🎤 صحبت‌های خانم زهرا توتونچی رتبه ۲۱ سهمیه آزاد و ۲۳ کل ژنتیک انسانی.
منابع 📚
نحوه مطالعه و برنامه‌ریزی 📝
توصیه‌های ایشون برای کنکوری‌های ۱۴۰۵ ✅
کارنامه ایشون 🏆
ایشون در دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی بنده شرکت کردن 💯


💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ (ظرفیت بسیار محدود) و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares


#مصاحبه

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

🎤 صحبت‌های خانم فاطمه صفاری رتبه ۳۰ سهمیه آزاد و ۳۲ کل ژنتیک انسانی.
منابع 📚
نحوه مطالعه و برنامه‌ریزی 📝
توصیه‌های ایشون برای کنکوری‌های ۱۴۰۵ ✅
کارنامه ایشون 🏆
ایشون در دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی بنده شرکت کردن 💯


💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ (ظرفیت بسیار محدود) و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares


#مصاحبه

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

✔️ دوستان همون‌طور که ملاحظه کردید، مصاحبه ۶ نفر از دوستانی که امسال رتبه خوبی کسب کردند رو گذاشتم؛ حتما به توصیه‌های این عزیزان توجه کنید و مطمئن باشید تجربه این دوستان، تو موفقیت شما تاثیرگذار هست؛ و اما لیست دوستانی که از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی و جزوات بنده تا الان استفاده کردن و رتبه شدن:

🏆 رتبه برترهای کنکور ۱۴۰۱:
🏅 خانم پرنیان آل‌آقا رتبه ۶ سهمیه آزاد و ۹ کل
🏅 خانم زهرا جمالی رتبه ۱۹ سهمیه آزاد و ۲۵ کل
🏅 خانم غزاله فرجی‌نیا رتبه ۳۷ سهمیه آزاد
🏅 خانم سولماز حسنی‌فرد رتبه ۳۹ سهمیه آزاد
🏅 خانم فائزه خدامرادی رتبه ۴۲ سهمیه آزاد
🏅 آقای سورین سیف‌الدینی رتبه ۵۸ سهمیه آزاد
🏅 خانم فرناز نوروزی رتبه ۱۷ سهمیه
🏅 آقای میلاد سالاری رتبه ۲۳ سهمیه

🏆 رتبه برترهای کنکور ۱۴۰۲:
🏅 خانم ستاره نساجی رتبه ۲ سهمیه آزاد و ۳ کل
🏅 خانم فاطمه غدیانی رتبه ۲ سهمیه و ۵ کل
🏅 خانم مهسا محمدی رتبه ۱۹ سهمیه آزاد و ۲۳ کل
🏅 خانم فاطمه زیادلو رتبه ۳۰ سهمیه آزاد و ۳۶ کل
🏅 خانم فرناز نوروزی رتبه ۱۱ سهمیه و ۶۶ کل
🏅 خانم مهسا اخوان رتبه ۲۶ سهمیه آزاد و ۳۱ کل
🏅 خانم کوثر باقری رتبه ۴۴ سهمیه آزاد و ۵۲ کل
🏅 خانم اسرا رستمی رتبه ۲۳ سهمیه
🏅 خانم زهرا مقدسی رتبه ۲۶ سهمیه

🏆 رتبه برترهای کنکور ۱۴۰۳:
🏅 خانم ر.ش رتبه ۳ سهمیه و ۱۳ کل
🏅 خانم نیوشا جوادزاده رتبه ۱۴ سهمیه آزاد و ۱۷ کل
🏅 خانم ثمین رشت‌چی رتبه ۲۲ سهمیه آزاد و ۲۵ کل
🏅 خانم مهسا رضاییان‌ رتبه ۳۴ سهمیه آزاد و ۳۹ کل
🏅 خانم عارفه دهقانی رتبه ۳۷ سهمیه آزاد و ۴۲ کل
🏅 خانم مریم دلیلی رتبه ۴۷ سهمیه آزاد و ۵۶ کل
🏅 خانم مریم کاظمی رتبه ۵۶ سهمیه آزاد و ۶۲ کل
🏅 آقای امیرعلی میرمظهری رتبه ۶۰ سهمیه آزاد و ۶۶ کل
🏅 آقای کسری علایی رتبه ۶۳ سهمیه آزاد و ۷۰ کل
🏅 آقای میلاد کرمی رتبه ۶۴ سهمیه آزاد و ۷۱ کل
🏅 خانم سعیده باقدرت رتبه ۲۳ سهمیه بیوتک پزشکی

🏆 رتبه برترهای کنکور ۱۴۰۴:
🏅 خانم آیدا رضوانی رتبه ۲ سهمیه و ۲ کل
🏅 خانم شقایق رشتی رتبه ۹ سهمیه آزاد و ۱۱ کل
🏅 خانم زهرا پروانه رتبه ۱۱ سهمیه آزاد و ۱۳ کل
🏅 خانم فاطمه سلامت رتبه ۱۳ سهمیه آزاد و ۱۵ کل
🏅 خانم زهرا توتونچی‌ رتبه ۲۱ سهمیه آزاد و ۲۳ کل
🏅 خانم فاطمه صفاری‌ رتبه ۳۰ سهمیه آزاد و ۳۲ کل
🏅 خانم زهرا پیروی رتبه ۳۲ سهمیه آزاد و ۳۵ کل
🏅 خانم دنیا حبیبی رتبه ۴۷ سهمیه آزاد و ۵۱ کل
🏅 خانم سلوا ولی‌زاده رتبه ۴۸ سهمیه آزاد و ۵۲ کل
🏅خانم مهسا مسلمی رتبه ۵۲ سهمیه آزاد و ۶۱ کل
🏅 آقای پدرام چزانی رتبه ۵۷ سهمیه آزاد و ۶۶ کل
🏅 خانم صدیقه جعفری رتبه ۶۸ سهمیه آزاد
🏅 خانم شیدا آزرم رتبه ۱۸ سهمیه
🏅 آقای علیرضا رحیمی رتبه ۷۵ سهمیه آزاد


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ (ظرفیت بسیار محدود) و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares


#مصاحبه
#کارنامه

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

✔️ با این لیست هم می‌تونید به مصاحبه‌ رتبه‌‌ برترهای چهار سال اخیر که از طرح برنامه‌ریزی و مشاوره و همین‌طور جزوات استفاده کردند، دسترسی داشته باشید:


🎤 مصاحبه رتبه برترهای کنکور ۱۴۰۱:

⬅️ مصاحبه با خانم پرنیان آل‌آقا رتبه ۶ سهمیه آزاد و ۹ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی و جزوات جمع‌بندی و تامپسون)

⬅️ مصاحبه با خانم سولماز حسنی‌فرد رتبه ۳۹ سهمیه آزاد و ۴۶ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی و جزوات جامع امری، تامپسون و جمع‌بندی)

⬅️ مصاحبه با خانم زهرا جمالی رتبه ۱۹ سهمیه آزاد و ۲۵ کل ژنتیک انسانی (استفاده از جزوات جمع‌بندی)

⬅️ مصاحبه با خانم فائزه خدامرادی رتبه ۴۲ سهمیه آزاد و ۴۹ کل ژنتیک انسانی (استفاده از جزوات جمع‌بندی)

⬅️ مصاحبه با خانم غزاله فرجی‌نیا رتبه ۳۷ سهمیه آزاد و ۴۴ کل ژنتیک انسانی (استفاده از جزوات جامع امری و جمع‌بندی)


🎤 مصاحبه رتبه برترهای کنکور ۱۴۰۲:

⬅️ مصاحبه با خانم ستاره نساجی رتبه ۲ سهمیه آزاد و ۳ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و جزوات جمع‌بندی و تامپسون)

⬅️ مصاحبه با خانم فاطمه غدیانی رتبه ۲ سهمیه و ۵ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و جزوات جمع‌بندی و تامپسون)

⬅️ مصاحبه با خانم مهسا محمدی رتبه ۱۹ سهمیه آزاد و ۲۳ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه)

⬅️ مصاحبه با خانم فاطمه زیادلو رتبه ۳۰ سهمیه آزاد و ۳۶ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و جزوات تامپسون)

⬅️ مصاحبه با خانم مهسا اخوان رتبه ۲۶ سهمیه آزاد و ۳۱ کل ژنتیک انسانی (استفاده از جزوات جمع‌بندی ژنتیک پزشکی)


🎤 مصاحبه رتبه برترهای کنکور ۱۴۰۳:

⬅️ مصاحبه با خانم نیوشا جوادزاده رتبه ۱۴ سهمیه آزاد و ۱۷ کل ژنتیک انسانی (استفاده از جزوات جمع‌بندی و تامپسون)

⬅️ مصاحبه با خانم ثمین رشتچی رتبه ۲۲ سهمیه آزاد و ۲۵ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و جزوات جمع‌بندی و تامپسون)

⬅️ مصاحبه با خانم مهسا رضاییان رتبه ۳۴ سهمیه آزاد و ۳۹ کل ژنتیک انسانی (استفاده از جزوات جمع‌بندی و تامپسون)

⬅️ مصاحبه با خانم عارفه دهقانی رتبه ۳۷ سهمیه آزاد و ۴۲ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی)


🎤 مصاحبه رتبه برترهای کنکور ۱۴۰۴:

⬅️ مصاحبه با خانم آیدا رضوانی رتبه ۲ سهمیه آزاد و ۲ کل ژنتیک انسانی (استفاده از دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی)

⬅️ مصاحبه با خانم خانم شقایق رشتی رتبه ۹ سهمیه آزاد و ۱۱ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی، دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی و جزوات لغات زبان پزشکی)

⬅️ مصاحبه با خانم زهرا پروانه رتبه ۱۱ سهمیه آزاد و ۱۳ کل ژنتیک انسانی (استفاده از دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی)

⬅️ مصاحبه با خانم فاطمه سلامت رتبه ۱۳ سهمیه آزاد و ۱۵ کل ژنتیک انسانی (استفاده از طرح مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و جزوات لغات زبان پزشکی)

⬅️ مصاحبه با خانم زهرا توتونچی رتبه ۲۱ سهمیه آزاد و ۲۳ کل ژنتیک انسانی (استفاده از دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی)

⬅️ مصاحبه با خانم فاطمه صفاری رتبه ۳۰ سهمیه آزاد و ۳۲ کل ژنتیک انسانی (استفاده از دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی)


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ (ظرفیت بسیار محدود) و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares


#مصاحبه
#کارنامه

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

🔍 ثبت‌نام آزمون دکتری وزارت بهداشت ۱۴۰۴ شروع شد.

لینک ثبت‌نام:
https://phd2.sanjeshp.ir/1404/Startpage.aspx

* مهلت ثبت‌نام: تا ۲۱ مرداد.


#اخبار
#دکتری
#وزارت_بهداشت

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📝 تفسیر و جزییات نتایج FastQC (پارت سوم یا آخر).
👈 پارت اول
👈 پارت دوم

🔒 رمز فایل (حروف بزرگ و کوچک رعایت شود): GeneticsAS

🔹دوستان تفسیر نتایج دیتاهای مختلف مثل bulk RNA-seq، single cell RNA-seq، ChIP-seq، WES/WGS و ... می‌تونه تفاوت‌های کمی باهم داشته باشه، اما توضیحات فایل یک حالت کلی رو در نظر گرفته.

⭕️ شاید برای آنالیز دیتاهای NGS، نیازی به چک کردن همه‌ی این پلات‌ها نباشه؛ اما چون خیلی از دوستان موقع آنالیز به این پلات‌ها هیچ توجهی ندارن و خیلی سطحی از آنالیز رد می‌شن، جزییات بیشتری به این فایل‌ها اضافه کردم تا با ریپورت FastQC آشنایی بیشتر و کامل‌تری داشته باشید.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ (ظرفیت بسیار محدود) و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📌 بعد از بررسی کیفیت فایل‌های Fastq با استفاده از ابزار FastQC، می‌تونید طی فرآیندی به نام trimming، کل یا بخشی از readهای بی‌کیفیت رو trim کنید یا برش بزنید؛ در واقع trimming باعث حذف بازهایی با کیفیت پایین یا آلودگی‌هایی مانند adapter می‌شود و این موضوع می‌تواند به بهبود فرآیندهایی مثل alignment کمک کند. این کار رو می‌تونید با ابزارهای مختلفی مثل Trimmomatic یا Cutadapt یا Fastp انجام بدید که در ادامه این پست،‌ کامندها و توضیحات مربوط به ابزار Trimmomatic قرار داده شده.

1️⃣ نصب ابزار Trimmomatic در Ubuntu ←

sudo apt install default-jre
sudo apt install trimmomatic 

2️⃣ کامند Trimming برای حالت Single-end ←

 java -jar trimmomatic-0.39.jar SE -threads 4 -phred33 input_SE.fastq output_trimmed.fastq ILLUMINACLIP:<adapters/TruSeq3-SE.fa>:2:30:10 HEADCROP:10 CROP:60 LEADING:20 TRAILING:20 SLIDINGWINDOW:4:20 MINLEN:36 

3️⃣ کامند Trimming برای حالت Paired-end ←

 java -jar trimmomatic-0.39.jar PE -threads 4 -phred33 input_R1.fastq input_R2.fastq output_R1_paired.fastq output_R1_unpaired.fastq output_R2_paired.fastq output_R2_unpaired.fastq ILLUMINACLIP:<adapters/TruSeq3-PE.fa>:2:30:10 HEADCROP:10 CROP:60 LEADING:20 TRAILING:20 SLIDINGWINDOW:4:20 MINLEN:36 

4️⃣ توضیحات پارامترها ←

 HEADCROP:n 

✅ این فلگ تعداد n باز ابتدایی همه‌ی readها را کات می‌کند؛ در واقع این فلگ به کیفیت بازها توجهی ندارد و به تعداد n باز، از ابتدای همه‌ی readها بریده می‌شود؛ مثلا اگر HEADCROP:10 را در کامند قرار دهیم، ۱۰ باز از ابتدای همه‌ی readها، کات می‌شود. بنابراین HEADCROP یک حالت blind-cut است.

 CROP:n 

✅ این فلگ تعداد n باز ابتدایی همه‌ی readها را حفظ می‌کند و بقیه رو کات می‌کند؛ در واقع بازها از سمت انتهای readها کات می‌شوند؛ مثلا CROP:60، شصت باز ابتدایی همه‌ی readها را نگه داشته شده و بقیه بازها کات می‌شوند؛ در این حالت همه‌ی readها ۶۰ باز خواهند داشت. بنابراین CROP نیز یک حالت blind-cut است.

 LEADING:n

✅ این فلگ امتیاز n را در نظر گرفته و از ابتدای readها شروع می‌کند و هر بازی که امتیاز آن زیر n باشد را کات می‌کند؛ همین‌طور وقتی به اولین باز با امتیاز بالای n برسد، trimming را متوقف می‌کند. مثلا پنج باز ابتدایی یک read حاوی امتیازهای ۳۰-۲۶-۲۱-۱۷-۱۰ و LEADING:20 باشد، دو باز ابتدایی با امتیاز ۱۰ و ۱۷ کات شده و چون باز سوم امتیاز ۲۱ دارد (بزرگتر از ۲۰)، فرآیند trimming ادامه نمی‌یابد.

 TRAILING:n

✅ این فلگ امتیاز n را در نظر گرفته و از انتهای readها شروع می‌کند و هر بازی که امتیاز آن زیر n باشد را کات می‌کند؛ همین‌طور وقتی به اولین باز با امتیاز بالای n برسد، trimming را متوقف می‌کند. در واقع روش کار این فلگ مشابه LEADING است، با این تفاوت که trimming را از انتهای readها انجام می‌دهد.

SLIDINGWINDOW:n:m

✅ این فلگ trimming را از میانه‌ی readها انجام می‌دهد؛ به این صورت که هر read را به پنجره‌های nبازی تقسیم می‌کند؛ حال اگر میانگین امتیاز n بازِ یک پنجره از m کمتر باشد، کل آن پنجره به همراه توالی کنار آن بریده می‌شود؛ اگر پنجره به ابتدای read نزدیک باشد، کل بازها تا ابتدا و اگر پنجره به انتهای read نزدیک باشد، کل بازها تا انتها trim می‌شوند.

MINLEN:n

✅ این فلگ یک حدآستانه برای طول readها تعیین می‌کند؛ هر read که طول کمتر از n داشته باشد، به‌طور کامل حذف می‌شود؛ این مورد به این دلیل است که readهای بسیار کوتاه ممکن است در مرحله aligning و mapping، به‌طور غیراختصاصی به ژنوم مرجع map شوند؛ به همین دلیل readهای بسیار کوتاه بهتر است حذف شوند؛ مثلا اگر MINLEN:40 تنظیم شود، readهایی با طول کمتر از ۴۰ از دیتا حذف می‌شوند.

ILLUMINACLIP:<adapters/TruSeq3-SE.fa>:2:30:10

✅ اگر آداپتورها از ابتدای readهای موجود در دیتای ما حذف نشده باشند و readها حاوی آداپتور باشند، با فلگ ILLUMINACLIP می‌توان آداپتورهای ابتدایی readها را حذف کرد؛ adapters/TruSeq3-SE.fa یک فایل fasta حاوی توالی‌های آداپتور illumina هست که در پوشه trimmomatic قرار دارد.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

💯 پاسخ تست.

🖥 جهت مطالعه مباحث رفرنس استراخان، این هشتگ را دنبال کنید ⇦ #نکات_استراخان


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#تست_روز

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📌 کار با Trimmomatic؛ پارت دوم.

5️⃣ برای هر کدوم از پارامترهای Trimmomatic، کدوم پلات در FastQC رو بهتره چک کنیم؟ ←
✅ پارامتر LEADING ⬅️
Per base sequence quality
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر TRAILING ⬅️
Per base seuqence quality
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر SLIDINGWINDOW ⬅️
Per base sequence quality
Per base sequence content
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر MINLEN ⬅️
Sequence length distribution
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر HEADCROP ⬅️
Per base sequence content
Per base sequence quality
Overrepresented sequences
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر CROP ⬅️
Per base sequence content
Per base sequence quality
Sequence length distribution
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر ILLUMINACLIP ⬅️
Adapter content
Overrepresented sequences

6️⃣ حدآستانه‌های معمول و بهینه برای هر پارامتر Trimmomatic ←
✅ پارامتر LEADING ⬅️
حدآستانه بهینه برای این پارامتر ۲۰ است؛ با این حال اگر کیفیت بازهای ابتدایی خوب باشد، می‌توان ۲۵ تا ۳۰ نیز در نظر گرفت.
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر TRAILING ⬅️
حدآستانه بهینه برای این پارامتر ۲۰ است؛ با این حال اگر کیفیت بازهای انتهایی خوب باشد، می‌توان ۲۵ تا ۳۰ نیز در نظر گرفت. اگر کیفیت بازها پایین باشد، می‌توان سخت‌گیری را کمتر کرد و پارامتر را روی ۱۵ تا ۲۰ تنظیم کرد.
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر SLIDINGWINDOW ⬅️
حدآستانه بهینه برای این پارامتر ۴:۲۰ است؛ با این حال اگر کیفیت بازها عالی باشد، می‌توان ۴:۲۵ یا ۵:۲۵ نیز در نظر گرفت و اگر کیفیت بازها پایین باشد، می‌توان ۴:۱۵ یا ۵:۱۵ تنظیم کرد.
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر MINLEN ⬅️
حدآستانه بهینه برای این پارامتر در RNA-seq حدود ۳۵ تا ۵۰، در small RNA-seq حدود ۱۸ تا ۲۵، در WGS یا WES حدود ۳۵ تا بالای ۵۰ و در ChIP-seq حدود ۳۵ تا ۴۰.
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر HEADCROP ⬅️
حدآستانه بهینه برای این پارامتر ۱۰ است؛ با این حال بسته به شرایط می‌تواند ۵ تا ۱۵ نیز باشد. حتی اگر کیفیت بازهای ابتدایی خوب باشد، می‌توان این پارامتر را نادیده گرفت.
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
✅ پارامتر CROP ⬅️
اگر کیفیت بازهای انتهایی خیلی بد باشد، می‌توان برای readهایی با طول ۱۵۰، از حدآستانه ۱۲۰ استفاده کرد؛ با این حال این پارامتر به طول readها بستگی دارد و در خیلی از مواقع می‌توان آن را نادیده گرفت.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📍 نکته ۷۰ استراخان: پیش‌بینی تغییرات بدمعنی (مهم؛ احتمال طرح تست برای کنکور بعد).


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#ژنتیک
#نکات_استراخان
#نکته۷۰

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📌 توزیع سوالات ژنتیک ارشد بهداشت از کنکور ۱۳۹۳-۱۳۹۴ تا ۱۴۰۴-۱۴۰۵ بر اساس فصل‌های رفرنس امری

🔴 توضیحات ◀️

🔴 دوستان این پای‌چارت فکت‌ها و نکته‌های جالبی از سوالات ژنتیک کنکور ارشد بهداشت ارائه می‌ده؛ یکی از این موارد اینه که تقریبا ۴۰٪ سوالات تو این سال‌ها، فقط از فصل‌های ۲، ۳، ۶ و ۱۴ طرح شدن! بنابراین گام اول برای اینکه به درصد خوبی برای ژنتیک برسید، باید روی تک تک کلمات این فصل‌ها مسلط باشید.

🟢 نکته بعدی اینه که تقریبا ۲۱٪ سوالات از فصل‌های ۹، ۱۷، ۱۸ و ۱۹ طرح شدن که نشون می‌ده بعد از فصل‌های ۲، ۳، ۶ و ۱۴، مهم‌ترین فصل‌های امری هستن (البته فصل ۵ هم می‌تونه جزو این فصل‌ها قرار بگیره، اما چون سوالاتش ترکیب با سوالات قدیمی و طرح‌شده از رفرنس براون هست، جزو این لیست نیاوردم). پس گام بعدی‌ برای کسب درصد خوب، تسلط کافی روی این فصل‌ها هست.

🟠 و اما نکته آخر این مورد رو نشون می‌ده که فقط ۱۴٪ سوالات از نه فصل ۴، ۷، ۸، ۱۰، ۱۱، ۱۲، ۱۳، ۱۶ و ۲۰ طرح شدن؛ در واقع با احتساب فصل‌های ۱ و ۲۱، فقط ۱۴٪ از کل سوالات، از نصف کتاب امری طرح شدن! بنابراین در قدم آخر، سعی کنید روی این فصل‌ها مسلط بشید.

🟡 البته دوستان مهم‌ترین نکته اینه که برای کسب یک درصد عالی برای درس ژنتیک، باید به تسلط خوبی روی کل رفرنس امری برسید؛ چون توزیع سوالات هر سال، ممکنه با حالت کلی متفاوت باشه؛ با این حال، یک‌سری از فصل‌ها و مباحث نیاز به توجه بسیار بیشتری دارن که در موردشون توضیح داده شد و توجه به این پا‌ی‌چارت می‌تونه مسیر مطالعه‌تون رو هموارتر کنه.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#مشاوره

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📍 نکته ۷۱ استراخان: چند نکته در مورد جهش از دست رفتن عملکرد (مهم؛ احتمال طرح تست برای کنکور بعد).


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#ژنتیک
#نکات_استراخان
#نکته۷۱

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📌 اپلیکیشن YPT

🔴 توضیحات ◀️

🔴 دوستان یکی از کارهایی که می‌تونه باعث ایجاد نظم در مطالعه‌تون بشه، ثبت زمان مطالعه هر درس به‌صورت منظم و روزانه هست. در واقع شما با این کار یک لیست از درس‌هایی که در طول روز مطالعه می‌کنید یا کارهایی که انجام می‌دید رو می‌سازید و زمان هر مورد رو روزانه ثبت می‌کنید.

🟢 برای این مورد، اپلیکیشن‌های مختلفی مثل Atracker، Forest، Focus To-Do و ... وجود داره، اما یکی از اپلیکیشن‌هایی که کار باهاش ساده هست و امکان مطالعه شخصی و گروهی رو فراهم می‌کنه، YPT هست؛ تو این اپلیکیشن می‌تونید لیست درس‌هایی که باید مطالعه کنید رو بسازید و به صورت آفلاین یا آنلاین و شخصی یا گر‌وهی زمان‌هاتون رو ثبت کنید. البته توجه کنید که برای مطالعه گروهی و آنلاین، تایم مطالعه شما برای دیگران و تایم مطالعه دیگران برای شما نمایش داده می‌شه؛ این مورد شاید باعث ایجاد حس رقابت مثبت بشه.
✅ لینک دانلود اپلیکیشن از گوگل‌پلی:
https://play.google.com/store/apps/details?id=com.pallo.passiontimerscoped

🟠 به همین منظور، یک گروه درسی برای مطالعه گروهی درست کردم که می‌تونید جوین شید و در کنار هم برنامه درسی و کاری‌مون رو با ثبت زمان انجام بدیم.
لینک گروه: https://link.yeolpumta.com/P3R5cGU9Z3JvdXBJbnZpdGUmaWQ9NTM0OTM0MQ==
رمز گروه: top7a
اول روی لینک گروه بزنید و اپلیکیشن رو با گزینه open باز کنید؛ وقتی وارد اپلیکیشن شدید، گزینه ok رو بزنید و بعد رمز گروه رو وارد کنید؛ بعد گزینه look around و بعدش گزینه join رو بزنید تا درخواستتون برای عضویت ثبت شه. توجه کنید که ظرفیت گروه فقط ۵۰ نفر هست.

🟡 ضمن اینکه پارسال هم همچین گروهی داشتیم و خانم آیدا رضوانی (رتبه ۲)، خانم شقایق رشتی (رتبه ۱۱) و خانم فاطمه سلامت (رتبه ۱۵) هم با این اپلیکیشن درس می‌خوندن.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#مشاوره

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

💯 پاسخ تست.

🖥 جهت مطالعه مباحث رفرنس جرد، این هشتگ را دنبال کنید ⇦ #نکات_جرد


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#تست_روز

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📌 نحوه‌ مطالعه‌ی فصل نوزده رفرنس امری

🔴 توضیحات ◀️

🔴 یکی از دغدغه‌های دوستان موقع مطالعه رفرنس امری، مطالعه فصل ۱۹ این رفرنس هست. طبیعتاً مطالعه‌ پیوسته‌ی این فصل با توجه به اینکه بیماری‌های زیادی داره، خیلی کار درستی نیست و علاوه بر اینکه زمان خیلی زیادی طول می‌‎کشه تا تموم بشه و انرژی زیادی می‌گیره، در نهایت چیز زیادی هم از جزییات این فصل تو ذهن باقی نمی‌مونه و تو این مدت از مطالعه فصل‌های دیگه هم عقب میافتید.

🟢 یکی از روش‌هایی که می‌تونید برای مطالعه این فصل استفاده کنید اینه که بعد از اینکه فصل‌های بیسیک ۲ و ۶ رو مطالعه کردید، در کنار مطالعه فصل جدید (مثلا فصل ۳)، روزی یک یا دو بیماری از بیماری‌های فصل ۱۹ رو هم مطالعه کنید. بعد از اینکه به آخرین بیمای فصل ۱۹ رسیدید، دوباره برگردید و از اول، روزی یک یا دو بیماری رو مرور کنید. با این روش هم مطالعه فصل‌های دیگه جلو می‌ره و هم می‌تونید راحت‌تر فصل ۱۹ رو هندل کنید.

🟠 و اما برای مرور روزانه این فصل، می‌تونید از فایل‌های خلاصه این فصل که تو کانال آپلود شد، استفاده کنید:
⬅️ پارت ۱ خلاصه اختلالات تک‌ژنی 👈🏻 پارت ۱
⬅️ پارت ۲ خلاصه اختلالات تک‌ژنی 👈🏻 پارت ۲
⬅️ پارت ۳ خلاصه اختلالات تک‌ژنی 👈🏻 پارت ۳
⬅️ پارت ۴ خلاصه اختلالات تک‌ژنی 👈🏻 پارت ۴


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#مشاوره

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📎 دوستان DataCamp احتمالا قراره از دوشنبه تا ۳۱ آگوست به مدت یک هفته، دسترسی به بخشی از کورس‌هاش رو رایگان کنه. حواستون باشه که از دست ندید.

📎 وب‌سایت DataCamp یکی از بهترین پلتفرم‌های یادگیری زبان‌های برنامه‌نویسی، مشین لرنینگ، هوش مصنوعی و دیتاساینس هست که با تکمیل کردن هر دوره، بهتون سرتیفیکت معتبر می‌ده که می‌تونید تو رزومه‌تون بذارید.
✅ لینک سایت:
https://www.datacamp.com/
✅ لینک دانلود اپلیکیشن از گوگل‌پلی:
https://play.google.com/store/apps/details?id=com.datacamp


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍

📌 دیتابیس DGIdb

🔴 توضیحات ◀️

🔴 یکی از دیتابیس‌های معروف جهت به دست آوردن اینتراکشن‌های بین ژن و دارو (Gene-Drug)، دیتابیس DGIdb هست؛ با وارد کردن اسم ژن یا ژن‌های خودتون می‌تونید اینتراکشن‌ این ژن‌ها با داروهای مربوطه رو بررسی کنید.

🟢 از این دیتابیس به‌عنوان یکی از استپ‌های مقاله‌تون می‌تونید استفاده کنید؛ به این صورت که ژن‌های نهایی‌ (مثل هاب‌ژن‌ها یا مارکرهای کاندید حاصل از یادگیری ماشین و فیچر سلکشن) رو وارد این دیتابیس کنید تا ارتباطات این ژن‌ها با داروها رو ریپورت کنید.

🟠 یکی از کارهایی که تو مقاله‌های بیوانفورماتیکی با این دیتابیس می‌شه انجام داد، به این صورت هست که اینتراکشن‌های بین ژن‌ها و داروها رو می‌شه از این دیتابیس به دست آورد و این اینتراکشن‌ها رو به‌صورت یک شبکه، تحت‌عنوان gene-drug network، با نرم‌افزار cytoscape نمایش داد.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ارشد بهداشت و علوم ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
💗💗💗💗💗💗©️💗 ⭐ 🤍🤍