Разбирая живое | Reverse Biology
39 subscribers
32 photos
15 videos
2 files
5 links
Разбираем живые системы с двух сторон: экспериментальная биология и инженерный подход.

Exploring living systems from two perspectives: experimental biology and engineering.
Download Telegram
Единая стратегия системного восстановления
Сочетание методов вычислительной транскриптомики и модели митохондриального «компромисса» (trade-off) формирует единую стратегию для поиска и проверки лекарств против старения.

Мы определяем «молодое состояние» как скоординированный оптимум, достигаемый на уровнях транскрипции, метаболизма и поддержания белков в активном состоянии. Старение представляет собой предсказуемое нелинейное отклонение от этого оптимума, обусловленное петлями обратной связи, связанными с регуляторной энтропией.

Данный подход позволяет естественным образом учесть тканеспецифическую гетерогенность: поскольку различные ткани поддерживают разные метаболические оптимумы, различаются и их специфические «бассейны притяжения» (аттракторы). Как следствие, дрейф от этих состояний-аттракторов проявляется в виде неравномерного старения, наблюдаемого в масштабах всего организма.

А именно: Дифференцированные взрослые клетки способны поддерживать лишь фиксированное количество митохондриальной ДНК без потери функциональности.
В то время как митохондрион, как и любой биологический организм, стремится к размножению, по крайней мере, на уровне своей ДНК.
Согласно гипотезе, молодое состояние соответствует четко определенному функциональному состоянию, в котором мтДНК является константой. Если значение этой константы увеличивается, дифференцированное состояние начинает отклоняться от своих полных функциональных возможностей, которые были определены адаптацией, эволюционной причиной происхождения этого признака.
Различные адаптационные признаки требуют разного баланса между функциональностью и количеством мтДНК для поддержания этих функций.
Поэтому, скорость старения различается у разных адаптивных признаков, тканей, органов и организмов.

Ключевой вывод для данной области исследований заключается в необходимости перехода от концепции «замедления старения» к стратегии «активного восстановления».

Выявление ключевых регуляторных параметров, стабилизирующих аттрактор «молодой клетки», открывает путь к фармакологической «перезагрузке» клеточной системы. Определенная нами комбинация пяти компонентов — Vd, ZM, Cn, Ln и сиролимуса — служит обоснованной отправной точкой для такого восстановления.
Продолжаем "разбирать живое". Собственно, собирать обратно. В предыдущих сообщениях было обьявленно об идентификации комбинации лекарств, которые могут обратить старение.
Именно лекарства, так как всё они в клинической практике более 30 лет.

Попробуем вернуть функционал взрослому организму.
Я уже вернул, но нужно ещё больше и лучше. Причём функционал возвращается одним и тем же лекарством, как червям, так и человеческим клеткам.

Рапамицин я уже тестировал, на червях, и наиболее перспективное лекарство тестировал.
Теперь комбинации, включая новые вещества.

Логика проста: ищем продление жизни червям более 30 дней, до 40-60, в идеале ещё больше.
30 дней это их естественный предел, который можно достичь "просто" оптимизируя условия содержания.
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Это как они выглядят вблизи. Это черви которые уже завершили репродуктивный период. Им около 10 дней отроду. Многочисленные гормоны, аскаразиды, дафахронивая кислота, огромный набор инсулиновых факторов, самого разного размера, всё ограничивает продолжительность жизни.
А вот когда уже всё, наступает мудрость, понимание и долгая, очень долгая жизнь. А если ещё подтолкнуть лекарствами, то совсем уж долгая.
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Где-то 20-30 червей на лунку. всего 4 лунки на дозу/комбинацию.

Если комбинация продлит их жизнь на 100 и более %, тогда она будет работать на млекопитающих. Исходя из принципа, что старение это эволюционно консервативный процесс. Появился у одноклеточных, а потом "оброс" адаптивными признаками. Которые, признаки стали стареть также, но ...downstream from the basic, original molecular mechanism of aging. Если адаптация способствовала появлению мозгов, то старели мозги. Если мозги не нужны, то они и не стареют. И так далее, по всем органам и тканям.
👍1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Посмотрим... Уже многое, что работает, но нужно оно, чудо. А чудеса иногда свершаются, или происходят.
🙏1
Страшненько, но иформативно. Опять же быстро...
Неплохо получилось, стильно
Forwarded from Sergei Vatolin
Основная проблема это бактериальные инфекции. Вокруг много чего летает. Лаба это open office. Невозможно контролировать стерильность на 100%.
Черви дохнут от инфекции. Довольно часто.
По этому приходится добавлять антибиотики.

При оптимизации условий: на агаре, в присутствии FUdR (100 uM), ампицилин 100 U, и ещё кое чего, черви начинают жить очень долго.
На фото и видио это оптимизировпнные условия, червям 24-25 дней.
Живы все. Даже личинки, которые не растут и не развиваются из-за присутствия FUdR.

Кстати интересный эффект, и взрослым хорошо, и детям...
🔥1
Forwarded from Sergei Vatolin
А это эксперимент с червями более ранний. Этим уже сегодня 28-29 дней. После оптимизации условий, похоже начал работать "lead drug", при низкой концентрации. Понедельник покажет. Если черви в луках обозначенных цифрой "5" не сдохнут, то ... есть неприятная, но Работающая новая комбинация.
В любом случае, С100 работает. И там ещё нет смертей на 28-29 день жизни.
Но могут "упасть", умереть к понедельнику. Так бывало.
Forwarded from Sergei Vatolin
Зелёная цифра - количество живых;
Красная цифра - количество мёртвых;
DOB - date of birth;
AB1 - strain name;
F100 = FUdR 100uM
G1 = gemcytibin 1uM

На верхней плате один контроль заражён неизвестно чем;
На средней два контроля заpажено;
На нижней заражений нет, но из-за отсутствия FUdR контроль умер.