AACR Virtual Journal Club: Cancer Discovery & Blood Cancer Discovery

⏰ Среда, 15 июля 2020 (5:00 PM - 6:00 PM MSK)

👥 John E. Dick и Charles G. Mullighan

Будут обсуждать свои 2 свежие статьи в журналах AACR:

Relapse-Fated Latent Diagnosis Subclones in Acute B Lineage Leukemia Are Drug Tolerant and Possess Distinct Metabolic Programs


Mutational Landscape and Patterns of Clonal Evolution in Relapsed Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia

Регистрация бесплатная.

#какбытьученым #онлайнмероприятия

​​Статьи Blood Advances меня очень радуют вот уже на протяжении года.

И у журнала появился первый импакт фактор = 4.584.

Очень хочу опубликовать в этом журнале следующий кусочек своей работы.

Серия вебинаров от EMBL.

⏰ 3 июля 2020 11:00-12:00 (CEST)
Карьера в фарме и биотехе.
👥 Oryzon genomics, Sanofi.
Регистрация бесплатная.

⏰ 24 июля 2020 11:00-12:00 (CEST)
Как стать групп-лидером.
Регистрация бесплатная.

Регистрироваться нужно отдельно на каждый из вебинаров.

#какбытьученым #онлайнмероприятия

Сегодня расскажу вам про эти организации и о том, как и зачем в них вступать.

​​Из заметок (31 июля 2015 года). Неопубликованное.

Не смотря на то, что я еще не вернулась, а сижу на вокзале в г. Чупа, самое время описать свои впечатления о поездке. Самое время.

Во-первых, для тех, кто не знает, 2 недели я провела на Белом море, если быть точной на о.Оленевский. Что я там делала? В последнее время я прохожу практику в Лаборатории молекулярной генетики МФТИ, в которой я, вроде как, занимаюсь неким подобием научной деятельности. Так вот, в конце июня поступило предложение от заведующего лабораторией Ильи Владимировича Манухова поехать на Белое море во второй половине июля, послушать ЛЕКЦИИ крутых биологов и поучаствовать в работе по сбору люминесцентных БАКТЕРИЙ. Планы на этот период были. Планы резко поменялись. Куча нервов и несколько дней были потрачены на поиск нужного оборудования и экипировки. Кстати, сразу можно сдодать маленький ВЫВОД: собираться в экспедиции я явно не умею. Хотя несколько полезных вещей в моем рюкзаке нашлись: офигенная ЗЕЛЕНАЯ ВЕРЕВКА, дождевик, треки и ГЕРМОМЕШОК. Очень не хватало НЕПРОМОКАЕМЫХ брюк и болотников.

Поезд Москва-Чупа. Бездорожье. Моторная лодка. Группа студентов и Мария Николаевна. Мчимся в хорошем настроении на остров.

Палаточный лагерь. Отсутствие бани. Подъем в 8 утра. Еда с песком. Ставим палатку, разворачиваем спальники.

"Вообще-то после поезда у нас люди считаются стерильными".

Лекции на свежем воздухе от Михаила Колобов. Прогулки по литорали. Собираем образцы. Лужицы внутри непромокаемых ботинок превращаются в озера.

"Морские звезды видят каждой точкой своего тела".

Рыбалка. Посев кишечной микрофлоры рыб на чашки Петри. Дежурство на кухне. Осознаем, что еду-то можно готовить и без песка!

"Почему мы не уезжаем раньше? Как нам пришло в голову поехать на 2 недели?"

Вышло солнце. Самое время искупаться и помыть голову. Вода 10 градусов. Забегаем, отнимаются ноги, выбегаем.

"Термоштаны - это моя вторая кожа. Не помню, когда я в последний раз видела свою настоящую".

День рождение Марии Николаевы. Вы когда-нибудь пекли блины без яиц? Вы когда-нибудь искали по лагерю сгущенку, пытаясь выменять её на банку кукурузы? Это было не просто. Но мы справились.

"Покажите вашу банку кукурузы. Большая. Держите сгущенку".

Поход на полярный круг. Нужно сфотографироваться в купальниках. Только быстро, пока комары не съели.

"Давайте поменяем билеты. Ну зачем нам конференция на о.Средний. С ума все посходили".

Лекции по ботанике. Разговоры о жизни с доком, которого много раз заставали врасплох волки и медведи. Кофеек от Ильи Владимировича. Выезд в палаточную баньку и купание в несоленой воде.

"Мне кажется, мы слишком чистые".

28 числа запланирован отъезд на конференцию. На другой остров. Остров Средний. До которого добираться черт пойми как. До отъезда 2 дня. Льет дождь.

"А на поезд есть билеты! Ребята, покупаем? Сваливаем"

Никуда на уехали. Ваня с Мишей за рулем уазика. Калина мчит по бездорожью.

"Доедем до Керети, а там не мало вероятен ужасный шторм, до острова не доберемся. Пару дней поживем в заброшенной деревушке в палатках"

Море спокойно. До Среднего дозвонились. Деревянная церквушка. Ночь. Двухметровый иван-чай.

"Черт, ключи в машине. Машина захлопнута. Утром разберемся. Лодка уже подъехала".

Тропы не наблюдается. Пробираемся через заросли иван-чая. Мокрые. Голодные. Холодные. Вычерпываем воду из летящей по морю лодки.

"Ужин на вас приготовлен. Устанавливайте палатку и приходите".

Два часа ночи. Блинчики с мясом. Лисички. И горячий чай. Подъем.

"Черт, на флешке нет презентации по биолюминесцентным бактериям"

Конференция. 15 км пешком до поездка. Занавес.

Никаких сомнений. Ехать надо было. Ехать хотелось. Ничего лучше на июль придумать было нельзя. Бесценный опыт. Гора впечатлений и безграничное удовольствие.

​​И такое со мной было. Что я в грязных, мокрых штанах ковырялась ватной палочкой в кишечнике собственноручно выловленных рыб.

Обещанное видео с Белого моря. Оригинал у меня не сохранился, поэтому проходите по ссылке ВК.

Вопрос/ответ с Антоном Буздиным.

Спроси ученого о биоинформатике.


Наша лаборатория давно коллаборирует с научной группой Антона, которая занимается разработкой новых методов анализа транскриптома злокачественных клеток. Антон — доктор биологических наук, с недавнего времени заведующий лабораторией трансляционной геномной биоинформатики МФТИ, научный директор биомедицинской компании Oncobox, руководитель Группы геномного анализа сигнальных систем клетки ИБХ РАН. Индекс Хирша — 35.

Пару лет назад я читала лекцию на Физтех.Читалке и участвовала в Q&A «Спроси ученого о клетках».

#какбытьученым #онлайнмероприятия

Virtual Vancouver

⏰ 26-28 Октября 2020
Регистрация: ранняя - до 29 июля, стандартная - до 2 сентября.

Секции: Bioengineering Cellular Therapeutics, Self-organizing models of tissue function and disease, From Discovery to Clinical Translation и др.

Регистрационный взнос: 150$ для студентов и молодых ученых (undergraduate or graduate student, post-doctoral fellow, research associate, technical staff or clinical research staff)

Подав до 29 июля, можно выиграть бесплатную регистрацию, Drew Lyall Award of Excellence, получить устный доклад.

Кроме того, по ссылке вы можете посмотреть вебинары о том, как писать тезис на конференцию.

​​​​​​По результатам опроса всего 9% людей состоят в одной из организаций: EACR, EMBO, ASH, AACR, ASCO.

Дважды за последний учебный год я посещала конференции в городах Эшторил (Португалия) и Бергамо (Италия) абсолютно бесплатно. Это было возможным благодаря членству в организациях European Association for Cancer Research (EACR) и European School of Haematology (ESH) и их грантам для молодых ученых - Travel Grant или же Meeting Bursary.

Что такое Travel Grant/Meeting Bursary?

Это стипендия, которая предоставляет организация, чтобы финансово помочь молодым учёным посетить их конференции. Travel Grant обычно покрывает регистрационный взнос, билеты и проживание. В случае получении гранта, Вам вручают сертификат и после конференции необходимо написать отчёт о поездке. EACR, например, публикует отчёты в своём журнале.

Как получить Travel Grant/Meeting Bursary?

Нужно быть членом соответствующего сообщества и подать тезис на конференцию. Для подачи на Travel Grant обычно необходимо предоставить:

⁃ CV
⁃ список публикаций
⁃ мотивационное письмо
⁃ letter of recommendation, подписанное научным руководителем или официальную справку из отдела аспирантуры о том, что вы учитесь или закончили не более 3-5 лет назад.

Какие организации предоставляют Travel Grant?

EACR (European Association for Cancer Research)

AACR (American Association for Cancer Research)

ESH (European School of Haematology)

ASH (American Society of Hematology)

EHA (European Hematology Association)

ISSCR (International Society for Stem Cell Research)

ICIS (International Cytokine and Interferon Society)

EMBO (European Molecular Biology Organization)

The Company of Biologists

Помимо оплачиваемых поездок на конференции, некоторые организации на конкурсной основе предоставляют возможность получить грант на поездку к коллабораторам (обычно до 3х месяцев).

Кроме того, некоторые из них имеют программу поиска ментора, образовательные курсы, научные и научно-популярные журналы.

Если вы состоите в одной из этих организацией (или в любой другой) и получали от этого какой-то профит, поделитесь своим опытом в комментариях! Если нет, расскажите почему 👇

В следующий раз подробно расскажу о тех организациях, в которых состою сама и о плюшках, которые уже получила или собираюсь получить.

​​У MDPI появился новый журнал!


Journal of Molecular Pathology

Виртуальная конференция RNA at the Bench and Bedside II от Nature.

📆 11-13 Ноября 2020

⏰ Тезисы принимаются до 21 сентября 2020.

Секции: Advances in RNA Targeting Technologies, Targeted delivery of therapeutic oligonucleotides –opportunities & challenges, RNA Splicing and Isoforms.

В состав организационного комитета входит компания Ionis Pharmaseuticals, которые коммерциализировали первую антисмысловую терапию (введение коротких нуклеотидных последовательностех комплементарных к молекуле мРНК) SPINRAZA.

Вебинар Deciphering the immunogenomic landscape in melanoma: from basic science to translational science and back от EACR

📆 23 июля 2020

📝 Регистрация: бесплатно для членов EACR

👥 EACR Board member Yardena Samuels

Вот такой шаблон постера в формате Adobe Illustrator. Естественно, без данных.

​​Как сделать постер для конференции?

В первый раз едете на конференцию с постерным докладом и не знаете с чего начать? Поделюсь с вами своими принципами/советами.

1. Идея.

У вашего постера должна быть идея и история. Постер - это не просто набор схем и графиков. Это способ поделиться неоднозначными результатами и построить свою пробную научную теорию. Это, чаще всего, первая презентация Ваших результатов для широкой аудитории. Возможность получить похвалу и дельные комментарии, которые Вы сможете учесть при планировании дальнейших экспериментов для публикации. Постер должен отражать Ваше личное понимание и интерпретацию результатов.

2. Цветовая гамма.

Можно подсмотреть в картинках на Pinterest. Ищите подходящую цветовую гамму не только в научных постерах, но и в различных рекламных плакатах. Используйте цвета, подходящие для дальтоников.

3. Дизайн.

Постер - пространство для полёта фантазии. У Вас есть шанс привлечь больше зрителей, сделав необычный дизайн. Но не забывайте, что дизайн и расположение разделов на постере - должны соответствовать ходу повествования.

5. Лучшие заголовки = емкие выводы.

Поместив основной вывод вместо стандартного заголовка, Вы привлечете больше заинтересованных людей, а также сократите количество текста на постере. Многие постеры трудно понять, потому что они перегружены текстом и мелкими графиками, и не отражают основную идею автора. Краткость. Емкость. Последовательность.

6. Шрифт.

Шрифт без засечек легче читается.

7. Доклад.

Постер - это тоже доклад. Не забудьте придумать и отрепетировать Ваш рассказ для подходящих зрителей.

8. Правильный постер - новые коллабораторы.

Не забудьте указать Вашу рабочую почту, аккаунты в Instagram и Twitter. Поместите ссылку на сайт лаборатории и QR-код для скачивания вашей последней наиболее подходящей под тематику постера статьи. Можно также подготовить визитки с мини-версией постера на обороте.

——

Я хочу поделиться с каждым заинтересованным человеком своим макетом постера (в формате Adobe Illustrator). Чтобы получить макет, необходимо поделиться любой записью из моего канала с любым человеком (или чатом) и прислать мне скрин в личные сообщения @elmira_mi. В ответ на Ваше сообщение я пришлю макет! 🥳

3 совета начинающему ученому.

Читать много научный статей, выходящих в Nature, Science и Cell, а также в профильных журналах по вашей теме.

Много работать руками. Во-первых, чем больше вы работаете, тем больше вы получите результатов. Во-вторых, времени на работу отведено не так много. Через пару лет вы поймёте, что бумажная работа занимает 60% вашего времени. Если вы будете участвовать в нескольких проектах, то выучите больше методов, сделаете больше статей и будете реже сталкиваться с неудачами (в единицу времени). Со временем вы сможете «покинуть» неудачные или неподходящие для вас, выбрав свою траекторию движения.

Учить статистику. И делать достаточное количество повторов. Чтобы ваши результаты не остались навсегда “unpublished” в вашем лабораторном журнале.

Посмотрите на обложку последнего выпуска Cancer Cell 😍

Признаюсь, я смысл не разгадала. Думала, что это экзосмомы. А оказалось нет.

Пациент с мелкоклеточным раком легкого окружен цветными сферами, представляющими собой узлы в сигнальных сетях, построенных по результатам протеомного анализа. Среди этих узлов протеинкиназа A - PKA. Иллюстрация имеет название «Неизбежное исцеление» и относится к статье Coles et al.

Протеомный анализ позволил выявить мишени PKA, а также сигнальные каскады, контролируемые данным белком.

До сих пор функция PKA в злокачественных тканях не определена.

Неизвестно почему PKA является онкогеном в нейроэндокринных опухолях, и опухолевым антигеном в других тканях.

Активация PKA приводит к приобретению эпителиальных характеристик клетками мелкоклеточного рака легкого. Это состояние связано с повышенной онкогенностью клеток.

Интересно, что в клетках рака молочной железы активация PKA способствует мезенхимально- эпителиальному переходу, связанному со снижением онкогенности.

Следовательно, глобально функция PKA может заключаться в активации эпителиального перехода, который в одних типах злокачественных тканей приводит к прогрессии опухоли (нейроэндокринный тип), а в других к подавлению опухолевого роста.