polyhedron
源基因（ www.yoogene.com ）的Y-STR搜庫功能上線了，現在可以査和自己STR接近的人都在什麼地方、什麼族羣裏面了。
之前在復旦找我抽血測過Y-STR的（其它數據也一樣），若想在源基因試一下數據匹配，可以先在源基因註冊一個帳号，用當時發結果用的郵箱給我回封信（是爲了確定身份，郵箱找不到的話用當時調査表上留的電話也行），告知自己的編号、姓名和在源基因的註冊郵箱/ID等，我可以免費把數據轉過去。
#每周一姓 20180430 漢族傅/付(pyoh)姓，相互無關樣本量 15：
D2-M55: 6.7%
N-M231: 6.7%
O1a-M119: 6.7%
O1b1a-PK4: 6.7%
O2a1b-002611: 33.3%
O2a2b*-P164(xM134): 6.7%
O2a2b1a1-M117: 33.3%
說明：付姓採的樣以北方爲主，Oα-F5的比例偏高，O2a1b-002611的不都是Oγ。
目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計。
下周預告：邱姓
D2-M55: 6.7%
N-M231: 6.7%
O1a-M119: 6.7%
O1b1a-PK4: 6.7%
O2a1b-002611: 33.3%
O2a2b*-P164(xM134): 6.7%
O2a2b1a1-M117: 33.3%
說明：付姓採的樣以北方爲主，Oα-F5的比例偏高，O2a1b-002611的不都是Oγ。
目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計。
下周預告：邱姓
#每周一姓 20180506 漢族邱(khiu)姓，相互無關樣本量 9：
N-M231: 11.1%
O1a-M119: 33.3%
O2a2b1*-M134(xM117): 33.3%
O2a2b1a1-M117: 22.2%
說明：採樣中客家話區比例較高，但Y染色體單倍羣暫未表現出與方言區的關係。
目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計。
下周預告：萬姓
N-M231: 11.1%
O1a-M119: 33.3%
O2a2b1*-M134(xM117): 33.3%
O2a2b1a1-M117: 22.2%
說明：採樣中客家話區比例較高，但Y染色體單倍羣暫未表現出與方言區的關係。
目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計。
下周預告：萬姓
汶(min > mín)川，岷(min > mín)江，山東汶(myonh > wèn)水，閩(min > mín)江
Forwarded from 𗷲𗒅 Zsjit Ngiam@Hiang-krungx
我有打算恢復一個定期的問答性質的互動。之前做過幾次在“一直播”的直播。知乎live因爲是強制收費的，我還是想在有正經、緊湊內容的時候做，而不是問答/閑聊。還有什麼更推薦的方式/平臺麼？
Forwarded from 𗷲𗒅 Zsjit Ngiam@Hiang-krungx
#每周一姓# 20180512 漢族萬(myanh)姓，相互無關樣本量 9：
O1a-M119: 11.1%
O1b*-M268(xPK4,M176): 11.1%
O1b1a-PK4: 11.1%
O2a1b-002611: 11.1%
O2a2b1*-M134(xM117): 22.2%
O2a2b1a1-M117: 22.2%
Q1a1a-M120: 11.1%
說明：萬姓樣本從南到北都有，單倍羣分佈目前來看也很散。
目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計。
下周預告：鄒姓
O1a-M119: 11.1%
O1b*-M268(xPK4,M176): 11.1%
O1b1a-PK4: 11.1%
O2a1b-002611: 11.1%
O2a2b1*-M134(xM117): 22.2%
O2a2b1a1-M117: 22.2%
Q1a1a-M120: 11.1%
說明：萬姓樣本從南到北都有，單倍羣分佈目前來看也很散。
目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計。
下周預告：鄒姓
我今年2月在香港的演講：
「中國360度透視」嚴實 - 從DNA看中國人的起源和演化
https://www.youtube.com/watch?v=a4Xrsa97BPU
或
https://www.bilibili.com/video/av23566511/ （暫時還在審覈中）
團結香港基金 （Our Hong Kong Foundation）錄製，主持人：香港城市大學前任校長張信剛敎授，主講人：上海復旦大學現代人類學實驗室嚴實博士
0:03:50 張信剛敎授介紹
0:15:50 嚴實博士演講
1:29:00 座談環節
相關視頻：
【一席】分子人类学 严实：Y染色体携带的历史 https://www.bilibili.com/video/av4418798
「中國360度透視」嚴實 - 從DNA看中國人的起源和演化
https://www.youtube.com/watch?v=a4Xrsa97BPU
或
https://www.bilibili.com/video/av23566511/ （暫時還在審覈中）
團結香港基金 （Our Hong Kong Foundation）錄製，主持人：香港城市大學前任校長張信剛敎授，主講人：上海復旦大學現代人類學實驗室嚴實博士
0:03:50 張信剛敎授介紹
0:15:50 嚴實博士演講
1:29:00 座談環節
相關視頻：
【一席】分子人类学 严实：Y染色体携带的历史 https://www.bilibili.com/video/av4418798
YouTube
「中國360度透視」嚴實 - 從DNA看中國人的起源與變化
傑出的古代漢語硏究者，鄭張尚芳先生千古！ 💔
https://mp.weixin.qq.com/s/bt4inB0JEj5avHDv6fnfcw
https://mp.weixin.qq.com/s/bt4inB0JEj5avHDv6fnfcw
G18: Zjangx-haix Ghung-gieu, Nom-kieng nom, Brungx-boh nom, Cex-nom se, Pok-kieng nom
#每周一姓 20180524 漢族鄒(criu)姓，相互無關樣本量 9：
C2a-F1067: 11.1%
O1b*-M268(xPK4,M176): 22.2%
O1b1a-PK4: 11.1%
O2a1b-002611: 22.2%
O2a2b1*-M134(xM117): 11.1%
O2a2b1a1-M117: 22.2%
說明：採樣基本在長江流域。分佈暫未看出什麼特徵。
目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計。
下周預告：呂姓
C2a-F1067: 11.1%
O1b*-M268(xPK4,M176): 22.2%
O1b1a-PK4: 11.1%
O2a1b-002611: 22.2%
O2a2b1*-M134(xM117): 11.1%
O2a2b1a1-M117: 22.2%
說明：採樣基本在長江流域。分佈暫未看出什麼特徵。
目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計。
下周預告：呂姓
今天有人在源基因的客服羣裏問我：“非洲黑人大部分是E，为什么说非洲黑人的基因多样性高？”
我的回答：
基因比較少有在Y染色體的（常染色體、X染色體上基因多），所以這兩個沒有必然聯繫。
如果是問Y染色體多樣性的問題，其實需要一個標準，即如何定義多樣性。如果你只測了M175, M119, M122, M134之類（都在O單倍羣及其下游）在中國常見有多態性的位點，那麼非洲多樣性幾乎是0了。大單倍羣的名稱明顯是在F、K下游分得更細的。（這種測試位點選擇造成的對多樣性估計的不客觀稱作ascertainment bias（沒有很通用的漢譯，“確證偏差”？）。）
需要看到E內部的分化年齡不比F和K小，E下面E1-P147和E2-M75分開5万多年，而整個F下面（從F2, G, H一直到T這些單倍羣名稱）分離年代不到5万年。
另外非洲還有A00, A0, A1a, A1b1, B這樣不屬於M168+的早期分離的支系，雖然人數不太多。
也許計算Y染色體的多樣性，一個普適且沒有ascertainment bias的方法是計算一個人羣中隨機取兩個人的Y染色體的分離年代（或者全序中的突變差異）的平均值。但目前並沒見過一個比較完善的硏究來做這件事。但隨着目前全序越來越多，這事應該已經可以做了。
我的回答：
基因比較少有在Y染色體的（常染色體、X染色體上基因多），所以這兩個沒有必然聯繫。
如果是問Y染色體多樣性的問題，其實需要一個標準，即如何定義多樣性。如果你只測了M175, M119, M122, M134之類（都在O單倍羣及其下游）在中國常見有多態性的位點，那麼非洲多樣性幾乎是0了。大單倍羣的名稱明顯是在F、K下游分得更細的。（這種測試位點選擇造成的對多樣性估計的不客觀稱作ascertainment bias（沒有很通用的漢譯，“確證偏差”？）。）
需要看到E內部的分化年齡不比F和K小，E下面E1-P147和E2-M75分開5万多年，而整個F下面（從F2, G, H一直到T這些單倍羣名稱）分離年代不到5万年。
另外非洲還有A00, A0, A1a, A1b1, B這樣不屬於M168+的早期分離的支系，雖然人數不太多。
也許計算Y染色體的多樣性，一個普適且沒有ascertainment bias的方法是計算一個人羣中隨機取兩個人的Y染色體的分離年代（或者全序中的突變差異）的平均值。但目前並沒見過一個比較完善的硏究來做這件事。但隨着目前全序越來越多，這事應該已經可以做了。
#每周一姓 20180529 漢族呂(liox)姓，相互無關樣本量 9：
C2a-F1067: 11.1%
N-M231: 11.1%
O2a1*-KL1(x002611): 11.1%
O2a1b-002611: 11.1%
O2a2a*-M188(xM7): 11.1%
O2a2a1b-M7: 11.1%
O2a2b1*-M134(xM117): 33.3%
說明：目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計
下周預告：范姓
C2a-F1067: 11.1%
N-M231: 11.1%
O2a1*-KL1(x002611): 11.1%
O2a1b-002611: 11.1%
O2a2a*-M188(xM7): 11.1%
O2a2a1b-M7: 11.1%
O2a2b1*-M134(xM117): 33.3%
說明：目前貼出的每周一姓只包括我在復旦檢測的數據，未包括源基因( www.yoogene.com )或其它機構的結果。源基因的數據積累足夠多以後，會有新的統計
下周預告：范姓
http://blog.sina.com.cn/s/blog_465ddf790100yciq.html
回頭看我這篇7年前寫的《人類學雜記》，科硏體系正是我近年來痛苦的源頭。發文章難，而所有評價體系全都圍繞着文章，讓我陷入了一個死循環，跳不出來。想花一些時閒來讓別人知道自己的科硏，但總有另一個聲音提醒我，要發文章！要發文章！沒有文章就沒有一切東西。於是文章也寫不出來，而離做科硏的初心也越來越遠了。已經不知道做科硏是爲了什麼了。
回頭看我這篇7年前寫的《人類學雜記》，科硏體系正是我近年來痛苦的源頭。發文章難，而所有評價體系全都圍繞着文章，讓我陷入了一個死循環，跳不出來。想花一些時閒來讓別人知道自己的科硏，但總有另一個聲音提醒我，要發文章！要發文章！沒有文章就沒有一切東西。於是文章也寫不出來，而離做科硏的初心也越來越遠了。已經不知道做科硏是爲了什麼了。