Визуализация данных single cell секвенирования- это всегда красиво, а в виртуальной реальности - ещё круче!
Вам нужен только телефон и картонные очки виртуальной реальности, чтобы перенести Ваши данные в новую вселенную singlecellvr.
Поддерживаются результаты кластеризации Scanpy, Episcanpy, PAGA (@fabian_theis lab), Seurat (@satijalab) and STREAM (@lucapinello lab).
Статья выложена на bioarxiv.
Вам нужен только телефон и картонные очки виртуальной реальности, чтобы перенести Ваши данные в новую вселенную singlecellvr.
Поддерживаются результаты кластеризации Scanpy, Episcanpy, PAGA (@fabian_theis lab), Seurat (@satijalab) and STREAM (@lucapinello lab).
Статья выложена на bioarxiv.
Twitter
Luca Pinello
Have you ever wanted to visualize your #SingleCell data in virtual reality? Now you can! We are happy to present https://t.co/pvKPKxlqSI! You just need a cheap cardboard #VR visor (~$8) and your phone to upload and explore your data in VR! Preprint here …
О плюсах и минусах виртуальных конференций.
Рассуждения организаторов крупных онлайн мероприятий Global ImmunoTalks, Immunometabolism Mini-Symposia, Transforming Vaccinology Keystone и Eco Seminars.
Организаторам конференций и форумов в этом году пришлось быстро реагировать и делать непростой выбор - переносить мероприятие на неизвестную дату или переводить его в онлайн формат.
По ссылке Вы можете прочитать мнения/рассказы разных людей об онлайн мероприятиях, я перечислю лишь то, о чем задумывалась сама.
👍 виртуальные конференции можно смотреть в записи, перематывать, ставить на паузу
👍 онлайн-формат дает возможность поучаствовать большему количество молодых ученых и студентов, которые не ездят на международные конференции из-за финансовых ограничений
👍 больший охват. В качестве примера: участников встречи во Флоренции должно было быть 350, но благодаря переходу в онлайн поучаствовать смогли 1774 человека (RR)
👎 отсутствие неформальных моментов. Нет обсуждений в кулуарах и за кофе, где рождаются идеи и коллаборации. А также случайных столкновений в коридоре, которые могут привести к продуктивному сотрудничеству
👎 меньшая сфокусированность слушателя на докладе.
Ещё мне понравилось мнение о том, что виртуальные конференции могут стать дополнением к оффлайн мероприятиям. Например, тот, кто не может поехать по той или иной причине сможет поучаствовать со скидкой.
И идея об улучшении качества онлайн мероприятий за счёт увеличения времени на обсуждение и создания отдельных виртуальных «комнат» для неформальных знакомств и разговоров.
Рассуждения организаторов крупных онлайн мероприятий Global ImmunoTalks, Immunometabolism Mini-Symposia, Transforming Vaccinology Keystone и Eco Seminars.
Организаторам конференций и форумов в этом году пришлось быстро реагировать и делать непростой выбор - переносить мероприятие на неизвестную дату или переводить его в онлайн формат.
По ссылке Вы можете прочитать мнения/рассказы разных людей об онлайн мероприятиях, я перечислю лишь то, о чем задумывалась сама.
👍 виртуальные конференции можно смотреть в записи, перематывать, ставить на паузу
👍 онлайн-формат дает возможность поучаствовать большему количество молодых ученых и студентов, которые не ездят на международные конференции из-за финансовых ограничений
👍 больший охват. В качестве примера: участников встречи во Флоренции должно было быть 350, но благодаря переходу в онлайн поучаствовать смогли 1774 человека (RR)
👎 отсутствие неформальных моментов. Нет обсуждений в кулуарах и за кофе, где рождаются идеи и коллаборации. А также случайных столкновений в коридоре, которые могут привести к продуктивному сотрудничеству
👎 меньшая сфокусированность слушателя на докладе.
Ещё мне понравилось мнение о том, что виртуальные конференции могут стать дополнением к оффлайн мероприятиям. Например, тот, кто не может поехать по той или иной причине сможет поучаствовать со скидкой.
И идея об улучшении качества онлайн мероприятий за счёт увеличения времени на обсуждение и создания отдельных виртуальных «комнат» для неформальных знакомств и разговоров.
CYTO Virtual 2020
Конференция посвящена проточной цитофлуориметрии и геномным данным.
📆 4-5 Августа 2020
💸 для студентов - 75$
Туториалы, семинары, устные и постерные доклады. Несколько докладов будут о COVID-19.
Конференция посвящена проточной цитофлуориметрии и геномным данным.
📆 4-5 Августа 2020
💸 для студентов - 75$
Туториалы, семинары, устные и постерные доклады. Несколько докладов будут о COVID-19.
Женщина-биолог должна быть способна в горящую лабу войти, коня на скаку остановить (где-то же нужно конскую сыворотку добывать) и машину с реагентами разгрузить.
Планирование - залог успеха.
Каждое утро пишу себе задачи на день, правда использую TAPPSK и лабораторный журнал. По вечерам не люблю это делать, потому что утром настроение вершить великие деда, а после работы все мысли о «поесть и спать».
Каждое утро пишу себе задачи на день, правда использую TAPPSK и лабораторный журнал. По вечерам не люблю это делать, потому что утром настроение вершить великие деда, а после работы все мысли о «поесть и спать».
Forwarded from Ты ж биолог
Записала видео о том, как использую Notion для планирования:
• как я визуализирую в Notion иерархию “задачи-недели-месяцы-цели-области жизни”
• как выглядит процесс планирования недели с нуля
• рефлексия по окончанию недели
В качестве приятного бонуса сделала шаблон на базе системы, которой пользуюсь (ссылка есть в описании к видео). В шаблоне уже есть все связанные базы данных + формулы прогресса по целям + краткое описание процесса планирования и пару важных моментов, про которые забыла сказать в видео.
🔗: https://youtu.be/IKcYHBUeoBU
#планирование #notion
• как я визуализирую в Notion иерархию “задачи-недели-месяцы-цели-области жизни”
• как выглядит процесс планирования недели с нуля
• рефлексия по окончанию недели
В качестве приятного бонуса сделала шаблон на базе системы, которой пользуюсь (ссылка есть в описании к видео). В шаблоне уже есть все связанные базы данных + формулы прогресса по целям + краткое описание процесса планирования и пару важных моментов, про которые забыла сказать в видео.
🔗: https://youtu.be/IKcYHBUeoBU
#планирование #notion
YouTube
Планирование в Notion / Моя личная система продуктивности
Как я организовала планирование в Notion, начиная с целей по областям жизни, заканчивая задачами на день.
Это первый ролик из серии роликов про Notion. В следующих видео расскажу про другие части моей системы жизни в Notion (управление знаниями + личное).…
Это первый ролик из серии роликов про Notion. В следующих видео расскажу про другие части моей системы жизни в Notion (управление знаниями + личное).…
Forwarded from Минобрнауки России
Актуальная подборка действующих конкурсов для ученых и исследователей
Читайте, участвуйте и побеждайте!
Мегагранты:
📍Восьмой конкурс на получение «мегагрантов»
Конкурсы РФФИ:
📍Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Национальным центром научных исследований Франции
📍Совместный конкурс на лучшие научные проекты, направленные на решение проблем, связанных с глобальной пандемией COVID-19, проводимый организациями - участниками Рамочной программы БРИКС в сфере науки, технологий и инноваций
📍Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Научным и технологическим исследовательским советом Турции
📍Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Японским обществом продвижения науки
📍Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Национальным исследовательским советом Италии
📍Совместный конкурс на лучшие исследовательские проекты, проводимый организациями-участниками инициативы Бельмонтского форума по совместной исследовательской деятельности «Устойчивость почв и грунтовых вод для общества»
📍Конкурс на лучшие научные проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Австрийским научным фондом
Другие конкурсы:
📍Конкурсы РНФ
📍Премия Президента России в области науки и инноваций для молодых ученых
📍Конкурс МФТИ на 2021–2022 учебный год
📍Конкурс «Молодые исследователи» NG
#МинобрнаукиРоссии
Читайте, участвуйте и побеждайте!
Мегагранты:
📍Восьмой конкурс на получение «мегагрантов»
Конкурсы РФФИ:
📍Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Национальным центром научных исследований Франции
📍Совместный конкурс на лучшие научные проекты, направленные на решение проблем, связанных с глобальной пандемией COVID-19, проводимый организациями - участниками Рамочной программы БРИКС в сфере науки, технологий и инноваций
📍Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Научным и технологическим исследовательским советом Турции
📍Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Японским обществом продвижения науки
📍Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Национальным исследовательским советом Италии
📍Совместный конкурс на лучшие исследовательские проекты, проводимый организациями-участниками инициативы Бельмонтского форума по совместной исследовательской деятельности «Устойчивость почв и грунтовых вод для общества»
📍Конкурс на лучшие научные проекты фундаментальных научных исследований, проводимый совместно РФФИ и Австрийским научным фондом
Другие конкурсы:
📍Конкурсы РНФ
📍Премия Президента России в области науки и инноваций для молодых ученых
📍Конкурс МФТИ на 2021–2022 учебный год
📍Конкурс «Молодые исследователи» NG
#МинобрнаукиРоссии
Статья в Nature о переходе из академии в бизнес.
🗣 Barbara Domayne-Hayman, химик, Francis Crick Institute, ментор для учёных, которые переходят из академии в индустрию.
«Управление компанией подходит не всем. Часто у ученых есть отличные идеи, но нет правильного личного бренда - или, возможно, желания самостоятельно продвигать свою технологию или разработку» - перевод.
На самом деле умение продвигать свои идеи, разработки нужно не только в индустрии, но и в академической науке. Зачастую ученые публикуют статьи и даже не пытаются поделиться результатами с общественностью. Таким образом, задвигая опубликованный материал в ящик стола.
Особенно остро это ощущается в России.
Из-за этого, например, у многих складывается впечатление, что ученые в России публикуются только в российских журналах.
🗣 Barbara Domayne-Hayman, химик, Francis Crick Institute, ментор для учёных, которые переходят из академии в индустрию.
«Управление компанией подходит не всем. Часто у ученых есть отличные идеи, но нет правильного личного бренда - или, возможно, желания самостоятельно продвигать свою технологию или разработку» - перевод.
На самом деле умение продвигать свои идеи, разработки нужно не только в индустрии, но и в академической науке. Зачастую ученые публикуют статьи и даже не пытаются поделиться результатами с общественностью. Таким образом, задвигая опубликованный материал в ящик стола.
Особенно остро это ощущается в России.
Из-за этого, например, у многих складывается впечатление, что ученые в России публикуются только в российских журналах.
Nature
The four pillars of a successful science spin-off company
Want to get ahead in business? Entrepreneurs need to be resilient, patient and strong team players, says Barbara Domayne-Hayman.
Forwarded from Научная жизнь Эльмиры
Полезные для начинающего учёного ссылки ✅
https://www.instagram.com/p/BegDIJPBNNc/?igshid=1qdqz023kko0m - пару лет назад я делала пост в своём Инстаграмм на эту тему и это самый сохраняемый пост за всю историю ведения мной блога (54 сохранения!).
Однако прошло время, я изменилась и список изменился.
Напишу несколько онлайн ресурсов, которыми я чаще всего пользуюсь:
1️⃣ cBioportal.org - для работы с транскриптомными данными. Здесь собраны большие датасеты и есть встроенные методы анализа - можно построить 2D плоты, кривые выживания, хитмапы. Идеально подходит в качестве первичного анализа данных.
2️⃣ www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ - для дизайна праймеров для ПЦР в реальном времени. Можно подобрать размер, температуру плавления и увидеть оффтаргеты.
3️⃣ eu.idtdna.com - для проверки вторичных структур и дуплексом праймеров (очень важные параметры для меня успешного проведения ПЦР в реальном времени).
4️⃣ biorender.io - подходит для тех, кто хочет быстро сделать красивую презентацию для защиты диплома или курсовой или же для выступления с научно-популярной лекцией. Для более серьёзных вещей (постеров и публикаций) я предпочитаю использовать Illustrator и рисовать все фигуры самостоятельно.
➕ GraphPad - не онлайн сервис, но я вообще не представляю как без него жить мокрому биологу (необходим для идеальных графиков и статистического анализа)
#наука #какбытьученым
https://www.instagram.com/p/BegDIJPBNNc/?igshid=1qdqz023kko0m - пару лет назад я делала пост в своём Инстаграмм на эту тему и это самый сохраняемый пост за всю историю ведения мной блога (54 сохранения!).
Однако прошло время, я изменилась и список изменился.
Напишу несколько онлайн ресурсов, которыми я чаще всего пользуюсь:
1️⃣ cBioportal.org - для работы с транскриптомными данными. Здесь собраны большие датасеты и есть встроенные методы анализа - можно построить 2D плоты, кривые выживания, хитмапы. Идеально подходит в качестве первичного анализа данных.
2️⃣ www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ - для дизайна праймеров для ПЦР в реальном времени. Можно подобрать размер, температуру плавления и увидеть оффтаргеты.
3️⃣ eu.idtdna.com - для проверки вторичных структур и дуплексом праймеров (очень важные параметры для меня успешного проведения ПЦР в реальном времени).
4️⃣ biorender.io - подходит для тех, кто хочет быстро сделать красивую презентацию для защиты диплома или курсовой или же для выступления с научно-популярной лекцией. Для более серьёзных вещей (постеров и публикаций) я предпочитаю использовать Illustrator и рисовать все фигуры самостоятельно.
➕ GraphPad - не онлайн сервис, но я вообще не представляю как без него жить мокрому биологу (необходим для идеальных графиков и статистического анализа)
#наука #какбытьученым
Instagram
Elmira Vagapova 🔬
Last week I found very useful and beautiful online tools for designing biological objects (signaling pathways, cellular interactions, translation/transcription processes, etc.). They offer set of amazing objects: molecules, cells, organisms and even lab equipment…
Forwarded from Юрий
Приглашаем в магистратуру Биокад & Пущгени. Подробнее тут: https://magistr-pushgu.biocad.ru/
career.biocad.ru
Карьера в инновационной биотехнологической компании BIOCAD
Найди работу мечты в международной инновационной компании BIOCAD. Зарегистрируйся на сайте, заполни профиль в личном кабинете и откликнись на желаемую вакансию или стажировку.
Forwarded from Юрий
В ближайшее время на нашем сайте https://magistr-pushgu.biocad.ru появится раздел, где в научно-популярном стиле мы познакомим вас с примерами проектов над которыми работают подразделения, принимающие магистрантов. Также будут приведены примеры публикаций наших студентов/выпускников во время выпонения магистерской (чтобы было понимание по возможным темам работ), а также публикации сотрудников факультета за время работы в компании.
career.biocad.ru
Карьера в инновационной биотехнологической компании BIOCAD
Найди работу мечты в международной инновационной компании BIOCAD. Зарегистрируйся на сайте, заполни профиль в личном кабинете и откликнись на желаемую вакансию или стажировку.
Две стипендии от EHA и ISTH.
И ещё 8 от самого сообщества ISTH. По всей видимости, различие будет в сумме.
Для кратковременной стажировки (2 месяца) молодых учёных (клинические, трансляционные и фундаментальные исследования) в европейские институты, специализирующиеся на #тромбозе и #гемостазе.
Покрывают перелёт, проживание и ежедневные расходы.
Особые требования: нужно быть членом EHA или ISTH.
⏰ подача заявок до 15 сентября 2020
🏆 результаты будет оглашены 1 ноября 2020.
И ещё 8 от самого сообщества ISTH. По всей видимости, различие будет в сумме.
Для кратковременной стажировки (2 месяца) молодых учёных (клинические, трансляционные и фундаментальные исследования) в европейские институты, специализирующиеся на #тромбозе и #гемостазе.
Покрывают перелёт, проживание и ежедневные расходы.
Особые требования: нужно быть членом EHA или ISTH.
⏰ подача заявок до 15 сентября 2020
🏆 результаты будет оглашены 1 ноября 2020.
Нравятся ли вам научные ТикТоки?
Я начала познавать этот формат.
Основной плюс: быстрота и удобство. Можно создать мини-видео за 10 минут, не прилагая усилий для обработки.
Я начала познавать этот формат.
Основной плюс: быстрота и удобство. Можно создать мини-видео за 10 минут, не прилагая усилий для обработки.
Большинство конференций EACR перенесены на 2021 год.
В этом году будут ещё две виртуальные конференции:
Cancer Metabolism
📆 2 сентября 2020
📩 Подать тезисы уже нельзя, но можно зарегистрироваться.
Liquid Biopsies
📆 18-19 ноября 2020
📩 Тезисы принимают до 29 сентября.
Если решите вступить в EACR, пишите мне.
European Association for Cancer Research
В этом году будут ещё две виртуальные конференции:
Cancer Metabolism
📆 2 сентября 2020
📩 Подать тезисы уже нельзя, но можно зарегистрироваться.
Liquid Biopsies
📆 18-19 ноября 2020
📩 Тезисы принимают до 29 сентября.
Если решите вступить в EACR, пишите мне.
European Association for Cancer Research
Не научный, но вполне лабораторный контент.
Вдруг кому окажется полезным мой пресет для мобильной обработки фото в Lightroom.
Для того, чтобы воспользоваться пресетом нужно:
- скачать мобильное приложение Lightroom
- перейти по ссылке под этим постом
- сохранить стиль
- применить стиль к любой вашей фотографии
Вдруг кому окажется полезным мой пресет для мобильной обработки фото в Lightroom.
Для того, чтобы воспользоваться пресетом нужно:
- скачать мобильное приложение Lightroom
- перейти по ссылке под этим постом
- сохранить стиль
- применить стиль к любой вашей фотографии
