Genomics UA
875 subscribers
97 photos
2 files
161 links
Громадська організація "Геноміка ЮА". Ваш дім біоінформатики та омік в Україні.

Чат: https://t.me/BioinformaticsUA
Вебсайт: genomics.org.ua
YouTube: https://www.youtube.com/@genomicsUA
Download Telegram
NGSchool приготував п'ять семінарів з 18.06.20 для швидкого старту у біоінформатиці!
У програмі:
👉Вступ до Linux

🖖Вступ до Python, R

🤘Snakemake, Nextflow

Кількість місць не обмежена 🏁
👨‍🔬👩‍🔬 Нагадуємо, що лекція Софії про дослідження латерального аміотрофічного склерозу буде вже за декілька днів, цієї п'ятниці!
Будь ласка, завчасно зробіть безкоштовну реєстрацію, бо тільки так можна отримати посилання на конференцію Zoom та YouTube-трансляцію.
Реєстрація: https://www.eventbrite.com/e/105936210056

🖥 Ми записали для вас коротке відео про те, як зареєструватися і де подивитися посилання:
https://www.youtube.com/watch?v=51Kv8rqKjHM
Альтернативно, посилання на трансляцію доступні в листі-підтвердженні після реєстрації (див. скріншот)

Якщо виникли питання, наша команда допоможе! Напишіть нам в чат: @kyivbioinformatics, на пошту i@genomics.org.ua, або на фейсбук-сторінку fb.me/genomicsua.
Вже за десять днів відбудеться презентація нових інструментів від компанії Illumina: NextSeq 1000 та NextSeq 2000, яку організовують наші друзі з компанії BioLabTech, Ltd. Запрошуємо приєднатися та дізнатися про нові можливості для лабораторій 16-го червня об 11 годині. Переходь на сторінку заходу та реєструйся!


https://www.facebook.com/events/873889273118683/
Заявка на віртуальну грантову подорож 🧳🖥

Цього літа конференції були перенесені он-лайн. Але участь у них все ж чогось коштує.
BioUkraine пропонує грант для цієї особливої ситуації.
Збираймо свої матеріали та гайда на конференцію мрії не виходячи з дому! Слідуйте за посиланням 👣
We have new YouTube stream link instead of the old one:
https://youtu.be/a2RW7zp1Mm0

Enjoy!
Воркшопи з лабораторної біобезпеки

Бюро ВООЗ України проводить семінари на тему заходів безпеки під час тестування на COVID-19.

Серія міжнародних семінарів націлена на працівників лабораторій, але кожен охочий має можливість пройти даний курс.
Семінари записуватимуться, тому можна продивитися їх у зручний для вас час.

Після кожного семінару буде невеличкий тест, а після завершення курсу ви отримаєте офіційний сертифікат.

Приєднатися дуже легко! Перейдіть за посиланням
Meeting number: 145 764 7286
Пароль: ULabBSS-Web1

Перший захід вже 19-го червня о 14:00 за Києвом!
Ось і настали часи, коли шляхи мистецтва та науки перетнулися!

Nanobot Medical Animation Inc. — це компанія, що розробляє мультімедіа для візуалізації складних біологічних процесів. Nanobot Medical працюють у напрямках 3D анімації, ілюстрацій, доповненої та віртуальної реальності. Їх продукт затребуваний для освітніх програм і реклами у фармацевтичній, біотехнологічній галузях та в індустрії медичних пристроїв.

Наш гість: Андрій Конюх, CEO Nanobot Medical

Розповідатиме про принципи роботи в галузі біомед анімації, чого можна досягнути на міжнародному рівні на прикладі Студії, та що робити тому, хто хоче спробувати себе як біомед-художника.

Коли: 1 липня, 19:00
Ви можете поспілкуватися безпосередньо із гостем у
Zoom https://us02web.zoom.us/j/8511143843?pwd=dk5ubkx6Z001US9JV281ZWtCSXFjdz09
Ідентифікатор: 851 114 3843
Пароль: 7AEZ7K
або задати питанні в чаті на трансляції YouTube
https://www.youtube.com/watch?v=94fQbOT5gyw&feature=youtu.be

Зображення взяті з https://nanobotmedical.com/
Діяльність GenomicsUA тримається на власному ентузіазмі 7 людей. У нас є проекти, які потребують додаткових рук; у нас є запал для реалізації нових ідей.

Ми завжди раді новим членам у команді, тому на наступній зустрічі ми хочемо розказати вам про наші плани і вислухати ваш відгук про нашу діяльність.

Запрошуємо всіх, хто цікавиться внутрішньою кухнею GenomicsUA і хотів би долучитися до команди.

Коли: 10.07 об 19:00
Де: тільки в Zoom , без запису
Давайте знайомитися ближче!🖐

У нашому приємному чаті вже зібралась велика компанія біоінформатиків. Ми бачимо на кожній лекції як наших постійних слухачів, так і нові обличчя.

👁 Ми дуже хочемо дізнатись трохи більше про вас. Це допоможе нам зосередити наші зусилля на найбільш важливих проектах, залучати вас до найбільш релевантних активностей та розвивати колаборації в нашій біоінформатичній, біологічній та біомедичній спільноті, де відкриваються нові можливості для кожного! 🤝

🖋Тому ми просимо вас заповнити форму, яка допоможе нам зрозуміти, скільки з вас студентів, хто тільки почав вивчати програмування, а хто вже кодить калькулятор за 60 секунд.
Це займе у вас щонайбільше 7 хвилин.
Пропозиція для магістрів зі спеціальності комп'ютерних наук

🇲🇨Міждисциплінарна Лабораторія біоінформатики та білкової інженерії у Варшаві наразі шукає магістрів для їх провідного проекту. Їх напрямок — опис структури та функцій ДНКзимів — синтетичних, одноланцюгових молекул ДНК, здатних до каталізу.

🧬💻Окрім моделювання ДНКзимів, у цій групі ви зможете працювати над розробкою нового софту для вивчення структури нуклеїнових кислот. Знаєте RNA Puzzles? У лабораторії ви познайомитеся з її розробниками! Плюс до цього вам надається стипендія і можливість долучитися до активного життя групи. Подробиці на сайті.

Заявки приймаються до 1-го вересня. Початок програми з жовтня 2020.
🧠Штучний інтелект уже давно перейшов зі сторінок наукової фантастики в сучасний світ. Окрім загальновідомих автопілотів та голосових асистентів AI, зокрема, використовується і для вирішення медико-біологічних проблем. На наступному воркшопі ви матимете змогу дізнатися більше про штучний інтелект, як він працює та про застосування його в біоінформатиці.

Воркшоп складатитметься з наступних блоків:
1. Загальний огляд штучного інтелекту. Увідна частина без написання коду.
2. Імплементація нейронної мережі на Python.
3. Виконання проекту з детекції меланоми на знімках із застосуванням нейромережі.

9.08 о 15:00 буде перша частина!

Лектор
: Євгеній Сидякін, фахівець у галузі комп'ютерних наук, підприємець. Має більше 5 років досвіду застосування штучного інтелекту.

🤓Воркшоп розрахований на початківців, тому запрошуємо всіх бажаючих!

Де: Zoom
лінк: https://us02web.zoom.us/j/87679633803?pwd=UFRUVzUxVlFwb3RUalRqaU5XeGVGZz09
ідентифікатор: 876 7963 3803
пароль: 896909
Дякуємо @viapacific_9 за підготовку анонсу
💥Унікальна вакансія наукового копірайтера в Nanobot Medical Animation Studio!

Пам'ятаєте нашу останню зустріч з CEO Nanobot Studio Андрієм Конюхом? Якщо ні, то відеозапис лекції нагадає!
Тепер ви можете познайомитися з компанією ближче, безпосередньо попрацювавши з ними.

До ваших обов'язків входитиме:
🖊Редагування текстів на медичну тематику
💻Пошук інформації по темі медицини для колег і клієнтів (робота з документацією, науковою літературою, Інтернет-джерелами)
📊Перевірка достовірності статистичних даних та цитування інформації з джерел
📑Створення контенту (тексти, схеми) для промоції фармацевтичних препаратів та медичного оснащення (CLM презентації, AR/VR, відео) на сайтах і в моб. додатках
🛡Оцінка й узгодження матеріалів продукції клієнтів з законодавчими нормами

Ідеальний кандидат: з медичною освітою, креативний, розбирається в маркетингу. Нехай ніщо не зупинить вас спробувати податися на вакансію!

Звертайтеся до info@nanobotmedical.com із CV (або просто розкажіть про себе)
❗️Attention: на вас чекатиме тестове завдання
Нам дуже приємно розповідати про діючі наукові проекти в Україні. Й ось ще один (започаткований, як не символічно, 14-го лютого): RO-UA Genomes.

На території Закарпаття ведуться геномні дослідження з Щебелко Христиною як провідним дослідником проекту. Вони націлені на виявлення та опис значимих для медицини мутацій в етнічно різноманітній популяції прикордонного регіону Румунії та України. Зібрані дані будуть опубліковані у вільному доступі зі збереженням анонімності учасників.

Для того, щоб узяти участь у проекті вам необхідно:
1) походити з території населеного пункту в межах Закарпаття (бабусі й дідусі по материнській та батьківській лінії повинні бути з одного населеного пункту);
2) бути повнолітнім (вік 18+).

Якщо ви або хтось з ваших знайомих відповідаєте обом критеріям, то дізнавайтеся подробиці у Христини за адресою khrystyna.shchubelka@uzhnu.edu.ua
Добрий Варшавський Міжнародний Інститут молекулярної і клітинної біології відкриває нові можливості!

Ведеться пошук PhD студентів за наступними напрямками:

🐟 Вияснення внеску епігенетики в спеціалізацію клітин серцево-судинних ліній (на zebrafish)
🏜 Lysine deserts як універсальний механізм уникнення передчасної деградації білків
🧫 Вплив цитоплазматичної поліаденіляції на локальну трансляцію в нейронах

Вір у свої сили і подавайся :)
Python входить в першу трійку основних мов програмування, а рейтингу мов програмування для Data Science впевнено займає перше. Популярність цієїмови можна пояснити універсальністю, простотою синтаксису та великим ком'юніті. Але популярність в Data Science Python принесли такі бібліотеки як numpy, scipy, pandas, matplotlib, scikit-learn, keras та інтерфейсів до TensorFlow, Spark та Torch.

На вебінарі розглянемо бібліотеку pandas, а саме:
* Основні причини популярності pandas
* Основні структури даних (Series та DataFrame) та фільтрація значень
* Завантаження даних: CSV, Ecxel, parquet, бази даних
* Перевірка завантажених даних та типи даних
* Основні операції з маніпуляції даними
* Вертикальне і горизонтальне об'єднання таблиць
* Додавання нових стовців в таблицю
* Групування та агрегація
* Візуалізація даних
* Зведені таблиці
* Додаткові функції та розгляд датасетів

Лектор: Дмитро Казанжи, дата аналітик
Коли: 16.08.2020, 19:00
Де: за посиланням у Zoom.
Запис: https://youtu.be/Y0ySlh27xm4
Світ змінюється, а разом з ним змінюємося й ми!

Ми розпочинали діяльність "Геноміки" ще у 2018-му. Нашим першим заходом був воркшоп з диференційної експресії генів🧬, який в Одесі провела Юлія Ситнікова. Після цього заходу розпочав працювати одеський клуб біоінформатики, а згодом був заснований і київський.

Аби наші зустрічі були безпечними😷, під час пандемії ми зустрічалися виключно онлайн. Такий формат згуртував нашу спільноту ще сильніше, а також дозволив знайти нових колег, які зараз працюють не в Україні. Ми вирішили сконцентруватися саме на такому форматі й надалі. І хоча ми плануємо робити офлайн зустрічі, коли це буде безпечно, ми вирішили не локалізовувати наші клуби, а розширити географію і бути глобальними!🌍

Тому відсьогодні ми об'єднуємо проєкти Odesa Bioinforamtics Club та Kyiv Bioinformatics Club у новий — Bioinformatics UA. Подальше спілкування з обох проєктів буде тут: t.me/bioinformaticsua (колишній чат київського клубу).

Дякуємо, що ви з нами🤩. Сьогодні разом ми робимо найбільшу українську спільноту з біоінформатики, системної біології та пов'язаних напрямів.
Час другого воркшопу з ML від Євгенія Сидякіна визначено!

Тема наступної зустрічі:
Імплементація нейронної мережі на Python.

Де: Zoom
лінк: https://us02web.zoom.us/j/88068491390?pwd=Nno5THlqemJPeUNkSEVXcHRDeld4QT09
ідентифікатор: 880 6849 1390
пароль: 338339

🤓Воркшоп розрахований на початківців, тому запрошуємо всіх бажаючих!