P.S. к предыдущему посту. Поскольку мы делали рекламу конференции в наших двух каналах (раз, два) и в нашей чатилке, то логично, что в Бремен приехало много участников чата и подписчиков каналов. Так что частично получилась и оффлайн встреча наших пересекающихся сообществ. И вот вам (ИИ-дополненная) фоточка разной степени бородатых и выпавших представителей научного сообщества этих самых каналов с прошлой пятницы. В том числе и вашего одмина💅

Так что желаю всем хорошей пятницы.✌️

Ох... встала перед одмином задачка посчитать положение спиновой плотности и радиус её гирации... Для этого, по классике, были сгенерированы соответствующие кубы, с сайта Multiwfn скачана (за огромную кучу времени) свежая версия этого софта для пингвиньей операционной системы, а также соответствующий мануал.

Но после очередной попытки разобраться в этом интерфейсе и мануале, на это было положен сверху х...ороший учебник и была произнесена фраза из картинки с постом. И в итоге написано за короткое время на Python функция по чтению кубов, к которой быстро прикручено вычисление соответствующих статистических моментов распределений.

Ну а поскольку это может пригодится кому-нибудь, кто может решит написать себе свою собственную реализацию бейдеровского анализа (или чего-то похожего) на нашем любимом скриптовом языке, держите этот файлик.

Вот тот самый файлик

В группе квантово-химических расчетов ФИЦ ХФ РАН разработана программа для конформационного поиска и сэмплинга Uniconf. Программа может быть использована для получения конформационной выборки как изолированных молекул с вращающимися связями, так и молекулярных/ионных кластеров. В частности, в серии наших недавних работ были получены конформации модельных белков, комплексов переходных металлов, молекулярных,(S)n, и ионных, Li+(S)n, Li+(S1)2(S2)2 кластеров где S — органические карбонаты, используемые в коммерческих Li-ионных аккумуляторах. В качестве входных данных требуются Декартовы координаты произвольной конформации системы с указанием вращающихся связей и атомных зарядов.
Uniconf представляет собой альтернативу другим решениям в области конформационного поиска и сэмплинга, таким как CREST и ABCluster, в большинстве случаев обеспечивая большее структурное и энергетическое разнообразие генерируемых ансамблей. Исполняемый файл самой программы, набор вспомогательных скриптов, краткое руководство пользователя и примеры использования доступны в GitHub репозитории нашей группы.
Будем рады комментариям, замечаниям и предложениям!

Очень обидно, когда твою экспериментальную установку называют малюсенькой... 🥺

КвⒶнт свободы
29.05.26 – 31.05.26, Фленсбург (Германия)

Мир находится в полной жопе: войны, эпидемии, ведомые очередным витком восхода ультракапиталистов и ультраправых к власти, ведёт к попранию базовых человеческих ценностей и прав, возможностей развития и качества жизни, свободы и справедливости.

Понять суть проблем и комплексно представить конструктивный подход к их решению возможно, если уже сейчас начать совместное обсуждение проблем и решений в кругу профессионалов сферах экономики, социологии, философии, естественных наук, искусства, политики, активизма. Это позволит не только наладить сотрудничество и поиск эффективных решений, но и избежать ситуаций, когда артистическая гениальность сочетается с глубокой безграмотностью, энциклопедическая эрудированность – с эмоциональной глухотой, политический активизм - с отсутствием глубокого понимания проблем.

Поэтому важно встречаться и нетворкить. Ведь понимание начинается с самых простых вещей. Квантовая механика нам говорит, что в условиях внешних ограничений, возможные состояния системы меняются не плавно и постепенно, а дискретными прыжками: квантами, минимально неделимыми порциями чего-либо. И вот такие кванты в понимании мира и своего места и борьбы в нём важно найти. Именно из таких кирпичиков мы сможем заложить фундамент для выстраивания дальнейших действий и планов.

Ради этого мы приглашаем активистов, политиков, художников и академических работников в хаус-проект в центре Фленсбурга, чтобы поделиться друг с другом своим видением и пониманием науки, общества, искусства, свободы и борьбы за них. В трёхдневной программе будут лекции, воршкопы, дискуссии, перформансы, экскурсия по Фленсбургу, а также совместное неофициальное времяпрепровождение (см. программу ниже). И хотя поездкой этой мир не удастся исправить, там будет всё необходимое, чтобы усилить собственную экспетизу в комплексном познании и осознании мира, а также познакомиться с новыми и интересными людьми, готовыми меняться и менять. Чтобы хотя бы на один малюсенький квⒶнт очеловечить наш сдавленный несвободой мир.

Программа, а также регистрация на мероприятие доступны по следующей ссылке:
https://www.compchemsymposium.org/quantumoffreedom