​​В суете научных будней нельзя забывать о красоте окружающего нас мира. Утренний вид из наших окон (время 7:50) 😊

Анонс нового мега-проекта по мозгу. В 2011 году был запущен Open Connectome Project, ресурс, содержащий базу данных открытого доступа, с открытым исходным кодом для хранения, анализа и визуализации больших объемов изображений. Однако, по мере того как изменялись технологии, объем данных становился все больше и больше, что привело к появлению нового ресурса NeuroData. Статья о старте этого проекта была опубликована в журнале Nature Methods 30 октября 2018 года (https://www.nature.com/articles/d41586-018-07195-2?ut.. ) Цель этого проекта состоит в интеграции результатов исследований нейробиологов для исследования фундаментальных принципов работы головного мозга. На сегодняшний день NeuroData включает в себя больше 100 различных баз данных, и содержит более ≥ 200 теравокселей данных, что делает эту базу крупнейшим хранилищем данных по нейробиологии.
Сайт проекта: https://neurodata.io
Любуемся и изучаем 😊

Некоторые подписчики укоряют нас в том, что мы уделяем много внимания проектам на загнивающем Западе и мало - нашим, Российским. Сегодня пытаемся исправиться:
В России стартовал проект «Нейронет», который должен сформировать среду для информационного обмена следующего поколения, который будет производиться при помощи специализированных технологий, так называемых «технологий Нейронет». Подробнее о технологии нейронета, который должен заменить интернет, можно прочитать в статье в Википедии, а страничка проекта в России: http://rusneuro.net/
Дорожная карта «Нейронет» Национальной технологической инициативы была одобрена президиумом Совета при Президенте Российской Федерации по модернизации экономики и
инновационному развитию России. В составе этого проекта отдельно следует выделить национальный исследовательский проект COBRAIN. Его целью является "расширение ресурсов больного и здорового мозга человека через разработку высокоэффективных технологий от клеточного уровня до уровня целостного мозга, а также интеграция мозга человека в информационные и технические среды различного уровня сложности".
http://rusneuro.net/chto-takoe-nejronet/segmenty-i-proyekty/cobrain?fbclid=IwAR3koXp7eKPGzOa_-NhiO9Abw1VTum3uVkBOpsaxV1B50AJXnA40Qf5enAA
Вот, как-то так 😊 А о другом крупном Российском проекте ученых из МГУ, "Ноев ковчег" мы уже писали

Отличный доклад о применении иммуногистохимии в онкоморфологии https://www.youtube.com/watch?v=UNQXcUCoTTM&index=167&list=PLhR3L77Kq8KvN5Z0A7tcCp3arOMoa-ZNs&t=2s

​​Очень нервный сосуд (вокруг сосуда можно наблюдать множество нервных волокон) справился с недельным стрессом путём фиксации в 70% спирте 💀 Данная фиксация по сравнению с формалиновой способствовала более сильному окрашиванию эозином. Надеемся, найдём время для написания более масштабного поста, посвящённого методам фиксации и артефактам в нейроморфологии. А пока желаем подписчикам поменьше стресса, больше позитива и хороших выходных! 😊

Всех с субботним вечером! На повестке дня – наш традиционный обзор новостей, заинтересовавших нас на этой неделе.
1. В журнале Nature была опубликована статья о применении МРТ сканеров ультра-высокого поля с магнитами в 10.5-Тесла. В этой статье освещаются перспективы использования высокопольных томографов в медицине. Интересно, что в Германии, Китае и Южной Корее уже начата разработка 14-Тесловых томографов для человека. На фотографии к этому посту сравнение изображений мозга, которые удается получить, используя томографы в 3 и 9.4 Тесла (Credit: Rolf Pohmann/Max-Planck-Institute for Biological Cybernetics).
На русском об этом можно прочитать: http://neuronovosti.ru/naturesci115-mri-go-go/?fbclid=IwAR25_IUmjPyRC1XylRrRaZGFIAEDNUiaOzlsmWAtQdREW75aiZhz-YcVjy4 Оригинал статьи: https://www.nature.com/articles/d41586-018-07182-7?utm_source=fbk_nr&utm_medium=social&utm_campaign=NGMTnature&fbclid=IwAR2EovmWVbmaS7WCeE6ikOc7aHebc0SGU3MR2rUzW9SAgIUwWSugC9gzHWY
2. Другие новости, имеющие отношение к нейроморфологии тоже опубликованы в Nature (и на русском тоже освещены в статье на портале «Нейроновости»): «Сколько различных типов клеток есть в мозге? Как минимум 133». http://neuronovosti.ru/naturesci118-new-neurons/?fbclid=IwAR1bsutftAWOtjwl4lClH3VVTyULzvr3Gb74RMBp1YKdniWOyDDWec0W-tM

Из других исследований этой недели можно еще выделить исследование о том, как «Одиночество вызывает изменения в головном мозге у мышей» Если верить сообщению исследователей, представленному на крупнейшей конференции нейробиологов SFN (Society for neuroscience meeting) https://abstractsonline.com/pp8/#!/4649/presentation/20940 , то «общее количество нейронов сократилось примерно на 20 процентов после месяца изоляции. После этого еще на протяжении трех месяцев число нейронов оставалось неизменным. К удивлению исследователей, после месяца изоляции у нейронов мышей была более высокая плотность дендритных шипиков - структур для создания нейронных связей» https://scientificrussia.ru/articles/odinochestvo-vliyaet-na-golovnoj-mozg-u-myshej?fbclid=IwAR1TjFhhAf5U3svW5klIhBoFsf2a5VDeUhlFuL8A8sVYRUFFqfDyvpnI_cA
С мест сообщают, что еще на этой конференции «было довольно много постеров о пользе куркумина - на моделях Альцгеймера, старения и других нейровоспалительных процессов. Прямо панацея.» Источник информации подозревает, что «еще немножко, и нейробиологи придут к рецепту кари: куркума, чеснок и имбирь».

Из других сплетен и скандалов недели то, что правительство США приостановило исследования стволовых клеток сердца. Что связано со скандалом с невоспроизводимостью исследований, о котором мы уже писали https://www.nature.com/articles/d41586-018-07232-0?utm_source=fbk_nnc&utm_medium=social&utm_campaign=naturenews&sf201399664=1&fbclid=IwAR2CEvPwXmQWOjZawGGUK6BKZ0gqQWb_SE7XoGaY2SOdiMHhTtgayO5xi4s

Мы опять пишем сегодня про научную политику. В ходе совместного заседания Совет Федерации РФ и президиум РАН подписали соглашение о сотрудничестве: https://indicator.ru/news/2018/11/08/sotrudnichestvo-soveta-federacii-i-ran/?utm_source=indifb&utm_medium=social&fbclid=IwAR3hHKVN2QnfsYJ0SXFFNevdLEd3B1Cw3V5B4GD3HFZ4wTe9Mpj1GS9fVe4 На этом же заседании было сформулировано предложение о передаче в ведение Российской академии наук полного цикла издательско-полиграфической деятельности.
Ниже можно найти ссылку на слайды доклада вице-президента РАН академика А.Р. Хохлова о положении дел с журналами РАН по биологии и физиологии.
https://docviewer.yandex.ru/view/402165639/?*=OKLiMcohns%2BBqeF1MLuoTRuq5A17InVybCI6InlhLWRpc2stcHVibGljOi8vMjdaMzY0MmR2OUdVdDFjeXJBSGszeVVFVnluZ3YwUEszWUNTUUlvcmpIVGVnNG95bHlIZWZMeFNXWnlXVU1JMHEvSjZicG1SeU9Kb25UM1ZvWG5EYWc9PSIsInRpdGxlIjoi0JbRg9GA0L3QsNC70Ysg0J7QkdCdINC4INCe0KTQnSAucGRmIiwidWlkIjoiNDAyMTY1NjM5IiwieXUiOiIyOTM5NDQyMjgxNTEyNTAyMjkzIiwibm9pZnJhbWUiOmZhbHNlLCJ0cyI6MTU0MTk2MzI5NjIzMH0%3D
Как явствует из доклада, положение с отечественными журналами в данной области - аховое. Заодно тут кроется и ответ на вопрос, почему сейчас ученым стало необходимым печататься на английском языке: количество более или менее приличных журналов на русском языке не выросло, а нам ввели строгий план по публикациям.

​​Эритроциты миноги, окрашенные по Маллори (объектив 20х). Обратите внимание на наличие ядер. Кроме того, эритроциты миноги по размеру больше эритроцитов человека.

После публикации про наш Российский нейронет сразу появились вопросы: а в каких странах еще запущены масштабные программы по изучению мозга, и , вообще, про что они? Начнем с Америки.
BRAIN Initiative (Brain Research through Advancing Innovative Neurotechnologies) - совместная государственно-частная исследовательская инициатива, объявленная администрацией Обамы еще в 2013 году. Цель этого проекта - поддержка разработки и применения инновационных технологий, которые будут содействовать пониманию функций мозга. Когда Барак Обама впервые высказывался о данной программе в своей традиционной речи «О положении страны», он сравнил её с проектом по расшифровке человеческого генома: "Каждый доллар, который мы вложили в составление генетической карты человека, принёс нашей экономике прибыль в 140 долларов". И, действительно, по нашим меркам бюджет этой программы просто космический 😊 Зато и результаты впечатляют. О некоторых из участников этой программы мы уже писали. Очень полезная штука - сайт этой программы https://www.braininitiative.nih.gov/ Там можно провести очень много времени. Можно найти много всего полезного, начиная от различных баз данных по мозгу и заканчивая всякими полезными программами.

Сегодня отмечается Всемирный день борьбы с диабетом.
Это заболевание характеризуется относительным или абсолютным дефицитом инсулина. Победить сахарный диабет пока не удалось:
1. Инсулинотерапия не лечит болезнь и не позволяет добиться нормального уровня глюкозы в крови без эпизодов гипо- и гипергликемии и полностью предотвратить развитие осложнений.
2. Замещение β-клеток (пересадка поджелудочной железы или отдельных островков): сопровождается осложнениями, требует пожизненной иммуносупрессивной терапии, при этом далеко не всегда достигается инсулинонезависимость, а также имеется существенный дефицит доноров.

Рисунок 1 - общая численность пациентов с сахарным диабетом по данным регистра сахарного диабета РФ за период 2000-2016 год
Рисунок 2 - Распределение частоты осложнений при сахарном диабете 1 и 2 типа, РФ, по данным на 2016 год. Подробнее читать: https://cyberleninka.ru/article/v/epidemiologiya-saharnogo-diabeta-v-rossiyskoy-federatsii-kliniko-statisticheskiy-analiz-po-dannym-federalnogo-registra-saharnogo?fbclid=IwAR2CpRFTWwRyzOOcY3eFpFhL_aUGiripnXuqBOl4R1QGIRelm2fTQT0fzw8

С тех пор положение дел существенно не улучшилось: https://endojournals.ru/index.php/dia/article/view/9686?fbclid=IwAR08AVjntWuq1e3By3zvFq3szvzsXQERW3WRxOeLyS7o9hlmvxtmxDIApdE

​​Выкладываем две уникальные книги сотрудницы московского Института мозга и кафедры антропологии МГУ Юлии Григорьевны Шевченко.

Первая книга, посвященная эволюции коры мозга приматов и человека, на обширном сравнительно-анатомическом материале описывает особенности строения мозга различных видов - от низших приматов, таких как тупайя, до человека (сразу оговоримся, это немного устаревшая классификация, в современной классификации тупайя входит в отряд Тупайи). И несмотря на некоторую архаичность, книга содержит бесценные данные об эволюции коры мозга, появлении новых цитоархитектонических полей и связанных с этим изменений миелоархитектоники.

Вторая книга отлично дополняет первую, раскрывая сложные вопросы онтогенеза коры мозга и его соотношение с филогенезом. Помимо этого в книге освящены вопросы расовой и индивидуальной изменчивости головного мозга, показана несостоятельность некоторых теорий, пропагандирующих превосходство одной расы над другой.

Новость для наших подписчиков!

Мы открываем новый YouTube-канал, на котором будем выкладывать различные ролики, посвящённые нашей деятельности, а также лекции по нейроморфологии. Подписываемся! А пока первое видео, поясняющее самой широкой публике, что такое морфология.
https://youtu.be/kIPlAMwcJZw

Всем хороших выходных!

Предлагаем провести часть субботнего вечера с пользой и посмотреть, что интересного происходило в области нейробиологии на этой неделе.
1. В рубрике "Хозяйке на заметку"‘ можно найти, как сделать прозрачной дохлую мышь 😊 Этот метод, сходный с тем, про который мы уже писали 15 сентября, помогает лучше изучать анатомию животных. Например, на картинке нервная система. https://www.nature.com/articles/d41586-018-07336-7?utm_source=fbk_nnc&utm_medium=social&utm_campaign=naturenews&sf202299582=1&fbclid=IwAR1VEZhyrmrpTX2QpZl2aC87vlV02RTU9nhql9khMUo6eMI0W8zDN_Ou6_A
2. Наиболее обсуждаемой новостью стало то, что "ученые обнаружили микрофлору мозга" Пока об этом даже не написана статья, а только небольшой постер с SFN (про эту конференцию мы уже писали в прошлую субботу) https://abstractsonline.com/pp8/#!/4649/presentation/32057 Но при этом это наблюдение стало "хитом недели" https://www.sciencemag.org/news/2018/11/do-gut-bacteria-make-second-home-our-brains?utm_source=6&utm_medium=social&utm_campaign=Science-%28ScienceMagazine%29&utm_term=SciMag&utm_content=AAAS&fbclid=IwAR2N_oEgUzoSvrpK3bReMTQVmkUX5vSd8jUXFukLaJq54aOq7BJLPrciuMA
На русском про эту историю можно почитать по ссылке: https://naked-science.ru/article/sci/uchenye-obnaruzhili-mikrofloru-mozga?fbclid=IwAR3bvqayECTKhs0lrke3Y0xdtC3ou1xFBZQZmZrGeK4Xk_J7c7ZbwaFwoVc Пока все сходятся на том, что похоже это посмертные изменения или банальное загрязнение образцов.
3. "С нетерпением ожидаемое многими нейроучеными и неврологами мира событие состоялось – впервые человеку с болезнью Паркинсона пересадили предшественники дофаминергических нейронов, перепрограммированные из кожи и выращенные в пробирке". http://neuronovosti.ru/ipsa-first-parkinson-patient/?fbclid=IwAR17Phyqgs0qFuGpw81qEAJx7e5vPkbDq3ci6r2gIfe5WUdW1PfP3SJBQE8 Посмотрим, что из этого выйдет.
4. Появились данные, что кесарево сечение может вызывать изменения в развивающемся мозге (мышей) Авторы предлагают призадуматься и людям, насколько нужно делать эту процедуру без жестких показаний к ней. http://www.pnas.org/content/115/46/11826?fbclid=IwAR1kY3SnIdn8MnQKo3OiDEfNlObiRQ7kmmB2bj_dVyFsYIv5ViUMA3zUkqo
5. Ну и на закуску новость о том, что "рыбы отличают настоящих врагов от «игрушечных» и зеркальных, что проявляется в том числе в активности генов в их головном мозге" Рекомендуем к прочтению со ссылками, так как рыбка, описанная в статье, - удивительное создание 😊 https://chrdk.ru/news/dazhe_ryby_otlichayut_realnyh_vragov_ot_vymyshlennyh?fbclid=IwAR3udBQ920ccgtLORgjZnru-JoHa7nmoRreBkbR5atolm4wnCWpL2SNv20o
http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/285/1891/20181610?fbclid=IwAR05478BRrlcblZm18w_6BJtaSDIZ0Q3Vf2hkBU-TAoNbYZ_v19PTKWcX00

Готовимся к рабочей неделе, смотрим новости отечественной науки. Опять все плохо.
На прошлой неделе было общее собрание членов РАН. Посмотреть как это все происходило и почувствовать себя академиком :) можно по ссылкам:
https://scientificrussia.ru/ran/obshchee-sobranie-chlenov-ran-den-pervyj-pryamaya-translyatsiya?fbclid=IwAR3WdzRvHLmF1li9eO1zTHVfDAHAHoVdLLYLyfHRUSy_b2HVVuMKhyLV4uw
https://scientificrussia.ru/ran/obshchee-sobranie-chlenov-ran-den-vtoroj-pryamaya-translyatsiya?fbclid=IwAR270qFpMPoLhmrWSrLVGBziflPY7MG-XHpwLYE3jbNwQZqRp7OlG9szj-I На этом же ресурсе можно посмотреть и отдельные доклады по тэгам https://scientificrussia.ru/ran
Самым обсуждаемым стал доклад заместителя председателя Правительства РФ Татьяны Голиковой, которая "обратила внимание академического сообщества на снижение важных показателей. Так, по ряду технологий и отраслей науки наблюдается снижение количества исследований в 2016-2017 годах, в том числе по клеточным технологиям (37%), биоинженерии (30%), диагностике наноматериалов и наноустройств (30%), высокопроизводительным вычислительным системам (32%), геномным технологиям (32%). К подобным отраслям науки также относятся физика, математика, биология, геология, горное дело и автоматика". http://www.ras.ru/news/shownews.aspx?id=28b25710-6685-493b-8903-7e95434c40a5&fbclid=IwAR1td3YPNYAIqPnHKO7gozbVDRyI-tiGOu8DYL9r6RZ72J6zhVUHFBLDINo#content
Что еще обсуждали на общем собрании, можно коротко узнать из статьи с говорящим название "Семь нянек для Стратегии научно-технологического развития России" https://indicator.ru/article/2018/11/15/reportazh-s-obshego-sobraniya-ran/?fbclid=IwAR1lxTmvBsPn0sjY_qzfpWqZPXulz3l_Aw0COVUD986h7Kn1AloX775PNPQ
Ну и вишенкой на тортике стала очень странная статья в "Независимой газете", из которой можно узнать, что ученые оказались в "надежных и крепких" руках. Управлять нами поставили лучших из лучших эффективных менеджеров. http://www.ng.ru/science/2018-11-13/9_7437_breakthrough.html Кое-что уже начало подтверждаться: Минобрнауки предложило выделить более 200 млрд рублей на развитие генетических технологий, а головным учреждением этой программы станет Курчатовский институт . Генетики испытывают по этому поводу сложную гамму чувств 😊 https://tass.ru/nauka/5774809?fbclid=IwAR2_IE3Re-A-3pBH37YiFsMhdXmOEfKNBEy1qMWmIY2gaAUQm6HqiK-X-1w
Еще на этой неделе "Президент РАН Александр Сергеев признал, что сотрудников научных институтов массово увольняли ради того, чтобы повысить остальным зарплату".
https://indicator.ru/news/2018/11/12/massovye-uvolneniya-ran/?utm_source=indifb&utm_medium=social&fbclid=IwAR21uE4T0icynbk_qApw41pAqFgjiZ3jzNcAsDHZwNhZ7r5gF6Q7rsiL9K4
Сразу вспомнился анекдот, найденный на просторах интернета
- Почему Вы ушли с предыдущего места работы?
- С такой зарплатой уехать было невозможно.
И еще одна плохая новость: Суд заблокировал Sci-Hub в России https://indicator.ru/news/2018/11/16/sud-zablokiroval-sci-hub/?utm_source=indifb&utm_medium=social&fbclid=IwAR33NM7WIgp2o8nyiP2YbG6TUB3KBy6x5_Nps54D4VWRSEqQNAMDEldCnaM
Чтобы разбавить весь этот трэш, приводим материалы "ШКОЛЫ НАУЧНОГО РЕМЕСЛА" САНКТ-ПЕТЕРБУРГ По ссылке можно найти несколько дельных докладов для тех, кому надо научится делать презентации, постеры и т.д. https://conf.eco-vector.com/data/?fbclid=IwAR08XQMW8FULK-U8lktIe2iaBkUUkzGBss9AozjAtI_D1maLCXwopsse5Qk
А тем, кто заинтересовался проектом Нейронет предлагаем последить за нейрофорумом 23-24 ноября в Санкт-Петербурге. Тема НейроФорума-2018: «Рынок NeuroNet: Мозг. Технологические решения по его развитию и усилению» https://leader-id.ru/event/12452/?fbclid=IwAR0nYvQjRIX2HMsId5oqkpezqQRftynt43wY2cKSI-Oh88OWqlT1xgcO1Rs

Отвлечемся от новостей, научной политики и мозга и просто посмотрим, что можно увидеть под микроскопом в мазке крови: http://www.morphology.mmu.ac.uk/ На сайте приведены изображения некоторых из основных морфологических форм. Казалось бы кровь, каждый из нас сдавал эти анализы. Однако этот анализ не так прост, как может показаться. Автор поста снимает шляпу перед теми, кто в этом всем разбирается 😊