از نزدیک شدن ماشینی مطلع شوید؟ این تصمیم گیری وابسته به شرایطی است که شما در آن قرار گرفته اید. یک عابر پیاده در آمریکا اول به سمت چپ نگاه می کند ولی یک عابر پیاده در انگلیس اول به سمت راست نگاه می کند.

💠گروهی از دانشمندان در انیستیتو زاکرمن-کلمبیا چگونگی تصمیم گیری حیوانات بر اساس شرایط محیطی را مورد مطالعه قرار داده اند. مطالعات اخیر نشان داده است که این تصمیم گیری وابسته به بخشی از مغز موش است که هرگز انتظارش نمی رفت، منطقه ایی به نام قشر قدامی-جانبی حرکتی یا ALM که سابقا نقش آن هدایت اولیه حرکت تعیین شده بود.

💡تصمیم گیری های قابل تغییر یک ابزار حیاتی برای شناخت و درک بهتر محیط اطراف است و این امکان را فراهم می کند تا بازخورد های متفاوتی نسبت به اطلاعات یکسان در شرایط متفاوت بروز دهیم.

🔹ژنگ وو نویسنده اصلی مقاله می گوید: " اگر یک نفر در یک خیابان خلوت بسیار نزدیک به من بایستد، احساس ناامنی در من ایجاد می کند و ممکن است تصمیم بگیرم از او دور شوم، اما اگر همین اتفاق در واگن شلوغ مترو رخ دهد، من همچین حس خطری نخواهم داشت. تصمیم اینکه جابجا شوم یا نه وابسته است به شرایط محیطی که در آن قرار گرفته ام".

🔷محققان برای درک این ساختار آزمایشی جدید طراحی کردند که لازم بود موش بتواند با استفاده از زبان و سیستم بویایی تصمیمات قابل تغییری اتخاذ کند.آزمایش به اینصورت بود که اول موش با یک عطر یا بوی خاصی مواجه می شود، موش می بایست این بو را بخاطر بسپارد چرا که پس از یک وقفه کوتاه ، عطر بعدی در بینی موش ها اسپری می شود. اگر هر دو بو یکسان باشد ، موش برای خوردن آب باید لوله ایی که در سمت چپ تعبیه شده است را لیس بزند و اگر هر دو بو متفاوت باشند، لوله سمت راست را.

💎دکتر وو میگوید:" نتایج ما نشان می دهد که ALM برای حل مساله که آیا دو بوی ساطع شده یکسان هستند یا نه و سپس تصمیم بگیرد کدام لوله را لیس بزند، ضروری است و ما را ترغیب کرد تا به شکل دقیق تری درباره چگونگی این تصمیم گیری ها توسط مغز مطالعه کنیم بخش ALM در تشخیص بو نقشی ندارد بنابر این نگاه دقیق تری به سلول های این ناحیه انداختیم".

🔸در این ناحیه نوع جدیدی از نورون ها را یافتند که به سطح مغز بسیار نزدیکند، بخشی که مسئول پاسخ به اولین بوی اسپری شده بود. برای درک این نتایج غیر منتظره، تیم تحقیقاتی به سراغ عصب شناس تئوری کار آشوک لیتوین-کومار رفتند تا مکانیسم های محتمل برای ALM بیابند.

🎯دکتر کومار می گوید:" فهم متعارف اینطور می گوید که ناحیه بویایی در مغز حیوانات می بایست فرآیند بویایی را خودش به تنهایی کنترل و پردازش کند، سپس اطلاعات را به ALM ارسال کند تا زبان را به سمت مناسب هدایت کند، اما داده ها داستانی متفاوت را روایت می کند، که بوی اول به عنوان سرنخی از شرایط محیطی عمل می کند و ALM را آماده می کند تا با ایجاد دومین بو تشخیص دهد چه پاسخی ایجاد شود".
یافته های کنونی با تمرکز بر روی بخش ALM به دانشمندان برای درک عملکرد مغز کمک می کند.


📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://www.codecool.ir/journal%20detail?file=7192


🔖 826 کلمه
زمان مطالعه: کمتر از 5 دقیقه


📝 تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها: #علمی_اجتماعی

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
https://www.sciencedaily.com/releases/2020/02/20022712
Audio
🎼موسیقی که می شنوید بخشی از ترجمه ساختار ویروس کرونا به موسیقی است. دانشمندان انیستیتو فناوری ماساچوست روشی نوین برای ذخیره سازی اطلاعات ساختاری پروتئین ها ارائه داده اند که بر این باور هستند این روش برای یافتن نواحی خاص در پروتئین سریعتر و قابل درک تر از روش های متداول مانند مدل سازی های مولکولی است. با این روش امیدوارند داروی مهار کننده ویروس را بیابند.

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: ۳۰۰ کلمه
زمان مطالعه: حدود دو دقیقه

📝 تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی دانشجوی دکترای #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها: #علمی_اجتماعی
کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع:

https://www.sciencemag.org/news/2020/04/scientists-have-turned-structure-coronavirus-music#:~:text=Using%20a%20new%20technique%20called,into%20a%20preliminary%20musical%20score
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
👩🏻‍⚕🧬💉👨🏻‍💼پزشکی شخصی شده چیست؟

🎙صداگذاری: #رایحه_وفایی

📝 ترجمه: #سارا_فیاض_زاده

دانشجویان دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه‌ها: #فیلم

کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics
🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🧠😫چگونه استرس مغز را تحت تٲثیر قرار می دهد؟

🎙صداگذاری: #رایحه_وفایی

📝 ترجمه: #سارا_فیاض_زاده

دانشجویان دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه‌ها: #فیلم

کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics
🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
🦠اگر کرونا بگیرید ، در بدن شما چه اتفاقی میافته؟

📽تهیه و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

🎞پنج شنبه ها: #فیلم

کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
🩺حسگرهای زیستی در جهت کمک به درمان اختصاصی بیماری

در مبارزه علیه بیماری های جدی مانند سرطان، اغلب بیماران پس از دریافت روش درمانی خاص باید هفته ها همراه با نگرانی منتظر باشند تا پزشک بر اساس پاسخ بدن آن ها به روش درمانی تصمیم گیری کنند که این روش ادامه پیدا کند یا باید استراتژی جدیدی در نظر گرفت. ریشه این مشکل اینجاست که در حقیقت ما قادر نیستیم روند بیماری را در زمان واقعی خودش دنبال کنیم .
🏢شرکت Glympse Bio که از دل آزمایشگاه سانجیتا باتیا به سرپرستی جان جی و دوروتی ویلسون بیرون آمده است و بر روی نحوه عملکرد بیماری کار می کنند و با حسگر زیستی سنتز شده روند بیماری را رصد میکنند. این گروه حسگر زیستی ساخته شده را به بدن تزریق می کنند سپس این حسگر به محل بیماری مهاجرت می کند و تغییرات پروتئینی مرتبط با روند بیماری را اندازه گیری می کند و در نهایت حسگر از طریق ادرار دفع و مورد آزمایش و بررسی قرار داده می شود.
این شرکت معتقد است که این فناوری با دنبال کردن روند بیماری و قرار دادن داده های لازم در اختیار پزشکان ، تحولی بزرگ در تشخیص بیماری ایجاد خواهد کرد.
🎗باتیا (Bhatia) از موسسان Glympse Bio و عضو انیستیو Koch در MIT می گوید: " وقتی یه بیمار دارویی دریافت میکنه یه بازی شروع میشه ....

ادامه مطلب...


تهیه و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #فناوری

کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🏩 آینده سیستم های درمانی

📽تهیه و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

🎞پنج شنبه ها: #فیلم

کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
اثرات انزوای اجتماعی بر روی سلامت روان

مردم در سراسر جهان به دلیل همه‌گیری کووید۱۹ متحمل اقدامات امنیتی بی‌سابقه‌ای شدند. برای کاهش سرعت انتقال بیماری، فاصله‌گذاری فیزیکی ضروری است، اما متخصصان بر این باور هستند که این انزوا و تنهایی خود موجب به خطر افتادن سلامت روحی و روانی می‌شود.

این روزها فاصله گذاری فیزیکی ، اثر منفی انزوای اجتماعی را بر روی سلامت روان به صورت کاملا بارزی نشان‌داده‌است و قرنطینه و تنهایی می‌تواند موجب افزایش و گسترش مشکلاتی شود که پیش از همه‌گیری هم وجود داشته اما پس از همه گیری نرخ آن افزایش یافته است. تحقیقات PRCS در سال 2018 نشان داده که از هر 10 آمریکایی یک نفر دچار حس تنهایی و انزوا است.

اگر میخواهید بدانید انزوای اجتماعی چی هست و با تنهایی چه تفاوتی دارد و چگونه باید آن را تحت کنترل داشت به سایت کدکول
مراجعه نمایید.




🔖 تعداد کلمات: ۹۱۰ کلمه
زمان مطالعه: ۴.۵ دقیقه

📝 تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی دانشجو دکتری#بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها: #علمی_اجتماعی

کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
منبع:
publichealth
ابزاری کامپیوتری جهت طراحی تبدیل سلولی به صورت کارآمد

تبدیل سلولی یا cellular conversion یک فناوری کلیدی  جهت مدلسازی بیماری‌های انسانی پیوند سلولی، ژن درمانی به حساب می‌آید که لازمه هر سه مورد ذکر شده دسترسی به بازه گسترده‌ای از انواع سلول‌های انسانی است. در این پژوهش ابزاری محاسباتی معرفی شده است که با کمک آن می توان شرایط تبدیل سلولی را به طرز قابل توجهی بهبود بخشید.

برای اطلاع بیشتر از این روش به این لینک
مراجعه کنید.



📝تعداد کلمات: 489 کلمه
زمان مطالعه: حدود ۳ دقیقه


📝تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


دوشنبه‌ها: #مقاله_هفته


کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
Nature
اوتیسم در برزگسالان

تعداد افراد بالغ مبتلا به اوتیسم در طول دو دهه آینده به عنوان گروه بزرگی از بزرگسالان اوتیسمی به طور قابل‌توجهی افزایش خواهد یافت و اوتیسم شدید در بزرگسالی به یک مساله بسیار نگران کننده برای جامعه و خانواده ها تبدیل خواهد شد. با وجود داستان‌هایی که ممکن است در این زمینه خوانده باشید، بسیار نادر است که یک کودک مبتلا به اوتیسم در بزرگسالی بتواند به بهبودی کامل دست یابد. در واقع کودکان مبتلا به اوتیسم ممکن است مهارت‌های زیادی را یاد بگیرند که در بزرگسالی اوتیسم را کم‌تر آشکار کند اما عموما به بهبودی کامل نخواهند رسید. برخی از بزرگسالان مبتلا به اوتیسم در جهان ...

ادامه مطلب را اینجا مطالعه نمایید.


📝تعداد کلمات: 712 کلمه
زمان مطالعه: حدود 4 دقیقه

📝تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه‌ها: #مقاله_علمی_اجتماعی

کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
https://irautism.org