#skigeon_in_science #methods
Уже семь месяцев я веду этот Телеграм-канал, но ещё ни разу не касалась напрямую своих рабочих проектов. В ближайшее время я стану рассказывать о них больше, а пока что оставлю ссылку на сегодняшний пресс-релиз о нашей с коллегами недавно принятой к публикации в Journal of Neural Engineering статье про новый метод автоматической детекции патологической активности мозга у пациентов с эпилепсией.
Написание этой статьи — отдельная история, начавшаяся с радостных слов моего научного руководителя "Тут всё просто, можно написать за несколько недель" и продолжавшаяся больше года в попытках точно удостовериться, что наш алгоритм устойчив к разным артефактам и уровням зашумления. И эта история в самом деле принесла мне много навыков как организации обработки данных, так и работы над научным текстом в целом (а ещё вежливых ответов рецензентам). Подробнее эти навыки и лайфхаки тоже будут изложены позже.
Уже семь месяцев я веду этот Телеграм-канал, но ещё ни разу не касалась напрямую своих рабочих проектов. В ближайшее время я стану рассказывать о них больше, а пока что оставлю ссылку на сегодняшний пресс-релиз о нашей с коллегами недавно принятой к публикации в Journal of Neural Engineering статье про новый метод автоматической детекции патологической активности мозга у пациентов с эпилепсией.
Написание этой статьи — отдельная история, начавшаяся с радостных слов моего научного руководителя "Тут всё просто, можно написать за несколько недель" и продолжавшаяся больше года в попытках точно удостовериться, что наш алгоритм устойчив к разным артефактам и уровням зашумления. И эта история в самом деле принесла мне много навыков как организации обработки данных, так и работы над научным текстом в целом (а ещё вежливых ответов рецензентам). Подробнее эти навыки и лайфхаки тоже будут изложены позже.
Глубина первого впечатления
#methods
Публикация: Peterson, J. C., Uddenberg, S., Griffiths, T. L., Todorov, A., & Suchow, J. W. (2022). Deep models of superficial face judgments. Proceedings of the National Academy of Sciences, 119(17), e2115228119.
Взаимодействуя с людьми впервые, мы автоматически оцениваем их внешность. На основе сформированного впечатления мы делаем выводы не только о таких характеристиках, как возраст или комплекция, но и о социальном статусе, а также ряде психологических черт (например, надёжности или бдительности). Поэтому первое впечатление может оказывать влияние на дальнейшие решения (например, при приёме на работу).
Недавно с использованием базы из более чем 1 млн. оценок был разработан алгоритм на основе глубокого обучения (deep learning), позволяющий смоделировать наиболее универсальную оценку внешности на основе многообразия параметров лица. Т. е. основная ценность подхода заключалась в том, что оценивалось не выражение лица или его атрибуты (наличие очков и т. д.), как это осуществлялось алгоритмами глубокого обучения ранее, а именно впечатление, которое производят черты этого лица.
Основное ограничение модели заключалось в том, что она обучалась на слишком гетерогенных данных, в которых на показатели впечатления могли влиять как непосредственно черты лица (размер глаз и т. д.), так и внешние атрибуты (освещение, наличие аксессуаров и т. д.) Также показатели впечатления могут зависеть от возраста человека: мы по-разному оцениваем привлекательность взрослых и детей. Впрочем, это не помешало достижения адекватной точности предсказания ряда показателей: например, дружелюбия, доминантности или надёжности.
Разработанная модель позволила также видоизменять лицо в соответствии с тем или иным психологическим показателем (см. изображение).
#methods
Публикация: Peterson, J. C., Uddenberg, S., Griffiths, T. L., Todorov, A., & Suchow, J. W. (2022). Deep models of superficial face judgments. Proceedings of the National Academy of Sciences, 119(17), e2115228119.
Взаимодействуя с людьми впервые, мы автоматически оцениваем их внешность. На основе сформированного впечатления мы делаем выводы не только о таких характеристиках, как возраст или комплекция, но и о социальном статусе, а также ряде психологических черт (например, надёжности или бдительности). Поэтому первое впечатление может оказывать влияние на дальнейшие решения (например, при приёме на работу).
Недавно с использованием базы из более чем 1 млн. оценок был разработан алгоритм на основе глубокого обучения (deep learning), позволяющий смоделировать наиболее универсальную оценку внешности на основе многообразия параметров лица. Т. е. основная ценность подхода заключалась в том, что оценивалось не выражение лица или его атрибуты (наличие очков и т. д.), как это осуществлялось алгоритмами глубокого обучения ранее, а именно впечатление, которое производят черты этого лица.
Основное ограничение модели заключалось в том, что она обучалась на слишком гетерогенных данных, в которых на показатели впечатления могли влиять как непосредственно черты лица (размер глаз и т. д.), так и внешние атрибуты (освещение, наличие аксессуаров и т. д.) Также показатели впечатления могут зависеть от возраста человека: мы по-разному оцениваем привлекательность взрослых и детей. Впрочем, это не помешало достижения адекватной точности предсказания ряда показателей: например, дружелюбия, доминантности или надёжности.
Разработанная модель позволила также видоизменять лицо в соответствии с тем или иным психологическим показателем (см. изображение).
PNAS
Deep models of superficial face judgments | PNAS
The diversity of human faces and the contexts in which they appear gives rise to an
expansive stimulus space over which people infer psychological ...
expansive stimulus space over which people infer psychological ...
Вердикт птицы Додо
#mental_health
Психотерапия изобилует разнообразием подходов, начиная от реинкарнаций психоанализа и заканчивая более творческими вариациями (психодрама и др.) Лично мне как метод наиболее близка и интересна когнитивно-поведенческая терапия благодаря прозрачности её протоколов и эмпирически подтверждённой эффективности. Тем не менее, в результате общения с другими людьми, когда-либо пользовавшимися услугами психотерапевта, создаётся впечатление, что сработать и помочь может едва ли не любой метод, даже самый экзотический.
Этому феномену соответствует так называемый "вердикт птицы Додо". Ещё в 1936 году это понятие ввёл американский психолог Сол Розенцвейг. Изучая факторы, влияющие на положительный исход психотерапии, Розенцвейг предположил, что более важными являются общие факторы терапии (такие, как эмпатия терапевта и его контакт с клиентом), чем специфичные черты её различных вариаций. В соответствии с этим предположением все психотерапевтические подходы одинаково эффективны. Цитируя известную книгу, "Победили все, и приз получит каждый! – заключил наконец Додо."
На текущий момент консенсуса относительно вердикта птицы Додо достичь не удалось. С одной стороны, в ряде случаев находятся подходы, которые сопоставимы со стандартными. Например, недавно были опубликованы результаты рандомизированного контролируемого исследования, в котором обнаружилось, что при лечении депрессии терапия, сочетающая в себе психологические методы с физической активностью (а именно, скалолазанием), не уступала в эффективности когнитивно-поведенческой терапии. Более общие оценки предполагают, что 30-70 процентов разброса исходов терапии определяются факторами, общими для всех методов. Специфичные черты каждого подхода, напротив, вносили вклад лишь в 5-15 процентов разброса. Наконец, нельзя сбрасывать со счетов и внешние факторы, такие как длительность проблемы, с которой к терапевту обращается клиент, ожидания клиента от терапии, мотивация клиента, поддержка со стороны окружения клиента и т. д. В соответствии с некоторыми оценками, непосредственно психотерапия отвечает за лишь 13% исходов, в то время как 87% разнообразия исходов связаны как раз с внешними факторами. Эти наблюдения могут указывать на то, что все средства хороши.
С другой стороны, вердикт птицы Додо может оказаться не настолько крепким, если рассматривать эффективность специфичных психотерапевтических подходов в рамках конкретного заболевания. Например, более заметно превосходство когнитивно-поведенческой терапии над другими подходами для коррекции тревожных расстройств. Также может оказаться более целесообразным использования более продвинутых метрик оценки вклада различных факторов терапии в её исход, поскольку традиционно общие и специфичные факторы рассматриваются как независимые, что приводит к искажению и упрощению. Более реалистичным был бы анализ взаимодействия между этими факторами и учёт их изменения во времени.
Определение валидности "вердикта Додо" несёт в себе последствия для области психотерапии. Если вердикт верен, следует обратить внимание на стандартизацию общих терапевтических факторов, направленных на продуктивное взаимодействие терапевта и клиента. Если вердикт не верен и какая-либо группа психотерапевтических подходов является более эффективной, следует внедрять специфичные свойства именно этой группы в широкую практику.
#mental_health
Психотерапия изобилует разнообразием подходов, начиная от реинкарнаций психоанализа и заканчивая более творческими вариациями (психодрама и др.) Лично мне как метод наиболее близка и интересна когнитивно-поведенческая терапия благодаря прозрачности её протоколов и эмпирически подтверждённой эффективности. Тем не менее, в результате общения с другими людьми, когда-либо пользовавшимися услугами психотерапевта, создаётся впечатление, что сработать и помочь может едва ли не любой метод, даже самый экзотический.
Этому феномену соответствует так называемый "вердикт птицы Додо". Ещё в 1936 году это понятие ввёл американский психолог Сол Розенцвейг. Изучая факторы, влияющие на положительный исход психотерапии, Розенцвейг предположил, что более важными являются общие факторы терапии (такие, как эмпатия терапевта и его контакт с клиентом), чем специфичные черты её различных вариаций. В соответствии с этим предположением все психотерапевтические подходы одинаково эффективны. Цитируя известную книгу, "Победили все, и приз получит каждый! – заключил наконец Додо."
На текущий момент консенсуса относительно вердикта птицы Додо достичь не удалось. С одной стороны, в ряде случаев находятся подходы, которые сопоставимы со стандартными. Например, недавно были опубликованы результаты рандомизированного контролируемого исследования, в котором обнаружилось, что при лечении депрессии терапия, сочетающая в себе психологические методы с физической активностью (а именно, скалолазанием), не уступала в эффективности когнитивно-поведенческой терапии. Более общие оценки предполагают, что 30-70 процентов разброса исходов терапии определяются факторами, общими для всех методов. Специфичные черты каждого подхода, напротив, вносили вклад лишь в 5-15 процентов разброса. Наконец, нельзя сбрасывать со счетов и внешние факторы, такие как длительность проблемы, с которой к терапевту обращается клиент, ожидания клиента от терапии, мотивация клиента, поддержка со стороны окружения клиента и т. д. В соответствии с некоторыми оценками, непосредственно психотерапия отвечает за лишь 13% исходов, в то время как 87% разнообразия исходов связаны как раз с внешними факторами. Эти наблюдения могут указывать на то, что все средства хороши.
С другой стороны, вердикт птицы Додо может оказаться не настолько крепким, если рассматривать эффективность специфичных психотерапевтических подходов в рамках конкретного заболевания. Например, более заметно превосходство когнитивно-поведенческой терапии над другими подходами для коррекции тревожных расстройств. Также может оказаться более целесообразным использования более продвинутых метрик оценки вклада различных факторов терапии в её исход, поскольку традиционно общие и специфичные факторы рассматриваются как независимые, что приводит к искажению и упрощению. Более реалистичным был бы анализ взаимодействия между этими факторами и учёт их изменения во времени.
Определение валидности "вердикта Додо" несёт в себе последствия для области психотерапии. Если вердикт верен, следует обратить внимание на стандартизацию общих терапевтических факторов, направленных на продуктивное взаимодействие терапевта и клиента. Если вердикт не верен и какая-либо группа психотерапевтических подходов является более эффективной, следует внедрять специфичные свойства именно этой группы в широкую практику.
British Psychological Society
<em>British Journal of Clinical Psychology</em> | Wiley Online Library
Objectives
Bouldering has shown promising results in the treatment of various health problems. In previous research, bouldering psychotherapy (BPT) was shown to be superior to a waitlist control gro...
Bouldering has shown promising results in the treatment of various health problems. In previous research, bouldering psychotherapy (BPT) was shown to be superior to a waitlist control gro...
#popsci
В рамках выпуска подкаста Russky.Digital мы вместе с Михаилом Лебедевым, руководителем Центра нейробиологии и нейрореабилитации Сколтеха, рассказали о нейроинтерфейсах и о многом другом, что с ними связано. Беседа получилась живой и интересной, за что отдельное спасибо авторам подкаста!
Ссылки на разных платформах:
Яндекс. Музыка
YouTube
Apple Podcasts
VK
В рамках выпуска подкаста Russky.Digital мы вместе с Михаилом Лебедевым, руководителем Центра нейробиологии и нейрореабилитации Сколтеха, рассказали о нейроинтерфейсах и о многом другом, что с ними связано. Беседа получилась живой и интересной, за что отдельное спасибо авторам подкаста!
Ссылки на разных платформах:
Яндекс. Музыка
YouTube
Apple Podcasts
VK
YouTube
Подкаст RUSSKY.DIGITAL | Выпуск 14: Нейроинтерфейсы
Управление техникой с помощью силы мысли, новые чувства, успешное восстановление после тяжелых травм – что из этого нас ждет в будущем, а что уже стало реальностью? Об этом поговорили с руководителем центра нейробиологии и нейрореабилитации им. В. Зельмана…
Наука – верить или нет?
#metascience #thoughts
Публикация: O'Brien, T. C., Palmer, R., & Albarracin, D. (2021). Misplaced trust: When trust in science fosters belief in pseudoscience and the benefits of critical evaluation. Journal of Experimental Social Psychology, 96, 104184.
Влияние науки на принятие важных решений (в частности, в сферах здравоохранения) зависит от степени доверия к ней со стороны общества. Казалось бы, чем больше люди доверяют научному знанию, тем лучше, но, как показало недавнее исследование, и у этого есть оборотная сторона.
В ходе экспериментов участникам предлагали читать статьи, в которых содержалась ложная информация о несуществующем вирусе, который якобы был создан в качестве биологического оружия, а также о негативном влиянии ГМО на образование опухолей. Часть текстов содержала отсылки к научным источникам (псевдонаучные утверждения). Предварительно оценивалось, насколько участники доверяют науке, а также их способность критически оценивать информацию, используя собственные знания.
Обнаружилось, что люди, доверяющие науке, оказались склонны верить и псевдонаучным утверждениям. Зато уровень критического мышления обратно коррелировал с этой верой. Также, если участников предварительно настраивали на критическое мышление, предлагая им привести примеры людей, которые мыслили самостоятельно и не доверяли слепо сторонним источникам, то степень последующей веры в псевдонаучные утверждения снижалась. Когда же участникам предварительно предлагали вспомнить, как наука спасала жизни людей, предсказуемо вера в псевдонаучные утверждения оставалась на прежнем уровне.
Таким образом, доверие науке никогда не станет антидотом против псевдонауки или исходящих со стороны СМИ/публичных лиц громогласных заявлений, покрытых флёром научности, но не соответствующих научной действительности. Но зато таким антидотом может стать критическое мышление.
Занимаясь популяризацией науки, я часто сталкиваюсь с соблазном упростить контент, сделав из него красивую историю, воспевающую величие науки и её современных достижений, повышающую доверие к ней. Если же выбирать второй путь и излагать всю подноготную с противоречивыми результатами и методологическими ограничениями, есть риск потерять слушателя или читателя. Ведь гораздо приятнее и интереснее читать о том, что, например, наука раскрыла загадку сознания или разработала теорию всего, чем о том, что учёные, с одной стороны, в чём-то разобрались, но не до конца. "Чему тогда верить, если даже вы, учёные, ничего не знаете со стопроцентной уверенностью?" – с таким лейтмотивом реакций приходится сталкиваться, если выбирать второй путь. Но всё же я его выбираю в надежде, что хотя бы немного помогу слушателю или читателю принять решение – верить или не верить – более обоснованно.
#metascience #thoughts
Публикация: O'Brien, T. C., Palmer, R., & Albarracin, D. (2021). Misplaced trust: When trust in science fosters belief in pseudoscience and the benefits of critical evaluation. Journal of Experimental Social Psychology, 96, 104184.
Влияние науки на принятие важных решений (в частности, в сферах здравоохранения) зависит от степени доверия к ней со стороны общества. Казалось бы, чем больше люди доверяют научному знанию, тем лучше, но, как показало недавнее исследование, и у этого есть оборотная сторона.
В ходе экспериментов участникам предлагали читать статьи, в которых содержалась ложная информация о несуществующем вирусе, который якобы был создан в качестве биологического оружия, а также о негативном влиянии ГМО на образование опухолей. Часть текстов содержала отсылки к научным источникам (псевдонаучные утверждения). Предварительно оценивалось, насколько участники доверяют науке, а также их способность критически оценивать информацию, используя собственные знания.
Обнаружилось, что люди, доверяющие науке, оказались склонны верить и псевдонаучным утверждениям. Зато уровень критического мышления обратно коррелировал с этой верой. Также, если участников предварительно настраивали на критическое мышление, предлагая им привести примеры людей, которые мыслили самостоятельно и не доверяли слепо сторонним источникам, то степень последующей веры в псевдонаучные утверждения снижалась. Когда же участникам предварительно предлагали вспомнить, как наука спасала жизни людей, предсказуемо вера в псевдонаучные утверждения оставалась на прежнем уровне.
Таким образом, доверие науке никогда не станет антидотом против псевдонауки или исходящих со стороны СМИ/публичных лиц громогласных заявлений, покрытых флёром научности, но не соответствующих научной действительности. Но зато таким антидотом может стать критическое мышление.
Занимаясь популяризацией науки, я часто сталкиваюсь с соблазном упростить контент, сделав из него красивую историю, воспевающую величие науки и её современных достижений, повышающую доверие к ней. Если же выбирать второй путь и излагать всю подноготную с противоречивыми результатами и методологическими ограничениями, есть риск потерять слушателя или читателя. Ведь гораздо приятнее и интереснее читать о том, что, например, наука раскрыла загадку сознания или разработала теорию всего, чем о том, что учёные, с одной стороны, в чём-то разобрались, но не до конца. "Чему тогда верить, если даже вы, учёные, ничего не знаете со стопроцентной уверенностью?" – с таким лейтмотивом реакций приходится сталкиваться, если выбирать второй путь. Но всё же я его выбираю в надежде, что хотя бы немного помогу слушателю или читателю принять решение – верить или не верить – более обоснованно.
#аспирантское
Некоторые пункты опроса от Аспирантской школы ВШЭ как почва для обострения академической рефлексии
Некоторые пункты опроса от Аспирантской школы ВШЭ как почва для обострения академической рефлексии
Избавление от ненужного
#programming #tools
В последнее время я стараюсь как можно больше заниматься диссертацией и проверяю работу некоторых алгоритмов на разнообразных симуляциях мозговой активности. Сценарии симуляций множатся, я вхожу в раж, пробую разные параметры, и всё это приводит к тому, что мой код превращается в длинное полотно, некоторые фрагменты которого уже нерелевантны.
Поэтому сейчас решила вынести часть кода в модули и функции в соответствии с культурой программирования, которую я упоминала в одном из прошлых постов. На этом страдания не закончились, так как при создании модулей обнаружила большое число ненужных переменных и импортов неиспользуемых библиотек. Казалось бы, можно было бы просто не допускать их появления, но в моём случае красивый код и научное вдохновение редко сопутствуют друг другу.
К счастью, даже для моего хаотичного подхода находятся автоматизированные решения: в данном случае — тулбокс Autoflake. Теперь достаточно одного запроса, и в питоновском файле автоматически удалятся все ненужные импорты и неиспользуемые переменные.
#programming #tools
В последнее время я стараюсь как можно больше заниматься диссертацией и проверяю работу некоторых алгоритмов на разнообразных симуляциях мозговой активности. Сценарии симуляций множатся, я вхожу в раж, пробую разные параметры, и всё это приводит к тому, что мой код превращается в длинное полотно, некоторые фрагменты которого уже нерелевантны.
Поэтому сейчас решила вынести часть кода в модули и функции в соответствии с культурой программирования, которую я упоминала в одном из прошлых постов. На этом страдания не закончились, так как при создании модулей обнаружила большое число ненужных переменных и импортов неиспользуемых библиотек. Казалось бы, можно было бы просто не допускать их появления, но в моём случае красивый код и научное вдохновение редко сопутствуют друг другу.
К счастью, даже для моего хаотичного подхода находятся автоматизированные решения: в данном случае — тулбокс Autoflake. Теперь достаточно одного запроса, и в питоновском файле автоматически удалятся все ненужные импорты и неиспользуемые переменные.
#popsci
В новом выпуске нашего подкаста "Кортекс" мы с Настей поговорили про нейропластичность — о её положительных и отрицательных проявлениях, о её роли в нейрореабилитации и о том, как на неё влияют возрастные изменения. Приятного прослушивания!
В новом выпуске нашего подкаста "Кортекс" мы с Настей поговорили про нейропластичность — о её положительных и отрицательных проявлениях, о её роли в нейрореабилитации и о том, как на неё влияют возрастные изменения. Приятного прослушивания!
4 выпуск 1 сезона
Нейропластичность: о даре и проклятии нашего мозга — Подкаст «Кортекс»
Всем привет, с вами Настя и Даша!Наш новый выпуск — о пластичности мозга. Говорят, что любой опыт меняет наш мозг (иногда до неузнаваемости). Разбираемся, так ли это на самом деле и чем эти изменения плохи, а чем хороши. В выпуске поговорили, как про
#анонс #resources
Сейчас ожидаю самолёт, который отправляется в Ингушетию. Там пройдёт научная школа по экспериментальной и теоретической нейробиологии от научного центра «Идея».
В прошлом году я участвовала в аналогичной школе, организованной тем же центром, и определённо это был полезный опыт, поскольку в России сложно найти мероприятия, в рамках которых происходит настолько интенсивное погружение одновременно в нейробиологическое, математическое и физическое описание активности нейронов и их сетей.
В течение школы планирую оставлять в канале заметки по некоторым лекциям и семинарам, а пока прилагаю ссылку на записи лекций с прошлогодней школы.
Сейчас ожидаю самолёт, который отправляется в Ингушетию. Там пройдёт научная школа по экспериментальной и теоретической нейробиологии от научного центра «Идея».
В прошлом году я участвовала в аналогичной школе, организованной тем же центром, и определённо это был полезный опыт, поскольку в России сложно найти мероприятия, в рамках которых происходит настолько интенсивное погружение одновременно в нейробиологическое, математическое и физическое описание активности нейронов и их сетей.
В течение школы планирую оставлять в канале заметки по некоторым лекциям и семинарам, а пока прилагаю ссылку на записи лекций с прошлогодней школы.
brain.scientificideas.org
Научный Центр «Идея» / IDEAS Center
IDeAS: Inter-Disciplinary & Advanced Studies Center
IDEAS Neuroscience School. Начало
#анонс #resources
В данный момент идёт открытие научной школы по экспериментальной и теоретической нейробиологии. На официальном сайте стала доступна ссылка с трансляцией, используя которую можно послушать лекции и семинары.
#анонс #resources
В данный момент идёт открытие научной школы по экспериментальной и теоретической нейробиологии. На официальном сайте стала доступна ссылка с трансляцией, используя которую можно послушать лекции и семинары.