Genomics UA
Час другого воркшопу з ML від Євгенія Сидякіна визначено! Тема наступної зустрічі: Імплементація нейронної мережі на Python. Де: Zoom лінк: https://us02web.zoom.us/j/88068491390?pwd=Nno5THlqemJPeUNkSEVXcHRDeld4QT09 ідентифікатор: 880 6849 1390 пароль: 338339…
За два дні відбудеться другий воркшоп. Переходьте у зум о 15:00 🙂 Запис воркшопа буде викладено пізніше.
Запис першого ви можете вже передивитися на каналі https://www.youtube.com/watch?v=aQ9q9sgkS-8
Запис першого ви можете вже передивитися на каналі https://www.youtube.com/watch?v=aQ9q9sgkS-8
YouTube
ML Workshop. Урок 1. Sidyakin
DIAGEN - це більше, ніж медична лабораторія із сучасним обладнанням, це місце, де народжуються інноваційні та амбітні проекти. Наша унікальна спеціалізація - рідкісні і складні аналізи.
Що ми очікуємо від Вас?
• Медичне / біологічну освіту
• Досвід роботи в лабораторії ПЛР
• Бажано спеціалізація по вірусології, мікробіології або генетиці • Здатність навчатися, бажання освоювати нові методи • Комунікабельність, сумлінне ставлення до роботи
Вашими завданнями будуть:
• Виділення ДНК, РНК
• Збірка реакційних сумішей
• Проведення досліджень
Що ми гарантуємо?
• Офіційне працевлаштування, соціальні гарантії • Конкурентну і стабільну заробітну плату, бонуси за якісну роботу • 24 дні оплачуваної відпустки • Оплачувані лікарняні • Знижки на дослідження для Вас і Вашої родини • Навчання за рахунок компанії • Можливості для кар'єрного зростання • Дружний і молодіжний колектив • Можливість повної зайнятості / неповної зайнятості / роботи у вечірній час / позмінної роботи
Зв'язок: info@diagen.com.ua | +38 066 00 234 66
Що ми очікуємо від Вас?
• Медичне / біологічну освіту
• Досвід роботи в лабораторії ПЛР
• Бажано спеціалізація по вірусології, мікробіології або генетиці • Здатність навчатися, бажання освоювати нові методи • Комунікабельність, сумлінне ставлення до роботи
Вашими завданнями будуть:
• Виділення ДНК, РНК
• Збірка реакційних сумішей
• Проведення досліджень
Що ми гарантуємо?
• Офіційне працевлаштування, соціальні гарантії • Конкурентну і стабільну заробітну плату, бонуси за якісну роботу • 24 дні оплачуваної відпустки • Оплачувані лікарняні • Знижки на дослідження для Вас і Вашої родини • Навчання за рахунок компанії • Можливості для кар'єрного зростання • Дружний і молодіжний колектив • Можливість повної зайнятості / неповної зайнятості / роботи у вечірній час / позмінної роботи
Зв'язок: info@diagen.com.ua | +38 066 00 234 66
29 вересня відбудеться друга частина вебінару про національні біоінформатичні спільноти в європейській організації ELIXIR, яка ставить за мету інтегрувати бази даних, програмне забезпечення, навчальні матеріали в єдину інфраструктуру. 📩📨🗃🗄
На вебінарі буде наведена структура ELIXIR та перелічені переваги членства в ELIXIR для дослідників. 👨⚕️👩🏫👨💻🧑🔬
Друге засідання буде присвячене співпраці науковців у сфері дослідження геноміки людини та трансляційним даним. У ході сесії будуть представлені спільноти ELIXIR, що займаються координацією даних біології людини, а також буде описана інфраструктура федеративних даних та участь ELIXIR у дослідженнях COVID-19.
Вебінар створений для дослідників з Румунії🇷🇴, але досвід колег може стати в нагоді й українським науковцям🇺🇦.
Коли: 29 вересня з 10:00 до 12:00
Організатор: Societatea Română de Bioinformatică
Посилання на реєстрацію: https://elixir-europe.org/events/webinar-elixir-romania
Посилання на захід в Facebook: https://fb.me/e/4poZcEx3r
На вебінарі буде наведена структура ELIXIR та перелічені переваги членства в ELIXIR для дослідників. 👨⚕️👩🏫👨💻🧑🔬
Друге засідання буде присвячене співпраці науковців у сфері дослідження геноміки людини та трансляційним даним. У ході сесії будуть представлені спільноти ELIXIR, що займаються координацією даних біології людини, а також буде описана інфраструктура федеративних даних та участь ELIXIR у дослідженнях COVID-19.
Вебінар створений для дослідників з Румунії🇷🇴, але досвід колег може стати в нагоді й українським науковцям🇺🇦.
Коли: 29 вересня з 10:00 до 12:00
Організатор: Societatea Română de Bioinformatică
Посилання на реєстрацію: https://elixir-europe.org/events/webinar-elixir-romania
Посилання на захід в Facebook: https://fb.me/e/4poZcEx3r
Facebook
Webinar: National bioinformatics communities in ELIXIR. Session 2: Collaboration in human genomics and translational data.
Health event by Societatea Română de Bioinformatică on Tuesday, September 29 2020
Молодий start-up шукає спеціаліста з solid tumor micro-environment.
🏖Місце роботи: офіс з видом на пляж у Барселоні або дистанційно.
💶Очікувана заробітна плата: 20-30% з капіталу стартапу, як кофандр + рингова EU з/п + Іспанська start-up visa за необхідності.
Обов'язки: to build the solid micro-environment side of the business in dry lab.
Ідеальний кадидат:
▫️мова спілкування з коллегами - англійська
▫️має підприємницький підхід до вирішення справ
▫️величезний досвід в області мікрооточення щільних пухлин
▫️PhD + 2 постдоки в цій сфері
▫️~10 статей на цю тему
▫️PI-level
АБО
🩺Лікар-онколог з досвідом лікування щільних пухлин
Щоб податися, надсилайте лінк на Google Scholar та CV @benstaf
🏖Місце роботи: офіс з видом на пляж у Барселоні або дистанційно.
💶Очікувана заробітна плата: 20-30% з капіталу стартапу, як кофандр + рингова EU з/п + Іспанська start-up visa за необхідності.
Обов'язки: to build the solid micro-environment side of the business in dry lab.
Ідеальний кадидат:
▫️мова спілкування з коллегами - англійська
▫️має підприємницький підхід до вирішення справ
▫️величезний досвід в області мікрооточення щільних пухлин
▫️PhD + 2 постдоки в цій сфері
▫️~10 статей на цю тему
▫️PI-level
АБО
🩺Лікар-онколог з досвідом лікування щільних пухлин
Щоб податися, надсилайте лінк на Google Scholar та CV @benstaf
Привіт!
Нагадуємо, що до цієї сторінки під'єднана група для спілкування.
Бажаєте зустріч з певної теми? Є наукова задача, з якою вам потрібна допомога? Чи, мабуть, просто бажаєте спілкуватися в професійній спільноті? Будемо ради вас бачити! -> Bioinformatics UA
Гарного вам дня від команди "Геноміка ЮА" 🧬🖥
Нагадуємо, що до цієї сторінки під'єднана група для спілкування.
Бажаєте зустріч з певної теми? Є наукова задача, з якою вам потрібна допомога? Чи, мабуть, просто бажаєте спілкуватися в професійній спільноті? Будемо ради вас бачити! -> Bioinformatics UA
Гарного вам дня від команди "Геноміка ЮА" 🧬🖥
Telegram
Bioinformatics UA
Спільнота громадської організації "Геноміка ЮА". Обговорення новин та подій, освітні матеріали та взаємодопомога.
Канал Геноміки: @genomicsua
YouTube: https://www.youtube.com/@genomicsua
genomics.org.ua
Канал Геноміки: @genomicsua
YouTube: https://www.youtube.com/@genomicsua
genomics.org.ua
Наша команда взяла участь у Digital Med 2020 — конференції з IT, eHealth та інновацій у сфері охорони здоров'я.👨⚕️
Там ми розповіли аудиторії лікарів та медичних менеджерів про біоінформатику у світі та в Україні. Показали, як біоінформатика використовується у клінічній діагностиці та наукових дослідженнях рідкісних хвороб. 💊
Надзвичайно приємно бачити, що ця тема привертає все більше інтересу в Україні! Будемо ради використати компетенцію команди ГО "Геноміка ЮА" та залучити нашу спільноту у разі спільних проєктів з медичними установами. 🧪
Дякуємо учасникам заходу за участь та організаторам за запрошення! 🧬
Там ми розповіли аудиторії лікарів та медичних менеджерів про біоінформатику у світі та в Україні. Показали, як біоінформатика використовується у клінічній діагностиці та наукових дослідженнях рідкісних хвороб. 💊
Надзвичайно приємно бачити, що ця тема привертає все більше інтересу в Україні! Будемо ради використати компетенцію команди ГО "Геноміка ЮА" та залучити нашу спільноту у разі спільних проєктів з медичними установами. 🧪
Дякуємо учасникам заходу за участь та організаторам за запрошення! 🧬
Хей йо✌️
А наші друзі з проєкту Cup of Immunology запрошують на лекцію про CRISPR/Cas9 та останню Нобелівську премію з хімії. Розповідати про це буде Оксана Півень, докторка біологічних наук та провідна співробітниця відділу генетики людини ІМБГ НАН України.
Що у програмі:
👉 Для чого насправді досліджували імунну систему бактерій і що з цього вийшло🙀
👉 Як же працює технологія CRISPR/Cas9?
👉 Де зараз ми використовуємо цю систему і що нас чекає в майбутньому?
👉 Чому Нобелівську премію Еммануель Шарпентьє і Дженніфер Дудні отримали саме зараз?
👉 І як зараз почуваються перші генетично модифіковані дівчатка-близнюки?
👩💻Початок завтра, 20-го жовтня, о 19:00.
🙌 Сторінка події, де відбудеться трансляція:
https://www.facebook.com/events/836100130494003
P.S. А за їх хештегом #nobel_cup можна знайти запис лекції про Нобелівську премію з фізіології або медицини.
А наші друзі з проєкту Cup of Immunology запрошують на лекцію про CRISPR/Cas9 та останню Нобелівську премію з хімії. Розповідати про це буде Оксана Півень, докторка біологічних наук та провідна співробітниця відділу генетики людини ІМБГ НАН України.
Що у програмі:
👉 Для чого насправді досліджували імунну систему бактерій і що з цього вийшло🙀
👉 Як же працює технологія CRISPR/Cas9?
👉 Де зараз ми використовуємо цю систему і що нас чекає в майбутньому?
👉 Чому Нобелівську премію Еммануель Шарпентьє і Дженніфер Дудні отримали саме зараз?
👉 І як зараз почуваються перші генетично модифіковані дівчатка-близнюки?
👩💻Початок завтра, 20-го жовтня, о 19:00.
🙌 Сторінка події, де відбудеться трансляція:
https://www.facebook.com/events/836100130494003
P.S. А за їх хештегом #nobel_cup можна знайти запис лекції про Нобелівську премію з фізіології або медицини.
Центр громадського здоров'я МОЗ України шукає мікробіолога з досвідом секвенування для роботи в лабораторії з діагностики ВІЛ/СНІДу.
Детальніше за посиланням.
Детальніше за посиланням.
🤩Світовий лідер з генетичних технологій - Illumina представляє ряд вебінарів, які почнуться вже в найближчу середу!
На заходах будуть представлені приклади застосування NGS в дослідженнях онкологічних і складних генетичних захворювань. Також протягом події будуть представлені останні досягнення повногеномного профілювання в аналізі рідкісних захворювань.
🤭Для участі у вебінарах запрошено понад 20 вчених і фахівців з усієї Європи, Близького Сходу та Африки.
Вас чекає понад 10 годин наукових бесід, на яких ви зможете поставити питання та отримати розгорнуту відповідь від фахівців.
НЕ пропустіть, участь безкоштовна.
Реєстрація за посиланням - https://cvent.me/d4dBvm
Подія на Фейсбук: https://www.facebook.com/events/358850385400678
На заходах будуть представлені приклади застосування NGS в дослідженнях онкологічних і складних генетичних захворювань. Також протягом події будуть представлені останні досягнення повногеномного профілювання в аналізі рідкісних захворювань.
🤭Для участі у вебінарах запрошено понад 20 вчених і фахівців з усієї Європи, Близького Сходу та Африки.
Вас чекає понад 10 годин наукових бесід, на яких ви зможете поставити питання та отримати розгорнуту відповідь від фахівців.
НЕ пропустіть, участь безкоштовна.
Реєстрація за посиланням - https://cvent.me/d4dBvm
Подія на Фейсбук: https://www.facebook.com/events/358850385400678
Менеджмент біомедичних даних.
Підхід Університету Цюриха
Вебінар буде присвячений biomedical data life cycle management про те, які виклики зараз стоять перед аналітиками біомедичних даних та які є доступні open source рішення.
Ця тема напряму пов'язана з біологами, медиками та всіма залученими в сучасні наукові проєкти.
У презентації буде висвітлений досвід роботи в наукових дослідженнях з боку BioMed Data Life Cycle.
Прикладом для кращого висвітлення теми буде портал Університету Цюриха для Data management, аналізу та візуалізації.
А наприкінці буде трохи про самоосвіту в Data management і Bioinformatics data analysis, найпоширеніші інструменти та методики.
Лектор: Rostyslav Kuzyakiv, clinical data scientist в Zurich Hospital
Де: онлайн (посилання на Zoom), Facebook event
Коли: 20:00 (Київ), 24 листопада 2020
Підхід Університету Цюриха
Вебінар буде присвячений biomedical data life cycle management про те, які виклики зараз стоять перед аналітиками біомедичних даних та які є доступні open source рішення.
Ця тема напряму пов'язана з біологами, медиками та всіма залученими в сучасні наукові проєкти.
У презентації буде висвітлений досвід роботи в наукових дослідженнях з боку BioMed Data Life Cycle.
Прикладом для кращого висвітлення теми буде портал Університету Цюриха для Data management, аналізу та візуалізації.
А наприкінці буде трохи про самоосвіту в Data management і Bioinformatics data analysis, найпоширеніші інструменти та методики.
Лектор: Rostyslav Kuzyakiv, clinical data scientist в Zurich Hospital
Де: онлайн (посилання на Zoom), Facebook event
Коли: 20:00 (Київ), 24 листопада 2020
Genomics UA
Менеджмент біомедичних даних. Підхід Університету Цюриха Вебінар буде присвячений biomedical data life cycle management про те, які виклики зараз стоять перед аналітиками біомедичних даних та які є доступні open source рішення. Ця тема напряму пов'язана…
Лекція "Менеджмент біомедичних даних" вже доступна для перегляду на нашому каналі!
https://youtu.be/wWo57wTQeM8
https://youtu.be/wWo57wTQeM8
YouTube
Менеджмент біомедичних даних. Rostyslav Kuzyakiv
Вебінар присвячений biomedical data life cycle management, про те які виклики зараз стоять перед аналітиками біомедичних даних та які є доступні open source рішення.
Ця тема напряму пов'язана з біологами, медиками та усіма хто залучений у сучасні наукові…
Ця тема напряму пов'язана з біологами, медиками та усіма хто залучений у сучасні наукові…
131935314_747374485894016_3028086330080254603_o.jpg
114.1 KB
Введення в диференційну експресію генів
Біоінформатика існує, щоб знаходити відповіді на біологічні питання, котрі неможливо розв'язати лабораторними методами. Одне з таких питань — точне визначення фенотипових різниць у біологічних зразках. Як виокремити пацієнтів, котрим допоможуть нові ліки? Як клітини реагують на подразник або на гормон? Які метаболічні шляхи активуються при загоєнні ран?
Відповідями на ці питання займається транскриптоміка та її базові методи: Differential Gene Expression та Gene Set Enrichment Analysis. Цими методами ми можемо отримати різницю між обраними фенотипами за результатами їх РНК-секвенування. На лекції ви зможете більше дізнатися про те, як правильно аналізувати дані генної експресії для визначення диференційної експресії.
Лектор: Олександр Шинкаренко, співзасновник HTuO Biosciences, співзасновник Genomics UA.
Дата: 26.12.2020
Час: 20:00 (по Києву)
Де: Zoom
Біоінформатика існує, щоб знаходити відповіді на біологічні питання, котрі неможливо розв'язати лабораторними методами. Одне з таких питань — точне визначення фенотипових різниць у біологічних зразках. Як виокремити пацієнтів, котрим допоможуть нові ліки? Як клітини реагують на подразник або на гормон? Які метаболічні шляхи активуються при загоєнні ран?
Відповідями на ці питання займається транскриптоміка та її базові методи: Differential Gene Expression та Gene Set Enrichment Analysis. Цими методами ми можемо отримати різницю між обраними фенотипами за результатами їх РНК-секвенування. На лекції ви зможете більше дізнатися про те, як правильно аналізувати дані генної експресії для визначення диференційної експресії.
Лектор: Олександр Шинкаренко, співзасновник HTuO Biosciences, співзасновник Genomics UA.
Дата: 26.12.2020
Час: 20:00 (по Києву)
Де: Zoom
Існує міф, що до карантину Homo sapiens могли збиратись у людних місцях і в одному приміщенні слухати лекції.
Пропонуємо разом перевірити це, занурившись у доісторичні часи, та послухати семінар Maryna Korshevniuk по Single-cell RNA sequencing, що відбувся в далекому лютому поки ще недалекого 2020 року.
Introduction to single-cell sequencing, day 1.
Відео, Слайди
Introduction to single-cell sequencing, day 2.
Відео, Слайди
Пропонуємо разом перевірити це, занурившись у доісторичні часи, та послухати семінар Maryna Korshevniuk по Single-cell RNA sequencing, що відбувся в далекому лютому поки ще недалекого 2020 року.
Introduction to single-cell sequencing, day 1.
Відео, Слайди
Introduction to single-cell sequencing, day 2.
Відео, Слайди
Вже через годину, о 20:00 по Києву, розпочнеться вебінар Олександра Шинкаренка "Введення в диференційну експресію генів". Долучитись до вебінару можна через платформу Zoom за посиланням.
Даний захід відбудеться завдяки організаційній підтримці Олени Мельник, учасниці спільноти "Геноміка ЮА".
Кожен новонароджений має близько ста нових мутацій, з яких приблизно десять — шкідливі.
❓Наскільки пристосованість людини через це знижена?
❓Чи слід чекати накопичення шкідливих алелів у популяціях, що живуть у шкідливих умовах?
❓Чи буде користь від редагування генотипів?
Усі ці питання будуть розглянуті під час лекції.
👨🏫 Лектор: професор Олексій Кондрашов, Університет Мічигану, США.
📅 Дата: 11.01.2021, початок о 18:00 (київський час).
🌎 Де: Zoom, дані для підключення доступні після реєстрації: https://us02web.zoom.us/meeting/register/tZ0kcOmvrz0jG9cww20ZCFtkkCALpKwfTWtT
Лекція читатиметься російською мовою, та за необхідності організатори допоможуть з перекладом під час сесії «питання-відповідь».
Зображення заходу використовує знімок Кліффа з Арлінгтона, штат Вірджинія, США, опублікований під ліцензією Creative Commons Attribution 2.0 Generic (https://www.flickr.com/people/28567825@N03).
Кожен новонароджений має близько ста нових мутацій, з яких приблизно десять — шкідливі.
❓Наскільки пристосованість людини через це знижена?
❓Чи слід чекати накопичення шкідливих алелів у популяціях, що живуть у шкідливих умовах?
❓Чи буде користь від редагування генотипів?
Усі ці питання будуть розглянуті під час лекції.
👨🏫 Лектор: професор Олексій Кондрашов, Університет Мічигану, США.
📅 Дата: 11.01.2021, початок о 18:00 (київський час).
🌎 Де: Zoom, дані для підключення доступні після реєстрації: https://us02web.zoom.us/meeting/register/tZ0kcOmvrz0jG9cww20ZCFtkkCALpKwfTWtT
Лекція читатиметься російською мовою, та за необхідності організатори допоможуть з перекладом під час сесії «питання-відповідь».
Зображення заходу використовує знімок Кліффа з Арлінгтона, штат Вірджинія, США, опублікований під ліцензією Creative Commons Attribution 2.0 Generic (https://www.flickr.com/people/28567825@N03).
Вже за годину професор Олексій Кондрашов (University of Michigan) розповість про мутаціїї людини.
Приєднуйтесь до нас в Zoom.
Приєднуйтесь до нас в Zoom.
Друзі, а ми з чудовими новинами! 🥳
Команда Геноміки починає нову рубрику #ДайджестВакансiй
Періодично ми будемо ділитися з вами актуальними вакансіями для роботи/ навчання в області біоінформатики та системної біології.
Будемо дуже раді, якщо ви долучитесь до цього проекту, та повідомлятимете про цікаві можливості одного з організаторів (@mkorshe, @xander_petrenko, @kazanzhy). Отже, перша підбірка:
PhD student position in bioinformatics in International Centre for Translational Eye Research / Institute of Physical Chemistry, Polish Academy of Sciences
Deadline: 20.01.2021
Link: https://euraxess.ec.europa.eu/jobs/588801
IMB PostDoc prigramme (Mainz, Germany)
Deadline: 28.01.2021
Link: https://www.imb.de/students-postdocs/imb-postdoc-programme
Bioinformatician on Genomics of Ageing in Institute of Molecular Biology gGmbH (IMB)
Deadline: 31.01.2021
Link: https://euraxess.ec.europa.eu/jobs/588564
PhD position in computational systems biology
Deadline: 01.02.2021
Link: https://www.rug.nl/about-ug/work-with-us/job-opportunities/?details=00347-02S00080RP
ESR in Bioinformatics: Integrating the bacterial pan-genome with GWAS and machine learning approaches to study antibiotic resistance
Deadline: 01.03.2021
Link: https://alpaca-itn.eu/vacancies
PhD in bioinformatics (Institut Pasteur de Lille)
Deadline: 31.03.2021
Link: https://www.science.hr/jobs/74865/phd-in-bioinformatics/
Команда Геноміки починає нову рубрику #ДайджестВакансiй
Періодично ми будемо ділитися з вами актуальними вакансіями для роботи/ навчання в області біоінформатики та системної біології.
Будемо дуже раді, якщо ви долучитесь до цього проекту, та повідомлятимете про цікаві можливості одного з організаторів (@mkorshe, @xander_petrenko, @kazanzhy). Отже, перша підбірка:
PhD student position in bioinformatics in International Centre for Translational Eye Research / Institute of Physical Chemistry, Polish Academy of Sciences
Deadline: 20.01.2021
Link: https://euraxess.ec.europa.eu/jobs/588801
IMB PostDoc prigramme (Mainz, Germany)
Deadline: 28.01.2021
Link: https://www.imb.de/students-postdocs/imb-postdoc-programme
Bioinformatician on Genomics of Ageing in Institute of Molecular Biology gGmbH (IMB)
Deadline: 31.01.2021
Link: https://euraxess.ec.europa.eu/jobs/588564
PhD position in computational systems biology
Deadline: 01.02.2021
Link: https://www.rug.nl/about-ug/work-with-us/job-opportunities/?details=00347-02S00080RP
ESR in Bioinformatics: Integrating the bacterial pan-genome with GWAS and machine learning approaches to study antibiotic resistance
Deadline: 01.03.2021
Link: https://alpaca-itn.eu/vacancies
PhD in bioinformatics (Institut Pasteur de Lille)
Deadline: 31.03.2021
Link: https://www.science.hr/jobs/74865/phd-in-bioinformatics/