Як термофільні бактерії допомогли створити ПЛР

Як ви вже здогадалися сьогодні мова буде йти про полімразну ланцюгову реакцію (ПЛР). Напевно всі чули цю абревіатуру та зараз зануримося трохи в молекулярні подробиці даного методу.

Метод ПЛР був винайдена Кері Маллісом у 1983 році й з того часу цю реакцію почали використовувати в різноманітних біологічних, медичних та клінічних дослідженнях. Незважаючи на універсальність та ефективність даного аналізу на початку його застосування було велике обмеження і стосувалося воно саме ДНК-полімерази. ДНК-полімераза - це фермент, який використовується клітиною для синтезу нової молекули ДНК та міститься в усіх живих організмах.

Тож, як відбувалася ПЛР в перших прототипах методу? Щоб почалася реакція, потрібно розкрутити молекулу ДНК, тому реакційну суміш разом з ДНК нагрівали на водяній бані до 94°C. Лише після цього етапу додавали ДНК-полімеразу, оскільки при такій високій температурі вона як звичайний фермент розкладається та не працює. Такі дії дослідник мав повторювати раз за разом в кожному циклі реакції, а таких циклів потрібно 30-40. Можете уявити скільки часу та ферменту мав витратити вчений на одну реакцію.
Але на допомогу молекулярним біологам приходить термофільна бактерія Thermus aquaticus, яка живе в гарячих гейзерах. Якщо ж сама бактерія здатна витримувати високі температури понад 55°C, тож її ферменти мають бути термостабільними. Так розмірковували вчені та й не прогадали, з цієї бактерії була виділена полімераза, яка отримала назву - ДНК-полімераза Taq. Згодом винахідник ПЛР, Кері Малліс, запропонував цю полімеразу для широкого використання, тому що це дало можливість зекономити час та змішувати всі компоненти реакційної суміші одразу.

ДНК-полімераза Taq мала такий шалений успіх, що стала "Молекулою року" за версією журналу Science в 1989 році. Навіть зараз цей тип полімераз є досить поширеним в молекулярно-генетичних методах.

Ось так завдяки одній маленькій бактерії біотехнологи отримали цілу низку можливостей та світ побачив новаторські дослідження в різних галузях біології.

Напишіть у коментарях, про які методи вам цікаво було б ще дізнатися.

Джерело: https://www.thermofisher.com/ua/en/home/brands/thermo-scientific/molecular-biology/molecular-biology-learning-center/molecular-biology-resource-library/spotlight-articles/history-pcr.html

#біотехнології #молекулярнабіологія

Авторка: @r_yulia

Привіт-Привіт!
Всі ми чули про славнозвісну вівцю , яка була клонована з соматичної клітини іншого дорослого організму.
Вже 29 квітня о 18:00 відбудеться зустріч «Клонування. Детальніше про вівцю Доллі».
Кисіль Микола, учень Dumfries Academy, взяв інтерв'ю в одного з професорів Рослінського інституту, який брав участь у клонуванні Доллі.
Реєстрація на подію тут!
Нехай все буде біологічно!
#лекції

Ви любите подарунки? Бо ми обожнюємо!🎁

Друзі, вчора біологічній спільноті PROФАЗА виповнилось півроку! Якщо ви хочете зробити подарунок для нас, то нам буде дуже приємно, якщо пройдете дане опитування (час проходження = 3 хв).🎉

Це неоціненний скарб, адже допоможе для створення ще крутішого контенту й цікавіших заходів.😍

Також всю нашу організацію МГО UkrTeenScience, до складу якої й входить PROФАЗА, завжди можна підтримати фінансово за посиланням! Це твій невеличкий внесок у розвиток молодіжної науки і квиточок у світ великих відкриттів!🔬

Нехай все буде біологічно!🌿

Сьогодні о 19 завершується реєстрація на травневу PROФОРІЄНТАЦІЮ! Поспішай!

The Mindfulness Trend

Have you heard that majority of famous people meditate regularly? We often hear that meditations can help you improve concentration, increase self-awareness, thus make you more effective and happier. What does science say about it?

The amygdala, the brain’s “fight or flight” center, shrinks during regular meditations. As the amygdala’s activity decreases, the prefrontal cortex, that is known as an awareness center of the brain, activates more. As a result, initial reactions to stressful situations become more aware and moderate.

In more details, meditation leads to increased activity in brain regions associated with attention such as dorsal lateral prefrontal cortex (DLPFC) and anterior cingulate cortex (ACC).

Of course, you don’t have to think of meditation as a spiritual ritual to take advantage of it. Researches show that focusing on breathing (the most common meditation practice) improve your ability to concentrate. The more you practice meditating, the faster you enter the state of focusing attention. During first experiences of meditating people may need more time to enter the focus state.
Have you ever practiced meditation? How did you feel after it? Share your experience in comments below👇

the amygdala - region of the brain primarily associated with emotional processes (especially with fear)
to shrink - to become smaller
the prefrontal cortex - the front part of the brain, that is important in human behavior such as planning, decision-making, and self-control

Resources:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2816391/
https://blogs.scientificamerican.com/guest-blog/what-does-mindfulness-meditation-do-to-your-brain/

Авторка: @myroslavvaaa

Дизайнерка: @Tertychnikova_O

Привіт усім!
Наші друзі-біологи влітку організовують біоінформатичну школу! Вся інформація нижче👇

Впевнені, що вам таке буде цікаво. Тому реєструйтеся!🌿

Biological Data Science Summer School (BDS^3) 2023 in Uzhhorod, Ukraine

The two-week Biological Data Science Summer School in Uzhhorod, Ukraine, 2-14 July 2023, teaches basic and advanced methods of bioinformatics and computational data analysis of modern molecular data types in biology and biomedicine (genomics, multi-omics). It comprises lectures covering underlying theory and concepts, and practical hands-on exercises. The lecture topics include underlying biology, modern biotechnologies for quantitative measurements, statistical analysis, visualization, and computational toolsets. The hands-on exercises will be looking at real datasets from recent international research projects, and using the R / Bioconductor and/or Python environments. At the end of the course, you should be able to design, implement and interpret data analysis workflows on (multi-)omic data, select and adapt available tools and packages, and make informed and scientifically sound choices about analysis strategies.

BDS^3 faculty:

Wolfgang Huber (EMBL, Germany),
Roderic Guigo (CRG, Spain),
Serghi Mangul (USC, USA),
Fyodor Kondrashov (OIST, Japan),
Robert Gentleman (Harvard University, USA)
Aleksandra Pękowska (NIEB, Poland)
Taras Oleksyk (Oakland University, USA)

We accept students enrolled in Bachelor's or Master's programs who are citizens or residents of Ukraine. In exceptional cases we will consider applications from PhD students enrolled in a university in Ukraine. If you don't have any previous coding experience, but are keen to learn the required skills, this school may still be for you. We aim to be able to provide a limited number of places for such participants. Participation in the course is free - BDS^3 will provide room and board and help cover travel costs to/from Uzhhorod. The BDS^3 school is organized in part by the School of Molecular and Theoretical Biology, a United States of America charitable 501c3 school.

Applications are open until May 20, 2023.
You can find more information in our application form: https://forms.gle/v6fZeeo2i7FZqxUM6

Друзі, чи є серед вас прихильники програмування, підприємництва, юриспруденції?

Цими вихідними зустрічаємося в Івано-Франківську 😻💕

👋Привіт, друзі! Уже маєте плани на наступні вихідні? Якщо ні - то команда UkrTeenScience підготувала для вас неймовірно цікавий фінал "Весняних курсів"

ЩО?
●лекція з комп'ютерних наук від Ігоря Мічуріна💻
●перерва та смаколики🧁
●бізнес-гра, що допоможе вам відчути себе справжніми підприємцями🤩

ДЕ?
📍Захід відбудеться у чудовому місті Івано-Франківську, у просторі наших партнерів “Між Іншим” за адресою: вул. Довга, 20б

КОЛИ?
📆30 квітня з 11 до 16 години

Цікаво? Тоді хутчіш реєструйся, заповнивши форму! Запрошення на онлайн-курси вже розіслані.

Деталі та програму проведення заходу дізнаєтесь в окремому телеграм каналі учасників заходу та в листі електронною поштою. Побачимося на заході!