Как биоинформатики видят мокрых биологов
https://twitter.com/odedrechavi/status/1326968969052434444?s=21
https://twitter.com/odedrechavi/status/1326968969052434444?s=21
Twitter
Oded Rechavi 🦉
How bioinformaticians imagine wet lab biologists live https://t.co/0wtCkmxfZX
Мой знакомый ищет биологов/генетиков/биотехнологов/учёных, которые связаны с производством протеина/казеина и используют при этом генную инженерию, чтобы задать несколько вопросов. Компания проводит исследование в сфере Биотехнологий (non-dairy foods) с фокусом в России и СНГ.
Напишите мне в личные сообщения @elmira_mi, если вы этим занимаетесь и готовы уделить немного времени или знаете людей, которые работают в этой области.
Оригинал сообщения:
#экспертиза
Исследования в сфере производства протеина/казеина с помощью технологий генной инженерии (из неживотных источников, с помощью биоинженерной микрофлоры - дрожжи-бактерии с модифицированным ДНК).
Напишите мне в личные сообщения @elmira_mi, если вы этим занимаетесь и готовы уделить немного времени или знаете людей, которые работают в этой области.
Оригинал сообщения:
#экспертиза
Исследования в сфере производства протеина/казеина с помощью технологий генной инженерии (из неживотных источников, с помощью биоинженерной микрофлоры - дрожжи-бактерии с модифицированным ДНК).
Forwarded from Гранты/Стипендии
Летняя школа для студентов в Австрии
Принимаются заявки на участие в Венской летней школе Biocenter 2020 в Австрии, Европа.
Венская летняя школа биоцентра предоставляет уникальную возможность для 30 студентов бакалавриата поработать бок о бок с ведущими исследователями в динамичной научной среде.
Дедлайн: 31 января 2021
Каждый студент получит стипендию в размере 1400 евро за девятинедельную программу.
Необходимо закончить не менее 2-х лет обучения в университете (например, 2/3 года обучения в бакалавриате или не менее 1 года обучения в магистратуре – к 30 июня).
Подробнее: https://www.training.vbc.ac.at/summer-school/how-to-apply/
Принимаются заявки на участие в Венской летней школе Biocenter 2020 в Австрии, Европа.
Венская летняя школа биоцентра предоставляет уникальную возможность для 30 студентов бакалавриата поработать бок о бок с ведущими исследователями в динамичной научной среде.
Дедлайн: 31 января 2021
Каждый студент получит стипендию в размере 1400 евро за девятинедельную программу.
Необходимо закончить не менее 2-х лет обучения в университете (например, 2/3 года обучения в бакалавриате или не менее 1 года обучения в магистратуре – к 30 июня).
Подробнее: https://www.training.vbc.ac.at/summer-school/how-to-apply/
Forwarded from Elizaveta Minina
#объявления
МФТИ проводит международную школу-вебинар "Molecular mechanisms of neurodegenerative diseases", которая пройдет 26 ноября онлайн. Участие бесплатное, необходима регистрация. Количество мест ограничено!
https://cmm-mipt.ru/2020-molecular-mechanisms-of-neurodegenerative-diseases.html
МФТИ проводит международную школу-вебинар "Molecular mechanisms of neurodegenerative diseases", которая пройдет 26 ноября онлайн. Участие бесплатное, необходима регистрация. Количество мест ограничено!
https://cmm-mipt.ru/2020-molecular-mechanisms-of-neurodegenerative-diseases.html
cmm-mipt.ru
Molecular mechanisms of neurodegenerative diseases - The Research Center of Molecular Mechanisms of Aging and Age-Related Diseases
Повеселилась вчера со стёклами.
Правда не все пережили битву со мной: в одной руке пинцет, в другой пипетка с PBS - Бах! одно стекло потеряно.
А вместе со стеклом и клетки, которые на нем сидели.
В общем, подготовка проб для конфокального микроскопа - дело не для слабонервных.
За три дня до опыта клетки нейроблатсомы должны быть посеяны на покровное стекло.
За сутки до съёмки на конфокальном микроскопе клетки фиксируют в растворе формальдегида (для остановки клеточного цикла и любых изменений внутри клетки).
Мембраны дырявят с помощью Triton X-100, чтобы открыть доступ для антител.
Миллион раз все промывают раствором PBS.
Оставляют с антителами в холодильнике для ночной инкубации.
Перед микроскопией добавляем DAPI для окрашивания ядер, заклеиваем стекло лаком для ногтей и наслаждаемся процессом!
Правда не все пережили битву со мной: в одной руке пинцет, в другой пипетка с PBS - Бах! одно стекло потеряно.
А вместе со стеклом и клетки, которые на нем сидели.
В общем, подготовка проб для конфокального микроскопа - дело не для слабонервных.
За три дня до опыта клетки нейроблатсомы должны быть посеяны на покровное стекло.
За сутки до съёмки на конфокальном микроскопе клетки фиксируют в растворе формальдегида (для остановки клеточного цикла и любых изменений внутри клетки).
Мембраны дырявят с помощью Triton X-100, чтобы открыть доступ для антител.
Миллион раз все промывают раствором PBS.
Оставляют с антителами в холодильнике для ночной инкубации.
Перед микроскопией добавляем DAPI для окрашивания ядер, заклеиваем стекло лаком для ногтей и наслаждаемся процессом!
Forwarded from Биомолекула
#Биомолекула_рекомендация
SCAMT открывает подачу заявок на 6-ую научную школу SCAMT Workshop Week, которая пройдет 1-6 февраля 2021!
SCAMT Workshop Week — это уникальный междисциплинарный Хим/Био/IT воркшоп: за 1 неделю у участников будет возможность сделать научный проект в одной из самых современных областей нанотехнологий и освоить новые практические навыки.
Язык проведения зимней школы - русский! Заявка на участие тоже подается на русском языке.
Для студентов, прошедших отбор, участие в SWW бесплатное, иногородним предоставляется проживание. Дополнительный бонус для участников — возможность поступить в магистратуру без вступительных испытаний.
Подать заявку можно до 29 ноября 2020г (23:59 по московскому времени)
https://scamt.ifmo.ru/ru/sww/
SCAMT открывает подачу заявок на 6-ую научную школу SCAMT Workshop Week, которая пройдет 1-6 февраля 2021!
SCAMT Workshop Week — это уникальный междисциплинарный Хим/Био/IT воркшоп: за 1 неделю у участников будет возможность сделать научный проект в одной из самых современных областей нанотехнологий и освоить новые практические навыки.
Язык проведения зимней школы - русский! Заявка на участие тоже подается на русском языке.
Для студентов, прошедших отбор, участие в SWW бесплатное, иногородним предоставляется проживание. Дополнительный бонус для участников — возможность поступить в магистратуру без вступительных испытаний.
Подать заявку можно до 29 ноября 2020г (23:59 по московскому времени)
https://scamt.ifmo.ru/ru/sww/
Обнаружила, что в предпоследней версии статьи ссылки на статьи, добавленные с помощью Mendeley слетели 😢
Варианта 2:
- добавлять ссылки заново
- переписывать текст статьи и переносить изменения из последнего файла
В общем, работы на целый вечер, а это значит статью сегодня отправить в журнал не получится.
Варианта 2:
- добавлять ссылки заново
- переписывать текст статьи и переносить изменения из последнего файла
В общем, работы на целый вечер, а это значит статью сегодня отправить в журнал не получится.
Ура! У меня почти 3000 подписчиков в Instagram 😭😍
Я стараюсь показывать науку такой, какой ее вижу я (когда я в хорошем настроении). Мне приносит удовольствие каждый результат ПЦР, каждое измерение на цитометре, каждый подсчёт клеток. Для меря в науке нет рутины. Не смотря на то, что я устаю; конечно же, получаю отрицательные результаты; не могу месяцами опубликовать статью, я знаю, что не хочу заниматься ничем другим кроме клеточной/молекулярной биологии. Иногда у меня бывают на 200% загруженные дни и недели, что настроения и времени на блог просто нет, и возникает желание больше никогда ничего не публиковать, не писать, не фотографировать. Но все же, реализация идей для фото и видео приносит мне колоссальное удовольствие.
В общем, Instagram - это о моей большой любви к науке, способ разгрузить мозг и возможность впустить вас ненадолго за двери лаборатории.
Я стараюсь показывать науку такой, какой ее вижу я (когда я в хорошем настроении). Мне приносит удовольствие каждый результат ПЦР, каждое измерение на цитометре, каждый подсчёт клеток. Для меря в науке нет рутины. Не смотря на то, что я устаю; конечно же, получаю отрицательные результаты; не могу месяцами опубликовать статью, я знаю, что не хочу заниматься ничем другим кроме клеточной/молекулярной биологии. Иногда у меня бывают на 200% загруженные дни и недели, что настроения и времени на блог просто нет, и возникает желание больше никогда ничего не публиковать, не писать, не фотографировать. Но все же, реализация идей для фото и видео приносит мне колоссальное удовольствие.
В общем, Instagram - это о моей большой любви к науке, способ разгрузить мозг и возможность впустить вас ненадолго за двери лаборатории.
Научная жизнь Эльмиры
Есть ли у вас в лаборатории «Журнальный клуб»?
Журнальный клуб - это встреча для обсуждения свежей научной статьи.
Как это происходит? 1 человек (учёный или студент) готовит доклад/подробный разбор статьи, остальные участники за несколько дней до мероприятия получают текст статьи, читают его и во время встречи задают спикеру вопросы.
Журнальный клуб - это способ научиться читать и понимать статьи, узнавать новые методы исследования, быть в курсе современных разработок и трендов области.
Журнальный клуб учит критически относится к опубликованным работам, а также понимать, как делаются научные исследования мирового уровня. Вы не сможете написать свою научную работу, если не умеете читать и понимать чужие.
Как это происходит? 1 человек (учёный или студент) готовит доклад/подробный разбор статьи, остальные участники за несколько дней до мероприятия получают текст статьи, читают его и во время встречи задают спикеру вопросы.
Журнальный клуб - это способ научиться читать и понимать статьи, узнавать новые методы исследования, быть в курсе современных разработок и трендов области.
Журнальный клуб учит критически относится к опубликованным работам, а также понимать, как делаются научные исследования мирового уровня. Вы не сможете написать свою научную работу, если не умеете читать и понимать чужие.
Хотели бы Вы получить возможность поучаствовать в онлайн журнальном клубе, на котором учёный-биолог будет разбирать статью по молекулярной биологии, а Вы сможете задавать вопросы?
Anonymous Poll
88%
Да
3%
Нет
9%
Что такое Молекулярная биология?
Forwarded from Anna Gribkova
https://meduza.io/feature/2020/11/19/16-let-nazad-v-mit-pridumali-konkurs-dlya-biohakerov-igem-v-etom-godu-na-nem-rossiyu-vpervye-predstavlyayut-srazu-dve-komandy
На медузе недавно сделали хороший материал про конкурс и команды этого года, так что кто еще не знаком с iGEM, можно здесь почитать
На медузе недавно сделали хороший материал про конкурс и команды этого года, так что кто еще не знаком с iGEM, можно здесь почитать
Meduza
16 лет назад в MIT придумали конкурс для биохакеров — iGEM. В этом году на нем Россию впервые представляют сразу две команды
С 13 по 22 ноября 2020 года проходит iGEM — престижный мировой конкурс по генной инженерии и биотехнологиям. Это не конкурс знаний, а состязание живых проектов, где студенты, школьники и выпускники вузов работают с генами, молекулярными комплексами и клетками.…
Forwarded from Biotech Deal Watch
Продолжаем биотех марафон🚀
В прекрасный воскресный день у нас пост про Bit Bio 🇬🇧
(https://bit.bio/)
Страна: UK
Отрасль: программирование стволовых клеток
Основатель: Mark Kotter
Год: 2017
Последнее финансирование: 41.5 млн $ (06/2020)
От кого: Richard Klausner, Foresite Capital, Blueyard Capital and Arch Venture Partners
🧬Кратко:
Компания Bit Bio занимается разработкой технологии, позволяющей с большой эффективностью и точностью программировать человеческие плюрипотентные стволовые клетки (hPSC). Пока в продуктах компании только два возможных типа клеток: скелетные миоциты и глутаматэргические нейроны, но в планах – развить технологию до такого уровня, чтобы из hPSC можно было бы создать любую клетку человеческого организма.
🧬Чуть подробнее:
В последние десятилетия технология в области стволовых клеток шагнула далеко вперёд. Стали появляться различные подходы как дедифференцировки зрелых соматических клеток в плюрипотентные, так и дифференцировки плюрипотентных клеток по какому-то определённому пути. Один из таких подходов – прямое программирование клеток (forward cell programming) – заключается в том, что необходимые для дифференцировки транскрипционные факторы вставляются в геном клеток с помощью вируса. После вставки и индукции транскрипции экспрессия транскрипционных факторов приводит к запуску программ экспрессии генов, специфичных для какой-либо ткани, что приводит к стабильной и эффективной дифференцировке.
🧬Крутость темы:
У этой технологии довольно обширная область применения: с одной стороны, такие клетки можно напрямую использовать в качестве клеточной терапии, с другой стороны их можно использовать в качестве хорошей биологической модели для проведедения научных исследований и преклинических испытаний.
🧬Будущее:
В одной из новостей 2019 года также сообщается о коллаборации компании с Charles River Laboratories – лабораторией, в том числе специализирующейся на доклинических испытаниях. Возможно, продукты Bio Bit уже начали использоваться непосредственно на практике. Было бы интересно узнать результаты...
Автор: @praefrontalis
В прекрасный воскресный день у нас пост про Bit Bio 🇬🇧
(https://bit.bio/)
Страна: UK
Отрасль: программирование стволовых клеток
Основатель: Mark Kotter
Год: 2017
Последнее финансирование: 41.5 млн $ (06/2020)
От кого: Richard Klausner, Foresite Capital, Blueyard Capital and Arch Venture Partners
🧬Кратко:
Компания Bit Bio занимается разработкой технологии, позволяющей с большой эффективностью и точностью программировать человеческие плюрипотентные стволовые клетки (hPSC). Пока в продуктах компании только два возможных типа клеток: скелетные миоциты и глутаматэргические нейроны, но в планах – развить технологию до такого уровня, чтобы из hPSC можно было бы создать любую клетку человеческого организма.
🧬Чуть подробнее:
В последние десятилетия технология в области стволовых клеток шагнула далеко вперёд. Стали появляться различные подходы как дедифференцировки зрелых соматических клеток в плюрипотентные, так и дифференцировки плюрипотентных клеток по какому-то определённому пути. Один из таких подходов – прямое программирование клеток (forward cell programming) – заключается в том, что необходимые для дифференцировки транскрипционные факторы вставляются в геном клеток с помощью вируса. После вставки и индукции транскрипции экспрессия транскрипционных факторов приводит к запуску программ экспрессии генов, специфичных для какой-либо ткани, что приводит к стабильной и эффективной дифференцировке.
🧬Крутость темы:
У этой технологии довольно обширная область применения: с одной стороны, такие клетки можно напрямую использовать в качестве клеточной терапии, с другой стороны их можно использовать в качестве хорошей биологической модели для проведедения научных исследований и преклинических испытаний.
🧬Будущее:
В одной из новостей 2019 года также сообщается о коллаборации компании с Charles River Laboratories – лабораторией, в том числе специализирующейся на доклинических испытаниях. Возможно, продукты Bio Bit уже начали использоваться непосредственно на практике. Было бы интересно узнать результаты...
Автор: @praefrontalis
www.bit.bio
Synthetic biology for human health | bit.bio
With our opti-ox™ technology, we precisely, consistently, & efficiently reprogram stem cells into any cell type at scale for your research needs. Learn more!
25 ноября у меня отчетная конференция по гранту, а о том, что презентацию надо прислать до 22.11 сообщили только в пятницу. Очень неудобно получается.
Научная жизнь Эльмиры
Хотели бы Вы получить возможность поучаствовать в онлайн журнальном клубе, на котором учёный-биолог будет разбирать статью по молекулярной биологии, а Вы сможете задавать вопросы?
По многочисленным просьбам: регистрация на журнальный клуб открыта (количество мест ограничено)
📆 23 ноября 2020
⏰ 19:00
📍Платформа ZOOM
📝 Для регистрации необходимо заполнить гугл-форму, доступ получат только первые 30 человек (осталось 20 мест)
📃 Imaging mass cytometry and multiplatform genomics define the phenogenomic landscape of breast cancer, Nature Cancer, 2020
Больше информации в канале Учёный Отвечает:
https://t.me/scientistanswers/3
Подписывайтесь @scientistanswers, чтобы не пропустить объявления о следующих встречах. Также в канале будут появляться записи разборов.
📆 23 ноября 2020
⏰ 19:00
📍Платформа ZOOM
📝 Для регистрации необходимо заполнить гугл-форму, доступ получат только первые 30 человек (осталось 20 мест)
📃 Imaging mass cytometry and multiplatform genomics define the phenogenomic landscape of breast cancer, Nature Cancer, 2020
Больше информации в канале Учёный Отвечает:
https://t.me/scientistanswers/3
Подписывайтесь @scientistanswers, чтобы не пропустить объявления о следующих встречах. Также в канале будут появляться записи разборов.
Google Docs
Журнальный клуб
Лебедев Тимофей Дмитриевич разберет статью Imaging mass cytometry and multiplatform genomics define the phenogenomic landscape of breast cancer (https://www.nature.com/articles/s43018-020-0026-6), Nature Cancer, 2020
В общем, GraphPad Prism - сила.
И графики красивые построить (диаграммы, точечные, хитматы), и обработку добавить (корреляции, t-test, ANOVA, регрессии), и layout создать (для презентаций просто отлично: быстро и удобно).
Пользуюсь им уже лет 5, и он меня никогда не подводит.
И графики красивые построить (диаграммы, точечные, хитматы), и обработку добавить (корреляции, t-test, ANOVA, регрессии), и layout создать (для презентаций просто отлично: быстро и удобно).
Пользуюсь им уже лет 5, и он меня никогда не подводит.