SciArticle
9.37K subscribers
217 photos
14 videos
7 files
255 links
Продуктовый канал стартапа SciArticle. Разрабатываем ИИ продукты для поиска и анализа информации, делимся новостями и успехами.
Download Telegram
Докмед_мануал.pdf
3.3 MB
😍 Уважаемые коллеги, добрый день.

Спешим отчитаться по большой проделанной работе коллектива авторов: Бурлов Н.Н., Лобастов К.В., Макарова Д.Д., Марапов Д.И., Навасардян А.Р.

Доказательная медицина: навигатор по материалам тематических каналов.

◈ Это не просто подборка ссылок, а структурированный путеводитель по темам критического анализа научных публикаций и биостатистики. Каждая тема снабжена несколькими источниками с пометкой уровня: БАЗА (с чего начать), СРЕДНИЙ (практика и примеры) или УГЛУБЛЁННО (нюансы и частные случаи), так что навигатор одинаково полезен и новичку в ДМ, и опытному исследователю.

◈ Внутри Вы найдете 2 части и 20 разделов:
📌 Часть 1. Критический анализ научных публикаций: от иерархии доказательств и дизайна исследований до систематических ошибок, публикационного смещения, регистрации КИ и off-label назначений.
📌 Часть 2. Биостатистика: от описательной статистики до анализа выживаемости, множественных сравнений, эстимандов и обзора статистического ПО.

◈ В навигатор включена информация следующих каналов: ННАДМ (114 постов) Medstatistic (100 постов), EBM_base (47 постов), Lobastov's Library (14 постов), Journal Club · Base of EBM (12 постов) и ряда других каналов.

◈ Мануал живой и находится в процессе наполнения. Если у вас есть материалы, каналы или темы, которые стоит добавить, пишите под этим постом или в личном сообщении.

⚠️ Подписывайтесь на ресурсы экспертов:
Medstatistic
EBM_base
Lobastov's Library
Journal Club · Base of EBM

◈ Будем рады любой обратной связи.

👨‍🏫 Читайте. Думайте. Делитесь. Создавайте.

ННАДМ |Medstatistic|EBM_base| Lobastov's Library | Journal Club · Base of EBM

👉 Подписаться на рассылку от ННАДМ по почте
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
5❤13👍6🔥2🗿1
🧬 Метод из соседней науки может открыть новый путь к эксперименту

Похожая задача уже могла быть решена в другой области — на другом типе данных, под другим названием или для другого объекта. Полезно сначала найти такие работы и понять, можно ли перенести их подход.

• 🔬 область-источник и исходную задачу
• ⚙️ принцип работы
• 📊 требования к данным и оборудованию

Найденные публикации можно сохранить в рабочей подборке, сопоставить по методу и зафиксировать, какие условия переноса ещё нужно проверить.

scid.ai
🔥12✍3👍3🗿1
📈 Определить, как меняется научная область

Сравнение двух периодов помогает увидеть, какие методы и типы данных выходят на первый план, где появляются новые исследовательские группы и какие темы из первых публикаций становятся устойчивыми направлениями.

scid.ai позволяет:
• 🧭 выбрать направление для дальнейшей работы через граф
• 🏢 найти растущие исследовательские группы и организации
• 🧪 увидеть смену методов и типов данных

Подборку работ можно сохранить для дальнейшего сравнения и построить по ним граф: так изменения в теме не теряются между поиском, заметками и подготовкой обзора.

scid.ai
🔥9👍4👏2🗿1
🧩 Собрать доказательства по спорному вопросу

В сложной теме мало найти статьи «за» и «против». Важно понять, на каких данных и методах основаны выводы и где проходят границы их применимости.

• 🔎 scid.ai находит научные статьи по вопросу пользователя
• 🧩 из найденных работ выделяет утверждения, связанные с вопросом
• ✅ к каждому утверждению сопоставляет подтверждающие и противоречащие результаты

Так формируется проверяемая база доказательств: видно, на каких работах основан каждый вывод и что ещё требует проверки.

scid.ai
🔥13👍5❤3🗿1
📝 Согласовать план обзора литературы до его написания

Перед написанием обзора важно определить его структуру: какие вопросы раскрыть, в какой последовательности представить выводы и на какие источники опереться в каждом разделе.

В scid.ai достаточно задать исследовательский вопрос. Система найдёт релевантные публикации, выделит ключевые утверждения, свяжет их с конкретными источниками и поможет сформировать редактируемый план обзора.

Разделы можно добавлять, объединять, уточнять и менять местами. После согласования структуры обзор можно писать по частям, сохраняя связь каждого вывода с источниками.

План, утверждения, публикации и рабочие документы остаются внутри одного исследования. Их можно редактировать, а история изменений сохраняется.

scid.ai
👍13🔥4❤2
📄 Подготовить материал исследования

После поиска литературы приходится оформлять документ, переносить выводы, оформлять формулы и таблицы, восстанавливать ссылки на источники и готовить отдельные версии.

В scid.ai можно подготовить материал во вкладке «Документ». В тексте сразу доступны формулы, таблицы и ссылки на использованные источники. Так материалы сразу превращаются в связный документ, который можно проверить, дополнить и использовать дальше. А готовую версию можно экспортировать в Word, PDF или LaTeX.

Также из документа можно подготовить обзор и опубликовать его как отдельную индексируемую страницу — например, чтобы поделиться обзором с коллегами или дать ссылку на материал вместо пересылки файла.

scid.ai
👍11🔥6❤4👏1
SciArticle pinned a video
🧭 Как учёные пришли к сегодняшним выводам?

У научной темы есть своя история: менялись вопросы, появлялись новые методы, одни результаты подтверждались, другие требовали пересмотра.

В scid.ai можно собрать публикации разных лет и подготовить обзор развития темы:
🔬 Какие вопросы ставили исследователи.
⚙️ Как менялись методы и типы данных.
📊 Какие результаты подтвердили последующие работы.
⚠️ Где остались расхождения и ограничения.

Так проще понять, на чём основаны современные представления и какие вопросы ещё стоит проверить.

Источники, заметки и черновик обзора — в одном исследовании. Дополняйте текст и возвращайтесь к работам, на которых он основан.
🔥8👍6❤4
Доброго дня! Хотим порекомендовать авторский блог академического письма Дины Красносельской. В нем наша коллега-преподаватель делится своими экспертными знаниями по теме написания научных статей. 

Вы узнаете:
✍️Как быстро собрать и обработать источники литературы за час? Бесплатный интенсив
✍️ Как правильно структурировать каждый раздел статьи по IMRAD - ссылка
и чем может быть полезна модель CARs при написании раздела Введения - ссылка
✍️ Как корректно использовать ИИ в исследованиях? - ссылка
 ✍️ Лучшие ИИ инструменты для исследований - ссылка
✍️ Границы корректного использования ИИ в исследованиях. Где в статье следует указать на его использование? - ссылка
✍️ Вы опубликовали статью в журнале Scopus, а его исключили из базы… Что будет с индексацией статьи? - ссылка
✍️ В каких дружественных гуманитарных журналах Scopus/WoS сегодня публикуются российские исследователи?
• Право, Q3;
• Искусство и гуманитарные науки, Q4;
• Гуманитарные науки: лингвистика, Q2;
• Психология, социальные науки, история, Q1;
• Образование, педагогика, Q2.

На канале просто и понятно рассказывается о типах и структуре статей, академическом английском и многом другом.

Если Вам важно профессиональное развитие, присоединяйтесь по ссылке.
🔥11❤7👍5
🔗 Поделиться исследованием вместе с его источниками

После подготовки материала им нужно поделиться с экспертами и коллегами. Отдельные файлы и версии в переписке усложняют обсуждение: не всегда понятно, какой документ читать, актуальна ли эта версия, что изменилось по сравнению с предыдущей и на каких источниках основаны выводы.

В scid.ai можно подготовить материал во вкладке «Обзор», а затем опубликовать его как отдельную индексируемую страницу.

Перед публикацией можно:
📝 уточнить разделы и формулировки;
📚 дополнить текст источниками;
📊 оформить таблицы и формулы;
🔎 проверить основания ключевых выводов.

Опубликованный материал получает ссылку, которой можно поделиться с коллегами. Например, отправить обзор литературы по теме исследования перед встречей, чтобы участники заранее ознакомились с аргументами и подготовили вопросы — пример

Рабочие источники и история исследования остаются в scid.ai.

scid.ai
👍7❤6🔥3
🔎 Найти вопрос, на который исследования пока не дали ответа

Публикаций по теме может быть много, а данных для конкретного решения — недостаточно. Например, метод проверяли только на одной группе объектов, в лабораторных условиях или на коротком промежутке времени.

В scid.ai можно собрать литературу по своему вопросу и сопоставить, что уже изучено, какие результаты получены и где авторы отмечают ограничения.

При анализе полезно выяснить:
📚 какие вопросы и объекты уже исследованы;
🧪 в каких условиях проверялись методы;
📊 каких данных не хватает для сравнения;
⚠️ какие выводы требуют независимой проверки.

Так можно сформулировать исследовательский пробел и связать его с конкретными работами. Отсутствие статьи в одной подборке само по себе ещё не доказывает, что вопрос никто не изучал.

Источники и заметки о пробелах можно сохранить и использовать при подготовке гипотезы, обзора или плана следующего исследования.

scid.ai
🔥6👍5❤2
🚀 Редактор вместо Word, презентации и глубокие исследования

Обновили scid.ai: теперь можно готовить и дорабатывать любые материалы — от аналитической справки по теме исследования до статьи с иллюстрациями и презентации для выступления.

Что появилось:
✏️ Режим редактирования рукописи. Правьте текст прямо в scid.ai — больше не нужно переносить черновик в Word.
🎨 Генерация изображений в рукописи. Создавайте иллюстрации в разных форматах под свой материал.
🖼️ Презентации с иллюстрациями в разных стилях. Готовый результат доступен в редактируемом формате — его можно доработать перед выступлением.
🔎 Глубокие исследования в формате справки. Разбирайтесь в вопросе по источникам из интернета и получайте материал с обоснованными выводами.
🤝 Бонус за приглашение коллеги. Пригласите коллегу — каждый из вас получит 1 000 кредитов.

Доработайте текст, подготовьте презентацию и опубликуйте материалы на scid.ai. В следующих постах расскажем подробнее о каждой новой функции.
🔥10👍6❤4👏1
5 проверок данных перед анализом: что исследователю стоит позаимствовать у дата-инженера?

Дата-инженер (DE) по умолчанию не доверяет данным: источник изучают в начале работы с ним, а таблица попадает в отчёт только после тестов. У исследователя данные приходят от прибора, анкет, соавтора или репозитория, и многие проблемы качества повторяются. Пять проверок до детального анализа:
1. типы данных
2. количество строк
3. ключи и дубли
4. пропуски
5. допустимые значения и распределения

🔸 1. типы: данные прочитались так же, как лежат в источнике

Excel, pandas и R при чтении файла угадывают тип каждой колонки, и не всегда удачно. Известный случай из биоинформатики: Excel превращает название гена SEPT2 в дату 2-Sep. Ошибка встречалась так часто, что HGNC переименовал 27 генов человека, чтобы их названия не совпадали с датами.

Что делать:
• при чтении указывайте типы: dtype в pandas, col_types в readr
• ID и коды читайте как строки, иначе пропадут ведущие нули (007 → 7)
• проверьте десятичный разделитель и формат дат: 03.04 это 3 апреля или 4 марта?

🔸 2. объём: сколько строк пришло и сколько осталось

В пайплайнах считают количество строк на входе и выходе каждого шага и сверяют с источником. Так, из-за лимита в 65 536 строк в старом формате .xls часть тестов на COVID однажды молча отрезалась при выгрузке, и тысячи случаев не передали контактным трекерам вовремя.

Что делать:
• выпишите из протокола, сколько должно быть участников, образцов, измерений
• сверяйте это число после загрузки, каждого фильтра и каждого merge
• записывайте, сколько строк отброшено на каждом шаге и почему

🔸 3. ключи: одна строка, один участник

Перед работой с таблицей стоит понять её гранулярность: что описывает одна строка, участника, визит или замер. От этого зависит ключ уникальности строки и то, как таблицы соединяются между собой.

DE после каждого джоина проверяют количество строк и заполненность по ключевым полям, иначе можно наплодить дублей: у части людей несколько замеров, строк после соединения станет больше, чем участников, и расчёт по участникам даёт больший вес тем, у кого замеров больше.

Что делать:
• проверьте до merge, что ID уникален в каждой таблице
• укажите ожидаемую связь прямо в merge: validate="one_to_one" в pandas, relationship = "one-to-one" в dplyr
• ищите и полные, и неполные дубли, где совпадает только ключ

🔸 4. пропуски: NA бывает в десятке обличий


Классика у DE: select distinct по новому полю показывает '123', '456', 'None', '789'. Числа хранятся как текст, а вместо null строка None. В исследовательских данных вариантов больше: пустая строка, n/a, дефис, #N/A из Excel и коды-заглушки вроде 99 или -999.

Текстовые заглушки обычно ломают расчёт сразу. Числовые опаснее: 999 в шкале от 0 до 100 спокойно участвует в среднем и в регрессии, и даже указанный в описании датасета код пропуска большинство пропускает.

Что делать:
• замените все коды пропусков на NA до любых расчётов
• посчитайте долю пропусков по каждой колонке и отдельно по группам
• найдите колонки, заполненные только пропусками

🔸 5. значения и распределения: проверка здравого смысла

Финальный шаг в DE, sanity check: посчитать основные агрегаты и убедиться, что данные похожи на реальные. Пример: в исследовании о честности на данных страховой компании, где клиенты сами сообщали пробег автомобиля, пробег оказался распределён почти равномерно, без единого значения выше 50 000 миль. Данные признали сфабрикованными, статью отозвали.

Что делать:
• сравните min и max с физически возможными значениями: возраст, проценты, концентрации, даты из далёкого будущего или прошлого
• постройте гистограмму каждой ключевой переменной
• схлопывайте в одно значение одинаковые по смыслу категории: Male, male и M в male
• после перекодировки постройте кросс-таблицу старой и новой переменной

Все эти проверки можно оформить кодом: в Python есть pandera и pointblank, в R пакеты validate и pointblank.

Больше про инжиниринг данных в канале @rzv_de
❤9👍6✍2
🆕 От исследования — к рукописи с картинками и презентации

В обновлённом scid.ai можно не только разобраться в теме, но и подготовить материал для работы и выступления.

Что доступно:
✏️ Редактор рукописи: меняйте текст, оформляйте абзацы, добавляйте таблицы и формулы прямо в документе.
🧩 ИИ-правка выделенного фрагмента: опишите, что нужно изменить в конкретном месте.
🎨 Изображения в рукописи: создавайте иллюстрации в разных форматах, меняйте их расположение и перегенерируйте при необходимости.
📚 Настройка списка литературы: выбирайте стиль и порядок записей.
🖼 Презентации с картинками в разных стилях: создавайте слайды из обзора и скачивайте редактируемый PPTX.
🔎 Справки с глубоким исследованием по интернет-источникам.

Подготовьте содержание, внесите правки и переходите к слайдам в том же исследовании.

scid.ai
🔥11❤5👍4
🎨 Создать иллюстрацию по смыслу фрагмента

В обзоре описан объект или процесс, который читателю легче понять с изображением. В scid.ai иллюстрацию можно создать прямо при работе над рукописью.

Откройте scid.ai и выберите режим «Редактор». Вставьте свой текст,или проведите исследование с нуля. В редакторе выделите абзац и нажмите кнопку «ИИ-иллюстрация».

Перед генерацией сформулируйте:
🎯 какую мысль должна объяснять картинка;
🔎 какие объекты и детали нужно показать;
🎨 какой стиль подходит материалу;
🖼 какой формат нужен для размещения в тексте.

Так можно проиллюстрировать блок-схему, превратить таблицу в диаграмму, показать реалистичные объекты исследования.

scid.ai
🔥12👍5❤4
🧩 Переписать один абзац с помощью ИИ

Мысль верная, но абзац слишком длинный? Задайте ИИ правку именно для этого фрагмента.

Откройте scid.ai и выберите режим «Редактор». Вставьте текст или проведите исследование с нуля.

1️⃣ Выделите фрагмент текста.
2️⃣ Нажмите «Правка (ИИ)».
3️⃣ В поле «Как изменить?» напишите, что нужно исправить.
4️⃣ Нажмите «Сгенерировать» и проверьте результат.

Например: «Сделай короче и в научном стиле, сохрани смысл и ссылки».

Так можно доработать аннотацию, описание метода или вывод. После правки сверьте формулировку с исходным текстом и сохраните изменения.

scid.ai
👍11❤4🔥4
Хочешь изучать Data Science, но не знаешь, с чего начать?

Поиск материалов легко превращается в отдельную науку. Мы собрали всё для изучения Data Science и машинного обучения в одном канале - чтобы больше времени оставалось на само обучение.

👉 Data Science | Machine Learning
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍6❤3🔥3
📚 Настроить библиографию прямо в рукописи

Текст уже собран, но список литературы нужно привести к требованиям работы. В scid.ai настройки библиографии доступны прямо в редакторе.

Откройте scid.ai и выберите режим «Редактор». Вставьте готовый текст или проведите исследование с нуля.

Вы можете добавить в текст ссылки на источники из проекта, избранного или групп, а также найти нужную статью по DOI. При этом список литературы обновляется автоматически.

На панели «Список литературы» можно:
🔢 выбрать порядок записей — по порядку упоминания или по алфавиту;
📝 выбрать стиль оформления — APA или ГОСТ;
✏️ отредактировать отдельные записи вручную.

Это помогает привести список литературы к нужному виду в той же среде, где подготовлен текст.

scid.ai
🔥6👍5❤3
Инструменты для исследовательской работы

Поделились опытом, какие инструменты можно использовать на разных этапах исследовательской работы — от поиска научных источников и работы с библиографией до анализа материалов с помощью ИИ.

Разобрали Google Scholar, Zotero, Claude и другие сервисы, а также показали, что из этого процесса уже можно делать в scid.ai.

Подробнее — в статье
👍9🔥4❤2