«Пора писать свежие посты» - подумала я, отодвинула от себя ноутбук, на котором надо срочно до вечера сделать перевод статьи для журнала, и вот я уже здесь, набираю текст.

Краткая справка: Научную работу, как вы знаете, я выполняю в Институте Молекулярной Биологии РАН. А вот учусь я сейчас на 3 курсе аспирантуры Московского Физико-Технического Института, факультет биологической и медицинской физики. А это означает, что в этом году мне нужно сдать кандидатский минимум по специальности (Молекулярная Биология) и активно двигаться к защите диссертации.

Дополнительно на кафедре у нас есть ежегодная отчётность в виде презентации научных результатов сотрудникам кафедры, которая пройдёт в январе. Особенно забавно, что сейчас я участвую в заседаниях и в качестве сотрудника, и в качестве аспиранта.

Педагогическую практику я успешно закрыла ещё 2 года назад, так как официально стала руководителям двух студентов-бакалавров.

План-минимум по публикациям я тоже уже давно выполнила. Но во благо дальнейшей карьеры в академии надо написать ещё парочку приличных статей.

Но какая же учеба без сюрпризов! На почту только что пришло уведомление о некой аттестации аспирантов, которая пройдёт в январе. Ничего ранее о ней я не слышала и не читала. В общем, январь для меня станет месяцем презентации научной работы, что в общем-то не в тягость, а в радость.

А пока скажите, интересно ли вам будет почитать об аспирантуре в России? Я об этом никогда не писала, но если интересно поделюсь своим опытом.

Поздравляю всех с наступающим!

Желаю повышения Хирша, побольше экспериментов, приносящих удовольствие, поменьше сломанных приборов и недостающих реагентов, хороших статей (написанных и прочитанных) и любви! ❤️

А ещё грантов, стипендий, конференций и коллабораций! Теперь все ❤️

Долго откладывала подачу тезиса на ExpBio2021, и вот в последний день я все таки решилась на написание.

Оказалось, что все не так просто. Для подачи необходимо либо состоять в одном из сообществ (AAA, APS, ASBMB, ASIP, ASPET), либо указать спонсора, который состоит в одной из перечисленных организаций. Не так давно я участвовала в конференции PISA2020 от ASIP, но платить за членство не стала и подала заявку как non-member. В общем-то это было ошибкой молодости. Спонсора в моем окружении не нашлось (я и не искала, так как знала, что его нет), и я решила выбрать организацию для вступления.

Взгляд пал на ASBMB - American Society for Biochemistry and Molecular Biology.

Оказалось, что вступить можно за 10 минут, просто заплатив 25 долларов. Это круто!

Кроме того, меня приятно удивило родство Journal of Biological Chemistry и ASBMB.

Плюс ко всему у них есть курс о научной коммуникации - надо будет почитать подробнее.

В общем, я обожаю все эти организации и их бенефиты. Это, кстати, мое 4 членство!

Ах да, забыла сказать о самом важном, только будучи членом AAA, APS, ASBMB, ASIP или ASPET, можно претендовать на стипендию ExpBio.

Я тут сейчас потратила 30 минут, чтобы найти статистику по злокачественным заболеваниям по странам. Помню, когда писала магистерский диплом тоже искала и не нашла данных (именно количество случаев, не смертей).

Так что делюсь с вами, вдруг кому-то пригодится:

https://gco.iarc.fr/today/fact-sheets-populations

Завтра последний день подачи на конференцию EXPERIMENTAL BIOLOGY, которая пройдёт онлайн в апреле.

Очень правильная стратегия. Советую всем институтам, как академическим, так и исследовательским, перенять идею!

Всем привет! Научный клуб ФББ по-прежнему очень ждет ваших историй о ваших исследованиях, как уже оформленных в виде публикации, так и просто исследовательских проектах. Если вы - выпускник ФББ, то вы можете рассказать о своем студенческом исследовательском проекте. Ваши истории будут опубликованы на страницах Научного клуба в соцсетях и, несомненно, вдохновят других! Для желающих мы можем даже организовать небольшой научно-популярный пресс-релиз о вашем исследовании. Чтобы поделиться своей историей, заполняйте форму: https://forms.gle/8XknjzFCB5kKRxLD8. Очень ждем ваших ответов!

Надо бы придумать какую-то крутую активность, чтобы отметить 500 участников 🥳

Advances in Neuroblastoma Research Webinars

Когда: 25-26-27 Января 2021

https://www.anr2021.org/

Намечается интересный пост про рецензирование статей!

У меня сейчас на рецензии статья из журнала BMC, и она очень странная.

Хочу с вами поделиться своими мыслями и ошибками, на которые я указываю авторам в рецензии, не называя имён, названий генов и прочего.


Надеюсь, будет полезно.

P.S. Это моя 8 статья в качестве ревьюера 😈

Прямо сейчас :)

‼️ Друзья, напоминаю, что уже сегодня в 17:00 состоится лекция Алексея Паевского @damantych , посвященная нейроглии! Присоединяйтесь к трансляции на Youtube: https://fbb.lv/sciclubyt или, если хотите задать свои вопросы лектору голосом, к виртуальной аудитории https://fbb.lv/sciclub. Регистрация не нужна, просто введите свое имя и фамилию и выберите режим с микрофоном. Ждём вас!

Наконец-то выполняю обещание - буду рассказывать про рецензирование статей (взгляд рецензента), а точнее про последнюю статью.

*статьи в приличных журналах проходят несколько этапов: техническая проверка -> рассмотрение главного редактора -> рецензия от 2-3 человек -> ответы рецензентам -> публикация

Первая статья на рецензию пришла мне 2 года назад из журнала PLOS ONE. Я очень въедливо изучала статью 2 недели (ровно 14 дней отводилось на подготовку ответа), нашла много неточностей, предложила эксперимент, в общем, major revision. Авторы успешно справились, а я было дико довольна тем, что предложенный мной эксперимент показал крутые результаты. В общем, мне понравилось!

Несколько дней назад я отправила рецензию на 8 статью (в качестве рецензента).

Это не первая странная статья, в которой почти полностью отсутствует последовательность действий, но она смогла меня удивить.

Заявленная тема исследования показалось мне очень интересной и соответствовала моей области исследований. Абстракт был многообещающим.

Но в ходе внимательного изучения я обнаружила много проблем в дизайне исследования.

Я напишу здесь часть своих замечаний и объясню, не называя авторов, генов, клеток и препаратов.

Надеюсь, мои заметки сделают кого-то из читающих этот пост более внимательным и вдумчивым исследователем.

Авторы предоставили экспериментальные данные для двух групп клеток -> ГРУППА I - экспрессируют ген X (белок X); Группа II - нет экспрессии гена X.

❗️Различные размеры выборки:
ГРУППА I - три клеточные линии
ГРУППА II - одна клеточная линия

✅ решение: дополнить ГРУППУ II еще двумя клеточными линиями или получить модельную клеточную линию путем нокаута или сверхэкспрессии гена X.

❗️Разный экспериментальный дизайн:
На ГРУППУ I воздействовали siRNA
На ГРУППУ II ингибитором
И сравнивали эффекты.

✅ Решение: используйте siRNA и ингибитор для обеих групп.

❗️Два ингибитора S и D:
Изменения экспрессии генов и фосфорилирования белков измеряли после обработки ингибитором S;
Токсичность оценивали только для D.
Да, Sи D нацелены на один белок, но они могут иметь разную эффективность и оффтаргеты.

✅Решение: выберите один ингибитор или предоставьте данные для обоих

❗️Выводы на основе одной клеточной линии:
В конце авторы проверяют токсичность ингибиторов двух разных ингибиторов, нацеленных на разные белки, на одной клеточной линии. Первый ингибитор оказывается эффективнее, на основании чего они делают вывод, что белок, являющийся его мишенью, для раковых клеток важнее.

✅Решение: предоставить данные для панели клеточных линий с разными характеристиками (хотя бы для 5).

Несмотря на кучу замечаний, я считаю, что статью можно улучшить с помощью дополнительных экспериментов, поэтому мое решение было MAJOR REVISION.

Мне нравится быть рецензентом, поскольку это делает меня более критичной к моим собственным исследованиям.

Надеюсь, было полезно или интересно.

Скоро и мне придёт такой комплект (@ortholike).

А если по теме канала, то сегодня будет большой список предстоящих конференций!

​​Конференции 2021!

Как вы понимаете конференции и конгрессы опять пройдут в онлайн формате.

Конкретно я оставляла отзывы о проведении для каждого мероприятия, что посетила в прошлом году. Основными проблемами почти для всех конференций были:

📎 слишком большое количество параллельных секций (как на настоящих конференциях), в которых очень сложно ориентироваться на сайте

📎 плохая постерная секция - загруженные на сайт постеры в формате PDF, не разделенные на секции, без дополнительных комментариев (отличная постерная сессия была на PISA 2020!)

📎 отсутствие круглых столов, онлайн-баров, переговорных

Надеюсь, что организации исправят ошибки 2020го года и отшлифуют формат.

А теперь перейдем к списку конференций:

📌 EACR 2021 Virtual Congress - Innovative Cancer Science: Better Outcomes Through Research

eacr2021.org

Дедлайн подачи тезисов: 08 марта 2021
Дата проведения: 09-12 июня 2021
Крупная конференция по онкологии для ученых, врачей и тех, кто на стыке. Для участия выгодно сначала вступить в сообщество EACR - будет дешевле, а также можно будет претендовать на стипендию.

📌 Bioinformatics in Cancer

eacr.org/conference/bioinformatics2021virtual

Дедлайн подачи тезисов: 25 марта 2021
Дата проведения: 18-19 июня 2021
Участвовала в прошлом году и планирую участвовать в этом. Для членов EACR доступны стипендии.

📌 EHA2021 Virtual Congress

ehaweb.org/congress/eha-congress-2021

Дедлайн подачи тезисов: 30 апреля 2021
Дата проведения: 9-17 июня 2021
Одна из самых крупных конференций по гематологии. Была чудесно организована в 2020 году в формате онлайн. Зачитывались почти все вопрос из формы для комментариев, видеозаписи выступлений были доступны до сентября, если не ошибаюсь.
В прошлом году подавала на стипендию, сначала отказали, но в последний момент расширили количество стипендиатов и одобрили - участвовала в итоге бесплатно.

📌 2021 ASBMB Annual Meeting

asbmb.org/meetings-events/2021-annual-meeting

Дедлайн подачи тезисов: 4 февраля 2021
Дата проведения: 27-30 апреля 2021
Интересная конференция, буду участвовать впервые. Несколько организаций объединились и получилась конференция Experimental Biology (experimentalbiology.org). Очень много разных тем по молекулярной и клеточной биологии. Подача на стипендию уже недоступна.


—
@sciencylife
Если будете регистрироваться на конференции EACR, пишите мне - я амбассадор этого сообщества (мой номер: EACR26153).

А вот список постов, опубликованных на моем канале, которые помогут вам подготовиться к участию в конференции:

https://t.me/sciencylife/177 - онлайн платформа для постеров;

https://t.me/sciencylife/140 - о плюсах и минусах онлайн-конференций;

https://t.me/sciencylife/102 - как сделать хороший постер;

https://t.me/sciencylife/94 - как получить стипендию/Travel Grant и посетить конференцию бесплатно
__
@sciencylife
Если будете регистрироваться на конференции EACR, пишите мне - я амбассадор этого сообщества (мой номер: EACR26153).

Давно здесь не было #биообои

Wow! Не знала этого. Дженет Роули открыла первую транслокацию в клетках лейкоза. Позже открыли транслокацию BCR-ABL в клетках хронического миелоидного лейкоза, которая стала успешной мишенью для препарата иматиниб (Gleevec). Ещё она ездила на работу на велосипеде чуть ли не до 90 лет!

Вообще она мой самый любимый учёный, и несколько лет назад у меня была коллаборация из иллюстратором из Инстаграмм - она рисует вдохновляющих женщин-учёных, и я выбрала ее. Внизу будет ссылка на тот пост, как только я ее найду.

А в комментариях можно посмотреть на Дженет.