🚨 Last Call for Applications: East European Bioinformatics and Computational Genomics Workshop 2025!

We invite graduate students, PhD candidates, postdocs, and early-career researchers from Ukraine and across Central & Eastern Europe to apply for EEBG 2025 — an intensive, hands-on summer workshop focused on bioinformatics, computational genomics, and data-driven biomedical research.

📅 Dates: July 7–12, 2025
📍 Location: Jagiellonian University, Kraków, Poland
🔗 Apply now: https://eebg2025.edu.pl/register/

⏳ Scholarship & early admission deadline: May 12, 2025. Only a few days left to register!

EEBG 2025 offers intensive, hands-on training in state-of-the-art genomic data analysis, including:

▪️ Variant calling and modern pipeline development
▪️ Population structure analysis and ancestry inference
▪️ Machine learning and AI methods in biomedical research
▪️ Practical exercises using real-world genomic datasets
▪️ Evening keynotes and research case studies by internationally recognized experts

Get ready to gain practical experience in exciting areas like variant calling, ancestry inference, and AI-driven biomedical approaches — all under the guidance of an international team of experts from world-leading universities and companies, including Oxford Nanopore Technologies, NVIDIA, and beyond.

The program emphasizes reproducibility, technical skill-building, and cross-disciplinary collaboration.

🧭 Venue: All in-person sessions will take place at the Małopolska Centre of Biotechnology (MCB), Jagiellonian University — one of Central Europe’s top centers for computational biology.

👥 Participation Options:
- On-site in Kraków (40 places): €450 / €550 fee after acceptance
- Online: free but for places are limited

🇺🇦 Ukrainian participants are eligible for a limited number of fellowships that cover participation fees and/or accommodation. To be considered, please apply by May 12 and indicate your interest in the application form.

🖇 What You Need to Apply:
1. Fill out the application form
2. Upload your CV
3. Add a brief motivation statement
5. Mark if you are applying for a scholarship

📩 For further inquiries, contact the organizing committee at: support@eebg2025.edu.pl

You can also reach out through Bioinformatics For Ukraine, our Telegram Chat & LinkedIn for questions and community support!

🧬 Антитіла —це білки, які кодуються генами імуноглобулінів. Але у незрілих B-лімфоцитів
ці гени ще неактивні. Щоб імунна система могла ефективно боротися з інфекціями, має відбутися VDJ-рекомбінація — процес, під час якого частини генів (сегменти V, D, J) поєднуються для формування функціонального генаімуноглобуліну.
Гени імуноглобулінів кодують антитіла — ключову зброю адаптивного імунітету. У незрілих B-лімфоцитах ці гени ще не активні, доки не відбудеться V(D)J-рекомбінація — процес, коли генетичні сегменти V, D і J (для важких ланцюгів) або V і J (для легких) з’єднуються, створюючи унікальні антитіла.

Ця рекомбінація відбувається через контрольовані розриви в ДНК, які має зшити ферментативна система клітини. Проте в умовах персистуючої (сплячої) вірусної інфекції (наприклад, при інфікуванні вірусами герпесу або ВІЛ), ці механізми можуть порушуватися, призводячи до неправильної рекомбінації, і як наслідок — до онкогенезу.

🦠 Віруси як імунні маніпулятори
Деякі віруси здатні пригнічувати або підкорювати імунну систему:
– ВІЛ знищує CD4⁺-лімфоцити, спричиняючи імунодефіцит;
– HHV-8 (герпесвірус 8 типу) — латентний вірус, який "прокидається"
при імунодефіциті та запускає розвиток саркоми Капоші — злоякісного ураження судин шкіри та слизових.

🔬 Якщо цей процес не встигає запуститися або відбувається з помилками (через розриви ДНК і неправильне "зшивання"), B-клітини не виробляють ефективні антитіла. В деяких випадках — особливо за умов постійного імунного виснаження, якце часто трапляється в ендемічних зонах Західної Африки — імунна система стає вразливою до вірусів, які можуть «підпорядкувати» собі клітини.

🦠 Приклад —вірус герпесу людини 8 типу (HHV-8), який здатен викликати саркому Капоші — онкологічне захворювання, що вражає судини та шкіру. У людей з хорошим імунітетом HHV-8 зазвичай не активний. Але якщо розвивається імунодефіцит (наприклад, при ВІЛ/СНІДі або після трансплантації органів із застосуванням імуносупресорів), вірус може "прокинутися" та спричинити пухлинний процес.

🧪 Саркома Капоші часто проявляється у вигляді темних плям на шкірі, уражень слизових
оболонок або лімфовузлів. Вона може ефективно лікуватися при ранньому виявленні, але важливо контролювати первинний тригер — стан імунітету.

🦠 Віруси гепатиту B та C також є онковірусами. При хронічному перебігу вони можуть спричинити гепатоцелюлярну карциному — рак печінки. Тому важливо своєчасно виявляти інфекції та проходити лікування.

💉 Профілактика та лікування:
— Проти гепатиту B існує ефективна вакцина, рекомендована для всіх, включно з новонародженими.
— Проти гепатиту C вакцини немає, але є сучасні противірусні засоби.
— Лікування інтерферонами може бути ефективним, але має ризики: серед них —
депресія та суїцидальні думки, що вимагає уважного медичного супроводу.

Корисні посилання:
Вакцинація відгепатиту B — CDC
Що варто знати про гепатит — ВООЗ
Інформаціяпро саркому Капоші — Cancer Research UK
Механізм VDJ-рекомбінації — Nature Education

🧠 Імунітет —це не лише захист від застуди. Це складна й чутлива система, збій якої може
стати пусковим механізмом для інфекцій і пухлин. Вчасна вакцинація, скринінг і підтримка здоров’я — наші найкращі союзники.


Авторка @Anastasia_Gold1
Дизайнерка @ukaralius

Нещодавно американські дослідники знайшли несподіване відкриття – здоров’я кишечника і ризик розвитку лейкемії тісно пов’язані між собою.🩸👨‍🦳 Особливо це небезпечно при беззсимптомному клональному гемопоезі з невизначеним потенціалом (CHIP) – стані, який часто спостерігається у старших людей і може бути передвісником лейкемії, серцево-судинних та запальних захворювань.

З віком кишкова стінка стає більш проникною, а кількість певних бактерій, зокрема грамнегативних, зростає. Вони можуть виробляти цукор АДФ-гептозу, що потрапляє в кров і активує формування так званих TIFA — сигнальних структур у клітинах, які запускають ріст передлейкемічних клонів. Вплив здійснюється через рецептори ALPK1, що кодується геном UBE2N.

Коли клітини обробили інгібітором UBE2N, розмноження передлейкемічних клітин значно зменшилося, навіть якщо АДФ-гептоза вже насинтезувалася в організмі. Цей результат — важливий крок до створення нових засобів профілактики лейкемії і розуміння зв’язку між найнеочікуванішими факторами, що впливають на наше здоров’я.

Копірайтерка: @stars_in_the_fridge
Дизайнерка: @cerulean_sun
Джерела 1, 2

Мрієш дізнатися, як ботанічні сади стають науковими центрами світового рівня?
Цікавишся збереженням біорізноманіття та генетичних ресурсів?

Коли?
📅 15 травня (четвер)
🕛 12:00
Запрошуємо тебе на захопливу відкриту лекцію у змішаному форматі — онлайн та офлайн!

Разом із 🌿 Світланою Машковською — кандидаткою біологічних наук, старшою науковою співробітницею НБС ім. М.М. Гришка НАН України, curator assistant Cambridge University Botanic Garden (UK) — вирушимо у відеоекскурсію 30-ма ботанічними садами світу й поговоримо про роль таких установ у збереженні нашої планети 🌍.

Про що?
🔬 Ботанічні сади як наукові центри збереження біорізноманіття і мобілізації генетичних ресурсів
📽️ Формат: змішаний (офлайн + онлайн)

Де?
🏛️ Офлайн: зала засідань ректорату КНУТД (ауд. 1-0322)
💻 Онлайн: Zoom-посилання
🔢 Ідентифікатор конференції: 817 0005 2912
🔐 Код доступу: 891949

Приходь, став запитання та надихайся справжньою наукою! ✨

Привіт-привіт, це знову рубрика #генетикастаті, і сьогодні ми поговоримо далі про психологічні аспекти статі. Перед тим, як говорити про різницю між статями, ми маємо розглянути, як загалом формується сексуальна поведінка – щоб було краще уявлення про такий феномен.

Як відомо, переважній більшості чоловіків є привабливими риси, які вважаються жіночими, а жінкам – чоловічі. Це теж обумовлено різницею у будові мозку.

За сексуальну поведінку відповідають такі структури, як: система винагороди, таламус, гіпоталамус, мигдалина, префронтальна та поясна кора.

Сексуальний потяг і відчуття задоволення є ключовими компонентами циклу сексуального задоволення, досвід якого залежить від дофамінергічних нейронів системи винагороди, розташованих головним чином у середньому мозку.

Крім того, сексуальна поведінка вимагає неявних сенсорних стимулів, які оцінюються як сексуально помітні та порівнюються з минулим досвідом, таким чином спонукаючи до викликаного мотиваційного стану. Відповідними анатомічними субстратами є лімбічні структури переднього мозку. Різні сенсорні сигнали інтегруються лімбічними структурами на несвідомому, таким чином запускаючи типові вегетативні реакції.

У гіпоталамусі є медіальна преоптична область/передній гіпоталамус, до якого надходять сексуальні стимули. Їхнє надходження до цієї ділянки викликає сексуальну мотивацію, щойно вони додатково інтегруються з інформацією, що передається різними ядрами. Також гіпоталамус бере участь в ерекції статевого члена.

Передній гіпоталамус також відіграє роль у регуляції типової чоловічої сексуальної поведінки. Було продемонстровано, що 3-тє інтерстиціальне ядро переднього гіпоталамуса (INAH3) є диморфним. У чоловіків воно, як правило, більше, ніж у жінок. Однак у гомосексуальних чоловіків воно менше, ніж у решти чоловіків. Тобто, ймовірно, саме ця структура визначає спрямованість сексуальної поведінки, або термінологічно точніше орієнтація. Однак про це детальніше буде у наступному дописі.

Результати досліджень на тваринах чітко вказали на мигдалину як ключову структуру в опосередкуванні
сексуальної поведінки. Докази ролі мигдалеподібного тіла в статевому функціонуванні у людей отримано з досліджень уражень: стимуляція мигдалини може викликати відчуття задоволення, схоже на оргазм.

Усі етапи статевого циклу людини включають складне свідоме усвідомлення, яке вказує на кору головного мозку як головного учасника процесу.

Префронтальна кора головного мозку (PFC) бере участь у плануванні складної когнітивної поведінки, самовираженні особистості, прийнятті рішень і
модеруванні правильної соціальної поведінки, тобто може пригнічувати бажання, які є соціально неприйнятними.

Поясна кора є найбільш помітною частиною
лімбічної системи. Її передня частина бере участь в обробці сексуальних стимулів у різних контекстах, покращуючи процес прийняття рішень за допомогою
своїх виходів у моторні зони.

Про сексуальну направленість поведінки чоловіків та жінок буде вже у наступному дописі, а на цьому бажаємо вам гарного дня!
Автор: @euchromatin
Дизайнер: @cerulean_sun
Джерела: 1,

Радіємо, що напередодні Дня науки в Україні голова та заступниця нашої молодіжної громадської організації "UkrTeenScience" були відзначені подяками за участь у конкурсі на здобуття Премії НАН України "За популяризацію науки", куди була номінована біологічна спільнота "PROФАЗА".🔬

Ця нагорода — ще одне підтвердження, що стратегічна програма — "PROФАЗА", створена понад два роки тому, є важливою спільнотою для формування наукової картини серед української молоді. ⚛️

Ми щасливі, бо цей проєкт допомагає об'єднати школярів, студентів, аспірантів, вчених та любителів, створює міст між академічною та індустріальною наукою. За ці роки ми маємо десятки успішних кейсів, створених самостійно чи у співпраці з партнерами— фестивалі, заходи, науково-популярні лекції, воркшопи, курси, екскурсії.

Щиро вітаємо усіх з Днем науки в Україні! Продовжуймо робити усе можливе для її популяризації!😍