آزمایشگاه پارس سیلیکو
921 subscribers
245 photos
61 videos
91 files
212 links
اولین آزمایشگاه خصوصی بیوانفورماتیک کشور

Pars Silico is one of the leading Middle Eastern companies in the field of Chemoinformatics and Bioinformatics. Founded in 2013 ...
ParsSilico.com
ارتباط:
@bioinformatics1
Download Telegram
goo.gl/qaum4C

✍️معرفی دیتابیس RepurposeDB
داروی مناسب در دز صحیح، برای بیمار درست، در زمان لازم و از مسیر صحیح، یکی از نتایج پزشکی فردمحور و multi-omic است. تغییر کاربری دارو (drug repositioning) به صورت سیستماتیک ما را قادر می سازد تا بینش خودمان از تحلیل های محاسباتی که با یافته های تجربی و آزمایشگاهی ترکیب شده است را در زمان کوتاه تری به یافته های علمی ثابت شده ترجمه کنیم. از اولین گزارشی از تغییر کاربری دارو که ابتدای دهه ی 1950 منتشر شد تا امروز، بیش از 250 گزارش موفق در این مورد منتشر شده است. خالقان RepurposeDB مجموعه ی از این گزارش ها را مورد بررسی قرار داده و یک کد مولکولی برای تغییر کاربری دارو را استخراج کردیم. تحلیل داده هایی که به شکل داروها، اندیکاسیون های اولیه و اندیکاسیون های ثانویه وجود داشتند از اولویت های مولکولی؛ دسته بندی های لیگاندها، نقش های عملکردی و مسیرهای موفقیت تغییر کاربری داروها پرده برداشتند. دیتابیس RepurposeDB در ایجاد مدل های پیش بینی تغییر کاربری دارو می تواند کمک کننده باشد و می تواند تاثیر بزرگی در تغییر کاربری داروی فرد محور داشته باشد که زمینه ی درمانی در حال ظهور و جدیدی در پزشکی فرد محور و مبتنی بر داده هاست.
▫️آدرس دسترسی به این دیتابیس👇👇
repurposedb.dudleylab.org
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/gr0hbX


ابزار AQUA-DUCT ابزار جدیدی است که انالیز جریان مولکول های حلال را در شبیه سازی دینامیک مولکولی آسان می کند. AQUA-DUCT به ما اجازه می دهد تا رفتار مولکول های حلال را در تمام مراحل شبیه سازی زیر نظر بگیریم و آن را تحلیل و تصویرسازی کنیم. این گونه تحلیل ها می تواند برای بررسی آنزیمهای دارای جایگاه فعال مدفون که از طریق تونل هایی با ماده حلال پیرامونی در ارتباط هستند، مفید باشد. جریان آب را می توان از طریق خواص مولکولی ترکیب آمینو اسیدهای به کار رفته، در تونل ها یا برای آنزیمهای پیچیده تر، از طریق درهای کنترلی که مسیرهای دسترسی را باز می کنند یا می بندند، کنترل کرد.

▫️آدرس دسترسی به این ابزار👇👇
aquaduct.pl/
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
آزمایشگاه پارس سیلیکو
goo.gl/9GR1qJ ✍️ نرم افزار Cytoscape یک نرم افزار یوانفورماتیک متن باز و رایگانی است که برای مصور سازی شبکه های میانکنش مولکولی و نیز برای یکپارچه سازی این میانکنش ها با پروفایل های بیان ژنی و دیگر داده های آماری به کار می رود. برای این نرم افزار اپلیکیشن…
goo.gl/4R3o7C

✍️معرفی و آموزش Cytoscape (صفحه خوش آمدگویی) بخش 1
▫️"گزینه From Network Database ": این گزینه به شما اجازه می دهد تا یک شبکه را از دیتابیس های عمومی اینتراکشن یا از وب سرور Pathway وارد کنید. اگر می خواهید داده های یک شبکه ی عمومی را آنالیز کنید یا اگر یک ژن خاص یا دسته ای از ژنها را دارید و می خواهید اینتراکنش های آنها را بیابید، از این گزینه استفاده کنید. جزییات در زیر آمده است.
▫️" گزینه Organism Networks ": دسته ای از آیکن ها که در پایین ایکون From Network Database قرار گرفته شده اند و شامل مجموعه ای از شبکه ها مدل های ارگانیسم مانند انسان، موش و.. می باشد که از BioGRID گرفته شده اند.
در طرف راست صفحه ی خوش آمدگویی، دو گزینه ی دیگر قرار دارند که برای بارگذاری کارهای موجود استفاده می شوند:
▫️"گزینه Open Recent Session": این لیستی از تمام فایل های کارهایی است که تا بحال باز کرده اید
. توجه کنید که "نمونه شبکه مخمر" همیشه وجود دارد و دسترسی به galFiltered.cys را مهیا می کند که اغلب برای نشان دادن ویژگی های سیتواسکیپ به کار می رود.
▫️"گزینه Open Session File": به شما اجازه می دهد تا برای بارگذاری فایل های کارهای سایتواسکیپ، فایل های سیستمی شما مورد جستجو قرار گیرد.

✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/DVSsll

✍️معرفی Cytoscape (صفحه خوش آمدگویی) بخش 2
💎 گزینه From Network Database
انتخاب گزینه From Network Database صفحه ی واسطه ی the Interaction Database Universal Client را باز می کند:

▪️در این بخش، جستجوی خود را وارد کنید مثلا ژن یا مجموعه ژن هایی که مورد نظر شماست مانند "BRCA2".
▪️در کشوی "Search Mode"، شما می توانید نوع جستجوی خود را به Search Interactome تغییر دهید تا بتوانید به جستجوی یک اینتراکتوم کامل بر اساس گونه ها بپردازید.
▪️بخش Select Database، دیتابیس های موجود را نشان می دهد. بعد از آغاز جستجو با کلیک کردن بر روی کلمه ی Search، نتایج جستجو در ستون Records Found قابل مشاهده است:

▪️در بخش Select Database، نتایج را از طریق چک باکس ستون Import انتخاب کنید یا از انتخاب خارج کنید. وقتی آماده بودید بر روی Import کلیک کنید.
▪️می توانید تمام اینتراکشن ها را وارد کنید یا تعدادی از آنها را انتخاب نکنید. با کلیک بر روی Import، شبکه های یافته شده وارد می شوند.
▪️منو The Interaction Database Universal Client نیز از اینجا قابل دسترسی است:
File → Import→ Public Databases

✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🎁 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🌹سال خوبی را برای شما آرزومند است🌹


📢 @practicalbioinformatics
🌍www.ParsSilico.com
☎️09106665590
📢دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی با همکاری پارس سیلیکو برگزار می کند:
▫️کارگاه های بهار
اردیبهشت ماه
▫️کارگاه های بیوانفورماتیک، طراحی دارو
🎁با تخفیف های ویژه
ParsSilico.com

@practicalbioinformatics
goo.gl/qk8CFi

✍️واکنش های رسانه ها به دستکاری ژنوم انسان
به تازگی من گزارش آکادمی ملی علوم آمریکا درباره دستکاری ژنوم انسان رو مطالعه کردl این گزارش درباره خیلی از مشکلات و چالش های علمی و اخلاقی در زمینه دستکاری ژن های انسانی اشاره کرده است گزارش آکادمی به صورت محتاطانه از دست کاری سلول های جنسی انسانی استقبال کرده بود اما در صورتی که این دستکاری ها به صورت شفاف ، تحت نظارت و در جهت منافع سلامت انسان صورت گیرد
از این رو من در اینجا من یک سری از واکنش های رسانه های جهانی را به این گزارش برای شما ارایه میدهم.

Human genome editing shouldn’t be used for enhancement – yet (New Scientist)
https://www.newscientist.com/article/2121264-human-genome-editing-shouldnt-be-used-for-enhancement-yet/


With stringent oversight, heritable human genome editing could be allowed (Science Daily)
https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170214130539.htm


Genome-edited humans get green light from expert panel (Ars Technica)
https://arstechnica.com/science/2017/02/science-experts-endorse-genetically-editing-humans/


US scientists back gene editing but warn against ‘designer babies’ (Telegraph)
http://www.telegraph.co.uk/science/2017/02/14/us-scientists-back-gene-editing-warn-against-designer-babies/


CRISPR should be used to combat disease, not make designer babies (yet) (Wired)
http://www.wired.co.uk/article/crispr-disease-designer-babies-regulations


No red line against CRISPR’ing early embryos, experts rule (STAT)
https://www.statnews.com/2017/02/14/national-academy-crispr-report/


US panel gives yellow light to human embryo editing (Science)
http://www.sciencemag.org/news/2017/02/us-panel-gives-yellow-light-human-embryo-editing


Review favours human gene editing under stringent conditions (Financial Times)http://www.sciencemag.org/news/2017/02/us-panel-gives-yellow-light-human-embryo-editing


Germline gene editing should be allowed – in certain cases (BioWorld Online)
http://www.bioworld.com/content/germline-gene-editing-should-be-allowed-%E2%80%93-certain-cases


Human Gene Editing Receives Science Panel’s Support (New York Times)
https://www.nytimes.com/2017/02/14/health/human-gene-editing-panel.html


Ethicists advise caution in applying CRISPR gene editing to humans (Washington Post)
https://www.washingtonpost.com/news/speaking-of-science/wp/2017/02/14/ethicists-advise-caution-in-applying-crispr-gene-editing-to-humans/


Human gene editing therapies are OK in certain cases, panel advises (Science News)
https://www.sciencenews.org/article/human-gene-editing-therapies-are-ok-certain-cases-panel-advises

✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/csD8Ka

✍️لیست تعدادی ازمجلات مهم در زمینه بیوانفورماتیک و زیست شناسی محاسباتی را خدمتتان ارایه میدهم.

▪️Name Impact Factor
▫️Bioinformatics IF=5.766
▫️BMC Bioinformatics IF=2.435
▫️BMC Systems Biology IF=3.150
▫️Briefings in Bioinformatics IF=8.399
▫️Computational Biology and Chemistry IF=1.014
▫️Computers in Biology and Medicine IF=1.521
▫️Current Bioinformatics IF=0.770
▫️Evolutionary Bioinformatics IF=1.404
▫️Genome Biology IF=11.313
▫️Genome Research IF=11.351
▫️Journal of Computational Biology IF=1.537
▫️Journal of Biomedical Informatics IF=2.447
▫️Journal of Bioinformatics and Computational Biology IF=0.931
▫️Molecular Systems Biology IF=10.872
▫️Microbiome IF=9.000
▫️Nature Genetics IF=31.616
▫️Nature Reviews Genetics IF=35.898
▫️Nucleic Acids Research IF=9.202
▫️PLOS Computational Biology IF=4.587
▫️PLOS Genetics IF=6.661
▫️Scientific Reports IF=5.228

✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️معرفی مقاله
مقاله ای در زمینه بررسی تنوع ژنتیکی برروی عملکرد و ساختار پروتئینی با بررسی بیش از صد ها پروتئین
مطالعه این مقاله را به دوستان علاقه مند پیشنهاد میکنم👇👇

✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
2017_Impact_of_genetic_variation.pdf
3.4 MB
📝 Impact of genetic variation on three dimensional structure and function of proteins
✒️ Author: A. Prlić
Year: 2017
#variation #Protein
🌐 www.ParsSilico.com
@practicalbioinformatics
goo.gl/UHzJJX

🔔 وبینار رایگان Upcoming Webinar

💎با موضوع :معرفی آموزش ابزارWebMeV جهت انالیز داده های RNA-Seq

Public RNA-Seq Data Analysis using WebMeV
📢 توضیح :
In this tutorial, we will demonstrate the followings:

▫️ How to upload private data and perform RNASeq analysis on WebMeV
▫️How to pull level 3 TCGA data and use clinical data to stratify the cohort
▫️How to perform complex set operation to create trait specific cohorts
▫️Use WebMeV to perform RNASeq analysis and explore high dimensional data
▫️Use WebMeV to perform unsupervised RNASeq analysis
▫️How to pull GEO data sets directly from GEO

🏆مجری برگزاری: The Center for Cancer Computational Biology

🕘 جمعه 18 فروردین ماه ساعت 18:30 الی 19:30

🌐 لینک ثبت نام goo.gl/uw1BZ8

✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/vWAuah

🔔موقعیت شغلی
✍️متخصص بیوانفورماتیک
محل:شیکاگو
دپارتمان بیوشیمی و ژنتیک مولکولی دانشگاه فاینبرگ به دنبال متخصصان بیوانفورماتیک می گردند که دارای توانایی انجام پروژه در زمینه های توالی یابی نسل جدید با استفاده از دیتاستهای ChIp-seq , RNA-seq و از این دست باشند.
🔍شرایط لازم :
دارا بودن مدرک دکترا و یا فوق لیسانس در رشته های بیوانفورماتیک، ریاضات زیستی و علوم کامپیوتر با پیش زمینه زیستی
داشتن مهارت کافی در لینوکس R, پایتون و یا پرل
و..
اطلاعات بیشتر:
goo.gl/CRlHV5

✔️عضویت در کانال پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/NmrHGf

✍️برنامه ی ژنوم قطر، کنسرسیوم تحقیقاتی خود را آغاز کرد.
13 مارچ 2017، بیش از 90 محقق ژنومیکس دور هم جمع شدند تا در کنسرسیوم تحقیقاتی برنامه ی ژنوم قطر (QGP) مشارکت کنند. این کنسرسیوم تازه ترین اقدام از مجموعه تلاش های QGP برای بهره برداری از "پزشکی دقیق" است.
این محققان در این کنسرسیوم، نمایندگان چندین موسسه در قطر از جمله QGP، بیوبانک قطر، مرکز تحقیقاتی و بالینی السدرة، شرکت تعاونی پزشکی حماد، انستستو مطالعات پزشکی قطر، موسسه ی پزشکی ویل کرنل شعبه ی قطر، موسسه ی تحقیقات محاسباتی قطر و دانشگاه قطر هستند. بسیاری از این محققان دارای همکارانی در بسیاری از نقاط جهان هستند.
اسما الثانی مدیر برنامه ژنوم قطر و رییس بیوبانک قطر می گوید: "افتتاح این کنسرسیوم تحقیقاتی گامی حیاتی در مسیر ما به سمت پزشکی دقیق است. با گرد هم آوری این تعداد محققان از موسسات گوناگون، ما در برنامه ژنوم قطر به هماهنگی یک پروژه ی ملی برای نقشه یابی ژنوم قطری ها کمک خواهیم کرد".
این پژوهشگران بر روی جستجوی مجموعه داده های عظیم ژنوتیپی و فنوتیپی که برای شناسایی ویژگی های کلیدی ژنوم قطری ها توسط دو موسسه ی بیوبانک قطر و QGP تولید خواهند شد، کار خواهند کرد. از این دانش در ایجاد و گسترش روش های درمانی فردمحور بیماری ها و نیز روش های پیشگیری استفاده خواهد شد .

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📢دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی با همکاری پارس سیلیکو برگزار می کند:
▫️کارگاه های بهار
اردیبهشت ماه
▫️کارگاه های بیوانفورماتیک، طراحی دارو
🎁با تخفیف های ویژه
ParsSilico.com

@practicalbioinformatics
🔷🔷کیوسار (QSAR) چیست؟🔷🔷
در تولید یک دارو، ترکیب پیش رو(Lead) به عنوان مرجعی برای طراحی و سنتز مشتقات مختلفی از داروها به کار می رود. با تغییرات اندک روی گروه های عاملی مختلف که در ترکیب اصلی است می توان شاهد تغییرات شگرف در فعالیت فارماکولوژیکی آن ترکیب شد؛ برای مثال با جابجایی گروه های عاملی مثل متیل، هیدروکسیل، بنزیل و غیره در ساختار ترکیب پیش رو می توان سبب بهبود عملکرد آن شد. یک داروی مؤثر بصورت سیستماتیک از بین هزاران داروی متفاوتی که با استفاده از ترکیب پیش رو طراحی و سپس سنتز شده و کارایی آن بصورت تجربی تحت روش های مختلف و در طی زمان آزموده شده است، مشخص و معلوم می گردد. این فرآیند، به رابطه ساختار با فعالیت (SAR) مرسوم است. (SAR) در واقع با سنتز و غربالگری ترکیبات مختلف بخش های مفید دارو (از نظر گروه عاملی) را شناسایی می کند.
@PracticalBioinformatics 🎄🎄
کیوسار یکی از روشهای متداول و پر کاربرد در طراحی دارو بر اساس لیگاند است. کیوسار در واقع عبارت است از اصول (SAR)که کمّی و عددی شده است. و به زبان ساده تر روشی است که مدل های ریاضی را ایجاد می کند تا بتواند رابطه معنی دار آماری بین ساختار و عملکرد را با استفاده از روش های کمومتری به دست بیاورد. در طراحی دارو منظور از ساختار، پارامترهای (در اصطلاح به دسکریپتور معروف است) هر مولکول است و منظور از عملکرد عبارت است از فعالیت های تجربی زیستی و یا بیوشیمیایی مانند ثابت اتصال، ثابت سرعت، فعالیت و غیره. روش های کمومتری مرسوم عبارتند از
: MLR- ANN- PLS- PCA- PCRو GA.
کاربردهای کیوسار ☑️
کیوسار علاوه بر این که در پیش بینی فعالیت زیستی ترکیبات روشی با ارزش در داروسازی محسوب می شود، در حوزه صنعت و محیط زیست نیز کاربرد فراوانی پیدا کرده است. به طور کلی کاربردهای کیوسار را می توان در پنج بخش خلاصه کرد:

1- بهینه سازی و شناسایی منطقی ترکیبات اصلی در تولید داروها، حشره کش ها و آفت کش ها.

2- بررسی و تولید ترکیباتی که در بدن اثرات جانبی و سمّیت نداشته باشند.

3- مطالعه ترکیباتی که از لحاظ فارماکوسینتیکی در سیستم های بیولوژیک پایدار هستند.

4- طراحی منطقی مواد پر مصرف در حوزه صنایع مانند عطرها، رنگ های شیمیایی و مواد شیمیایی.

5- شناسایی مواد سمّی برای محیط زیست.

@PracticalBioinformatics 👈👈🎄🎄
goo.gl/ufY05y

🔔مطالعه ارتباط کمی ساختار - فعالیت (QSAR)
✍️بخش اول
روش های پیش بینی که به مدل های ارتباط کمی ساختار- فعالیت (QSAR) مشهور هستند، اساساً یک روش آماری می باشند و اولین بار توسط هانشا و فری و همکارانش معرفی شده اند. بطور عمومی اصطلاح ارتباط کمی ساختار- خاصیت (QSPR) مربوط به یک خاصیت فیزیکی در نظر گرفته شده است و QSAR برای فعالیتهای بیولوژیکی استفاده می شود. اگر چه هانش اولین کسی بود که اصطلاح QSAR را تعریف کرد، کروس در سال ۱۸۶۳ عنوان کرد که سمیت الکل ها با کاهش حلالیت آنها در آب افزایش می یابد. محققان در سال ۱۸۹۰ سمیت ترکیبات آلی را وابسته به خاصیت چربی دوستی آنها دانستند.
▫️اساس مطالعه روش QSAR ، توسعه ارتباط بین خاصیت مشاهده شده و ویژگی ساختاری مولکولی میباشد. با در نظر گرفتن یک سری از مولکولها، مدل پیش بینی کنندهای توسعه داده می شود که میتواند برای پیش بینی فعالیت مولکولهای جدید استفاده شود.
▫️کلمه کلیدی ویژگی های ساختاری Structural features است.
این ویژگی ساختاری در مقایسه با پارامترهای تجربی در ارتباط با انرژی آزاد خطی، قرار دارد. نمایش عددی برخی از ویژگی های مولکولی، توصیف کننده"Descriptors نامیده می شوند. تعداد بسیار گستردهای از توصیف کننده ها شامل توصیف کننده های ساده از قبیل جرم مولکولی و تعداد اتم ها تا انواع پیچیده تر مثل ضریب تقسیم و توصیف کننده های خاصیت سطح، میتوانند محاسبه شوند. به وسیله مجموعه ای از توصیف کننده ها مدل QSAR می تواند از ارتباط این توصیف کننده ها (که به متغیر مستقل معروفند) و خاصیت مشاهده شده (متغیر وابسته) ساخته شود.
▫️اولین مدلهای QSAR توسعه داده شده توسط هانش، ارتباط های خطی بودند. تاکنون مدل های خطی به خاطر سادگی به صورت گسترده ای استفاده شده اند، هر چند پیشرفت آمار تعداد بسیار زیادی از روشهای جدید را به عنوان ابزار پیشبینی ایجاد کرده است. این روشها شامل رگرسیون غیرخطی و روشهای الگوریتمی هستند. زمینه های دیگر از قبیل تشخیص الگو" و یادگیری ماشینی " روشهای موفقی را در QSAR ایجاد شده اند که شامل شبکه های عصبی مصنوعی و درخت تصمیم گیری و غیره می باشند.
بطور مشخص پیشرفت در زمینه مدل سازی QSAR در ارتباط بسیار نزدیک با پیشرفت در زمینه های آمار، کامپیوتر و ریاضی است.
▫️در حقیقت مدل QSAR می تواند برای پیش بینی هر خاصیت فیزیکی یا فعالیت بیولوژیکی که برای مجموعه ای از ساختار مولکولها و خاصیت مشاهده شده در دسترسی باشد، بکار گرفته شود.
▫️مثال هایی از خواص فیزیکی شامل نقطه جوش، حلالیت آبی، دمای انتقال شیشه ، تحرک یونی و ◀️ فعالیت بیولوژیکی شامل ژنوتاکسیسیتی، سرطان زایی و جهش زایی است.
▫️بعلاوه، استفاده از مدلهای QSAR محدود به نقش غربال کردن مقدار زیادی از ترکیبات نیست و می تواند راهگشایی برای رسیدن به ترکیبات بهتر از نظر فعالیت باشد و همچنین می تواند بینشی را از لحاظ مکانیسم ان خاصیت ارائه دهد.

✔️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/ycfJYC

✍️بخش دوم

▫️روشهای QSAR بطور گسترده می توانند به سه گروه تقسیم شوند.

1️⃣ گروه اول روشهای دوبعدی است که ساختار سه بعدی مولکول را بطور مستقیم استفاده نمی کند و مدل با استفاده از توصیف کننده های مولکولی و خواص مشاهده شده ساخته می شود. باید ذکر شود که اگر چه بعضی از توصیف کننده ها اساس سه بعدی دارند ولی به خاطر این که فقط خواص مشاهده شده در نظر گرفته می شوند، بنابراین طبیعت دوبعدی دارند.
2️⃣ نوع دوم، روشهای سه بعدی هستند و مثال عمومی آن روش CoMFA" است در این حالت ساختار سه بعدی مولکولها موضوع مطالعه است. در این روش مولکول در راستای یک شبکه تقسیم بندی شده و خواص مختلف در قسمتهای مختلف شبکه بررسی می شود. از آنجا که این روش، مولکول را بطور سه بعدی و در حال برهمکنش با گیرنده بررسی میکند، نسبت به روش دوبعدی دارای برتری خواهد بود. در این روش قرار گرفتن مولکولها در یک راستا نسبت به مولکول الگو الزامی است؛ باید به این نکته توجه داشت که در این روش تنها یک صورت بندی مولکول را در نظر گرفته میشود.
3️⃣ نوع سوم، روش چهاربعدی است که در واقع توسعه روش سه بعدی بوده و اولین بار توسط هاپفینگرا و همکارانش ارائه شد. در این روش اطلاعات صورتبندی به عنوان بعد چهارم در نظر گرفته میشود مشابه با روش CoMFA روش QSAR چهاربعدی نیز از شبکه بندی مولکولی و بررسی خواص نقاط مختلف شبکه " شروع می شود که در این بین خواص صورتبندی نیز ارزیابی میگردد. این اطلاعات همراه با خواص مولکولی برای توسعه مدل پیش بینی کننده مورد استفاده قرار میگیرد.
▫️روش QSAR سه بعدی نسبت به روش دوبعدی برتری هایی دارد، از جمله این که تفسیر نتایج به صورت واقعی تر و راحت تر صورت می پذیرد.همچنین از آنجایی که در این روش مولکولها در حال برهمکنش با گیرنده و پیدا کردن موقعیت برهمکنش واقعی بررسی می شوند، نتایج ان نسبت به روش دوبعدی قابل اتکاتر است.همچنین از آنجایی که در این روش مولکولها در حال برهمکنش با گیرنده و پیدا کردن موقعیت برهمکنش واقعی بررسی می شوند، نتایج ان نسبت به روش دوبعدی قابل اتکاتر است.
▫️نکته ی دیگر این که، در روش دوبعدی اطلاعات زیادی درمورد جنبه های مختلف فعالیت مولکولی باهم ترکیب شده و به صورت مجزا ظاهر نمیشوند و روش های تفسیری که برای این مدل های خطی وجود دارند محدود به توصیف کننده های موجود در مدل هستند.
منبع: مطالعه ارتباط کمی ساختار-فعالیت بعضی از مولکول های ضد افسردگی و اضطراب با کمک روش های انالیز چند متغیره .. نویسنده: حدیث کاویانی

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📢آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو با همکاری گروه بیوشیمی بالینی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی برگزار می کند.

🔔مجموعه کارگاه های اردیبهشت ماه با همکاری دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی⚔️⚔️

1️⃣ کارگاه بیوانفورماتیک عمومی
تاریخ برگزاری: ۷ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۱۶۰ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۲۸فروردین

2️⃣ کارگاه بیوانفورماتیک ساختاری
تاریخ برگزاری: ۸ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۱۶۰ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۲۸ فروردین

3️⃣ کارگاه طراحی دارو و داکینگ مولکولی
تاریخ برگزاری: ۱۴ الی ۱۵ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۲۵۰هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۲۵ فروردین

4️⃣ کارگاه بایو لینوکس LINUX
تاریخ برگزاری: ۲۱ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۱۹۵ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۱ اردیبهشت

5️⃣ طراحی دارو پیشرفته (غربالگری مجازی)
تاریخ برگزاری: ۲۲ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۱۹۵ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۱ اردیبهشت

6️⃣ کارگاه طراحی پرایمر
تاریخ برگزاری: ۲۸ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۱۵۰هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۱۰ اردیبهشت

7️⃣مدلسازی و مهندسی پروتئین
تاریخ برگزاری: ۲۹ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۱۹۰ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۱۰ اردیبهشت

🏴آدرس محل برگزاری:
تهران - بزرگراه شهید چمران میدان شهید شهریاری -بلوار دانشجو - خیابان کودکیار - دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی


📢آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو برگزار می کند.
▪️مجموعه کارگاه های اردیبهشت ماه


🔵کارگاه کیوسار QSAR
تاریخ برگزاری: ۳۱ فروردین الی ۳ اردیبهشت ماه
هزینه کارگاه: ۳۵۰ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا تاریخ ۲۸ فروردین

🔵کارگاه کیوسار ۳ بعدی 3D-QSAR
تاریخ برگزاری : ۷ الی ۸ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۳۸۰ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف ثبت نام تا تاریخ ۲۸ فروردین

🔵کارگاه ایمونوانفورماتیک (طراحی واکسن)
تاریخ برگزاری: ۱۴ الی ۱۵ آردیبهشت ماه
هزینه کارگاه: ۳۰۰ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۲۸ فروردین

🔵کارگاه طراحی دارو پیشرفته ( فارماکوفور )
تاریخ برگزاری: ۲۸ الی ۲۹ اردیبهشت
هزینه کارگاه: ۳۵۰ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۱ اردیبهشت

🔵کارگاه شبیه سازی دینامیک مولکولی
تاریخ برگزاری: ۴ الی ۵ خرداد
هزینه کارگاه: ۳۵۰ هزار تومان + ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی + ۱۰ درصد تخفیف تا ۱۵ اردیبهشت


@practicalbioinformatics
💥۱۰ درصد تخفیف ثبت نام زود هنگام
💥۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

جهت مشاوره رایگان و کسب اطلاعات بیشتر با شماره های زیر تماس حاصل فرمایید:

👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻
📞۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
☎️ ۰۲۱۸۸۳۴۷۷۲۳
🌐www.DrugDesign.ir
🌐www.ParsSilico.com
@practicalbioinformatics


🏴نشاني: خیابان طالقاني -خیابان سميه- بین مفتح و موسوی - جنب هتل آزادی پلاک ۱۳۲-طبقه ۴ - واحد۴۴

✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics