Среди букв, которые ушли из русского алфавита последними, были графемы греческого происхождения, например, фита, Ѳ, ведущая родословную от греческой теты, θ, и писавшаяся в заимствованиях из греческого.
Но в Эрмитаже можно найти случаи, когда в XVIII веке по-русски пишут даже с использованием греческой буквы ѱ. В официальном русском алфавите ее уже нет, а в текстах есть.
Добавим сюда еще использование славянской Ј, которой тоже нет в официальных перечнях русских букв (фото из Музея Николая Островского).