Разбирая живое | Reverse Biology
39 subscribers
32 photos
15 videos
2 files
5 links
Разбираем живые системы с двух сторон: экспериментальная биология и инженерный подход.

Exploring living systems from two perspectives: experimental biology and engineering.
Download Telegram
В исследованных экспериментальных условиях данная репрофилированная монотерапия обеспечила приблизительно 100–150% увеличение хронологической продолжительности жизни C. elegans.

Кстати, количественный эффект монотерапии был так же предсказан и соответствует наблюдаемым экспериментальным данным, а именно 50-70%. При максимальной оптимизации условий жизни червей.
А это защита от бактерий, грибов, слабая гипоксия, мало еды. На таких условиях контроль может быть дотянут практически без смертей до 25 дней жизни.

Таким образом, речь идет не о незначительном увеличении продолжительности жизни, а о существенном, потенциально радикальном эффекте.

Ключевым результатом является независимое совпадение двух подходов.
Компьютерный анализ независимо предсказал активность тех же малых молекул, которые были идентифицированы экспериментальным подходом, причем компьютерное предсказание было выполнено без знания экспериментальных результатов. В свою очередь, экспериментальные исследования проводились независимо от последующего анализа LINCS.

Таким образом, два независимых подхода — экспериментальный и вычислительный — пришли не просто к сходной гипотезе, но и к идентичным конкретным фармакологическим кандидатам.
Это существенно усиливает значимость результата: совпадение между независимым теоретическим предсказанием и экспериментальным наблюдением снижает вероятность того, что обнаруженный эффект является случайным совпадением или результатом подгонки одной модели под другую.
Цель данной группы сугубо прагматическая. Мы разрабатываем (может быть уже разработали...) терапию, фармакологическую от старения. Обсуждаем только протоколы, подходы и практические молекулярные или системные (инженерные, компьютерные) методы для дальнейшей оптимизации терапии.
Разбирая живое | Reverse Biology pinned «Цель данной группы сугубо прагматическая. Мы разрабатываем (может быть уже разработали...) терапию, фармакологическую от старения. Обсуждаем только протоколы, подходы и практические молекулярные или системные (инженерные, компьютерные) методы для дальнейшей…»
Разбирая живое | Reverse Biology pinned «More details, experimental and theoretical: https://vk.ru/club223616395 https://habr.com/ru/articles/1059232/»
Кроме того, математический подход предсказал, что найденные молекулы могут оказывать эффект на продолжительность жизни практически сразу.

Этот же результат, независимо был показан экспериментально в декабре прошлого года. В то время математического подхода ещё не было... А вот сейчас он есть, и много что подтверждает. Того что было до .
Данные прилагаются.

Черви получали ~30 доз, 18, 12, или одну дозу. Эффект одной дозы равен эффекту 30. Делалось это простой сменой "культуральной среды" для червей.
Единая стратегия системного восстановления
Сочетание методов вычислительной транскриптомики и модели митохондриального «компромисса» (trade-off) формирует единую стратегию для поиска и проверки лекарств против старения.

Мы определяем «молодое состояние» как скоординированный оптимум, достигаемый на уровнях транскрипции, метаболизма и поддержания белков в активном состоянии. Старение представляет собой предсказуемое нелинейное отклонение от этого оптимума, обусловленное петлями обратной связи, связанными с регуляторной энтропией.

Данный подход позволяет естественным образом учесть тканеспецифическую гетерогенность: поскольку различные ткани поддерживают разные метаболические оптимумы, различаются и их специфические «бассейны притяжения» (аттракторы). Как следствие, дрейф от этих состояний-аттракторов проявляется в виде неравномерного старения, наблюдаемого в масштабах всего организма.

А именно: Дифференцированные взрослые клетки способны поддерживать лишь фиксированное количество митохондриальной ДНК без потери функциональности.
В то время как митохондрион, как и любой биологический организм, стремится к размножению, по крайней мере, на уровне своей ДНК.
Согласно гипотезе, молодое состояние соответствует четко определенному функциональному состоянию, в котором мтДНК является константой. Если значение этой константы увеличивается, дифференцированное состояние начинает отклоняться от своих полных функциональных возможностей, которые были определены адаптацией, эволюционной причиной происхождения этого признака.
Различные адаптационные признаки требуют разного баланса между функциональностью и количеством мтДНК для поддержания этих функций.
Поэтому, скорость старения различается у разных адаптивных признаков, тканей, органов и организмов.

Ключевой вывод для данной области исследований заключается в необходимости перехода от концепции «замедления старения» к стратегии «активного восстановления».

Выявление ключевых регуляторных параметров, стабилизирующих аттрактор «молодой клетки», открывает путь к фармакологической «перезагрузке» клеточной системы. Определенная нами комбинация пяти компонентов — Vd, ZM, Cn, Ln и сиролимуса — служит обоснованной отправной точкой для такого восстановления.
Продолжаем "разбирать живое". Собственно, собирать обратно. В предыдущих сообщениях было обьявленно об идентификации комбинации лекарств, которые могут обратить старение.
Именно лекарства, так как всё они в клинической практике более 30 лет.

Попробуем вернуть функционал взрослому организму.
Я уже вернул, но нужно ещё больше и лучше. Причём функционал возвращается одним и тем же лекарством, как червям, так и человеческим клеткам.

Рапамицин я уже тестировал, на червях, и наиболее перспективное лекарство тестировал.
Теперь комбинации, включая новые вещества.

Логика проста: ищем продление жизни червям более 30 дней, до 40-60, в идеале ещё больше.
30 дней это их естественный предел, который можно достичь "просто" оптимизируя условия содержания.
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Это как они выглядят вблизи. Это черви которые уже завершили репродуктивный период. Им около 10 дней отроду. Многочисленные гормоны, аскаразиды, дафахронивая кислота, огромный набор инсулиновых факторов, самого разного размера, всё ограничивает продолжительность жизни.
А вот когда уже всё, наступает мудрость, понимание и долгая, очень долгая жизнь. А если ещё подтолкнуть лекарствами, то совсем уж долгая.
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Где-то 20-30 червей на лунку. всего 4 лунки на дозу/комбинацию.

Если комбинация продлит их жизнь на 100 и более %, тогда она будет работать на млекопитающих. Исходя из принципа, что старение это эволюционно консервативный процесс. Появился у одноклеточных, а потом "оброс" адаптивными признаками. Которые, признаки стали стареть также, но ...downstream from the basic, original molecular mechanism of aging. Если адаптация способствовала появлению мозгов, то старели мозги. Если мозги не нужны, то они и не стареют. И так далее, по всем органам и тканям.
👍1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Посмотрим... Уже многое, что работает, но нужно оно, чудо. А чудеса иногда свершаются, или происходят.
🙏1