✅ الگوریتم های هوش مصنوعی ( machine learning ) چگونگی تنظیم ژن ها در سلولهای منحصر به فرد را پیشگویی می کنند...

🔹 یک تیم از محققین دانشگاه ایلینویز شیکاگو با طراحی یک سخت افزار توانستند به محققین کمک کنند تا تنظیم کننده های ژن را بهتر شناسایی کنند.
🔹 این سیستم از الگوریتم یادگیری ماشین برای پیش بینی فاکتورهای رونویسی که به احتمال زیاد در سلولهای جداگانه فعال هستند استفاده می کند.
https://phys.org/news/2021-06-machine-algorithm-genes-individual-cells.html


📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

#خبر_علمی

✳️همانطور که اسکلت و ماهیچه‌ها، بدن انسان را حرکت داده و شکل آن را حفظ می‌کنند، تمام سلول‌های بدن نیز توسط اسکلت سلولی تثبیت شده و حرکت می‌کنند. برخلاف اسکلت مهره‌داران، این اسکلت سلولی ساختاری بسیار پویا است و دائماً خود را تغییر داده و تجدید می‌کند و از انواع مختلف رشته‌های پروتئینی تشکیل شده است که شامل رشته‌های حدواسط و میکروتوبول‌ها است. اکنون‌، یک تیم تحقیقاتی از دانشگاه گوتینگن یک تعامل مستقیم بین میکروتوبول‌ها و رشته‌های حدواسط خارج سلول را مشاهده کرده و این تعامل را از نظر کمی اندازه‌گیری کرده است. نتایج این مطالعه در Nature Communications منتشر شد.
ادامه دارد👇

📱@stubiotech
شاخه دانشجویی انجمن بیوتکنولوژی ایران

ادامه خبر👆

میکروتوبول‌ها رشته های پویایی هستند که به طور مداوم رشد کرده و کوچک می‌شوند و از این طریق مسئول بسیاری از فرآیندهای مهم در سلول‌ها هستند. تیم تحقیق مشاهده کرد که رشته‌های حدواسط، میکروتوبول‌ها را تثبیت می‌کنند: وقتی رشته‌های حدواسط به میکروتوبول‌ها اضافه می‌شوند، تراکم کم می‌شود و بنابراین طول عمر میکروتوبول‌ها افزایش می‌یابد. برای بررسی اینکه آیا این امر واقعاً به دلیل فعل و انفعالات مستقیم بین دو رشته است، یک میکروتوبول منفرد با یک رشته حدواسط مورد بررسی قرار گرفت.
پروفسور استفان کلومپ از انستیتوی دینامیک سیستم‌های پیچیده در دانشگاه گوتینگن می‌گوید: "علاوه بر این، ما از مدل‌ها و شبیه‌سازی‌هایی استفاده کردیم که نشان می‌دهد تعامل منجر به تثبیت می‌شود. " تثبیت میکروتوبول‌های پویا می‌تواند مسئله مهمی برای سلول‌های بیولوژیکی باشد، به عنوان مثال برای تنظیم ثبات موضعی آن‌ها. کوستر می‌گوید: "فعل و انفعالاتی که مشاهده کردیم مهم است زیرا درک بهتر فرآیندهای سلولی را امکان‌پذیر می‌کند."

این نتایج به نوبه خود برای درک بسیاری از فرآیندهای دیگر، مانند آن‌هایی که در سلول‌های بیمار درگیر هستند، مرتبط هستند. روش جدید برای اندازه‌گیریِ مستقیمِ تعاملِ واقعیِ دو بیوپلیمر ِمختلف، همچنین می‌تواند در سایر رشته‌های پروتئینی و همچنین فیبرهای غیر بیولوژیکی اعمال شود.

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

#پست_آموزشی

💠پستی جذاب و کاربردی با موضوع:

🔸 HPLC UV_VIS ANIMATION

🔺با ما همراه باشید🔺


📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

شبکه پزشکی مولکولی وزارت بهداشت برگزار می نمایید:

هشتمین دوره آنلاین " برنامه کشوری تربیت زیست پژوهشگر "

پاسخگویی و ثبت نام صرفا از طریق پیام رسان های واتس آپ و تلگرام به شماره:
09373022275
امکان پذیر می باشد.

دبیرخانه شبکه پزشکی مولکولی
معاونت تحقیقات و فناوری
وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

#فراخوان
✅ دعوت به همکاری

💠 علاقه مندان به عضویت ویژه در شاخه دانشجویی انجمن بیوتکنولوژی ایران و همکاری با بخش تولید محتوا روابط عمومی، به آیدی زیر مراجعه فرمایند.

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

✴️ تشریح پلتفرم هایی که در آن بستر واکسن‌های کووید-19 ساخته می‌شوند.
✴️ واکسن‌های ایرانی چه پلتفرمی دارند؟
✴️ آیا یک پلتفرم به دیگری برتری دارد؟

✅ دکتر کیهان آزادمنش- متخصص زیست فناوری پزشکی انستیتو پاستور پاسخ می‌دهد.

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

جلسه چهارم از دومین دوره سلسله وبینارهای تخصصی با موضوع کارآفرینی و فرصت های ویژه شغلی در حوزه های زیست شناسی، زیست پزشکی و کشاورزی کشور

دوشنبه 28 تیرماه 1400
ساعت 18 الی 21


📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

✴️ تشریح پلتفرم هایی که در آن بستر واکسن‌های کووید-19 ساخته می‌شوند
✴️ واکسن‌های ایرانی چه پلتفرمی دارند
✴️ آیا یک پلتفرم به دیگری برتری دارد؟

✅ دکتر کیهان آزادمنش- متخصص زیست فناوری پزشکی انستیتو پاستور پاسخ می‌دهد. قسمت دوم

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

گزارش خبرگزاری صداوسیما از آیین گشایش مرکز جامع سلول‌های بنیادی و پزشکی‌بازساختی

🧬مرکز جامع سلول‌های بنیادی و پزشکی‌بازساختی دانشگاه تربیت مدرس به‌عنوان نخستین مرکز در مجموعه دانشگاه‌های وزارت علوم، تحقیقات و فناوری در سیزدهم تیرماه افتتاح شد.
▶️ scrm.modares

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

#فراخوان پنجمین #جشنواره اندیشمندان و پژوهشگران جوان
جشنواره قرن

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

#خبر_علمی

✅ محققان موسسه فرانسیس کریک موفق به کشف مکانیسم حیاتی در سلول‌های پستانداران شدند که تصور می‌شد با تکامل این جانداران از بین رفته است. این مکانیسم به محافظت از سلول‌های بنیادی پستانداران در برابر ویروس‌های RNAدار مانند SARS-CoV-2 و ویروس زیکا کمک می‌کند. دانشمندان پیشنهاد می‌کنند که این امر می‌تواند روزی در توسعه درمان‌های ضد ویروسی جدید مورد بهره‌برداری قرار گیرد.
با آلوده شدن میزبان، ویروس به منظور تکثیر وارد سلول می‌شود. با وجود اینکه در اکثر سلول‌های پستانداران اولین خط دفاعی، پروتئین‌هایی به نام اینترفرون‌ها هستند؛ اما سلول‌های بنیادی توانایی تحریک پاسخ اینترفرون را ندارند و در مورد نحوه محافظت این سلول‌ها از خود تردیدهایی وجود دارد.

ادامه دارد👇

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

ادامه خبر👆

دراین مطالعه، که در8 ژوئیه در Science منتشر شد، دانشمندان مواد ژنتیکی سلول‌های بنیادی موش را تجزیه و تحلیل کردند و دریافتند که این سلول‌ها حاوی دستورالعمل‌هایی برای ساخت پروتئینی ضد ویروسی به نام Dicer (aviD) هستند که RNA ویروسی را قطع می‌کند و بنابراین از تکثیر ویروس‌های RNA‌دار جلوگیری می‌کند. به این شکل از محافظت که در سلول‌های گیاهان و بی‌مهرگان نیز وجود دارد تداخل RNA گفته می‌شود.
واقعیت این است که این محافظت همان چیزی است که گیاهان و بی‌مهرگان از آن استفاده می‌کنند و ممکن است چیزی باشد که به تاریخ تکامل پستانداران بر می‌گردد. در حالی که تمام سلول‌های پستانداران توانایی ذاتی برای تحریک این مکانیسم را دارند‌، اما به دلایلی فقط در سلول‌های بنیادی واقع می‌شود.
طی آزمایشاتی که در آن سلول‌های انسانی مهندسی شده را در معرض SARS-CoV-2 قرار دادند نشان داده شده است که ویروس با حضور aviD در سلول‌ها، سه برابر سلول‌های بنیادی را کمتر آلوده کرده است در مقایسه با زمانی که محققان این پروتئین را حذف کردند.
دانشمندان همچنین ارگانوئیدهای مغزی را از سلول‌های بنیادی جنینی موش پرورش دادند و دریافتند که، هنگام آلوده شدن به ویروس زیکا، ارگانوئیدهای حاوی پروتئین aviD با سرعت بیشتری رشد می‌کنند و مواد ویروسی کمتری نسبت به ارگانوئیدهای فاقد این پروتئین تولید می‌شود.
انزو پوآیر، نویسنده و فوق دکترای آزمایشگاه ایمونوبیولوژی در کریک می‌گوید "ممکن است پاسخ اینترفرونی آسیب زیادی به سلول‌های بنیادی وارد کند، بنابراین پستانداران، از جمله انسان، برای محافظت از این سلول‌های گرانبها در برابر آسیب‌های ویروسی تکامل یافته‌اند.
🌐 https://www.sciencedaily.com/releases/2021/07/210708143923.htm

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

◼️انتشار شماره اول دوفصل‌نامه علمی-تخصصی رمزیست

در این شماره می‌خوانیم:
-چگونه علوم‌کامپیوتر، زیست‌شناسی را نجات داد
-مارکوف و مارکوف مخفی را بهتر بشناسیم
- دنیای بیوانفورماتیک و پروژه هزار ژنوم!
-کرونا دنیا را تغییر داده، تکنولوژی را چطور؟
- دانشمند قصه‌گو می‌شود
- هر بار ساز و کار طبیعت را فهمیدیم، تغییرش دادند
و‌ ......

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

#نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس


📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

#خبر_علمی

🟢 آنچه از واریانت دلتای ویروس کرونا می‌دانیم

🔻با ما همراه باشید 🔺


📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

🎧🎤📻
اپیزود چهارم رادیو اسکافوس ^^

🎙خب بریم ببینیم توی اپیزود چهارم چخبره؟!!!
.
:
🔖موضوع اپیزود چهارم ریزش مو و بیماری های ناخنه ...

🔶 فاطمه بدرابادی، سجاد ارمی و دانیال چالشی کلیات و درمان انواع ریزش مو و بیماری های ناخن رو برامون میگن .

🔷 و طبق روال همیشگی اقای علی زارع میزبان شما عزیزان هستن.

🧩 طراح و گرافیست: رضا قنبری

♦️تیم تولید محتوا: فاطمه قدیری، سجاد ارمی، فراز جلودار، کیان کاظمی، نرجس فریزنی،
زهرا قیاس، هانیه صداقت، علیرضا نیک نفس، فرناز پورمحمودی و محمدمعین درخشان
🔶نویسندگان: شکوفه محمدپور و
حسین هادیان

📌برای شنیدن ادامه پادکست امشب ساعت ۲۲ با رادیو اسکافوس همراه باشید😊

تهیه شده توسط دفتر یوسرن شهید صدوقی یزد

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

#خبر_علمی

✅ «سلول‌های انسانی از قدرت شوینده‌ها برای از بین بردن باکتری‌ها استفاده می‌کنند»
محققان، مولکولی را کشف کرده‌اند که در بیشتر قسمت‌های بدن ساخته می‌شود و مانند پاک‌کننده‌ای عمل می‌کند که به یک لکه روغنی حمله کرده و باکتری‌های مهاجم را از بین می‌برد.
محقق موسسه پزشکی هوارد هیوز، جان‌مک‌مکینگ و همکارانش، در ژورنال Science در 15 ژوئیه 2021 گزارش دادند که این پاک‌کننده‌ی قاتل، پروتئینی است معروف به APOL3، که با حل کردن غشاهای باکتریایی، عفونت‌ها را خنثی می‌کند. این تیم پروتئین را روی باکتری‌های سالمونلای مسموم کننده مواد غذایی و سایر میکروب‌های مشابه آزمایش کردند.
این کار بینش جدیدی در مورد چگونگی دفاع سلول‌های انسانی از خود در برابر عفونت ارائه می‌دهد، فرآیندی که از آن به عنوان ایمنی خود به خودی سلول یاد می‌شود. باوجود اینکه دانشمندان می‌دانستند سلول‌ها می‌توانند به غشاهای باکتریایی حمله کنند، این مطالعه چیزی را کشف کرد که به نظر می رسد اولین نمونه از پروتئین داخل سلولی محافظ با عملکردی مانند شوینده است.

ادامه خبر👇

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

ادامه خبر 👆

وقتی نوبت به دفاع از بدن انسان می‌رسد، سلول‌های تخصصی سیستم ایمنی بدن به عنوان خدمه محافظان سلولی عمل می‌کنند. اما همان سیگنال‌های هشدار دهنده که این سلول‌ها را به حرکت در می‌آورند می‌توانند سلول‌های عادی را نیز فعال کنند. به عنوان مثال سیگنالی به نام اینترفرون گاما باعث افزایش تولید پروتئین در سلول‌های غیر ایمنی بدن می‌شود كه بافت‌ها و اندام‌های ما را می‌سازند.
محققان برخی از این سلول‌های غیر ایمنی را با سویه‌ای از سالمونلا، که به فضای سیتوپلاسمی سلول‌ها حمله می‌کند، آلوده کردند. سالمونلا متعلق به دسته‌ای از باکتری‌ها است که دو غشا دارد.
این تیم دریافت که سیگنال اینترفرون گاما می‌تواند مانع از تصرف سلول‌های سالمونلا در سلول‌های انسانی شود، اما نمی‌دانستند کدام پروتئین‌ها به کمک این فرایند می‌آیند. از همین رو محققان، بدنبال ژن‌هایی که پروتئین‌های محافظ را کد می کنند، بیش از 19000 ژن از سلول‌های انسانی را غربال کردند. این کار منجر به کشف APOL3، که از مولکول GBP1 و احتمالاً دیگر مولکول ها کمک می‌گیرد، شد. GBP1 به غشای خارجی باکتری آسیب می‌رساند و به APOL3 اجازه می‌دهد تا غشای داخلی را از بین ببرد.
پروتئین APOL3، مانند مواد شوینده لباسشویی، دارای دو بخش متصل شونده به آب و جذب شونده به چربی است. دکتر MacMicking می‌گوید‌، این فرایند باید بسیار انتخابی باشد، زیرا APOL3 باید از حمله به غشای سلول‌های انسانی خود جلوگیری کند.
کارل ناتان، که بر روی فعل و انفعالات بین میزبان و پاتوژن در کالج پزشکی ویل کورنل مطالعه می‌کند، می‌گوید: کشف این مولکول شوینده-مانند در سلول‌های غیر ایمنی "شواهد بیشتری را به این نظریه اضافه می‌کند که هر سلول در بدن می‌تواند بخشی از سیستم ایمنی باشد".
محققان هنوز با اِعمال این کشف در درمان عفونت‌ها فاصله زیادی دارند. رمزگشایی از دفاع بدن می‌تواند به بشریت ابزارهای جدیدی در برابر میکروب‌ها، که به طور فزاینده‌ای در حال تکامل و پیشرفت درخنثی کردن آنتی‌بیوتیک‌های معمولی هستند، بدهد.

🌐 https://www.sciencedaily.com/releases/2021/07/210715142350.htm

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

#خبر_علمی

🔸پیش‌بینی نفوذپذیری غشای سلولی از پپتیدهای حلقوی به کمک ابررایانه
🔹محققان انستیتوی فناوری توکیو می‌گویند که آن‌ها یک روش محاسباتی مبتنی بر شبیه‌سازی دینامیک مولکولی در مقیاس بزرگ برای پیش‌بینی نفوذپذیری غشای سلولی از پپتیدهای حلقوی با استفاده از ابررایانه ایجاد کرده‌اند.

ادامه خبر 👇

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران

ادامه خبر 👆

این پروتکل قادر به پیش‌بینی نفوذپذیری غشا از 56 پپتید حلقویِ هشت_رزیدویی با ساختارهای شیمیایی متنوع است که از جمله طرح‌های محرمانه یک شرکت دارویی‌ می‌باشد. در نتیجه‌، یک ارتباط منطقی بین یافته‌های آزمایشگاهی و محاسبات نفوذپذیری غشایی از پپتیدهای حلقوی برای کتابخانه‌های پپتیدها بدست آمد. این مطالعات برای پپتیدهای بسیار آبگریز مستثناست.
آکیاما خاطرنشان می‌کند: "مطالعه ما اولین باری است که شبیه‌سازیی جامع برای حدود 156 پپتید حلقوی مختلف انجام داد، شبیه‌سازی هر پپتید حلقوی با استفاده از این پروتکل توسعه یافته، حدود 70 ساعت به ازای هر پپتید با استفاده از 28 GPU در ابر‌رایانه TSUBAME 3.0 در Tokyo Tech طول کشید".
🔹محققان میزان نفوذپذیری پیش‌بینی شده را در بهترین شرایط و با ضریب همبستگی قابل قبول R = 0.63، با مقادیر آزمایشگاهی تأیید کرده و پتانسیل این پروتکل را به نمایش گذاشتند. علاوه بر این، پس از تجزیه و تحلیل دقیق ترکیب پپتید و مقادیر انرژی حاصل از داده‌های مسیر، تیم Akiyama دریافت که قدرت فعل و انفعالات الکترواستاتیک بین اتم‌های تشکیل‌دهنده پپتید حلقوی و محیط اطراف، یعنی لیپیدغشایی و مولکول‌های آب، به شدت مربوط به میزان نفوذپذیری غشا است.

🌐 https://www.genengnews.com/news/supercomputer-predicts-cell-membrane-permeability-of-cyclic-peptides/

📱@stubiotech
شاخه دانشجويي انجمن بیوتکنولوژی ایران