🚀 @SBERLOGABIO webinar on bioinformatics:
👨🔬 Henrik Nielsen,Vineet Thumuluri , José Juan Almagro Armenteros "DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction using protein language models"
⌚️ Thursday 27 July, 20.00 (Moscow time)
The talk will be in English. (It might be useful for CAFA5 Kaggle competition participants. Announcement on Kaggle.)
Add to Google Calendar
The talk will be based on the recent paper with the same title (Nucleic Acids Res. 2022 ).
The prediction of protein subcellular localization is of great relevance for proteomics research. Here, we propose an update to the popular tool DeepLoc with multi-localization prediction and improvements in both performance and interpretability. For training and validation, we curate eukaryotic and human multi-location protein datasets with stringent homology partitioning and enriched with sorting signal information compiled from the literature. We achieve state-of-the-art performance in DeepLoc 2.0 by using a pre-trained protein language model. It has the further advantage that it uses sequence input rather than relying on slower protein profiles. We provide two means of better interpretability: an attention output along the sequence and highly accurate prediction of nine different types of protein sorting signals. We find that the attention output correlates well with the position of sorting signals. The webserver is available at services.healthtech.dtu.dk/service.php?DeepLoc-2.0.
📹 Video: https://youtu.be/4W12qYMuMhk
📖 Presentation: https://t.me/sberlogabio/58447
👨🔬 Henrik Nielsen,Vineet Thumuluri , José Juan Almagro Armenteros "DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction using protein language models"
⌚️ Thursday 27 July, 20.00 (Moscow time)
The talk will be in English. (It might be useful for CAFA5 Kaggle competition participants. Announcement on Kaggle.)
Add to Google Calendar
The talk will be based on the recent paper with the same title (Nucleic Acids Res. 2022 ).
The prediction of protein subcellular localization is of great relevance for proteomics research. Here, we propose an update to the popular tool DeepLoc with multi-localization prediction and improvements in both performance and interpretability. For training and validation, we curate eukaryotic and human multi-location protein datasets with stringent homology partitioning and enriched with sorting signal information compiled from the literature. We achieve state-of-the-art performance in DeepLoc 2.0 by using a pre-trained protein language model. It has the further advantage that it uses sequence input rather than relying on slower protein profiles. We provide two means of better interpretability: an attention output along the sequence and highly accurate prediction of nine different types of protein sorting signals. We find that the attention output correlates well with the position of sorting signals. The webserver is available at services.healthtech.dtu.dk/service.php?DeepLoc-2.0.
📹 Video: https://youtu.be/4W12qYMuMhk
📖 Presentation: https://t.me/sberlogabio/58447
Запустите свой проект в сфере биомедицины с поддержкой Сеченовского Университета! ✨
🔹 Приглашаем вас воспользоваться прекрасной возможностью поступить на новую программу магистратуры "Предприниматель в биомедицине" и стать частью передового мира предпринимательства и биомедицинских технологий. 🧠🌟
Кому подойдёт эта программа:
👩🔬 Студенты с биомедицинским образованием
💼 Студенты с менеджмент- и бизнес-образованием
💡 Предприниматели и инноваторы в биомедицине
Почему стоит выбрать нашу программу:
🔝 После поступления на программу "Предприниматель в биомедицине" в Сеченовском Университете, студенты открывают для себя множество возможностей и перспектив в сфере предпринимательства и биомедицины.
🎯 Стартап как диплом: Наши студенты получают уникальную возможность создать собственный стартап уже во время обучения. Они пройдут акселераторы и мастерскую стартапов, получат практические навыки и опыт, необходимые для успешного запуска и развития своего бизнеса в биомедицине.
💼 Привлечение инвесторов и развитие бизнеса: Наши магистранты научатся привлекать инвесторов, разрабатывать стратегии масштабирования и принимать важные управленческие решения.
🌐 Доступ к экосистеме Сеченовского Университета: Наши студенты получат не только специализированное образование, но и доступ к полной экосистеме Сеченовского Университета.
👨💼 Бизнес-наставничество и научное консультирование: На протяжении всего обучения, студенты получат индивидуальное бизнес-наставничество от опытных специалистов и научное консультирование от ведущих ученых в области биомедицины. Это позволяет им получать ценные советы по ведению бизнеса, а также быть в курсе последних научных разработок и инноваций.
❗Сеченовский Университет выделяет 5 бюджетных мест, а также предоставляет персональные скидки на обучение до 90% – идеальный шанс для тех, кто получает второе высшее образование.
🎯 Программа разработана в рамках программы "Код образовательных программ" Центра трансформации образования Школы управления СКОЛКОВО. Мы сотрудничаем с ключевыми партнерами, такими как Сбер, группа компаний "Р-Фарм", STADA, Группа компаний "МЕДСИ" и другими.
📅 Ознакомьтесь с подробностями программы и подайте документы до 30.07.2023, чтобы воплотить свою мечту и запустить свой бизнес в области биомедицины!
🎉 Для подписчиков Сберлоги мы можем провести индивидуальные онлайн-консультации по получению образовательного гранта.
Контакты: @JennyIva @lewinamm
🔹 Приглашаем вас воспользоваться прекрасной возможностью поступить на новую программу магистратуры "Предприниматель в биомедицине" и стать частью передового мира предпринимательства и биомедицинских технологий. 🧠🌟
Кому подойдёт эта программа:
👩🔬 Студенты с биомедицинским образованием
💼 Студенты с менеджмент- и бизнес-образованием
💡 Предприниматели и инноваторы в биомедицине
Почему стоит выбрать нашу программу:
🔝 После поступления на программу "Предприниматель в биомедицине" в Сеченовском Университете, студенты открывают для себя множество возможностей и перспектив в сфере предпринимательства и биомедицины.
🎯 Стартап как диплом: Наши студенты получают уникальную возможность создать собственный стартап уже во время обучения. Они пройдут акселераторы и мастерскую стартапов, получат практические навыки и опыт, необходимые для успешного запуска и развития своего бизнеса в биомедицине.
💼 Привлечение инвесторов и развитие бизнеса: Наши магистранты научатся привлекать инвесторов, разрабатывать стратегии масштабирования и принимать важные управленческие решения.
🌐 Доступ к экосистеме Сеченовского Университета: Наши студенты получат не только специализированное образование, но и доступ к полной экосистеме Сеченовского Университета.
👨💼 Бизнес-наставничество и научное консультирование: На протяжении всего обучения, студенты получат индивидуальное бизнес-наставничество от опытных специалистов и научное консультирование от ведущих ученых в области биомедицины. Это позволяет им получать ценные советы по ведению бизнеса, а также быть в курсе последних научных разработок и инноваций.
❗Сеченовский Университет выделяет 5 бюджетных мест, а также предоставляет персональные скидки на обучение до 90% – идеальный шанс для тех, кто получает второе высшее образование.
🎯 Программа разработана в рамках программы "Код образовательных программ" Центра трансформации образования Школы управления СКОЛКОВО. Мы сотрудничаем с ключевыми партнерами, такими как Сбер, группа компаний "Р-Фарм", STADA, Группа компаний "МЕДСИ" и другими.
📅 Ознакомьтесь с подробностями программы и подайте документы до 30.07.2023, чтобы воплотить свою мечту и запустить свой бизнес в области биомедицины!
🎉 Для подписчиков Сберлоги мы можем провести индивидуальные онлайн-консультации по получению образовательного гранта.
Контакты: @JennyIva @lewinamm
web.telegram.org
Telegram is a cloud-based mobile and desktop messaging app with a focus on security and speed.
Попрактикуемся в нейронках и пайторче ? Разыграем призы ?
Есть предложение поразбираться с пайторчем, начиная с азов. Тем кто не разбирался может быть полезно, а те кто разбирался и может поделиться опытом - тоже велкам. Можно взять текущее соревнование Каггл CAFA5 - как рабочий пример - но без "приват шаринга". Кому интересно - добавляйтесь в групп: https://t.me/+6Z2OPBOtjpNkNGIy
Чтобы было веселей устроим мини-конкурсы - например - сегодня (29 июля) такой - вот, есть простой ноутбук https://www.kaggle.com/code/alexandervc/pytorch-01-basics/notebook?scriptVersionId=138216862 . Задачка - поднять скор на лб только меняя параметры и архитектуру сетки на пайторче, то есть на тех же самых фичах и без блендов. Ну и чтоб локальный скор тоже подрос, а не только лб скор.
Кто сегодня поднимет скор ноутбука выше 0.46 - получает приз 1000р, если будет несколько вариантов - получает тот у кого выше скор на лб, (и ноутбук должен быть пабликом работающим на Каггл).
Есть предложение поразбираться с пайторчем, начиная с азов. Тем кто не разбирался может быть полезно, а те кто разбирался и может поделиться опытом - тоже велкам. Можно взять текущее соревнование Каггл CAFA5 - как рабочий пример - но без "приват шаринга". Кому интересно - добавляйтесь в групп: https://t.me/+6Z2OPBOtjpNkNGIy
Чтобы было веселей устроим мини-конкурсы - например - сегодня (29 июля) такой - вот, есть простой ноутбук https://www.kaggle.com/code/alexandervc/pytorch-01-basics/notebook?scriptVersionId=138216862 . Задачка - поднять скор на лб только меняя параметры и архитектуру сетки на пайторче, то есть на тех же самых фичах и без блендов. Ну и чтоб локальный скор тоже подрос, а не только лб скор.
Кто сегодня поднимет скор ноутбука выше 0.46 - получает приз 1000р, если будет несколько вариантов - получает тот у кого выше скор на лб, (и ноутбук должен быть пабликом работающим на Каггл).
(sci)Berloga Всех Наук и Технологий
Попрактикуемся в нейронках и пайторче ? Разыграем призы ? Есть предложение поразбираться с пайторчем, начиная с азов. Тем кто не разбирался может быть полезно, а те кто разбирался и может поделиться опытом - тоже велкам. Можно взять текущее соревнование…
🚀 "Везение и труд - все перетрут" ))) Поздравляем Лиду с успешным поднятием скора с 0.45+ до 0.47+ и получением приза. Линк на Ноутбук Лиды - апвоуты приветствуются !
Как оказалось, чтоб поднять можно было почти ничего не делать - просто запустить ноутбук и сделать сабмит. И ноутбук со скором 0.45+ превращается в скор 0.47+ , если вам немного везет. Как такое может быть ? Полезно подумать. Кто не придумает мы подскажем. Дополнительная замена активации с RELU на GELU во внутренних слоях - подняла скор еще, сигмойду в последнем слое - не меняем.
Новый пазл на 30 июля - приз такой же 1000р.
Цель - скор - 0.49+ на лидерборде.
Кто поднимает скор сегодня 30 июля выше 0.49 , тот получает 1000р
Доп. условия: Ноутбук должен быть пабликом, можно менять сетку, менять эмбеды, блендить свои сетки внутри ноутбука. Копировать чужие паблики нельзя, блендить с пабликами тоже, использовать бустинги и другие модели - нельзя - только пайторч сетки. Также оставить часть с вычислением локальных скоров из предыдущего ноутбука - локальный скор тоже должен подрасти - не только лб скор. Если несколько человек - приз получает тот у кого больше лб скор на конец 30 июля. Присоединяйтесь к обсуждениям пайторча в группе: https://t.me/+6Z2OPBOtjpNkNGIy
Update: Пазл продлен на 31 июля, с чуток повышенной целью 0.491
Update: Пазл продлен на 1 августа, с чуток повышенной целью 0.492
Ударный день - 1 августа:
Борис улучшил скор до 0.49545
Иван 0.49651
Лидия 0.51098
Андрей Шевцов 0.52875 - лучший паблик CAFA5, который получает скор моделью, без внешних данных
( https://www.kaggle.com/code/andreylalaley/pytorch-cafa-5-prediction?scriptVersionId=138595845
Ваши апвоуты - приветствуются ! )
Update: Следующая цель - 0.53 по лб, с аналогичными условиями
Как оказалось, чтоб поднять можно было почти ничего не делать - просто запустить ноутбук и сделать сабмит. И ноутбук со скором 0.45+ превращается в скор 0.47+ , если вам немного везет. Как такое может быть ? Полезно подумать. Кто не придумает мы подскажем. Дополнительная замена активации с RELU на GELU во внутренних слоях - подняла скор еще, сигмойду в последнем слое - не меняем.
Новый пазл на 30 июля - приз такой же 1000р.
Цель - скор - 0.49+ на лидерборде.
Кто поднимает скор сегодня 30 июля выше 0.49 , тот получает 1000р
Доп. условия: Ноутбук должен быть пабликом, можно менять сетку, менять эмбеды, блендить свои сетки внутри ноутбука. Копировать чужие паблики нельзя, блендить с пабликами тоже, использовать бустинги и другие модели - нельзя - только пайторч сетки. Также оставить часть с вычислением локальных скоров из предыдущего ноутбука - локальный скор тоже должен подрасти - не только лб скор. Если несколько человек - приз получает тот у кого больше лб скор на конец 30 июля. Присоединяйтесь к обсуждениям пайторча в группе: https://t.me/+6Z2OPBOtjpNkNGIy
Update: Пазл продлен на 31 июля, с чуток повышенной целью 0.491
Update: Пазл продлен на 1 августа, с чуток повышенной целью 0.492
Ударный день - 1 августа:
Борис улучшил скор до 0.49545
Иван 0.49651
Лидия 0.51098
Андрей Шевцов 0.52875 - лучший паблик CAFA5, который получает скор моделью, без внешних данных
( https://www.kaggle.com/code/andreylalaley/pytorch-cafa-5-prediction?scriptVersionId=138595845
Ваши апвоуты - приветствуются ! )
Update: Следующая цель - 0.53 по лб, с аналогичными условиями
Что разберем на вебинаре?
— Как крутая статья может помочь получить оффер на работу в Яндекс;
— Как вырасти от стажера до тимлида;
— C чего начать и как продуктивнее изучать алгоритмы и структуры данных;
— Каких ошибок нельзя совершать на алгоритмических секциях.
Кто проводит вебинар?
Тим-лид биллинговых микросервисов Яндекса. Выпускник МФТИ. Преподаватель МФТИ по алгоритмам и структурам данных Павел Косицын. Павел прошел путь от стажера до тимлида в Яндексе. Выступал на конференции для стажеров Яндекса.
💻Организаторы вебинара - сообщество алгоритмистов @eda_academy
Кого ждем?
Приглашаются действующие и начинающие разработчики С++/Python/Java/Go. Дс, аналитики тоже приходите.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🚀 @SBERLOGACOMPETE webinar on Kaggle competition:
👨🔬 Ivan Glebov "Kaggle competition: CommonLit - Evaluate Student Summaries"
⌚️ Thursday 10 August, 18.00 (Moscow time)
Link to Announcement on Kaggle.
Add to Google Calendar
Обзор текущего соревнования на Каггл "CommonLit - Evaluate Student Summaries" - новое НЛП соревнование от организаторов фидбэка, необходимо оценить уровень студентов в написании саммари (изложения). Есть несколько текстовых колонок, но к ним есть вопросы. Трейн выборка сильно меньше тестовой, паблик всего 13 процентов. Снова "стэк бертов"? Или что-то еще... Будет интересно ! Соревнование продлится еще 2 месяца. Общий призовой фонд 60 000$$.
Zoom link will be available in https://t.me/sberlogabig shortly before start of the talk.
📹 Video: https://youtu.be/dcOvr_51u-w
📖 Notebook1: (with transformers - public top4) https://www.kaggle.com/code/bulivington/transformers-predictions-base
📖 Notebook2: (no transformers ) https://www.kaggle.com/code/bulivington/no-transformers-but-not-so-bad
👨🔬 Ivan Glebov "Kaggle competition: CommonLit - Evaluate Student Summaries"
⌚️ Thursday 10 August, 18.00 (Moscow time)
Link to Announcement on Kaggle.
Add to Google Calendar
Обзор текущего соревнования на Каггл "CommonLit - Evaluate Student Summaries" - новое НЛП соревнование от организаторов фидбэка, необходимо оценить уровень студентов в написании саммари (изложения). Есть несколько текстовых колонок, но к ним есть вопросы. Трейн выборка сильно меньше тестовой, паблик всего 13 процентов. Снова "стэк бертов"? Или что-то еще... Будет интересно ! Соревнование продлится еще 2 месяца. Общий призовой фонд 60 000$$.
Zoom link will be available in https://t.me/sberlogabig shortly before start of the talk.
📹 Video: https://youtu.be/dcOvr_51u-w
📖 Notebook1: (with transformers - public top4) https://www.kaggle.com/code/bulivington/transformers-predictions-base
📖 Notebook2: (no transformers ) https://www.kaggle.com/code/bulivington/no-transformers-but-not-so-bad
🚀 @SBERLOGABIO webinar data science, bioinformatics:
👨🔬 John Mitchell "Kaggle Competition Review: Novozymes Enzyme Stability Prediction"
⌚️ Friday 18 August, 19.00 (Moscow time)
Link to Announcement on Kaggle.
Add to Google Calendar
Kaggle's Novozymes Enzyme Stability Prediction was a challenging competition that rewarded expertise in bioinformatics as much as in Machine Learning. Two issues that made the competition particularly difficult were that the training data was rather different from the test data, and that there was no obvious or easy local validation protocol available. A wide variety of features and models proved valuable, while ensembling was generally considered essential. The nature of the competition lent itself to overfitting, and it was unsurprising that there was a large shake-up between Public LB and Private LB ranks. I discuss the experience gained from this competition and consider how the lessons learned might be applicable to other bioinformatic competitions.
About the reporter:
John Mitchell is expert both in bioinformatics and machine learning, and also experienced Kaggler and one of the top participants of CAFA5 , will share his experience on the past Kaggle competition "Novoenzymes" which in certain respects similar to CAFA5 challenge.
Zoom link will be available in https://t.me/sberlogabig shortly before start of the talk.
📹 Video record: https://youtu.be/M8tqVF4Gyi0
📖 Presentation: https://t.me/sberlogabio/59283
👨🔬 John Mitchell "Kaggle Competition Review: Novozymes Enzyme Stability Prediction"
⌚️ Friday 18 August, 19.00 (Moscow time)
Link to Announcement on Kaggle.
Add to Google Calendar
Kaggle's Novozymes Enzyme Stability Prediction was a challenging competition that rewarded expertise in bioinformatics as much as in Machine Learning. Two issues that made the competition particularly difficult were that the training data was rather different from the test data, and that there was no obvious or easy local validation protocol available. A wide variety of features and models proved valuable, while ensembling was generally considered essential. The nature of the competition lent itself to overfitting, and it was unsurprising that there was a large shake-up between Public LB and Private LB ranks. I discuss the experience gained from this competition and consider how the lessons learned might be applicable to other bioinformatic competitions.
About the reporter:
John Mitchell is expert both in bioinformatics and machine learning, and also experienced Kaggler and one of the top participants of CAFA5 , will share his experience on the past Kaggle competition "Novoenzymes" which in certain respects similar to CAFA5 challenge.
Zoom link will be available in https://t.me/sberlogabig shortly before start of the talk.
📹 Video record: https://youtu.be/M8tqVF4Gyi0
📖 Presentation: https://t.me/sberlogabio/59283
🚀 @SBERLOGABIG webinar data science:
👨🔬 Никита Бухал "Разбор формулы attention и реализации в pytorch-е"
⌚️ Среда 23 Августа, 20.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
Будет рассказано о механизме внимания и его основных свойствах. Приведены примеры реализации на pytorch, пример на Каггл , в колабе.
📖 Презентация доступна тут.
📹 Video: https://youtu.be/OL3ZW2AY6yg
📹 Video Part2 : https://youtu.be/HmotCYcllOs?si=bZfkjCy3sDBH_HOk
👨🔬 Никита Бухал "Разбор формулы attention и реализации в pytorch-е"
⌚️ Среда 23 Августа, 20.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
Будет рассказано о механизме внимания и его основных свойствах. Приведены примеры реализации на pytorch, пример на Каггл , в колабе.
📖 Презентация доступна тут.
📹 Video: https://youtu.be/OL3ZW2AY6yg
📹 Video Part2 : https://youtu.be/HmotCYcllOs?si=bZfkjCy3sDBH_HOk
🚀 Голосуйте !)
📖 Сейчас на Каггл открыты (и будут продолжаться около 2 месяцев) - четыре "денежных" (не плейгруанд) соревнования
Если у вас есть интерес принять в них участие, то обычно это лучше делать в команде. В командах обычно идет интенсивный обмен опытом, нетворкинг, опыт командной работы и прочий фан. Чтобы было проще найти сокомандников - мы сделали голосовалки - голосуйте, пишите коллегам, кто в тоже проголосовал - объединяйтесь в команды - главное - не стесняйтесь:
Kaggle соревнование по картинкам :
RSNA 2023 Abdominal Trauma Detection
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/6638
Kaggle соревнование распознавание речи:
Bengali.AI Speech Recognition
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/6639
Kaggle соревнование NLP:
Kaggle - LLM Science Exam
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/6641
Kaggle соревнование NLP:
CommonLit - Evaluate Student Summaries
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/6640
Вводный доклад по этому соревнованию тут:
👨🔬 Ivan Glebov "Kaggle competition: CommonLit - Evaluate Student Summaries"
https://t.me/sberlogabig/299
Хакатон - цифровой прорыв 2023. Сезон искусственного интеллекта.
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/7160
Kaggle соревнование
TpuGraphs Kaggle competition, EvolutionaryScale.
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/7145
Kaggle соревнование
Child Mind Institute - Detect Sleep States
Detect sleep onset and wake from wrist-worn accelerometer data
https://t.me/sberlogacompete/7316
📖 Сейчас на Каггл открыты (и будут продолжаться около 2 месяцев) - четыре "денежных" (не плейгруанд) соревнования
Если у вас есть интерес принять в них участие, то обычно это лучше делать в команде. В командах обычно идет интенсивный обмен опытом, нетворкинг, опыт командной работы и прочий фан. Чтобы было проще найти сокомандников - мы сделали голосовалки - голосуйте, пишите коллегам, кто в тоже проголосовал - объединяйтесь в команды - главное - не стесняйтесь:
Kaggle соревнование по картинкам :
RSNA 2023 Abdominal Trauma Detection
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/6638
Kaggle соревнование распознавание речи:
Bengali.AI Speech Recognition
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/6639
Kaggle соревнование NLP:
Kaggle - LLM Science Exam
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/6641
Kaggle соревнование NLP:
CommonLit - Evaluate Student Summaries
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/6640
Вводный доклад по этому соревнованию тут:
👨🔬 Ivan Glebov "Kaggle competition: CommonLit - Evaluate Student Summaries"
https://t.me/sberlogabig/299
Хакатон - цифровой прорыв 2023. Сезон искусственного интеллекта.
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/7160
Kaggle соревнование
TpuGraphs Kaggle competition, EvolutionaryScale.
Голосуем тут: https://t.me/sberlogacompete/7145
Kaggle соревнование
Child Mind Institute - Detect Sleep States
Detect sleep onset and wake from wrist-worn accelerometer data
https://t.me/sberlogacompete/7316
🚀 @SBERLOGACOMPETE образовательный вебинар по data science:
👨🔬 Alexander Chervov "Hands on Hugging Face Transformers and Kaggle CommonLit challenge"
⌚️ Четверг 7 Сентября, 20.00 (Moscow time)
Link to Announcement on Kaggle. (Talk planned to be in English).
Add to Google Calendar
Образовательный вебинар для начинающих: примеры использования моделей типа DeBERTa из коллекции Hugging Face трансформеров для решения задач NLP. На примере Kaggle соревнования "CommonLit - Evaluate Student Summaries". Рассмотрим ноутбуки как файн-тюнить трансформеры под конкретные задачи. Это не так сложно, но все же несколько сложнее чем ".fit/.predict" (в sklearn), но не сильно - нужно примерно следующее 1) перевести данные в формат HF-датасета 2) токенизировть текст 3) добавить таргеты 4) подготовить параметры трейнинга 5) только потом запустить трейнинг. Мы рассмотрим как это происходит в деталях. Во второй половине обсудим соревнование "CommonLit" дадим обзор подходов и паблик ноутбуков, некоторых загадок подготовки данных организаторами, внешние данные и т.д.
Ноутбуки с моделями nb1, nb2, с обзором пабликов nb .
Zoom link will be available in https://t.me/sberlogabig shortly before start of the talk.
Предыдущий вебинар по данному соревнованию:
📹 Video: https://youtu.be/OL3ZW2AY6yg
👨🔬 Ivan Glebov "Kaggle competition: CommonLit - Evaluate Student Summaries"
Данный доклад:
📖 Presentation: https://docs.google.com/presentation/d/101mmtjEvIwKKP2klTwJZ_yIGydXyorQkKn19SrMoZnE/edit?usp=sharing
📹 Video: https://youtu.be/L6OQmXk1Am4
👨🔬 Alexander Chervov "Hands on Hugging Face Transformers and Kaggle CommonLit challenge"
⌚️ Четверг 7 Сентября, 20.00 (Moscow time)
Link to Announcement on Kaggle. (Talk planned to be in English).
Add to Google Calendar
Образовательный вебинар для начинающих: примеры использования моделей типа DeBERTa из коллекции Hugging Face трансформеров для решения задач NLP. На примере Kaggle соревнования "CommonLit - Evaluate Student Summaries". Рассмотрим ноутбуки как файн-тюнить трансформеры под конкретные задачи. Это не так сложно, но все же несколько сложнее чем ".fit/.predict" (в sklearn), но не сильно - нужно примерно следующее 1) перевести данные в формат HF-датасета 2) токенизировть текст 3) добавить таргеты 4) подготовить параметры трейнинга 5) только потом запустить трейнинг. Мы рассмотрим как это происходит в деталях. Во второй половине обсудим соревнование "CommonLit" дадим обзор подходов и паблик ноутбуков, некоторых загадок подготовки данных организаторами, внешние данные и т.д.
Ноутбуки с моделями nb1, nb2, с обзором пабликов nb .
Zoom link will be available in https://t.me/sberlogabig shortly before start of the talk.
Предыдущий вебинар по данному соревнованию:
📹 Video: https://youtu.be/OL3ZW2AY6yg
👨🔬 Ivan Glebov "Kaggle competition: CommonLit - Evaluate Student Summaries"
Данный доклад:
📖 Presentation: https://docs.google.com/presentation/d/101mmtjEvIwKKP2klTwJZ_yIGydXyorQkKn19SrMoZnE/edit?usp=sharing
📹 Video: https://youtu.be/L6OQmXk1Am4
Привет, Чемпион!
🏆 Хочешь быстрее покорить Kaggle и научиться выигрывать соревнования по анализу данных? Тогда приглядись к курсу "Введение в соревновательный Data Science"!
🎯 Что ты получишь?
- Первый русскоязычный курс по соревновательному Data Science с максимальным количеством практики.
- Насыщенная программа, содержащая эффективные методы для выбивания максимального качества из твоих ML-моделей.
- Более 200 практических заданий, интервью с Kaggle Grand Masters.
- Большое русскоязычное коммьюнити студентов курса для совместного прохождения и участия в соревнованиях.
🤘 На данный момент у курса:
👍 Уже 500+ участников.
👍 50+ отзывов, оценка 5 из 5.
👍 Выдано 70 сертификатов, отправлено 60 комплектов мерча.
😵 Медали на Kaggle у 5-ти студентов
🚀 На канале курса проводим еженедельные открытые вебинары, где разбираем решения победителей чемпионатов и делаем обзоры текущих соревнований.
🤕 Кстати, доступ к курсу можно получить оплатой через работодателя. Подробности тут.
📀 Промокод на скидку SBERLOGA
🏆 Хочешь быстрее покорить Kaggle и научиться выигрывать соревнования по анализу данных? Тогда приглядись к курсу "Введение в соревновательный Data Science"!
🎯 Что ты получишь?
- Первый русскоязычный курс по соревновательному Data Science с максимальным количеством практики.
- Насыщенная программа, содержащая эффективные методы для выбивания максимального качества из твоих ML-моделей.
- Более 200 практических заданий, интервью с Kaggle Grand Masters.
- Большое русскоязычное коммьюнити студентов курса для совместного прохождения и участия в соревнованиях.
🤘 На данный момент у курса:
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Forwarded from Alexander C
🚀 SciBerloga @deep_learners club: учебный семинар по дата-сайнс
👨🔬 Иван Павленко "Введение в автоэнкодеры"
⌚️ Понедельник 11 Сентября, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
План:
* Автокодировщики - что это такое.
* Область применения.
* Разбор реализации.
* Обзор набора данных UTKFace.
* Разбор класса модели и обучение.
* Обзор эпох обучения.
* Эксперимент с незнакомыми данными.
* Не самый удачный, но поучительный вариант с использованием свёрточных слоев.
* Небольшой эксперимент с восстановлением качества размытого изображения.
* Пара слов про вариационные автокодировщики.
Ноутбуки:
Основной ноутбук:
https://www.kaggle.com/code/mrgobus/autoencoder-utkface-from-old-to-young
Попытка использовать свёрточные слои:
https://www.kaggle.com/code/mrgobus/autoencoder-conv2d-utkface-from-man-to-woman
Не самая удачная, но поучительная =)
И на сладкое, вот эти два:
https://www.kaggle.com/code/mrgobus/ae-mnist-digits-distribution
https://www.kaggle.com/code/mrgobus/vae-mnist-digits-distribution
Это попытка посмотреть на распределение обычно и вариационного кодировщиков.
Зум линк будет доступен в группе: @deep_learners перед началом доклада.
👨🔬 Иван Павленко "Введение в автоэнкодеры"
⌚️ Понедельник 11 Сентября, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
План:
* Автокодировщики - что это такое.
* Область применения.
* Разбор реализации.
* Обзор набора данных UTKFace.
* Разбор класса модели и обучение.
* Обзор эпох обучения.
* Эксперимент с незнакомыми данными.
* Не самый удачный, но поучительный вариант с использованием свёрточных слоев.
* Небольшой эксперимент с восстановлением качества размытого изображения.
* Пара слов про вариационные автокодировщики.
Ноутбуки:
Основной ноутбук:
https://www.kaggle.com/code/mrgobus/autoencoder-utkface-from-old-to-young
Попытка использовать свёрточные слои:
https://www.kaggle.com/code/mrgobus/autoencoder-conv2d-utkface-from-man-to-woman
Не самая удачная, но поучительная =)
И на сладкое, вот эти два:
https://www.kaggle.com/code/mrgobus/ae-mnist-digits-distribution
https://www.kaggle.com/code/mrgobus/vae-mnist-digits-distribution
Это попытка посмотреть на распределение обычно и вариационного кодировщиков.
Зум линк будет доступен в группе: @deep_learners перед началом доклада.
🚀 @SBERLOGABIO вебинар по биологии:
👨🔬 Елена Белова "Глубокая стимуляция мозга при болезни Паркинсона – от истории поиска методов терапии к теориям двигательного контроля."
⌚️ Пятница 15 Сентября, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
Глубокая стимуляция мозга (англ. Deep Brain Stimulation, DBS) появилась 30 лет назад как чисто эмпирический подход для нейрохирургического облегчения симптомов паркинсонизма и других двигательных расстройств. За три десятилетия нейрофизиологи многое узнали о работе подкорковых структур головного мозга, участвующих в моторном контроле, предложили усовершенствования для этой технологии и опробуют возможности DBS для облегчения других неврологических расстройств. На лекции поговорим о современных представлениях о патофизиологии болезни Паркинсона и особенностях нейрохирургического лечения различных форм этого заболевания.
Ссылка на зум будет доступна в канале @sberlogabig перед началом доклада. Видео записи: https://www.youtube.com/c/SciBerloga - подписывайтесь на ютуб канал.
О докладчике: Елена - сотрудник ИХФ РАН, автор замечательннго телеграм канала - @hippopocampus - "удивительное про мозг, поведение и нейронауки" - подписывайтесь !
📖 Presentation: https://t.me/sberlogabio/61301
📹 Video: https://youtu.be/h1fSCaJu710?si=vnnFb8pGCW2q1hHH
📹 Video 2: https://youtu.be/hV4BWrYCWSk (короткое дополнение: по структурам СТЯ и внешнего бледного шара)
👨🔬 Елена Белова "Глубокая стимуляция мозга при болезни Паркинсона – от истории поиска методов терапии к теориям двигательного контроля."
⌚️ Пятница 15 Сентября, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
Глубокая стимуляция мозга (англ. Deep Brain Stimulation, DBS) появилась 30 лет назад как чисто эмпирический подход для нейрохирургического облегчения симптомов паркинсонизма и других двигательных расстройств. За три десятилетия нейрофизиологи многое узнали о работе подкорковых структур головного мозга, участвующих в моторном контроле, предложили усовершенствования для этой технологии и опробуют возможности DBS для облегчения других неврологических расстройств. На лекции поговорим о современных представлениях о патофизиологии болезни Паркинсона и особенностях нейрохирургического лечения различных форм этого заболевания.
Ссылка на зум будет доступна в канале @sberlogabig перед началом доклада. Видео записи: https://www.youtube.com/c/SciBerloga - подписывайтесь на ютуб канал.
О докладчике: Елена - сотрудник ИХФ РАН, автор замечательннго телеграм канала - @hippopocampus - "удивительное про мозг, поведение и нейронауки" - подписывайтесь !
📖 Presentation: https://t.me/sberlogabio/61301
📹 Video: https://youtu.be/h1fSCaJu710?si=vnnFb8pGCW2q1hHH
📹 Video 2: https://youtu.be/hV4BWrYCWSk (короткое дополнение: по структурам СТЯ и внешнего бледного шара)
Forwarded from Cancer Chameleon
В ближайшие два месяца мы будем делиться с вами публикациями и выступлениями с ряда ключевых конференций 2023 года: WCLC, ASCO, ESMO, AACR, SITC и SABCS, в которых принимали участие наши эксперты.
Сегодня начнем с WCLC. С 9 по 12 сентября в Сингапуре прошла Всемирная конференция по опухолям легкого (2023 World Conference on Lung Cancer). На ней были доложены результаты молекулярно-генетического анализа большой когорты карцином легкого на терапии ингибиторами контрольных иммунных точек: "NSCLC Microenvironment Subtypes Correlate with Response and Survival to Immune Checkpoint Inhibitor Therapy".
Соавторы работы — основатель нашего сообщества Владимир Кушнарев и эксперты курса по нейроэндокринным неоплазиям — Иван Валиев и Анастасия Макарова.
Завтра 21 сентября в 13:00 по Мск Владимир Кушнарев поделится опытом исследования на семинаре. Встречу проведем в этом телеграм канале.
Ждём всех желающих 🙂
Сегодня начнем с WCLC. С 9 по 12 сентября в Сингапуре прошла Всемирная конференция по опухолям легкого (2023 World Conference on Lung Cancer). На ней были доложены результаты молекулярно-генетического анализа большой когорты карцином легкого на терапии ингибиторами контрольных иммунных точек: "NSCLC Microenvironment Subtypes Correlate with Response and Survival to Immune Checkpoint Inhibitor Therapy".
Соавторы работы — основатель нашего сообщества Владимир Кушнарев и эксперты курса по нейроэндокринным неоплазиям — Иван Валиев и Анастасия Макарова.
Завтра 21 сентября в 13:00 по Мск Владимир Кушнарев поделится опытом исследования на семинаре. Встречу проведем в этом телеграм канале.
Ждём всех желающих 🙂
Заходите 21 сентября в 13:00 по Мск на вебинар Владимира Кушнарева на канале @cancerchameleon
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🚀 @SBERLOGACOMPETE вебинар по дата сайнс:
👨🔬 Лидия Шишина "Обзор Каггл соревнования TRAUMA Abdominal Detection Competitions."
⌚️ Понедельник 2 Октября, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
📖 Presentation: https://docs.google.com/presentation/d/1hOX0MD7Q09n6FjnC4kfa8Jpf31r0sn7_tewPdM9LmCk/edit?usp=sharing
✔️ Ноутбук: https://www.kaggle.com/code/lidiashishina/rsna23-weighted-mean-baseline-scale-adj-at-end
В докладе будет рассказано о соревновании - постановка задачи, метрика, и будет дан обзор интересных сеток и решений. В том числе несколько бейзлайнов на CNN и несколько других подходов.
Ссылка на соревнование: https://www.kaggle.com/competitions/rsna-2023-abdominal-trauma-detection , анонс на Каггл: https://www.kaggle.com/competitions/rsna-2023-abdominal-trauma-detection/discussion/444286
Ссылка на зум будет доступна в канале @sberlogabig перед началом доклада. Видео записи: https://www.youtube.com/c/SciBerloga - подписывайтесь на ютуб канал.
📹 Video: https://youtu.be/90zbKUUCoI8?si=h8BOUE7cHCzimTLM
👨🔬 Лидия Шишина "Обзор Каггл соревнования TRAUMA Abdominal Detection Competitions."
⌚️ Понедельник 2 Октября, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
📖 Presentation: https://docs.google.com/presentation/d/1hOX0MD7Q09n6FjnC4kfa8Jpf31r0sn7_tewPdM9LmCk/edit?usp=sharing
✔️ Ноутбук: https://www.kaggle.com/code/lidiashishina/rsna23-weighted-mean-baseline-scale-adj-at-end
В докладе будет рассказано о соревновании - постановка задачи, метрика, и будет дан обзор интересных сеток и решений. В том числе несколько бейзлайнов на CNN и несколько других подходов.
Ссылка на соревнование: https://www.kaggle.com/competitions/rsna-2023-abdominal-trauma-detection , анонс на Каггл: https://www.kaggle.com/competitions/rsna-2023-abdominal-trauma-detection/discussion/444286
Ссылка на зум будет доступна в канале @sberlogabig перед началом доклада. Видео записи: https://www.youtube.com/c/SciBerloga - подписывайтесь на ютуб канал.
📹 Video: https://youtu.be/90zbKUUCoI8?si=h8BOUE7cHCzimTLM
⚠️ Острожно - спуфинг атаки от имени админов Сберлоги и других чатов/каналов (не только Сберлоги) - будьте внимательны !
Некоторые коллеги получили просьбы перевести 120к на карту , некоторые предварительно получив оборвавшийся звонок по телеграм. Якобы от имени админов. Будьте внимальны - админы Сберлоги (и, думаю, других каналов) не пишут в личку с такими просьбами ! Не переводите денег ! Мошенники часто создают похожий по имени экаунт (спуфинг) и пишут от его имени - будьте внимательны !
Некоторые коллеги получили просьбы перевести 120к на карту , некоторые предварительно получив оборвавшийся звонок по телеграм. Якобы от имени админов. Будьте внимальны - админы Сберлоги (и, думаю, других каналов) не пишут в личку с такими просьбами ! Не переводите денег ! Мошенники часто создают похожий по имени экаунт (спуфинг) и пишут от его имени - будьте внимательны !
🚀 @SBERLOGACOMPETE webinar on bioinformatics and data science:
👨🔬 Alexander Chervov "Introduction to Kaggle competition - Single-Cell Perturbations."
⌚️ Thursday 5 October, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
We will give brief introduction mainly from machine learning perspective. Task contains about 614 samples in train and 255 in test, with only two features, which both are categorical (cell type, and drug). Metric is MMSE (row wise). Cross-validation - by cell types with modifications. Baselines with encoding categorical features - one-hot, target encoding with optimization of smoothing parameter, pytorch embedding neural network. Alternative features: "ChemBert" ( link - by Aleksey Trepetsky), molecular descriptors ( link by Antonina Dolgorukova), etc. Most of approaches use dimensional reduction (pca-like) of targets (18211) to smaller dimension 25-100, then predicting these reduced target and then making inverse transform. Notebooks: EDA , modeling , pytorch embeddings , single cell RNA-seq data brief look.
Unusual: 50 000$$ - for biologically insightful solutions which will shed light on "How did you integrate the ATAC data? Did you learn a gene regulatory network?" etc.
Announcement on Kaggle
Zoom link will be in @sberlogabig just before start. Video records: https://www.youtube.com/c/SciBerloga - subscribe !
📖 Presentation: A.Chervov:
📖 Presentation: A.Dolgorukova "Molecular descriptors"
📹 Video: https://youtu.be/dRG3qTaALp0?si=c6k6CARJuik-xF08
👨🔬 Alexander Chervov "Introduction to Kaggle competition - Single-Cell Perturbations."
⌚️ Thursday 5 October, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
We will give brief introduction mainly from machine learning perspective. Task contains about 614 samples in train and 255 in test, with only two features, which both are categorical (cell type, and drug). Metric is MMSE (row wise). Cross-validation - by cell types with modifications. Baselines with encoding categorical features - one-hot, target encoding with optimization of smoothing parameter, pytorch embedding neural network. Alternative features: "ChemBert" ( link - by Aleksey Trepetsky), molecular descriptors ( link by Antonina Dolgorukova), etc. Most of approaches use dimensional reduction (pca-like) of targets (18211) to smaller dimension 25-100, then predicting these reduced target and then making inverse transform. Notebooks: EDA , modeling , pytorch embeddings , single cell RNA-seq data brief look.
Unusual: 50 000$$ - for biologically insightful solutions which will shed light on "How did you integrate the ATAC data? Did you learn a gene regulatory network?" etc.
Announcement on Kaggle
Zoom link will be in @sberlogabig just before start. Video records: https://www.youtube.com/c/SciBerloga - subscribe !
📖 Presentation: A.Chervov:
📖 Presentation: A.Dolgorukova "Molecular descriptors"
📹 Video: https://youtu.be/dRG3qTaALp0?si=c6k6CARJuik-xF08
🚀 @SBERLOGACOMPETE webinar on data science:
👨🔬 Oleg Khudyakov "Introduction to Kaggle competition - Detect sleep states."
⌚️ Thursday 12 October, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
Introduction and overview of the competition will be given. Parsing the raw data, including data labeling errors. Basic feature engineering. Application of gradient boosting and neural networks. Assumptions for postprocessing.
Announcement on Kaggle
Zoom link will be in @sberlogabig just before start. Video records: https://www.youtube.com/c/SciBerloga - subscribe !
📹 Video: https://youtu.be/RDnz9QASwaQ?si=KijFwYk94pAwYCk1
📖 Materials: Link
👨🔬 Oleg Khudyakov "Introduction to Kaggle competition - Detect sleep states."
⌚️ Thursday 12 October, 19.00 (Moscow time)
Add to Google Calendar
Introduction and overview of the competition will be given. Parsing the raw data, including data labeling errors. Basic feature engineering. Application of gradient boosting and neural networks. Assumptions for postprocessing.
Announcement on Kaggle
Zoom link will be in @sberlogabig just before start. Video records: https://www.youtube.com/c/SciBerloga - subscribe !
📹 Video: https://youtu.be/RDnz9QASwaQ?si=KijFwYk94pAwYCk1
📖 Materials: Link
Ловите крутейший data-форум сезона — Loginom Day 2023!
Уже 5 лет мы собираем руководителей, специалистов по данным и IT-шников на наш форум экспертов по low-code аналитике
Реальные кейсы, экспертиза и прямой диалог со спикерами, которые успешно используют платформу Loginom для задач бизнеса. Это событие для людей, которые хотят обогатить свой опыт в анализе данных и получить множество классных идей и новых знакомств
Когда? 2 ноября 2023 года в 13:00 гибрид (Москва, ВДНХ + онлайн-трансляция). Участие бесплатное
И если вы хотите узнать, почему мигрировать с SAS Marketing Automation нужно именно на Loginom, за счет чего retail-компании удалось повысить лояльность клиентов, а также как силами нескольких аналитиков построить систему поддержки принятия решений крупного банка, ждем по ссылке.
Уже 5 лет мы собираем руководителей, специалистов по данным и IT-шников на наш форум экспертов по low-code аналитике
Реальные кейсы, экспертиза и прямой диалог со спикерами, которые успешно используют платформу Loginom для задач бизнеса. Это событие для людей, которые хотят обогатить свой опыт в анализе данных и получить множество классных идей и новых знакомств
Когда? 2 ноября 2023 года в 13:00 гибрид (Москва, ВДНХ + онлайн-трансляция). Участие бесплатное
И если вы хотите узнать, почему мигрировать с SAS Marketing Automation нужно именно на Loginom, за счет чего retail-компании удалось повысить лояльность клиентов, а также как силами нескольких аналитиков построить систему поддержки принятия решений крупного банка, ждем по ссылке.