Научная жизнь Эльмиры
1.14K subscribers
340 photos
24 videos
9 files
660 links
Привет. Меня зовут Эльмира. Я кандидат биологических наук.
Предупреждаю, между «ещё немного поработать» и написать полезный пост о науке, я выберу работу.
Download Telegram
Делать разборы научных статей? Если да, то в каком формате?
Anonymous Poll
42%
Текст
8%
Аудио
43%
Аудио + текст
7%
Другой вариант
Очень много раз меня спрашивали про заработок учёного, и очень много раз я не отвечала на этот вопрос, так как информации слишком много. Готова рассказать сегодня. Интересна ли вам эта тема?
Список тем на ближайшее время:

1) Заработок ученого. Есть ли он?
2) Откуда берутся научные задачи: можно ли их придумать самому?
3) Стажировки как способ полюбить науку: удачный и неудачный опыт.
4) Зачем учиться в МФТИ, чтобы стать биологом?

Хотите предложить тему поста или задать вопрос? Пишите в комментариях к посту или в личные сообщения @elmira_mi
Непопулярная наука

О чем обычно рассказывают научпоп-ресурсы? О медицине, социальных и психологических закономерностях, о всяких интересностях из мира животных и, конечно же, о космосе.

При этом многие горячие темы, регулярно попадающие в Nature и Science, остаются менее заметны для широких масс.

Не хочу показаться обделенным, но таковой мне кажется моя область исследований. Благо у меня есть блог, где я могу о ней рассказать=)

Я изучаю, как устроены мембранные белки в живых клетках. Пока звучит максимально скучно, но скоро будет интересно.

Немного скучного бэкграунда:

Наши с вами клетки окружены мембраной. Она не проницаема для большинства веществ. В мембране есть специальные девайсы — мембранные белки — которые регулируют обмен этих самых веществ с окружающей средой.

В популярной науке часто рассказывают, за что отвечают эти белки: запускают сердцебиение, пропускают нервный импульс, активируют все наши чувства от зрения и вкуса до жажды и сонливости. На картинках их упрощенно отмечают всякими палочками и ромбиками. Но сама структура и механизм работы этих белков тоже невероятно интересны.

Интересное начинается здесь:

Эти белки используют разные крутые механизмы, чтобы протащить вещества сквозь мембрану.

Например в наших нейронах есть мембранные белки, которые представляют из себя миниатюрную кабину лифта (синяя штука на фото, тык). У этого лифта есть две открывающиеся двери. В кабине есть несколько стульев, на которых как пассажиры рассаживаются молекулы. Каждая молекула может сесть только на стул соответствующей формы. Когда все пассажиры сели, двери закрываются, и кабина лифта спускается по лифтовой шахте сквозь мембрану. Спустившись “на этаж ниже” двери открываются, “пассажиры” выходят.

На этом магия не заканчивается. В кабине автоматически выставляется другой набор стульев, и другие молекулы садятся в кабину. Двери опять закрываются, кабина едет вверх. Цикл полностью автоматизирован — нет никакого лифтера, который это контролирует.

Чтобы вы представляли размеры, эти молекулярные лифты меньше обычных лифтов во столько же раз, во сколько обычные лифты меньше Солнца. Как и обычный лифт, их молекулярные аналоги могут ломаться. Только вот такие поломки наблюдаются в серьезных патологиях: шизофрения, нейродегенеративные заболевания (Альцгеймер, Хантингтон), наркотические зависимости и тп.

На этом чудеса мембранных белков не заканчиваются.

Возьмем чувство холода. Его запускают белки, которые напоминают дверь со специальным “электромагнитым сенсором”, реагирующим на холод (клац)). Как и многие двери, их можно взломать отмычкой подходящей формы. Хорошо подходит молекула ментола. Поэтому от жвачки с ментолом во рту холодно, хотя сама жвачка не холодная.

Это лишь два примера из кучи вычурных механизмов разных мембранных белков.

Все эти приблуды интересны для двух целей:

1. Многие болезни связаны с неправильной работой мембранных белков. Поняв, как они работают, можно придумывать лечение.
2. Биомиметика: мембранные белки — это наикрутейшие нанодевайсы. Зачем изобретать велосипед, если он уже есть в природе?

Вот такие интересные штуки я изучаю на работе.

ЗЫ.
Давно обещал рассказать про фотку черной дыры, но так и не смог написать об этом лаконично. Вот лучшее объяснение, которое я видел: оригинал - англ, перевод - рус.

Вопрос:
Раньше я пробовал писать посты про популярную науку (тык1,тык2), но потом увлекся рефлексированием.
Хотите вернуть посты с краткими обзорами интересных научных тем?

Всем добра,
Тг

#научпоп
Заработок учёного. Есть ли он?

Меня много раз спрашивали про то, какие отрасли в биологии сейчас наиболее выгодные, сколько денег можно заработать в лаборатории. Очень не люблю эти вопросы, но пришло время обозначить своё мнение, надеюсь, оно окажется для кого-то полезным.

Во-первых, хочу сказать, что в академической науке вами должны двигать увлечение и интерес, а не стремление заработать. Если вы хотите нормальную зарплату и стабильность, идите лучше сразу в фарму, например. Но это не значит, что учёные работают на общественных началах. Говорить буду за российскую науку, о зарубежной мне известно меньше.

Во-вторых, считаю зарплатообразование в российской науке совершенно нормальным. Почему? Потому что, как правило, до того как студент начинает приносить первую пользу (хотя бы результаты, а лучше гранты и публикации) проходит от полугода до года, а реагентов бывает потрачено на кругленькую сумму. Да, студентам нужно на что-то кушать и как-то ездить в лабораторию, да, для кого-то это причины для обид и разочарования в науке. Как по мне, за порог лаборатории нужно ступать с осознанием того, что быть студентом в лаборатории - это работать на своё будущее, получать навыки, необходимые для построения карьеры в науке. Практически всем приходится искать сторонние способы заработка в первые годы научной жизни.

С момента прихода в первую лабораторию (3 курс) я работала: занималась репетиторством, работала в приёмной комиссии и организовывала олимпиады. Платить мне начали через год - символические N тысяч рублей и меня это безумно радовало, как студента 4 курса. Потом я сменила лабораторию и вернулась на изначальную позицию с отсутствием зарплаты и необходимостью подрабатывать. Работала удалено в медицинской компании, иногда читала лекции за деньги на разных мероприятиях, получала повышенную стипендию. Научной работы было гораздо больше, чем в первой лаборатории, но вместе с тем и возможностей для развития, поэтому я проводила в лаборатории по 8-9 часов в день и бросила удаленную работу. На тот момент как раз прошёл год в лаборатории, и мне начали платить символические N/2 рублей, что не могло меня не расстраивать. Позже появилась возможность заниматься закупками (прим. работа лаб. менеджера) и получать за это некоторую стабильную зарплату. Вариант был приемлемым, но по счастливой случайности я начала преподавать в кружке при МФТИ (об этом подробно писать не буду), занималась этим довольно долго и продуктивно. Потом появились собственные гранты, надбавки за публикации, и жизнь стала немного проще.

В целом, з/п взрослого ученого (младшего или старшего научного сотрудника), складывается из ставки, надбавки из грантов, стипендии (для аспирантов) и выплат за публикации в высокорейтинговых журналах. Чаще всего коэффициентом является размер вашего личного вклада в научные проекты и деятельность лаборатории, в целом. Нужно добывать гранты, писать научные статьи, и не забывать, что наука - это не про деньги.

Поделитесь своим опытом или мыслями на этот счёт в комментариях.
О финансировании науки в России.
Forwarded from НОП.РФ
Мегагранты – издание восьмое

Минобрнауки объявило о начале сбора заявок на участие в восьмом конкурсе на получение мегагрантов, результаты которого будут подведены в конце 2020 года. В рамках конкурса планируется поддержать 35-40 проектов на создание лабораторий мирового уровня, с финансированием в размере до 90 млн. рублей для каждой.

Мы попросили комментарий у Ирины Коротковой, генерального директора компании «Инконсалт К» – оператора программы мегагрантов:

«Каждый этап программы мегагрантов вбирает в себя лучшие практики и самые эффективные методики отбора тем исследований и ведущих ученых, под руководством которых открываются лаборатории и ведутся научные изыскания. Это обусловлено, с одной стороны, требованиями времени, когда глобальные вызовы перешли из теоретической плоскости в сферу ежедневной повестки, а с другой стороны – растущей популярностью программы мегагрантов среди мировых ученых.

Конкурс среди ученых по предыдущему, седьмому конкурсу, составил более 10 человек на одно место. Восьмым конкурсом программы требования к соискателям значительно повышены. Например, значения наукометрических показателей ведущего ученого для участия в конкурсе были переведены из формата рекомендованных в формат обязательных.

Этот пункт условий конкурса, как и некоторые и другие, помогут еще более эффективно отобрать самых достойных исследователей мирового уровня для получения мегагрантов».

Отметим, что программа мегагрантов в свое время стала прорывом – как по объемам финансирования, так и по содержанию. Именно мегагранты сформировали многие «лучшие практики», на которые опираются масштабные гранты РНФ и РФФИ, а также мероприятия нацпроекта «Наука». Например, уровень и качество экспертизы – с обязательным привлечением иностранных ученых мирового класса.

Благодаря своей передовой механике и реализации, а также ощутимой результативности – как в количественном, так и в качественном плане, программа мегагрантов органично интегрировалась в нацпроект «Наука».

Также она является действенным инструментом научной дипломатии – на международной арене Россия подтверждает не только свои амбиции на одну из лидерских позиций в мировой науке, но и способность оперативно наращивать компетенции для этого.

Иностранные ученые и соотечественники, принимающие участие в мегагрантовых лабораториях, а также формирующиеся коллаборации и научные сети – демонстрируют нацеленность России на конструктивное сотрудничество, а интерес к программе лишний раз свидетельствует – никакие политические обстоятельства не могут остановить стремление исследователей к партнерству для новых открытий и свершений.

https://t.me/minobrnaukiofficial/302
​​Raymon L. Erikson

Реймонд Эриксон - биолог/вирусолог, который открыл белок SRC (c-Src - протоонкоген). SRC на данный момент является мишенью нескольких противоопухолевых препаратов. В этот список входит дазатиниб, который одобрен для лечения хронического миелоидного лейкоза и одного из подтипов острого лимфобластного лейкоза.

Изображение из статьи:
Inhibition of Src Family Kinases and Receptor Tyrosine Kinases by Dasatinib: Possible Combinations in Solid Tumors
Мудрость дня:

Не плачьте во время написания диплома: по-настоящему плакать вы будете, читая первый диплом своего студента.
Нарисую картинку и расскажу, почему 123 мое любимое число. Может кто догадается?
​​​​123 подписчика, а 123 это мое любимое число!

Потому что изучаю я CD123, он же IL3Ra.

Это рецептор цитокинов, который находится на поверхности большинства клеток острого миелоидного лейкоза. Острые миелоидные лейкозы плохо поддаются лечению.

Уровень CD123 повышен в лейкозных стволовых клетках (ЛСК), которые считаются основными игроками при возникновении терапевтической устойчивости и рецидивов.

CD123 очень любят те, кто занимается CAR T клетками (это такие химерные/модифицированные иммунные клетки, прицельно атакующие злокачественные клетки), так как можно атаковать ЛСК, при этом не трогая нормальные клетки крови.

И те, кто занимается разработкой терапевтических антител: для блокировки CD123 разработан ряд антител как моноклональных, так и биспецифических (DART).

Для меня интерес представляет молекулярный механизм, определяющий повышение CD123 на поверхности клеток лейкоза. Что запускает это повышение? Можно ли его предотвратить на ранней стадии?

https://www.nature.com/articles/s41375-018-0075-3
​​Вот и наступил тот момент, когда можно попросить друга сделать рецензию на диплом своего студента.

Завтра защищает диплом мой второй студент-бакалавр. Совсем недавно я была по другую сторону баррикад: волновалась перед отчётами, искала поддержки старших коллег, писала в первый раз диплом.

Отчёты никуда не делись - все же я учусь в аспирантуре. Только теперь отчёты - это повод для того, чтобы рассказать сотрудникам института о своём любимом проекте и результатах, которые тебя радуют.

Написание первого в жизни диплома было 4 года назад. После этого случилось написание первого тезиса на конференцию, первой заявки на грант, первого отчета по гранту и первой научной статьи. Впрочем, осталось впервые в жизни написать диссертацию 🧐.

Пишете сейчас диплом и не уверены в своём будущем? Не волнуйтесь, вы точно чему-то научились, даже если вам, вдруг, кажется, что все было напрасно.

Не могу оценить, с какой стороны мне нравится больше. Просто всему свое время и место.
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Скоро будет пост про клетки, а пока посмотрите видео.
​​На чем ставят опыты молекулярные биологи? Часть 1: клетки.

Представьте, что вы хотели сделать каменную дорожку. У вас есть два варианта:

1) поехать за город, набрать много-много камней и создавать дорожку, подбирая подходящие камушки. Скорее всего они все будут разного размера, цвета и фактуры - ваша дорожка несомненно получится необычной и красивой, методом проб и ошибок. Кроме того, вы можете годами ездить по разным местам в поисках того самого недостающего камня, идеально подходящего для вашей дорожки.

2) купить необходимое количество белых, круглых камней в специализированном магазине. Или розовых, угловатых. Или серых. Вы можете сделать много разных, идеальных дорожек, просто съездив в магазин!

Точно так же и в клеточной биологии. Когда вы начинаете новый проект, вы можете использовать первичные клетки от пациентов или же начать с перевиваемых=бессмертных клеток.

С начала 20-го века ученые стали работать с бессмертными клеточными культурами, с их помощью была изучена бОльшая часть биологических процессов. Бессмертные клеточные линии стали мощным инструментом для тестирования лекарств, изучения функций генов, а также производства вакцин, антител.

В основном, стабильные клеточные линии это продукт единичной клетки, поэтому конкретная культура клеток обладает известными и однообразными характеристиками при малом количестве пассажей. (Конечно, со временем культура становится все более гетерогенной и клетки приобретают новые характеристики).

Бессмертные клетки легко растут в чашках Петри, флаконах и планшетах, их можно замораживать и размораживать, наращивать в нужном количестве, и даже прививать мышам.

Первичные клетки человека выделяют непосредственно перед работой из тканей, поэтому они сохраняют морфологические и функциональные характеристики.

Первичные клетки не живут вечно. Для них характерна активация процесса старения, они имеют ограниченный потенциал для деления и дифференцировки in vitro.

Первичные клетки могут быть получены из здоровых или злокачественных тканей. Источниками являются здоровые доноры, донорские органы, ткани плода или посмертных доноров. Планируя свои эксперименты, имейте в виду, что источник первичных клеток человека ограничен. Это означает, что вы, скорее всего, не сможете получить дополнительный материал от того же донора. Зачастую набор образцов, достаточных для статистического анализа, длится годами.

На самом деле, нужно уметь комбинировать эксперименты, сделанные на иммортализованных и на первичных клетках, приправляя это мышиными моделями и статистикой по пациентам.
​​Для чего нужны иммортализованные клетки?
10 способов полюбить науку: зарубежные стажировки.

Возьмём абстрактного студента 1-2 курса естественно-научной специальности, который со школы мечтает стать ученым, имея романтизированное представление о науке, построенное на биографиях нобелевских лауреатов и их изобретений. Если только этому студенту не повезло большем чем остальным, он скорее всего никогда не был в лаборатории, не читал научных статей и с учеными дела не имел - одним словом студент не знает о работе исследователя ничего.

Вот и я когда-то мечтала стать учёным. Тем самым, который в белом халате держит в одной руке колбу с лекарством от рака, а в другой - вечный двигатель. В общем, хотела я стать довольно абстрактным ученым. Ни биологом, ни химиком, ни физиком. Просто очень успешным ученым.

А все потому что до конца 2 курса я и понятия не имела, что такое деятельность настоящего исследователя, что кроется за дверьми лабораторий и как делаются эти самые открытия из книжек. Я мечтала вырасти, попасть в ту самую лабораторию, научиться всему на свете и изобретать (не исследовать!), абстрактные, конечно, вещи. Потом я поступила в МФТИ и перестала, о чем-либо мечтать вообще. Учиться было тяжело, математика и физика пытались меня уничтожить, а биологии практически не было, а та что была вызывала отвращение.

Но в конце 2 курса случился поворотный момент. Папа, как человек, который вселял в себя (не в меня) веру в мое научное будущее, решил взять ситуацию под свой контроль и найти мне стажировку на лето. Несколько его сокурсников, закончив химфак СПБГУ, пошли в большую науку и помогли советом по выбору места. Я с неохотой собирала документы (мотивационное письмо и CV), так как была убеждена в своей тупости и не способности пройти отбор. Вот здесь я оговорюсь о необходимости найти себе ментора, который будет вселять в вас уверенность на протяжении вашего тернистого пути к профессорству!

Возвращаясь к стажировке, через пару недель переписки по электронной почте я уже держала в руках распечатанные статьи про болезнь Крона и ревматоидный артрит, в которых по лучшим традициям я не могла понять даже абстракт. В распечатанных статьях я снабжала почти каждое слово пояснениями из Википедии (первые 20 научных статей я читала именно так), хотела все бросить, параллельно работала в приёмной комиссии.

В Германии меня встретила PhD студентка и отвезла в лабораторию, где меня ждал заведующий Prof. Peter Schierack. Лаборатория была огромная и современная и произвела на меня, как на человека никогда не видевшего центрифуги и ламинары, незабываемое первое впечатление. За месяц меня научили выделять плазмиды, пересевать клетки, красить антителами. Училась я медленно, косячила и мало чего понимала.

Но главное чему меня научили это любить науку. На выходные профессор Schierack повез меня и приглашённого учёного из Беларуси в Саксонскую Швейцарию. Мы остановились выпить кофе в маленьком городке на границе Германии с Польшей:

«В выходные нужно полностью отключаться от работы!»- громко заявил он!

«Кстати, что там с теми образцами крови?» - сказал он через секунду, поворачиваясь к ученому из Беларуси.

В том самый момент, я поняла, кто такие учёные, чем они занимаются и что такое любимая работа. Я поняла, что хочу остаться в лаборатории навсегда.

Вернувшись в Москву, я выбрала свою первую лабораторию и начала строить свою научную карьеру. После окончания 4 курса я подавала на стажировку в DKFZ, но, к сожалению, прошла только первый этап отбора, а на втором этапе у меня не случилось match с выбранными супервайзерами, но все же опыт подачи был для меня полезен. Как минимум, я потренировалась писать мотивационные письма.

Пару лет назад поехать стажировку для студента МФТИ стало довольно рутинной задачей, поэтому хочу сказать, что шанс есть у каждого. Просто попробуйте!
Вот фото со стажировки. Тогда я стеснялась фотографировать в лаборатории.
#какбытьученым

Виртуальная конференция NEUROGENETICS от Nature.

Дедлайн подачи тезисов: 15 Июля, 2020 (6:00 p.m. EST)

Scientific Sessions
Session I: Cell-type diversity: between/within cell types, between species
Session II: Population Genetics
Session III: Functional validation: screens, models, organisms, stem cells
Session IV: Analytical tools and technology
GIBCO - компания, которая производит лучшие культуральные среды (по моему мнению) и ведёт классный аккаунт в Инстраграм, организует онлайн мероприятие 5 DAYS OF STEM CELLS.

Можно подать заявку на участие, если вы занимаетесь стволовыми клетками.